Protein–RNA interactions for Protein: P25963

NFKBIA, NF-kappa-B inhibitor alpha, humanhuman

Predictions only

Length 317 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NFKBIAP25963 CLPP-201ENST00000245816 1155 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
NFKBIAP25963 NDUFS8-201ENST00000313468 791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
NFKBIAP25963 ASMT-201ENST00000381229 1087 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
NFKBIAP25963 AC004987.2-201ENST00000395959 1148 ntBASIC16.21■□□□□ 0.19
NFKBIAP25963 RBM39-205ENST00000397370 612 ntTSL 2 BASIC16.21■□□□□ 0.19
NFKBIAP25963 CAMKMT-204ENST00000407131 652 ntTSL 3 BASIC16.21■□□□□ 0.19
NFKBIAP25963 TAS2R41-201ENST00000408916 924 ntAPPRIS P1 BASIC16.21■□□□□ 0.19
NFKBIAP25963 LY6E-204ENST00000519546 971 ntTSL 2 BASIC16.21■□□□□ 0.19
NFKBIAP25963 LINC01481-203ENST00000549651 883 ntTSL 2 BASIC16.21■□□□□ 0.19
NFKBIAP25963 BICD2-202ENST00000375512 4636 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
NFKBIAP25963 FO538757.1-201ENST00000623083 1397 ntBASIC16.21■□□□□ 0.19
NFKBIAP25963 CCNC-209ENST00000520371 2186 ntTSL 5 BASIC16.21■□□□□ 0.19
NFKBIAP25963 PDE4C-207ENST00000594617 4655 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
NFKBIAP25963 SORCS2-201ENST00000329016 5582 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.21■□□□□ 0.19
NFKBIAP25963 TOM1L2-201ENST00000318094 2259 ntTSL 2 BASIC16.21■□□□□ 0.19
NFKBIAP25963 YTHDF2-209ENST00000542507 2825 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.21■□□□□ 0.19
NFKBIAP25963 ADAMTSL4-204ENST00000369041 2908 ntTSL 5 BASIC16.21■□□□□ 0.18
NFKBIAP25963 AL513523.2-202ENST00000427283 2040 ntBASIC16.21■□□□□ 0.18
NFKBIAP25963 AL035685.1-202ENST00000637341 1688 ntTSL 5 BASIC16.21■□□□□ 0.18
NFKBIAP25963 HDHD2-201ENST00000300605 2212 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.18
NFKBIAP25963 C20orf166-AS1-201ENST00000412495 2302 ntTSL 2 BASIC16.2■□□□□ 0.18
NFKBIAP25963 AMZ1-201ENST00000312371 5516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
NFKBIAP25963 DHRS4L2-205ENST00000543805 1334 ntTSL 5 BASIC16.2■□□□□ 0.18
NFKBIAP25963 CMKLR1-204ENST00000550402 1893 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
NFKBIAP25963 CCR7-203ENST00000579344 1874 ntTSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
NFKBIAP25963 KLC4-202ENST00000347162 2404 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
NFKBIAP25963 AL354813.1-201ENST00000526566 2437 ntTSL 5 BASIC16.2■□□□□ 0.18
NFKBIAP25963 LONRF3-201ENST00000304778 2989 ntTSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
NFKBIAP25963 TVP23B-202ENST00000476139 2989 ntTSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
NFKBIAP25963 KREMEN1-203ENST00000407188 1422 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
NFKBIAP25963 EPHA10-203ENST00000427468 3167 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.2■□□□□ 0.18
NFKBIAP25963 CHTF18-220ENST00000631357 3555 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.2■□□□□ 0.18
NFKBIAP25963 ARPC1B-211ENST00000451682 1715 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.2■□□□□ 0.18
NFKBIAP25963 INHBB-201ENST00000295228 3204 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
NFKBIAP25963 WNT10B-203ENST00000407467 1802 ntTSL 2 BASIC16.2■□□□□ 0.18
NFKBIAP25963 SBSN-201ENST00000452271 1945 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
NFKBIAP25963 HRCT1-201ENST00000354323 950 ntAPPRIS P1 BASIC16.2■□□□□ 0.18
NFKBIAP25963 EFNA4-201ENST00000359751 1096 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
NFKBIAP25963 OTUD3-201ENST00000375120 6397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
NFKBIAP25963 SNRPB-201ENST00000381342 1154 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
NFKBIAP25963 GUK1-210ENST00000391865 990 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
NFKBIAP25963 SNRPB-202ENST00000438552 1008 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
NFKBIAP25963 AL359764.1-201ENST00000444330 504 ntTSL 3 BASIC16.2■□□□□ 0.18
NFKBIAP25963 SATB1-217ENST00000493952 626 ntTSL 3 BASIC16.2■□□□□ 0.18
NFKBIAP25963 MAPKAPK5-203ENST00000547305 494 ntTSL 2 BASIC16.2■□□□□ 0.18
NFKBIAP25963 NFATC3-222ENST00000575270 3824 ntTSL 5 BASIC16.2■□□□□ 0.18
NFKBIAP25963 AC004408.1-201ENST00000579256 573 ntTSL 4 BASIC16.2■□□□□ 0.18
NFKBIAP25963 LINC00473-203ENST00000581850 929 ntTSL 3 BASIC16.2■□□□□ 0.18
NFKBIAP25963 RAB34-223ENST00000636154 730 ntTSL 2 BASIC16.2■□□□□ 0.18
NFKBIAP25963 IL11RA-215ENST00000602473 1388 ntTSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
NFKBIAP25963 VASP-201ENST00000245932 2305 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
NFKBIAP25963 UNKL-201ENST00000248104 4320 ntTSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
NFKBIAP25963 FDPS-201ENST00000356657 1478 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
NFKBIAP25963 CD1E-212ENST00000368167 1458 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
NFKBIAP25963 WASHC2C-208ENST00000537517 4417 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.2■□□□□ 0.18
NFKBIAP25963 HPS1-202ENST00000338546 1580 ntTSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
NFKBIAP25963 MTA1-202ENST00000405646 2709 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.2■□□□□ 0.18
NFKBIAP25963 PARD3B-204ENST00000406610 8174 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
NFKBIAP25963 NT5C3A-204ENST00000405342 1759 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
NFKBIAP25963 USP4-201ENST00000265560 3126 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
NFKBIAP25963 C16orf89-201ENST00000315997 1872 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
NFKBIAP25963 CYP51A1-201ENST00000003100 3210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
NFKBIAP25963 NBL1-211ENST00000618761 2051 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
NFKBIAP25963 SHQ1-201ENST00000325599 2879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
NFKBIAP25963 P2RX5-TAX1BP3-201ENST00000550383 5905 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.2■□□□□ 0.18
NFKBIAP25963 ZNF804B-201ENST00000333190 4659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
NFKBIAP25963 AL591845.1-201ENST00000373137 1838 ntTSL 2 BASIC16.19■□□□□ 0.18
NFKBIAP25963 MCM3AP-AS1-202ENST00000420074 1947 ntTSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
NFKBIAP25963 PRKCSH-217ENST00000592741 2100 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
NFKBIAP25963 HSPA1B-201ENST00000375650 2521 ntAPPRIS P1 BASIC16.19■□□□□ 0.18
NFKBIAP25963 AQP1-201ENST00000311813 2913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
NFKBIAP25963 SNCAIP-202ENST00000261368 3745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
NFKBIAP25963 ZNF746-201ENST00000340622 3806 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
NFKBIAP25963 C15orf61-201ENST00000342683 4253 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
NFKBIAP25963 KEAP1-201ENST00000171111 2955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
NFKBIAP25963 AC006019.1-201ENST00000425591 2470 ntTSL 2 BASIC16.19■□□□□ 0.18
NFKBIAP25963 UBQLN1-201ENST00000257468 2299 ntTSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
NFKBIAP25963 CLMAT3-201ENST00000510576 1973 ntTSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
NFKBIAP25963 AL953897.1-201ENST00000376620 1868 ntTSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
NFKBIAP25963 TRAF3-204ENST00000539721 1786 ntTSL 2 BASIC16.19■□□□□ 0.18
NFKBIAP25963 TGFBR2-201ENST00000295754 4621 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
NFKBIAP25963 STT3B-201ENST00000295770 4248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
NFKBIAP25963 PRSS55-201ENST00000328655 1124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
NFKBIAP25963 SIVA1-202ENST00000347067 550 ntTSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
NFKBIAP25963 POLR3GL-202ENST00000369314 1165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
NFKBIAP25963 NDUFA3-204ENST00000391764 267 ntTSL 3 BASIC16.19■□□□□ 0.18
NFKBIAP25963 AC018685.2-201ENST00000414065 547 ntTSL 4 BASIC16.19■□□□□ 0.18
NFKBIAP25963 U52111.1-201ENST00000434284 914 ntTSL 3 BASIC16.19■□□□□ 0.18
NFKBIAP25963 TMEM120A-203ENST00000439537 1161 ntTSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
NFKBIAP25963 AL512638.1-201ENST00000457493 794 ntBASIC16.19■□□□□ 0.18
NFKBIAP25963 AC027369.6-201ENST00000525520 931 ntBASIC16.19■□□□□ 0.18
NFKBIAP25963 NDUFA4L2-202ENST00000554503 1177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
NFKBIAP25963 AC027088.1-201ENST00000557966 1117 ntTSL 2 BASIC16.19■□□□□ 0.18
NFKBIAP25963 AQP12B-206ENST00000621682 1080 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.19■□□□□ 0.18
NFKBIAP25963 LILRA2-208ENST00000629481 661 ntTSL 2 BASIC16.19■□□□□ 0.18
NFKBIAP25963 MARCKS-201ENST00000612661 4275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
NFKBIAP25963 ZSCAN2-214ENST00000546148 2242 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC16.19■□□□□ 0.18
NFKBIAP25963 SLC4A2-214ENST00000485713 4925 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
NFKBIAP25963 DAB2IP-201ENST00000259371 5469 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC16.19■□□□□ 0.18
NFKBIAP25963 GTF2H2C-201ENST00000380729 1803 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 28.6 ms