Protein–RNA interactions for Protein: Q9BST9

RTKN, Rhotekin, humanhuman

Predictions only

Length 563 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RTKNQ9BST9 MIR6775-201ENST00000617557 69 ntBASIC16.34■□□□□ 0.21
RTKNQ9BST9 LINC00668-206ENST00000581725 1902 ntTSL 2 BASIC16.34■□□□□ 0.21
RTKNQ9BST9 MAPK3-212ENST00000484663 2567 ntTSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
RTKNQ9BST9 FUT3-202ENST00000458379 2024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
RTKNQ9BST9 FAM222B-202ENST00000452648 2836 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.34■□□□□ 0.21
RTKNQ9BST9 FSTL3-206ENST00000592947 2144 ntTSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
RTKNQ9BST9 ZNF397-201ENST00000261333 1419 ntTSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
RTKNQ9BST9 NEO1-202ENST00000339362 7342 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.34■□□□□ 0.21
RTKNQ9BST9 ADRA2A-201ENST00000280155 3745 ntAPPRIS P1 BASIC16.34■□□□□ 0.21
RTKNQ9BST9 TVP23C-201ENST00000225576 1527 ntTSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
RTKNQ9BST9 PTBP1-202ENST00000350092 3069 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
RTKNQ9BST9 BX276092.9-201ENST00000636797 1563 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.34■□□□□ 0.21
RTKNQ9BST9 AC012485.3-201ENST00000637634 2424 ntTSL 5 BASIC16.34■□□□□ 0.21
RTKNQ9BST9 LINC00029-201ENST00000370341 1631 ntTSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
RTKNQ9BST9 AKR1B15-202ENST00000457545 1621 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.34■□□□□ 0.21
RTKNQ9BST9 KCNJ5-201ENST00000338350 1734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.21
RTKNQ9BST9 PAX3-207ENST00000409551 1782 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.21
RTKNQ9BST9 INTS11-203ENST00000419704 1798 ntTSL 2 BASIC16.33■□□□□ 0.21
RTKNQ9BST9 GPS1-228ENST00000624957 1825 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.33■□□□□ 0.21
RTKNQ9BST9 APBB1-224ENST00000621678 1907 ntTSL 5 BASIC16.33■□□□□ 0.21
RTKNQ9BST9 KLHDC8A-201ENST00000367155 2928 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.33■□□□□ 0.21
RTKNQ9BST9 AC009292.1-201ENST00000502156 1986 ntTSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.21
RTKNQ9BST9 FMNL3-202ENST00000352151 4006 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.33■□□□□ 0.21
RTKNQ9BST9 LSP1-202ENST00000381775 2016 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.33■□□□□ 0.21
RTKNQ9BST9 HLA-DQB2-231ENST00000435145 2026 ntBASIC16.33■□□□□ 0.21
RTKNQ9BST9 EXT2-210ENST00000533608 3136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.21
RTKNQ9BST9 KTN1-AS1-202ENST00000412224 2185 ntTSL 2 BASIC16.33■□□□□ 0.2
RTKNQ9BST9 GSAP-201ENST00000257626 3251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
RTKNQ9BST9 PURB-201ENST00000395699 9069 ntAPPRIS P1 BASIC16.33■□□□□ 0.2
RTKNQ9BST9 FES-204ENST00000414248 2327 ntTSL 2 BASIC16.33■□□□□ 0.2
RTKNQ9BST9 HLA-DMA-201ENST00000374843 1123 ntAPPRIS P1 BASIC16.33■□□□□ 0.2
RTKNQ9BST9 PHACTR1-202ENST00000379329 707 ntTSL 2 BASIC16.33■□□□□ 0.2
RTKNQ9BST9 CCL25-203ENST00000390669 924 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
RTKNQ9BST9 WNT7B-203ENST00000410058 714 ntTSL 3 BASIC16.33■□□□□ 0.2
RTKNQ9BST9 AL645941.2-201ENST00000429234 612 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.33■□□□□ 0.2
RTKNQ9BST9 PRSS42-202ENST00000447340 1280 ntTSL 2 BASIC16.33■□□□□ 0.2
RTKNQ9BST9 AP001471.1-201ENST00000454245 672 ntTSL 3 BASIC16.33■□□□□ 0.2
RTKNQ9BST9 FUZ-207ENST00000526575 482 ntTSL 4 BASIC16.33■□□□□ 0.2
RTKNQ9BST9 AC005833.2-201ENST00000527518 1249 ntTSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
RTKNQ9BST9 C12orf10-204ENST00000548632 988 ntTSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
RTKNQ9BST9 RAMP2-202ENST00000587142 549 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
RTKNQ9BST9 RAMP2-203ENST00000588576 573 ntTSL 5 BASIC16.33■□□□□ 0.2
RTKNQ9BST9 PHOSPHO2-207ENST00000616524 1253 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.33■□□□□ 0.2
RTKNQ9BST9 AC007431.3-201ENST00000623221 587 ntBASIC16.33■□□□□ 0.2
RTKNQ9BST9 AC008969.1-201ENST00000550135 6438 ntTSL 2 BASIC16.33■□□□□ 0.2
RTKNQ9BST9 GTDC1-219ENST00000542155 2677 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.33■□□□□ 0.2
RTKNQ9BST9 STC2-201ENST00000265087 5353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
RTKNQ9BST9 AC020907.1-201ENST00000616460 1350 ntBASIC16.33■□□□□ 0.2
RTKNQ9BST9 CCDC28B-202ENST00000421922 1415 ntTSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
RTKNQ9BST9 NEO1-206ENST00000558964 4441 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
RTKNQ9BST9 SIRT6-201ENST00000305232 1506 ntTSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
RTKNQ9BST9 HPCAL1-206ENST00000613496 1547 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.33■□□□□ 0.2
RTKNQ9BST9 GFY-202ENST00000610896 1557 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.33■□□□□ 0.2
RTKNQ9BST9 AP3S2-216ENST00000617003 1561 ntBASIC16.33■□□□□ 0.2
RTKNQ9BST9 PSMA8-202ENST00000343848 1675 ntTSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
RTKNQ9BST9 GABARAPL1-205ENST00000539170 1700 ntTSL 3 BASIC16.33■□□□□ 0.2
RTKNQ9BST9 DAND5-202ENST00000585548 1731 ntTSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
RTKNQ9BST9 HMGA1-202ENST00000347617 1773 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
RTKNQ9BST9 C17orf100-201ENST00000542475 1756 ntAPPRIS P1 BASIC16.33■□□□□ 0.2
RTKNQ9BST9 CYB5R3-204ENST00000407332 1849 ntTSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
RTKNQ9BST9 CACNA2D3-201ENST00000288197 3671 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
RTKNQ9BST9 CACNA2D3-206ENST00000474759 3675 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
RTKNQ9BST9 TINF2-208ENST00000558566 1874 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.33■□□□□ 0.2
RTKNQ9BST9 PRDM8-201ENST00000339711 4095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
RTKNQ9BST9 NEK2-202ENST00000366999 2131 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
RTKNQ9BST9 CHMP1A-202ENST00000535997 2295 ntTSL 2 BASIC16.33■□□□□ 0.2
RTKNQ9BST9 TSC22D4-201ENST00000300181 2383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
RTKNQ9BST9 LRRC57-204ENST00000563454 2407 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.33■□□□□ 0.2
RTKNQ9BST9 CACFD1-201ENST00000291722 2688 ntTSL 2 BASIC16.32■□□□□ 0.2
RTKNQ9BST9 SURF4-207ENST00000545297 2863 ntTSL 2 BASIC16.32■□□□□ 0.2
RTKNQ9BST9 LONRF3-201ENST00000304778 2989 ntTSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
RTKNQ9BST9 SLC43A2-204ENST00000571650 3261 ntTSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
RTKNQ9BST9 HIC2-201ENST00000407464 6798 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
RTKNQ9BST9 ASNS-201ENST00000175506 2356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
RTKNQ9BST9 CMA1-201ENST00000206446 633 ntTSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
RTKNQ9BST9 SNAI2-201ENST00000020945 2010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
RTKNQ9BST9 TLDC2-201ENST00000217320 2083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
RTKNQ9BST9 SMAP1-201ENST00000316999 2403 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
RTKNQ9BST9 RTL6-201ENST00000341255 5495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
RTKNQ9BST9 C14orf93-202ENST00000341470 2221 ntTSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
RTKNQ9BST9 SPATA20-202ENST00000356488 2634 ntTSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
RTKNQ9BST9 CLDN7-201ENST00000360325 1542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
RTKNQ9BST9 SUFU-202ENST00000369902 5001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
RTKNQ9BST9 HSFX1-201ENST00000370416 1963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
RTKNQ9BST9 AQP7-204ENST00000379506 1062 ntTSL 2 BASIC16.32■□□□□ 0.2
RTKNQ9BST9 EIF1AX-201ENST00000379593 765 ntTSL 3 BASIC16.32■□□□□ 0.2
RTKNQ9BST9 ASMT-201ENST00000381229 1087 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
RTKNQ9BST9 PRMT5-203ENST00000397440 1907 ntTSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
RTKNQ9BST9 MPPED1-202ENST00000417669 3657 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.32■□□□□ 0.2
RTKNQ9BST9 NECAP2-203ENST00000457722 935 ntTSL 2 BASIC16.32■□□□□ 0.2
RTKNQ9BST9 GPBAR1-201ENST00000479077 1869 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.32■□□□□ 0.2
RTKNQ9BST9 TPI1-206ENST00000488464 791 ntTSL 5 BASIC16.32■□□□□ 0.2
RTKNQ9BST9 CDH6-205ENST00000514738 2569 ntTSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
RTKNQ9BST9 AP002360.1-202ENST00000530460 2462 ntAPPRIS ALT2 BASIC16.32■□□□□ 0.2
RTKNQ9BST9 PPP1R14B-203ENST00000542235 920 ntTSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
RTKNQ9BST9 ZNF140-210ENST00000544426 2340 ntTSL 2 BASIC16.32■□□□□ 0.2
RTKNQ9BST9 C12orf49-204ENST00000548356 923 ntTSL 2 BASIC16.32■□□□□ 0.2
RTKNQ9BST9 IGHV3OR16-16-201ENST00000563644 343 ntBASIC16.32■□□□□ 0.2
RTKNQ9BST9 ORC6-206ENST00000568364 888 ntTSL 5 BASIC16.32■□□□□ 0.2
RTKNQ9BST9 AC068418.2-201ENST00000577309 3703 ntBASIC16.32■□□□□ 0.2
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 85.4 ms