Protein–RNA interactions for Protein: P35453

HOXD13, Homeobox protein Hox-D13, humanhuman

Predictions only

Length 343 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HOXD13P35453 SYN1-202ENST00000340666 3172 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
HOXD13P35453 DUSP6-202ENST00000308385 1959 ntTSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
HOXD13P35453 PLVAP-201ENST00000252590 2305 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
HOXD13P35453 TOM1-209ENST00000447733 2317 ntTSL 2 BASIC17.31■□□□□ 0.36
HOXD13P35453 PAPD5-202ENST00000436909 4635 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.31■□□□□ 0.36
HOXD13P35453 AC144831.1-201ENST00000573312 2656 ntBASIC17.31■□□□□ 0.36
HOXD13P35453 ILF3-210ENST00000588657 2697 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.31■□□□□ 0.36
HOXD13P35453 TMEM143-203ENST00000435956 2272 ntTSL 2 BASIC17.31■□□□□ 0.36
HOXD13P35453 ASAH1-201ENST00000262097 2618 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
HOXD13P35453 UBA5-213ENST00000494238 2997 ntTSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
HOXD13P35453 FAM135A-209ENST00000505769 4806 ntTSL 5 BASIC17.31■□□□□ 0.36
HOXD13P35453 RAPSN-203ENST00000524487 1462 ntTSL 5 BASIC17.31■□□□□ 0.36
HOXD13P35453 AQP3-201ENST00000297991 1849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
HOXD13P35453 RXRA-202ENST00000481739 1846 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
HOXD13P35453 CNN1-210ENST00000592923 1848 ntTSL 2 BASIC17.31■□□□□ 0.36
HOXD13P35453 FDPS-202ENST00000368356 1431 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC17.3■□□□□ 0.36
HOXD13P35453 AMHR2-202ENST00000379791 1437 ntTSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
HOXD13P35453 ATP6V0E1-203ENST00000519374 1433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
HOXD13P35453 UCP2-201ENST00000310473 2113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
HOXD13P35453 CHMP1A-201ENST00000397901 2483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
HOXD13P35453 COL8A2-202ENST00000397799 4670 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.3■□□□□ 0.36
HOXD13P35453 AL583722.1-201ENST00000540171 1307 ntTSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
HOXD13P35453 GRAMD1C-201ENST00000358160 4177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
HOXD13P35453 PDGFRL-203ENST00000541323 1905 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.3■□□□□ 0.36
HOXD13P35453 CHIA-203ENST00000353665 1214 ntTSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
HOXD13P35453 OR5C1-201ENST00000373680 963 ntAPPRIS P1 BASIC17.3■□□□□ 0.36
HOXD13P35453 AKIP1-204ENST00000396648 1084 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.3■□□□□ 0.36
HOXD13P35453 EVA1A-203ENST00000410010 696 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.3■□□□□ 0.36
HOXD13P35453 ESPNP-202ENST00000414828 571 ntTSL 3 BASIC17.3■□□□□ 0.36
HOXD13P35453 USP40-206ENST00000443711 628 ntTSL 2 BASIC17.3■□□□□ 0.36
HOXD13P35453 LINC01160-202ENST00000450155 894 ntTSL 3 BASIC17.3■□□□□ 0.36
HOXD13P35453 AL356441.1-201ENST00000452618 492 ntTSL 3 BASIC17.3■□□□□ 0.36
HOXD13P35453 CYMP-203ENST00000474680 1263 ntBASIC17.3■□□□□ 0.36
HOXD13P35453 AC124067.4-202ENST00000522471 397 ntTSL 3 BASIC17.3■□□□□ 0.36
HOXD13P35453 ARL6IP1-202ENST00000546206 1107 ntTSL 2 BASIC17.3■□□□□ 0.36
HOXD13P35453 CMC2-214ENST00000565925 640 ntTSL 5 BASIC17.3■□□□□ 0.36
HOXD13P35453 GABARAP-205ENST00000573928 476 ntTSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
HOXD13P35453 SSH2-210ENST00000582084 560 ntTSL 3 BASIC17.3■□□□□ 0.36
HOXD13P35453 AC243964.2-202ENST00000591312 752 ntTSL 2 BASIC17.3■□□□□ 0.36
HOXD13P35453 AC008738.7-201ENST00000609744 511 ntBASIC17.3■□□□□ 0.36
HOXD13P35453 AC004790.1-201ENST00000612686 536 ntBASIC17.3■□□□□ 0.36
HOXD13P35453 AL136531.2-202ENST00000617804 573 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC17.3■□□□□ 0.36
HOXD13P35453 ORC5-208ENST00000626700 344 ntTSL 3 BASIC17.3■□□□□ 0.36
HOXD13P35453 AC004840.1-201ENST00000636359 365 ntBASIC17.3■□□□□ 0.36
HOXD13P35453 DCHS2-201ENST00000339452 5064 ntTSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
HOXD13P35453 ZDHHC20-209ENST00000542645 5315 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.3■□□□□ 0.36
HOXD13P35453 AAMP-201ENST00000248450 1886 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
HOXD13P35453 AC087481.3-201ENST00000602886 1894 ntBASIC17.3■□□□□ 0.36
HOXD13P35453 GNG2-213ENST00000556766 2125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
HOXD13P35453 C3orf67-201ENST00000295966 2650 ntTSL 2 BASIC17.3■□□□□ 0.36
HOXD13P35453 MLKL-201ENST00000306247 1781 ntTSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
HOXD13P35453 ZP3-201ENST00000336517 1483 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
HOXD13P35453 PCDHA13-201ENST00000289272 5260 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
HOXD13P35453 MAN1C1-203ENST00000374332 4641 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
HOXD13P35453 MAN1C1-208ENST00000611903 4647 ntTSL 5 BASIC17.3■□□□□ 0.36
HOXD13P35453 AMBP-201ENST00000265132 1434 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
HOXD13P35453 ANXA4-202ENST00000409920 1414 ntTSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
HOXD13P35453 PPP1R21-202ENST00000294952 3142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
HOXD13P35453 ACSS1-201ENST00000323482 3680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
HOXD13P35453 MUTYH-211ENST00000456914 1692 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
HOXD13P35453 GPAT2-204ENST00000453542 2466 ntTSL 2 BASIC17.29■□□□□ 0.36
HOXD13P35453 AC007326.5-201ENST00000640084 1382 ntTSL 5 BASIC17.29■□□□□ 0.36
HOXD13P35453 FO681492.1-201ENST00000623662 5321 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC17.29■□□□□ 0.36
HOXD13P35453 POLG2-201ENST00000539111 1564 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
HOXD13P35453 AC008770.3-201ENST00000590798 1562 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.29■□□□□ 0.36
HOXD13P35453 IRS2-201ENST00000375856 8138 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
HOXD13P35453 EFNA4-201ENST00000359751 1096 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
HOXD13P35453 HDAC8-203ENST00000373559 632 ntTSL 2 BASIC17.29■□□□□ 0.36
HOXD13P35453 HDAC8-208ENST00000373583 434 ntTSL 5 BASIC17.29■□□□□ 0.36
HOXD13P35453 SPDYE18-201ENST00000510091 1050 ntBASIC17.29■□□□□ 0.36
HOXD13P35453 SDHAP3-202ENST00000515467 728 ntBASIC17.29■□□□□ 0.36
HOXD13P35453 AC064807.1-203ENST00000520357 575 ntTSL 5 BASIC17.29■□□□□ 0.36
HOXD13P35453 RAB35-202ENST00000534951 939 ntTSL 2 BASIC17.29■□□□□ 0.36
HOXD13P35453 DUT-210ENST00000559935 569 ntTSL 3 BASIC17.29■□□□□ 0.36
HOXD13P35453 AC007216.4-201ENST00000574364 562 ntTSL 4 BASIC17.29■□□□□ 0.36
HOXD13P35453 YPEL2-205ENST00000585166 881 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.29■□□□□ 0.36
HOXD13P35453 AGPAT1-202ENST00000375104 2017 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.29■□□□□ 0.36
HOXD13P35453 MLPH-203ENST00000409373 2031 ntTSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
HOXD13P35453 MLKL-202ENST00000308807 2523 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.29■□□□□ 0.36
HOXD13P35453 TMEM25-206ENST00000442938 2228 ntTSL 2 BASIC17.29■□□□□ 0.36
HOXD13P35453 C2orf68-202ENST00000409734 1722 ntTSL 2 BASIC17.29■□□□□ 0.36
HOXD13P35453 KLF3-201ENST00000261438 5122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
HOXD13P35453 AC004834.1-201ENST00000640784 2412 ntTSL 3 BASIC17.29■□□□□ 0.36
HOXD13P35453 SLC6A13-201ENST00000343164 2185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
HOXD13P35453 TMEM229B-201ENST00000357461 4068 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.29■□□□□ 0.36
HOXD13P35453 KLK3-202ENST00000360617 1664 ntTSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
HOXD13P35453 MDM2-209ENST00000393412 1404 ntTSL 5 BASIC17.29■□□□□ 0.36
HOXD13P35453 GHDC-207ENST00000587427 2396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
HOXD13P35453 COL4A3BP-204ENST00000405807 2843 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.29■□□□□ 0.36
HOXD13P35453 TMPRSS4-201ENST00000437212 2074 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
HOXD13P35453 HEY1-201ENST00000337919 2296 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
HOXD13P35453 ARHGEF28-211ENST00000512883 2936 ntTSL 2 BASIC17.28■□□□□ 0.36
HOXD13P35453 MANBAL-204ENST00000397151 1503 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.28■□□□□ 0.36
HOXD13P35453 MANBAL-205ENST00000397152 1539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
HOXD13P35453 BBS5-201ENST00000295240 3475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
HOXD13P35453 TSNARE1-201ENST00000307180 1907 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.28■□□□□ 0.36
HOXD13P35453 PTPN21-208ENST00000556564 6166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
HOXD13P35453 C2orf40-201ENST00000238044 789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
HOXD13P35453 CBX2-201ENST00000269399 1061 ntTSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
HOXD13P35453 H1FOO-201ENST00000324382 1067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 80.2 ms