Protein–RNA interactions for Protein: Q08188

TGM3, Protein-glutamine gamma-glutamyltransferase E, humanhuman

Predictions only

Length 693 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TGM3Q08188 GOLGA7B-201ENST00000370602 6447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
TGM3Q08188 PAQR8-202ENST00000442253 4738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
TGM3Q08188 ATG13-216ENST00000530500 2030 ntTSL 2 BASIC15.26■□□□□ 0.03
TGM3Q08188 ANKRD24-206ENST00000600132 4026 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.26■□□□□ 0.03
TGM3Q08188 KRT8-215ENST00000552150 1687 ntTSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
TGM3Q08188 EFR3B-203ENST00000402191 3685 ntTSL 5 BASIC15.26■□□□□ 0.03
TGM3Q08188 C8orf76-201ENST00000276704 1341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
TGM3Q08188 DHRS4L2-205ENST00000543805 1334 ntTSL 5 BASIC15.26■□□□□ 0.03
TGM3Q08188 EXT1-201ENST00000378204 8270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
TGM3Q08188 TRIM27-202ENST00000377199 2967 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
TGM3Q08188 U73166.1-201ENST00000439898 2625 ntTSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
TGM3Q08188 PCDHGA12-202ENST00000613314 2634 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.26■□□□□ 0.03
TGM3Q08188 CNP-201ENST00000393888 2583 ntTSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
TGM3Q08188 PSMG3-201ENST00000252329 1007 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.26■□□□□ 0.03
TGM3Q08188 FCN1-201ENST00000371806 1286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
TGM3Q08188 CSHL1-204ENST00000392824 823 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
TGM3Q08188 RBM39-205ENST00000397370 612 ntTSL 2 BASIC15.26■□□□□ 0.03
TGM3Q08188 IQCF3-201ENST00000437810 1270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
TGM3Q08188 COMT-209ENST00000449653 1035 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
TGM3Q08188 APBB2-208ENST00000504305 1274 ntTSL 5 BASIC15.26■□□□□ 0.03
TGM3Q08188 AC021744.1-201ENST00000518354 453 ntTSL 3 BASIC15.26■□□□□ 0.03
TGM3Q08188 SNHG6-201ENST00000520348 648 ntTSL 2 BASIC15.26■□□□□ 0.03
TGM3Q08188 VPS29-207ENST00000549970 818 ntTSL 3 BASIC15.26■□□□□ 0.03
TGM3Q08188 AC090607.3-202ENST00000558971 383 ntTSL 3 BASIC15.26■□□□□ 0.03
TGM3Q08188 LSM12-202ENST00000585388 942 ntTSL 3 BASIC15.26■□□□□ 0.03
TGM3Q08188 RN7SL828P-201ENST00000607615 303 ntBASIC15.26■□□□□ 0.03
TGM3Q08188 AC006538.3-201ENST00000612495 578 ntBASIC15.26■□□□□ 0.03
TGM3Q08188 BNIP3P1-202ENST00000550043 1585 ntBASIC15.26■□□□□ 0.03
TGM3Q08188 MYCBPAP-203ENST00000436259 3102 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.26■□□□□ 0.03
TGM3Q08188 ARVCF-201ENST00000263207 4041 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
TGM3Q08188 CAMKK2-203ENST00000347034 5218 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
TGM3Q08188 SUPT20HL2-201ENST00000486479 2409 ntBASIC15.26■□□□□ 0.03
TGM3Q08188 ANOS1-201ENST00000262648 6314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
TGM3Q08188 LITAF-201ENST00000339430 2356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
TGM3Q08188 C12orf65-201ENST00000253233 2073 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
TGM3Q08188 C11orf24-201ENST00000304271 2063 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
TGM3Q08188 ZBP1-202ENST00000395822 2073 ntTSL 2 BASIC15.26■□□□□ 0.03
TGM3Q08188 SPATA6-204ENST00000396199 4964 ntTSL 2 BASIC15.26■□□□□ 0.03
TGM3Q08188 AL136982.4-201ENST00000437689 1740 ntBASIC15.26■□□□□ 0.03
TGM3Q08188 SNCAIP-202ENST00000261368 3745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
TGM3Q08188 TK2-207ENST00000544898 3441 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
TGM3Q08188 PAXBP1-202ENST00000331923 3995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
TGM3Q08188 C9orf47-201ENST00000334490 4829 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
TGM3Q08188 WDR45-202ENST00000356463 1688 ntTSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
TGM3Q08188 TXNRD2-214ENST00000491939 2238 ntTSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
TGM3Q08188 DENR-201ENST00000280557 2769 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
TGM3Q08188 WDR81-204ENST00000419248 3315 ntTSL 2 BASIC15.25■□□□□ 0.03
TGM3Q08188 GADD45B-201ENST00000215631 1373 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
TGM3Q08188 LDOC1-201ENST00000370526 1381 ntAPPRIS P1 BASIC15.25■□□□□ 0.03
TGM3Q08188 CPSF6-203ENST00000456847 1915 ntTSL 5 BASIC15.25■□□□□ 0.03
TGM3Q08188 DUOXA1-202ENST00000430224 1317 ntTSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
TGM3Q08188 CLPTM1-203ENST00000546079 2342 ntTSL 2 BASIC15.25■□□□□ 0.03
TGM3Q08188 AC046158.3-201ENST00000624947 2558 ntBASIC15.25■□□□□ 0.03
TGM3Q08188 LSM1-201ENST00000311351 1147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
TGM3Q08188 GPR162-202ENST00000382315 1150 ntTSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
TGM3Q08188 NME1-NME2-202ENST00000393193 1021 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC15.25■□□□□ 0.03
TGM3Q08188 C2orf76-202ENST00000409466 1150 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
TGM3Q08188 CTDSP1-204ENST00000443891 1109 ntTSL 3 BASIC15.25■□□□□ 0.03
TGM3Q08188 AL359764.1-201ENST00000444330 504 ntTSL 3 BASIC15.25■□□□□ 0.03
TGM3Q08188 FAM86GP-201ENST00000448322 971 ntBASIC15.25■□□□□ 0.03
TGM3Q08188 AL391845.1-202ENST00000449154 437 ntTSL 3 BASIC15.25■□□□□ 0.03
TGM3Q08188 CALML4-206ENST00000467889 987 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
TGM3Q08188 FXR1-221ENST00000491674 365 ntTSL 2 BASIC15.25■□□□□ 0.03
TGM3Q08188 TMEM263-206ENST00000550344 925 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.25■□□□□ 0.03
TGM3Q08188 AC018558.2-201ENST00000566562 480 ntTSL 3 BASIC15.25■□□□□ 0.03
TGM3Q08188 AC244153.1-203ENST00000622796 419 ntTSL 2 BASIC15.25■□□□□ 0.03
TGM3Q08188 TRIM29-221ENST00000627238 510 ntTSL 5 BASIC15.25■□□□□ 0.03
TGM3Q08188 MAP7-207ENST00000616617 4326 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.25■□□□□ 0.03
TGM3Q08188 RBFOX3-212ENST00000584778 1547 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.25■□□□□ 0.03
TGM3Q08188 NPM1-201ENST00000296930 1758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
TGM3Q08188 ADAMTS2-201ENST00000251582 6754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
TGM3Q08188 CGGBP1-201ENST00000309534 4495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
TGM3Q08188 PHTF1-205ENST00000393357 3244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
TGM3Q08188 PAUPAR-201ENST00000630360 2965 ntBASIC15.25■□□□□ 0.03
TGM3Q08188 CCT6A-201ENST00000275603 2719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
TGM3Q08188 SEPT5-204ENST00000406395 1974 ntTSL 5 BASIC15.25■□□□□ 0.03
TGM3Q08188 RNF34-202ENST00000392464 1722 ntTSL 5 BASIC15.25■□□□□ 0.03
TGM3Q08188 FDPS-201ENST00000356657 1478 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
TGM3Q08188 FAM84A-201ENST00000295092 6355 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
TGM3Q08188 COQ8B-202ENST00000324464 2443 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
TGM3Q08188 PI4KAP1-201ENST00000610959 2425 ntTSL 2 BASIC15.25■□□□□ 0.03
TGM3Q08188 CETN4P-206ENST00000642099 2168 ntBASIC15.25■□□□□ 0.03
TGM3Q08188 RCC2-202ENST00000375436 4087 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
TGM3Q08188 AL445931.1-201ENST00000412181 2112 ntTSL 2 BASIC15.25■□□□□ 0.03
TGM3Q08188 NOS1AP-201ENST00000361897 4931 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
TGM3Q08188 SPDEF-202ENST00000544425 1866 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC15.25■□□□□ 0.03
TGM3Q08188 ANXA8-203ENST00000583874 1860 ntTSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
TGM3Q08188 ARHGEF28-202ENST00000296799 4424 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.25■□□□□ 0.03
TGM3Q08188 TNIP1-202ENST00000389378 2935 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.24■□□□□ 0.03
TGM3Q08188 UBE3A-207ENST00000614096 8741 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
TGM3Q08188 FEZF1-AS1-202ENST00000428449 2653 ntTSL 2 BASIC15.24■□□□□ 0.03
TGM3Q08188 SURF4-207ENST00000545297 2863 ntTSL 2 BASIC15.24■□□□□ 0.03
TGM3Q08188 LINC02138-201ENST00000378340 1326 ntTSL 2 BASIC15.24■□□□□ 0.03
TGM3Q08188 PRRG3-205ENST00000538575 1303 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.24■□□□□ 0.03
TGM3Q08188 KRT2-201ENST00000309680 2403 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
TGM3Q08188 BTC-201ENST00000395743 2816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
TGM3Q08188 UBE4B-201ENST00000253251 4772 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
TGM3Q08188 SMARCA2-214ENST00000450198 5602 ntTSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
TGM3Q08188 CACNA2D3-201ENST00000288197 3671 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
TGM3Q08188 CACNA2D3-206ENST00000474759 3675 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 101.3 ms