Protein–RNA interactions for Protein: Q14623

IHH, Indian hedgehog protein, humanhuman

Predictions only

Length 411 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
IHHQ14623 PHYH-203ENST00000396920 1829 ntTSL 5 BASIC15.96■□□□□ 0.14
IHHQ14623 NFE2-203ENST00000540264 1833 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.14
IHHQ14623 APOLD1-202ENST00000356591 4646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.14
IHHQ14623 HPCAL1-202ENST00000381765 1904 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.96■□□□□ 0.14
IHHQ14623 WDR81-204ENST00000419248 3315 ntTSL 2 BASIC15.96■□□□□ 0.14
IHHQ14623 MINDY2-202ENST00000450403 4820 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.14
IHHQ14623 LINC01168-201ENST00000461291 5254 ntTSL 2 BASIC15.96■□□□□ 0.14
IHHQ14623 DFNA5-202ENST00000409775 1689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
IHHQ14623 RAD51C-215ENST00000583539 1319 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.95■□□□□ 0.14
IHHQ14623 AC009237.3-202ENST00000608013 3042 ntTSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
IHHQ14623 NKIRAS1-201ENST00000388759 2335 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC15.95■□□□□ 0.14
IHHQ14623 CRAT-201ENST00000318080 2763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
IHHQ14623 RABEP1-202ENST00000537505 5365 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
IHHQ14623 AC012414.7-201ENST00000621235 1507 ntTSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
IHHQ14623 NCKIPSD-201ENST00000294129 2989 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
IHHQ14623 NDUFA6-AS1-203ENST00000439129 2950 ntTSL 5 BASIC15.95■□□□□ 0.14
IHHQ14623 AL512625.1-201ENST00000305709 2541 ntTSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
IHHQ14623 SEMA4C-201ENST00000305476 3545 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
IHHQ14623 MAP4K4-202ENST00000324219 7526 ntTSL 5 BASIC15.95■□□□□ 0.14
IHHQ14623 VGLL2-202ENST00000352536 1709 ntTSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
IHHQ14623 RPS5-201ENST00000196551 740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
IHHQ14623 SPCS1-201ENST00000233025 1082 ntTSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
IHHQ14623 EIF4E-201ENST00000280892 1097 ntTSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
IHHQ14623 CYSRT1-201ENST00000409414 1297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
IHHQ14623 EFHD1-202ENST00000409613 1156 ntTSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
IHHQ14623 AC008443.3-201ENST00000412295 549 ntTSL 4 BASIC15.95■□□□□ 0.14
IHHQ14623 TMEM210-201ENST00000413619 873 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.95■□□□□ 0.14
IHHQ14623 FAM8A3P-201ENST00000427218 844 ntBASIC15.95■□□□□ 0.14
IHHQ14623 SDHAP3-202ENST00000515467 728 ntBASIC15.95■□□□□ 0.14
IHHQ14623 SLC1A4-205ENST00000531327 1217 ntTSL 2 BASIC15.95■□□□□ 0.14
IHHQ14623 ARL16-202ENST00000570561 768 ntTSL 2 BASIC15.95■□□□□ 0.14
IHHQ14623 PRR29-204ENST00000577953 565 ntTSL 4 BASIC15.95■□□□□ 0.14
IHHQ14623 YPEL2-205ENST00000585166 881 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.95■□□□□ 0.14
IHHQ14623 AC011491.2-201ENST00000599584 447 ntTSL 5 BASIC15.95■□□□□ 0.14
IHHQ14623 RPS6KA3-201ENST00000379565 7918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
IHHQ14623 CTCF-201ENST00000264010 3939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
IHHQ14623 KLHDC8A-201ENST00000367155 2928 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.95■□□□□ 0.14
IHHQ14623 LINC00668-206ENST00000581725 1902 ntTSL 2 BASIC15.95■□□□□ 0.14
IHHQ14623 CALM3-212ENST00000599839 1355 ntTSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
IHHQ14623 AC007326.5-201ENST00000640084 1382 ntTSL 5 BASIC15.95■□□□□ 0.14
IHHQ14623 TFAP2A-201ENST00000319516 2035 ntTSL 5 BASIC15.95■□□□□ 0.14
IHHQ14623 RNPS1-220ENST00000566458 2037 ntTSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
IHHQ14623 NRXN1-209ENST00000405581 5078 ntTSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
IHHQ14623 NFIC-201ENST00000341919 1573 ntTSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
IHHQ14623 TCF25-201ENST00000263346 2233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
IHHQ14623 EGFR-203ENST00000344576 2864 ntTSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
IHHQ14623 MYEF2-201ENST00000267836 2958 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
IHHQ14623 KCNG3-201ENST00000306078 3824 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
IHHQ14623 LRFN1-201ENST00000248668 3381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
IHHQ14623 TRPC1-201ENST00000273482 4324 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
IHHQ14623 JRK-211ENST00000615982 2823 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
IHHQ14623 TRPM2-AS-202ENST00000456880 2056 ntTSL 2 BASIC15.95■□□□□ 0.14
IHHQ14623 SYBU-209ENST00000446070 2919 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
IHHQ14623 KLHL21-202ENST00000377663 6445 ntTSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
IHHQ14623 METTL21A-203ENST00000411432 4805 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.94■□□□□ 0.14
IHHQ14623 TMED1-201ENST00000214869 1340 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
IHHQ14623 FGFR3-204ENST00000412135 3951 ntTSL 5 BASIC15.94■□□□□ 0.14
IHHQ14623 CPEB3-203ENST00000614585 5789 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.94■□□□□ 0.14
IHHQ14623 VSTM2A-204ENST00000407838 3112 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.94■□□□□ 0.14
IHHQ14623 KANK1-204ENST00000382293 5249 ntTSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
IHHQ14623 MCF2L-208ENST00000397030 6580 ntTSL 2 BASIC15.94■□□□□ 0.14
IHHQ14623 CLN3-201ENST00000333496 1608 ntTSL 5 BASIC15.94■□□□□ 0.14
IHHQ14623 SEC14L4-204ENST00000381982 1603 ntTSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
IHHQ14623 HDAC8-209ENST00000373589 1740 ntTSL 2 BASIC15.94■□□□□ 0.14
IHHQ14623 ARHGEF7-214ENST00000478679 1833 ntTSL 2 BASIC15.94■□□□□ 0.14
IHHQ14623 MYCBPAP-201ENST00000323776 3186 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
IHHQ14623 ARID1B-202ENST00000346085 10194 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
IHHQ14623 PHKA1-201ENST00000339490 6121 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
IHHQ14623 YY1AP1-211ENST00000368340 2927 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
IHHQ14623 SP2-201ENST00000376741 3112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
IHHQ14623 TIGD2-202ENST00000603357 3217 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC15.94■□□□□ 0.14
IHHQ14623 MUC1-201ENST00000337604 859 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
IHHQ14623 OR5C1-201ENST00000373680 963 ntAPPRIS P1 BASIC15.94■□□□□ 0.14
IHHQ14623 BASP1P1-201ENST00000430708 665 ntBASIC15.94■□□□□ 0.14
IHHQ14623 RASL12-203ENST00000434605 982 ntTSL 2 BASIC15.94■□□□□ 0.14
IHHQ14623 ZMYND10-AS1-201ENST00000440013 250 ntTSL 3 BASIC15.94■□□□□ 0.14
IHHQ14623 BCRP1-201ENST00000444246 691 ntBASIC15.94■□□□□ 0.14
IHHQ14623 VCX3B-204ENST00000453306 868 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.94■□□□□ 0.14
IHHQ14623 AC092910.3-201ENST00000484076 969 ntTSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
IHHQ14623 CXCL6-203ENST00000515050 557 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
IHHQ14623 SPCS2P1-201ENST00000561636 679 ntBASIC15.94■□□□□ 0.14
IHHQ14623 AC074044.1-201ENST00000609673 707 ntBASIC15.94■□□□□ 0.14
IHHQ14623 MALAT1-213ENST00000618227 593 ntTSL 3 BASIC15.94■□□□□ 0.14
IHHQ14623 AL355493.2-201ENST00000568270 1395 ntTSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
IHHQ14623 HPSE-206ENST00000512196 1571 ntTSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
IHHQ14623 ALOX15B-204ENST00000572022 2396 ntTSL 2 BASIC15.94■□□□□ 0.14
IHHQ14623 WDR45B-201ENST00000392325 2587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
IHHQ14623 CACFD1-206ENST00000540581 2880 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.94■□□□□ 0.14
IHHQ14623 AC092384.3-202ENST00000564646 2873 ntBASIC15.94■□□□□ 0.14
IHHQ14623 GUCD1-204ENST00000407471 3482 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.94■□□□□ 0.14
IHHQ14623 GNA13-201ENST00000439174 4922 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
IHHQ14623 ELFN1-202ENST00000561626 3742 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.94■□□□□ 0.14
IHHQ14623 NRXN1-229ENST00000628515 3243 ntTSL 5 BASIC15.94■□□□□ 0.14
IHHQ14623 SYT3-201ENST00000338916 2915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
IHHQ14623 ZNF620-202ENST00000418905 2022 ntTSL 2 BASIC15.94■□□□□ 0.14
IHHQ14623 WDR6-222ENST00000615452 1949 ntTSL 5 BASIC15.94■□□□□ 0.14
IHHQ14623 TAPBPL-201ENST00000266556 1741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
IHHQ14623 CD40-207ENST00000620709 1522 ntTSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
IHHQ14623 URAHP-202ENST00000409873 1349 ntTSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
IHHQ14623 HSPA12B-201ENST00000254963 3151 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 28.8 ms