Protein–RNA interactions for Protein: Q9BSW7

SYT17, Synaptotagmin-17, humanhuman

Predictions only

Length 474 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SYT17Q9BSW7 AL157935.2-201ENST00000476274 1071 ntTSL 5 BASIC19.05■□□□□ 0.64
SYT17Q9BSW7 FABP5P3-202ENST00000477993 1027 ntTSL 5 BASIC19.05■□□□□ 0.64
SYT17Q9BSW7 AC093879.1-201ENST00000508959 1176 ntTSL 2 BASIC19.05■□□□□ 0.64
SYT17Q9BSW7 AP003398.1-201ENST00000531124 318 ntBASIC19.05■□□□□ 0.64
SYT17Q9BSW7 AP003065.1-201ENST00000540912 562 ntTSL 4 BASIC19.05■□□□□ 0.64
SYT17Q9BSW7 LTBR-209ENST00000541102 1084 ntTSL 5 BASIC19.05■□□□□ 0.64
SYT17Q9BSW7 NPTN-204ENST00000562924 1094 ntTSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
SYT17Q9BSW7 MIR5196-201ENST00000578146 115 ntBASIC19.05■□□□□ 0.64
SYT17Q9BSW7 AC006158.1-201ENST00000610661 249 ntBASIC19.05■□□□□ 0.64
SYT17Q9BSW7 TSLP-203ENST00000420978 2621 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
SYT17Q9BSW7 HPCAL1-202ENST00000381765 1904 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.05■□□□□ 0.64
SYT17Q9BSW7 HPCAL1-207ENST00000620771 1941 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.05■□□□□ 0.64
SYT17Q9BSW7 THOC5-202ENST00000397871 2560 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.05■□□□□ 0.64
SYT17Q9BSW7 TIMM50-202ENST00000544017 2572 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
SYT17Q9BSW7 SNAP47-201ENST00000315781 2367 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
SYT17Q9BSW7 CCDC40-202ENST00000374876 2010 ntTSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
SYT17Q9BSW7 TMEM9-204ENST00000367334 1529 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
SYT17Q9BSW7 TUBA4A-202ENST00000392088 2499 ntTSL 2 BASIC19.05■□□□□ 0.64
SYT17Q9BSW7 CBS-203ENST00000398158 2453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
SYT17Q9BSW7 CBSL-206ENST00000624406 2453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
SYT17Q9BSW7 TCP1-203ENST00000420894 1671 ntTSL 5 BASIC19.05■□□□□ 0.64
SYT17Q9BSW7 CLCF1-201ENST00000312438 1844 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
SYT17Q9BSW7 WDR45-224ENST00000485908 1301 ntTSL 5 BASIC19.04■□□□□ 0.64
SYT17Q9BSW7 CHRNA4-207ENST00000615287 5643 ntTSL 5 BASIC19.04■□□□□ 0.64
SYT17Q9BSW7 ZNF446-203ENST00000594369 2238 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
SYT17Q9BSW7 FBXO41-204ENST00000520530 3293 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.04■□□□□ 0.64
SYT17Q9BSW7 PSMF1-201ENST00000246015 2042 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC19.04■□□□□ 0.64
SYT17Q9BSW7 STYXL1-201ENST00000248600 1415 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
SYT17Q9BSW7 PTPRE-201ENST00000254667 5331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
SYT17Q9BSW7 PPA2-204ENST00000354147 667 ntTSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
SYT17Q9BSW7 ZDHHC9-202ENST00000371064 2473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
SYT17Q9BSW7 ESD-202ENST00000378720 1192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
SYT17Q9BSW7 GTF2A2-205ENST00000396064 633 ntTSL 3 BASIC19.04■□□□□ 0.64
SYT17Q9BSW7 PPA2-205ENST00000432483 859 ntTSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
SYT17Q9BSW7 IZUMO1R-202ENST00000440961 805 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.04■□□□□ 0.64
SYT17Q9BSW7 IMPA1-203ENST00000449740 1180 ntTSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
SYT17Q9BSW7 GTF2A2-208ENST00000484743 408 ntTSL 2 BASIC19.04■□□□□ 0.64
SYT17Q9BSW7 SCP2-213ENST00000528311 1896 ntTSL 2 BASIC19.04■□□□□ 0.64
SYT17Q9BSW7 NME1-NME2-203ENST00000555572 1193 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.04■□□□□ 0.64
SYT17Q9BSW7 AC127024.2-201ENST00000581019 789 ntTSL 5 BASIC19.04■□□□□ 0.64
SYT17Q9BSW7 AC044839.1-204ENST00000634777 1058 ntTSL 5 BASIC19.04■□□□□ 0.64
SYT17Q9BSW7 MIER1-204ENST00000371012 2420 ntTSL 2 BASIC19.04■□□□□ 0.64
SYT17Q9BSW7 CADPS2-201ENST00000313070 6065 ntTSL 5 BASIC19.04■□□□□ 0.64
SYT17Q9BSW7 CADPS2-208ENST00000615869 6066 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC19.04■□□□□ 0.64
SYT17Q9BSW7 AC134407.2-201ENST00000625089 1978 ntBASIC19.04■□□□□ 0.64
SYT17Q9BSW7 HSD17B6-201ENST00000322165 1512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
SYT17Q9BSW7 SNAP47-202ENST00000366759 2362 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
SYT17Q9BSW7 ECE2-205ENST00000404464 3229 ntTSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
SYT17Q9BSW7 SNAI3-AS1-202ENST00000563475 2081 ntTSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
SYT17Q9BSW7 PLA1A-205ENST00000494440 1775 ntTSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
SYT17Q9BSW7 ATP11A-AS1-201ENST00000446442 2192 ntTSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
SYT17Q9BSW7 EDC4-201ENST00000358933 4800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
SYT17Q9BSW7 PAX1-205ENST00000613128 5352 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
SYT17Q9BSW7 MRPL37P1-201ENST00000592451 1337 ntBASIC19.03■□□□□ 0.64
SYT17Q9BSW7 IL11RA-202ENST00000441545 1700 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.03■□□□□ 0.64
SYT17Q9BSW7 GABARAPL1-205ENST00000539170 1700 ntTSL 3 BASIC19.03■□□□□ 0.64
SYT17Q9BSW7 SCRN1-205ENST00000425819 1552 ntTSL 2 BASIC19.03■□□□□ 0.64
SYT17Q9BSW7 DARS-AS1-209ENST00000594219 1420 ntTSL 5 BASIC19.03■□□□□ 0.64
SYT17Q9BSW7 PROK2-201ENST00000295619 1022 ntTSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
SYT17Q9BSW7 RAB25-201ENST00000361084 1110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
SYT17Q9BSW7 AL139094.1-201ENST00000405549 1188 ntBASIC19.03■□□□□ 0.64
SYT17Q9BSW7 AC012442.2-201ENST00000414784 425 ntTSL 2 BASIC19.03■□□□□ 0.64
SYT17Q9BSW7 AL592076.1-201ENST00000424448 303 ntBASIC19.03■□□□□ 0.64
SYT17Q9BSW7 C9orf116-205ENST00000429260 678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
SYT17Q9BSW7 PLEKHA8P1-203ENST00000545609 277 ntTSL 3 BASIC19.03■□□□□ 0.64
SYT17Q9BSW7 AC009779.1-201ENST00000551138 283 ntBASIC19.03■□□□□ 0.64
SYT17Q9BSW7 ORAI2-204ENST00000473939 2493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
SYT17Q9BSW7 FAM222A-202ENST00000538780 3294 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
SYT17Q9BSW7 NPTX2-201ENST00000265634 2700 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
SYT17Q9BSW7 CSF3-201ENST00000225474 1509 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
SYT17Q9BSW7 ARL5A-201ENST00000295087 5326 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
SYT17Q9BSW7 COL9A1-204ENST00000370496 1372 ntTSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
SYT17Q9BSW7 PDZD3-202ENST00000355547 2252 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
SYT17Q9BSW7 RHD-206ENST00000423810 1637 ntTSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
SYT17Q9BSW7 B3GNT2-201ENST00000301998 2763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
SYT17Q9BSW7 GBGT1-203ENST00000372040 1980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.64
SYT17Q9BSW7 CHTF18-202ENST00000317063 2988 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.02■□□□□ 0.64
SYT17Q9BSW7 CPAMD8-202ENST00000388925 5355 ntTSL 5 BASIC19.02■□□□□ 0.64
SYT17Q9BSW7 OSTM1-201ENST00000193322 4467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.64
SYT17Q9BSW7 SLC39A9-209ENST00000556605 2065 ntTSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.64
SYT17Q9BSW7 TMEM170A-207ENST00000569540 2331 ntTSL 2 BASIC19.02■□□□□ 0.64
SYT17Q9BSW7 ISLR2-208ENST00000565159 2824 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC19.02■□□□□ 0.64
SYT17Q9BSW7 AL603756.1-201ENST00000606511 2163 ntBASIC19.02■□□□□ 0.64
SYT17Q9BSW7 SLC35E2B-204ENST00000614300 2156 ntTSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.64
SYT17Q9BSW7 LMNA-203ENST00000368297 1679 ntTSL 2 BASIC19.02■□□□□ 0.64
SYT17Q9BSW7 GGT3P-204ENST00000453783 1664 ntBASIC19.02■□□□□ 0.64
SYT17Q9BSW7 BRMS1-201ENST00000359957 1445 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.64
SYT17Q9BSW7 LIPE-AS1-204ENST00000594624 1448 ntTSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.64
SYT17Q9BSW7 KMT2E-207ENST00000476671 2523 ntTSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.64
SYT17Q9BSW7 FUT4-201ENST00000358752 6059 ntAPPRIS P1 BASIC19.02■□□□□ 0.64
SYT17Q9BSW7 SNRPD3-201ENST00000215829 1763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.64
SYT17Q9BSW7 ALKBH2-201ENST00000343075 1030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.64
SYT17Q9BSW7 SOD2-202ENST00000367054 815 ntTSL 2 BASIC19.02■□□□□ 0.64
SYT17Q9BSW7 Z69890.1-201ENST00000382990 339 ntBASIC19.02■□□□□ 0.64
SYT17Q9BSW7 AL118508.1-202ENST00000411595 709 ntTSL 2 BASIC19.02■□□□□ 0.64
SYT17Q9BSW7 AC100827.2-201ENST00000563214 1194 ntBASIC19.02■□□□□ 0.64
SYT17Q9BSW7 AC027139.1-201ENST00000565286 951 ntBASIC19.02■□□□□ 0.64
SYT17Q9BSW7 PAM16-211ENST00000575848 518 ntTSL 3 BASIC19.02■□□□□ 0.64
SYT17Q9BSW7 PAM16-214ENST00000576217 493 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.02■□□□□ 0.64
SYT17Q9BSW7 HIST1H2BE-201ENST00000614097 497 ntAPPRIS P1 BASIC19.02■□□□□ 0.64
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 62.3 ms