Protein–RNA interactions for Protein: P20036

HLA-DPA1, HLA class II histocompatibility antigen, DP alpha 1 chain, humanhuman

Predictions only

Length 260 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HLA-DPA1P20036 KLK8-202ENST00000320838 456 ntTSL 5 BASIC16.06■□□□□ 0.16
HLA-DPA1P20036 TMEM210-201ENST00000413619 873 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.06■□□□□ 0.16
HLA-DPA1P20036 CTDSP1-204ENST00000443891 1109 ntTSL 3 BASIC16.06■□□□□ 0.16
HLA-DPA1P20036 COMT-209ENST00000449653 1035 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
HLA-DPA1P20036 PPP6R2P1-201ENST00000450880 1275 ntBASIC16.06■□□□□ 0.16
HLA-DPA1P20036 TMEM44-AS1-203ENST00000453671 1119 ntTSL 2 BASIC16.06■□□□□ 0.16
HLA-DPA1P20036 MLF1-206ENST00000471745 1266 ntTSL 2 BASIC16.06■□□□□ 0.16
HLA-DPA1P20036 FAM72B-205ENST00000471903 676 ntTSL 5 BASIC16.06■□□□□ 0.16
HLA-DPA1P20036 MLF1-210ENST00000484955 1247 ntTSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
HLA-DPA1P20036 AC067863.1-201ENST00000494933 530 ntBASIC16.06■□□□□ 0.16
HLA-DPA1P20036 BEST1-205ENST00000526988 1263 ntTSL 2 BASIC16.06■□□□□ 0.16
HLA-DPA1P20036 OBP2A-206ENST00000539850 914 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.06■□□□□ 0.16
HLA-DPA1P20036 AC018558.2-201ENST00000566562 480 ntTSL 3 BASIC16.06■□□□□ 0.16
HLA-DPA1P20036 TIMM13-202ENST00000591871 631 ntTSL 5 BASIC16.06■□□□□ 0.16
HLA-DPA1P20036 AC026803.2-201ENST00000599784 819 ntTSL 3 BASIC16.06■□□□□ 0.16
HLA-DPA1P20036 AL589739.1-201ENST00000607720 493 ntBASIC16.06■□□□□ 0.16
HLA-DPA1P20036 GPER1-207ENST00000619052 571 ntTSL 2 BASIC16.06■□□□□ 0.16
HLA-DPA1P20036 CBR3-AS1-216ENST00000624883 564 ntTSL 3 BASIC16.06■□□□□ 0.16
HLA-DPA1P20036 TRIM24-202ENST00000415680 3799 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
HLA-DPA1P20036 MMP2-201ENST00000219070 3741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
HLA-DPA1P20036 AP003680.1-201ENST00000598970 3660 ntBASIC16.06■□□□□ 0.16
HLA-DPA1P20036 CORO2B-201ENST00000261861 3569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
HLA-DPA1P20036 CORO2B-204ENST00000566799 3566 ntTSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
HLA-DPA1P20036 TRPC3-202ENST00000379645 3548 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
HLA-DPA1P20036 CDS2-203ENST00000460006 9298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
HLA-DPA1P20036 ADAMTS2-201ENST00000251582 6754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
HLA-DPA1P20036 BRF1-206ENST00000446501 2858 ntTSL 2 BASIC16.06■□□□□ 0.16
HLA-DPA1P20036 AC026412.1-203ENST00000507841 2338 ntTSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
HLA-DPA1P20036 AQP10-203ENST00000484864 2262 ntTSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
HLA-DPA1P20036 ELOF1-203ENST00000586683 2154 ntTSL 2 BASIC16.06■□□□□ 0.16
HLA-DPA1P20036 NIN-203ENST00000382041 6496 ntTSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
HLA-DPA1P20036 RRBP1-204ENST00000377813 5041 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
HLA-DPA1P20036 PHLDA1-203ENST00000619060 5913 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
HLA-DPA1P20036 SPTLC2-201ENST00000216484 8170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
HLA-DPA1P20036 SLC2A13-202ENST00000380858 3082 ntTSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
HLA-DPA1P20036 ACSM2A-203ENST00000417235 1835 ntTSL 2 BASIC16.05■□□□□ 0.16
HLA-DPA1P20036 FAM53B-202ENST00000337318 5431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
HLA-DPA1P20036 IL11RA-202ENST00000441545 1700 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.05■□□□□ 0.16
HLA-DPA1P20036 PITPNA-201ENST00000313486 3912 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.05■□□□□ 0.16
HLA-DPA1P20036 KLHDC2-206ENST00000554589 1641 ntTSL 5 BASIC16.05■□□□□ 0.16
HLA-DPA1P20036 TNFRSF11A-202ENST00000586569 8147 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
HLA-DPA1P20036 HARS2-206ENST00000508522 1562 ntTSL 2 BASIC16.05■□□□□ 0.16
HLA-DPA1P20036 GBA2-203ENST00000378103 3611 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
HLA-DPA1P20036 DYNC1LI2-203ENST00000443351 1502 ntTSL 2 BASIC16.05■□□□□ 0.16
HLA-DPA1P20036 LINC01978-202ENST00000574526 1540 ntTSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
HLA-DPA1P20036 PCGF2-206ENST00000618941 1499 ntTSL 5 BASIC16.05■□□□□ 0.16
HLA-DPA1P20036 GLMP-213ENST00000612353 1365 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.05■□□□□ 0.16
HLA-DPA1P20036 GLMP-215ENST00000622703 1364 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.05■□□□□ 0.16
HLA-DPA1P20036 DHX40-202ENST00000425628 2255 ntTSL 2 BASIC16.05■□□□□ 0.16
HLA-DPA1P20036 CCDC6-201ENST00000263102 5811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
HLA-DPA1P20036 VSTM2A-204ENST00000407838 3112 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.05■□□□□ 0.16
HLA-DPA1P20036 ZDHHC19-201ENST00000296326 1306 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.05■□□□□ 0.16
HLA-DPA1P20036 ETV2-204ENST00000403402 1335 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
HLA-DPA1P20036 SFTPA2-201ENST00000372325 2189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
HLA-DPA1P20036 FAM215B-201ENST00000458392 2183 ntTSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
HLA-DPA1P20036 EIF4G1-209ENST00000414031 5569 ntTSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
HLA-DPA1P20036 EIF4E-201ENST00000280892 1097 ntTSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
HLA-DPA1P20036 BLOC1S2-202ENST00000370372 1249 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
HLA-DPA1P20036 UGGT2-202ENST00000376714 1233 ntTSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
HLA-DPA1P20036 C6orf52-202ENST00000379586 430 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.05■□□□□ 0.16
HLA-DPA1P20036 TNNT3-204ENST00000381558 1258 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.05■□□□□ 0.16
HLA-DPA1P20036 TAS2R41-201ENST00000408916 924 ntAPPRIS P1 BASIC16.05■□□□□ 0.16
HLA-DPA1P20036 AZGP1P1-201ENST00000411909 902 ntBASIC16.05■□□□□ 0.16
HLA-DPA1P20036 DNAJB6-209ENST00000443280 1159 ntTSL 2 BASIC16.05■□□□□ 0.16
HLA-DPA1P20036 AL121753.1-201ENST00000444717 529 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.05■□□□□ 0.16
HLA-DPA1P20036 SLC25A36-204ENST00000453248 1040 ntTSL 2 BASIC16.05■□□□□ 0.16
HLA-DPA1P20036 OST4-203ENST00000456793 561 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
HLA-DPA1P20036 UGGT2-212ENST00000621375 1004 ntTSL 5 BASIC16.05■□□□□ 0.16
HLA-DPA1P20036 POLR3D-202ENST00000397802 5494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
HLA-DPA1P20036 TNIP1-202ENST00000389378 2935 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.05■□□□□ 0.16
HLA-DPA1P20036 UNC13A-204ENST00000550896 5200 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.05■□□□□ 0.16
HLA-DPA1P20036 DENR-201ENST00000280557 2769 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
HLA-DPA1P20036 PDXK-202ENST00000327574 2583 ntTSL 2 BASIC16.05■□□□□ 0.16
HLA-DPA1P20036 RALGPS1-203ENST00000373434 2466 ntTSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
HLA-DPA1P20036 PIK3R1-211ENST00000521381 7011 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
HLA-DPA1P20036 POLR1D-207ENST00000621089 1606 ntTSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
HLA-DPA1P20036 C15orf52-202ENST00000397536 4717 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
HLA-DPA1P20036 DUSP14-204ENST00000613659 1559 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.04■□□□□ 0.16
HLA-DPA1P20036 VARS2-212ENST00000542001 4064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
HLA-DPA1P20036 MBD4-206ENST00000507208 2194 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.04■□□□□ 0.16
HLA-DPA1P20036 SHROOM4-201ENST00000289292 6261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
HLA-DPA1P20036 LRP11-201ENST00000239367 3260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
HLA-DPA1P20036 NDRG2-209ENST00000397853 2079 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC16.04■□□□□ 0.16
HLA-DPA1P20036 CNP-201ENST00000393888 2583 ntTSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
HLA-DPA1P20036 RSRP1-202ENST00000431849 1954 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
HLA-DPA1P20036 DIRC2-201ENST00000261038 3596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
HLA-DPA1P20036 C5orf24-204ENST00000504727 2923 ntTSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
HLA-DPA1P20036 CBWD5-204ENST00000377392 2863 ntTSL 2 BASIC16.04■□□□□ 0.16
HLA-DPA1P20036 PCNP-201ENST00000265260 2342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
HLA-DPA1P20036 SRP19-201ENST00000282999 937 ntTSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
HLA-DPA1P20036 MRPL13-201ENST00000306185 1086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
HLA-DPA1P20036 ATG2A-201ENST00000377264 6357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
HLA-DPA1P20036 HFE-208ENST00000397022 1280 ntTSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
HLA-DPA1P20036 RFX3-AS1-201ENST00000423112 552 ntTSL 3 BASIC16.04■□□□□ 0.16
HLA-DPA1P20036 PMS2P2-201ENST00000425039 1128 ntBASIC16.04■□□□□ 0.16
HLA-DPA1P20036 AC026202.2-201ENST00000439325 672 ntTSL 2 BASIC16.04■□□□□ 0.16
HLA-DPA1P20036 KLF2P3-201ENST00000451977 1087 ntBASIC16.04■□□□□ 0.16
HLA-DPA1P20036 LAMTOR4-206ENST00000473459 720 ntTSL 2 BASIC16.04■□□□□ 0.16
HLA-DPA1P20036 HLA-V-204ENST00000476601 1289 ntBASIC16.04■□□□□ 0.16
HLA-DPA1P20036 AC125807.1-201ENST00000483097 614 ntBASIC16.04■□□□□ 0.16
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 33.1 ms