Protein–RNA interactions for Protein: Q9C0F1

CEP44, Centrosomal protein of 44 kDa, humanhuman

Predictions only

Length 390 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CEP44Q9C0F1 VCAN-204ENST00000502527 2087 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
CEP44Q9C0F1 GAS7-213ENST00000580865 2417 ntTSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
CEP44Q9C0F1 GDF2-201ENST00000581492 1955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
CEP44Q9C0F1 REXO1L1P-202ENST00000608646 1974 ntBASIC16.18■□□□□ 0.18
CEP44Q9C0F1 FKBP6-202ENST00000413573 1507 ntTSL 5 BASIC16.18■□□□□ 0.18
CEP44Q9C0F1 SURF4-209ENST00000618229 3200 ntTSL 2 BASIC16.18■□□□□ 0.18
CEP44Q9C0F1 BTN3A1-204ENST00000425234 1882 ntTSL 2 BASIC16.18■□□□□ 0.18
CEP44Q9C0F1 ESR2-209ENST00000555278 1883 ntTSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
CEP44Q9C0F1 NPL-204ENST00000367554 3027 ntTSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
CEP44Q9C0F1 ATP6V0E2-212ENST00000611515 2565 ntTSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
CEP44Q9C0F1 AC063926.3-201ENST00000624734 5658 ntBASIC16.18■□□□□ 0.18
CEP44Q9C0F1 CENPN-202ENST00000305850 2481 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
CEP44Q9C0F1 SPINT1-202ENST00000562057 2456 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
CEP44Q9C0F1 LINC01301-205ENST00000531654 1347 ntTSL 5 BASIC16.18■□□□□ 0.18
CEP44Q9C0F1 TSPY26P-202ENST00000565928 3884 ntBASIC16.18■□□□□ 0.18
CEP44Q9C0F1 DACT3-203ENST00000410105 3085 ntTSL 2 BASIC16.17■□□□□ 0.18
CEP44Q9C0F1 JRK-209ENST00000612905 9124 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC16.17■□□□□ 0.18
CEP44Q9C0F1 POLI-208ENST00000579534 6133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
CEP44Q9C0F1 ZBTB17-216ENST00000537142 2511 ntTSL 2 BASIC16.17■□□□□ 0.18
CEP44Q9C0F1 SERPINF2-203ENST00000450523 1462 ntTSL 2 BASIC16.17■□□□□ 0.18
CEP44Q9C0F1 ARL14EP-201ENST00000282032 2430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
CEP44Q9C0F1 CPEB2-201ENST00000259997 5612 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.17■□□□□ 0.18
CEP44Q9C0F1 DYRK3-201ENST00000367106 2329 ntTSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
CEP44Q9C0F1 LIMS2-208ENST00000410011 2335 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
CEP44Q9C0F1 TGFBR2-202ENST00000359013 4605 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
CEP44Q9C0F1 CIB3-201ENST00000269878 711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
CEP44Q9C0F1 MRPL55-201ENST00000295008 632 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.17■□□□□ 0.18
CEP44Q9C0F1 CALY-202ENST00000368555 783 ntTSL 2 BASIC16.17■□□□□ 0.18
CEP44Q9C0F1 SERINC2-202ENST00000373710 2146 ntTSL 2 BASIC16.17■□□□□ 0.18
CEP44Q9C0F1 LRCOL1-201ENST00000376608 778 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
CEP44Q9C0F1 RASL12-203ENST00000434605 982 ntTSL 2 BASIC16.17■□□□□ 0.18
CEP44Q9C0F1 AL356441.1-201ENST00000452618 492 ntTSL 3 BASIC16.17■□□□□ 0.18
CEP44Q9C0F1 PHKG1P2-201ENST00000457537 863 ntBASIC16.17■□□□□ 0.18
CEP44Q9C0F1 SLC35B4-204ENST00000470969 1033 ntTSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
CEP44Q9C0F1 AL161781.2-201ENST00000509911 739 ntTSL 2 BASIC16.17■□□□□ 0.18
CEP44Q9C0F1 AC087612.1-201ENST00000560238 658 ntTSL 5 BASIC16.17■□□□□ 0.18
CEP44Q9C0F1 SLC1A6-208ENST00000598504 2987 ntTSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
CEP44Q9C0F1 AL450472.2-201ENST00000603663 1156 ntBASIC16.17■□□□□ 0.18
CEP44Q9C0F1 AC004233.3-201ENST00000607794 1269 ntBASIC16.17■□□□□ 0.18
CEP44Q9C0F1 CREB3L2-208ENST00000620715 1053 ntTSL 5 BASIC16.17■□□□□ 0.18
CEP44Q9C0F1 FGFR3-208ENST00000481110 4217 ntTSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
CEP44Q9C0F1 C15orf52-202ENST00000397536 4717 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
CEP44Q9C0F1 IDH3G-203ENST00000370093 1662 ntTSL 2 BASIC16.17■□□□□ 0.18
CEP44Q9C0F1 CCDC90B-203ENST00000525503 1919 ntTSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
CEP44Q9C0F1 AC004835.1-201ENST00000428222 2907 ntTSL 5 BASIC16.17■□□□□ 0.18
CEP44Q9C0F1 LINC00599-203ENST00000519461 2922 ntTSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
CEP44Q9C0F1 CCDC71L-202ENST00000523505 4232 ntAPPRIS P2 BASIC16.17■□□□□ 0.18
CEP44Q9C0F1 CLN8-205ENST00000520991 1305 ntTSL 5 BASIC16.17■□□□□ 0.18
CEP44Q9C0F1 LRRN2-203ENST00000367177 3463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
CEP44Q9C0F1 ZNF764-201ENST00000252797 2738 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
CEP44Q9C0F1 PRDM5-202ENST00000394435 2492 ntTSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
CEP44Q9C0F1 NUS1-201ENST00000368494 4676 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
CEP44Q9C0F1 RASAL3-201ENST00000343625 3293 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC16.16■□□□□ 0.18
CEP44Q9C0F1 MITF-204ENST00000352241 4814 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
CEP44Q9C0F1 SYBU-230ENST00000532779 2765 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.16■□□□□ 0.18
CEP44Q9C0F1 CCNA2-202ENST00000618014 2797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
CEP44Q9C0F1 PICALM-219ENST00000532317 3474 ntTSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
CEP44Q9C0F1 LTA-214ENST00000454783 1507 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.16■□□□□ 0.18
CEP44Q9C0F1 SCUBE2-207ENST00000520467 3148 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.16■□□□□ 0.18
CEP44Q9C0F1 ARID4B-202ENST00000349213 5811 ntTSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
CEP44Q9C0F1 ZSCAN2-203ENST00000334141 993 ntTSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
CEP44Q9C0F1 SYCE1-202ENST00000343131 1113 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
CEP44Q9C0F1 LCE1E-201ENST00000368770 1180 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
CEP44Q9C0F1 CYB561D1-202ENST00000369868 1085 ntTSL 2 BASIC16.16■□□□□ 0.18
CEP44Q9C0F1 EEF1B2-202ENST00000392221 880 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.16■□□□□ 0.18
CEP44Q9C0F1 LRP5L-201ENST00000402785 1193 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
CEP44Q9C0F1 PIN1P1-201ENST00000412108 996 ntBASIC16.16■□□□□ 0.18
CEP44Q9C0F1 GOLGA6L11P-201ENST00000417252 1298 ntBASIC16.16■□□□□ 0.18
CEP44Q9C0F1 AL109811.2-201ENST00000447600 487 ntTSL 3 BASIC16.16■□□□□ 0.18
CEP44Q9C0F1 LHX6-205ENST00000464484 666 ntTSL 2 BASIC16.16■□□□□ 0.18
CEP44Q9C0F1 AC055854.1-201ENST00000523627 570 ntTSL 4 BASIC16.16■□□□□ 0.18
CEP44Q9C0F1 AP000943.3-201ENST00000536540 954 ntTSL 3 BASIC16.16■□□□□ 0.18
CEP44Q9C0F1 COQ6-210ENST00000554920 649 ntTSL 3 BASIC16.16■□□□□ 0.18
CEP44Q9C0F1 AC104794.3-201ENST00000566840 1248 ntBASIC16.16■□□□□ 0.18
CEP44Q9C0F1 AC092337.1-201ENST00000568699 1129 ntBASIC16.16■□□□□ 0.18
CEP44Q9C0F1 ZNF226-211ENST00000588742 447 ntTSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
CEP44Q9C0F1 AC004461.2-201ENST00000629517 803 ntBASIC16.16■□□□□ 0.18
CEP44Q9C0F1 BAIAP2-219ENST00000575245 2229 ntTSL 5 BASIC16.16■□□□□ 0.18
CEP44Q9C0F1 CCDC83-201ENST00000280245 2358 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.16■□□□□ 0.18
CEP44Q9C0F1 ARHGEF28-211ENST00000512883 2936 ntTSL 2 BASIC16.16■□□□□ 0.18
CEP44Q9C0F1 ATP6AP2-215ENST00000636409 1962 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.16■□□□□ 0.18
CEP44Q9C0F1 AC074117.1-201ENST00000447070 3060 ntTSL 2 BASIC16.16■□□□□ 0.18
CEP44Q9C0F1 GLG1-202ENST00000422840 4748 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
CEP44Q9C0F1 SLC4A5-203ENST00000377632 3123 ntTSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
CEP44Q9C0F1 ARHGEF28-201ENST00000296794 5246 ntTSL 5 BASIC16.16■□□□□ 0.18
CEP44Q9C0F1 SNRPN-201ENST00000346403 1304 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.16■□□□□ 0.18
CEP44Q9C0F1 SEC23A-203ENST00000545328 2734 ntTSL 2 BASIC16.16■□□□□ 0.18
CEP44Q9C0F1 PPHLN1-204ENST00000358314 1643 ntTSL 2 BASIC16.16■□□□□ 0.18
CEP44Q9C0F1 LSP1-204ENST00000406638 2640 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.15■□□□□ 0.18
CEP44Q9C0F1 RNF168-201ENST00000318037 5347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
CEP44Q9C0F1 TRIML1-201ENST00000332517 1797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
CEP44Q9C0F1 CNTNAP3B-201ENST00000276974 3240 ntTSL 5 BASIC16.15■□□□□ 0.18
CEP44Q9C0F1 CCDC155-201ENST00000447857 2378 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
CEP44Q9C0F1 IRX6-201ENST00000290552 3128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
CEP44Q9C0F1 NR2C1-203ENST00000393101 1822 ntTSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
CEP44Q9C0F1 AFTPH-202ENST00000238856 4040 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
CEP44Q9C0F1 LINC00487-201ENST00000382045 2131 ntTSL 2 BASIC16.15■□□□□ 0.18
CEP44Q9C0F1 PTPN13-204ENST00000436978 8573 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC16.15■□□□□ 0.18
CEP44Q9C0F1 HCG18-233ENST00000412685 2552 ntTSL 2 BASIC16.15■□□□□ 0.18
CEP44Q9C0F1 PHGDH-223ENST00000641597 2585 ntAPPRIS P1 BASIC16.15■□□□□ 0.18
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 36.5 ms