Protein–RNA interactions for Protein: O43772

SLC25A20, Mitochondrial carnitine/acylcarnitine carrier protein, humanhuman

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SLC25A20O43772 SNHG10-201ENST00000500370 1531 ntTSL 2 BASIC10.79□□□□□ -0.68
SLC25A20O43772 MSRB3-202ENST00000355192 4289 ntTSL 1 (best) BASIC10.79□□□□□ -0.68
SLC25A20O43772 NCF1-201ENST00000289473 1396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.79□□□□□ -0.68
SLC25A20O43772 THAP3-201ENST00000054650 1366 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.79□□□□□ -0.68
SLC25A20O43772 RNF43-201ENST00000407977 5516 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.79□□□□□ -0.68
SLC25A20O43772 GGT5-202ENST00000327365 2494 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.79□□□□□ -0.68
SLC25A20O43772 PMM2-201ENST00000268261 2313 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.79□□□□□ -0.68
SLC25A20O43772 SLC29A1-201ENST00000371708 2159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.79□□□□□ -0.68
SLC25A20O43772 SLC29A1-202ENST00000371713 2168 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.79□□□□□ -0.68
SLC25A20O43772 KRT12-201ENST00000251643 1867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.79□□□□□ -0.68
SLC25A20O43772 SFI1-229ENST00000540643 4226 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC10.79□□□□□ -0.68
SLC25A20O43772 SPECC1-202ENST00000395522 2982 ntTSL 1 (best) BASIC10.79□□□□□ -0.68
SLC25A20O43772 MAD1L1-204ENST00000406869 2991 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.79□□□□□ -0.68
SLC25A20O43772 RSPO3-201ENST00000356698 2697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.79□□□□□ -0.68
SLC25A20O43772 PIK3R5-216ENST00000584803 2653 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC10.79□□□□□ -0.68
SLC25A20O43772 SLC27A4-202ENST00000372870 1557 ntTSL 1 (best) BASIC10.79□□□□□ -0.68
SLC25A20O43772 GLG1-203ENST00000447066 3626 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC10.79□□□□□ -0.68
SLC25A20O43772 PRNP-203ENST00000430350 2539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.79□□□□□ -0.68
SLC25A20O43772 E2F6-211ENST00000542100 3450 ntTSL 1 (best) BASIC10.79□□□□□ -0.68
SLC25A20O43772 GMDS-208ENST00000530927 1440 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.79□□□□□ -0.68
SLC25A20O43772 CCND3-201ENST00000372987 2233 ntTSL 2 BASIC10.79□□□□□ -0.68
SLC25A20O43772 TNIP1-214ENST00000522226 2238 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC10.79□□□□□ -0.68
SLC25A20O43772 PLPP7-201ENST00000372261 972 ntTSL 2 BASIC10.79□□□□□ -0.68
SLC25A20O43772 STK40-202ENST00000373129 3846 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.79□□□□□ -0.68
SLC25A20O43772 AP000523.1-201ENST00000398242 1049 ntBASIC10.79□□□□□ -0.68
SLC25A20O43772 AL731557.1-201ENST00000425264 744 ntTSL 3 BASIC10.79□□□□□ -0.68
SLC25A20O43772 AL357874.1-201ENST00000428948 574 ntTSL 1 (best) BASIC10.79□□□□□ -0.68
SLC25A20O43772 AC009487.1-202ENST00000437683 402 ntTSL 2 BASIC10.79□□□□□ -0.68
SLC25A20O43772 AC092718.1-201ENST00000501068 1088 ntTSL 1 (best) BASIC10.79□□□□□ -0.68
SLC25A20O43772 LINC01184-202ENST00000501173 949 ntTSL 5 BASIC10.79□□□□□ -0.68
SLC25A20O43772 HRASLS5-205ENST00000539221 1167 ntTSL 1 (best) BASIC10.79□□□□□ -0.68
SLC25A20O43772 MRPL52-210ENST00000555345 895 ntTSL 2 BASIC10.79□□□□□ -0.68
SLC25A20O43772 FITM1-202ENST00000559294 800 ntBASIC10.79□□□□□ -0.68
SLC25A20O43772 AC111152.3-201ENST00000569699 673 ntBASIC10.79□□□□□ -0.68
SLC25A20O43772 AC005943.1-201ENST00000585937 1002 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC10.79□□□□□ -0.68
SLC25A20O43772 FAM98C-205ENST00000588262 826 ntTSL 1 (best) BASIC10.79□□□□□ -0.68
SLC25A20O43772 TTLL10-AS1-201ENST00000379317 3532 ntTSL 2 BASIC10.79□□□□□ -0.68
SLC25A20O43772 CASP2-207ENST00000619992 4006 ntTSL 1 (best) BASIC10.79□□□□□ -0.68
SLC25A20O43772 SCLY-202ENST00000409736 1774 ntTSL 1 (best) BASIC10.79□□□□□ -0.68
SLC25A20O43772 HNRNPH1-203ENST00000393432 2279 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.79□□□□□ -0.68
SLC25A20O43772 PROM2-203ENST00000403131 2922 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.79□□□□□ -0.68
SLC25A20O43772 TIGAR-201ENST00000179259 2782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.79□□□□□ -0.68
SLC25A20O43772 UNC13B-202ENST00000378496 5063 ntTSL 1 (best) BASIC10.79□□□□□ -0.68
SLC25A20O43772 PEX16-201ENST00000241041 1479 ntTSL 1 (best) BASIC10.79□□□□□ -0.68
SLC25A20O43772 WDR90-202ENST00000315764 1454 ntTSL 1 (best) BASIC10.79□□□□□ -0.68
SLC25A20O43772 GPR89P-201ENST00000407924 1495 ntBASIC10.79□□□□□ -0.68
SLC25A20O43772 AJ011931.1-201ENST00000618749 2492 ntBASIC10.79□□□□□ -0.68
SLC25A20O43772 PLK2-201ENST00000274289 2960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.79□□□□□ -0.68
SLC25A20O43772 LINC00476-204ENST00000429781 2825 ntTSL 2 BASIC10.79□□□□□ -0.68
SLC25A20O43772 FAM53C-202ENST00000434981 1686 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.79□□□□□ -0.68
SLC25A20O43772 SYNGR1-203ENST00000328933 4391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.79□□□□□ -0.68
SLC25A20O43772 PRF1-202ENST00000441259 2533 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.79□□□□□ -0.68
SLC25A20O43772 LMNA-213ENST00000473598 2015 ntTSL 2 BASIC10.79□□□□□ -0.68
SLC25A20O43772 PLEKHG2-203ENST00000425673 8132 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC10.79□□□□□ -0.68
SLC25A20O43772 SLC6A6P1-201ENST00000413933 1850 ntBASIC10.78□□□□□ -0.68
SLC25A20O43772 MAP3K21-202ENST00000366623 3910 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.78□□□□□ -0.68
SLC25A20O43772 IKBKB-217ENST00000520810 3086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.78□□□□□ -0.68
SLC25A20O43772 BCAS3-204ENST00000585744 2203 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.78□□□□□ -0.68
SLC25A20O43772 CHRNB4-202ENST00000412074 1355 ntTSL 1 (best) BASIC10.78□□□□□ -0.68
SLC25A20O43772 SV2A-201ENST00000369145 2903 ntTSL 2 BASIC10.78□□□□□ -0.68
SLC25A20O43772 AKAP13-201ENST00000361243 9468 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC10.78□□□□□ -0.68
SLC25A20O43772 SRPX-202ENST00000432886 1725 ntTSL 2 BASIC10.78□□□□□ -0.68
SLC25A20O43772 TBC1D9B-208ENST00000519746 2755 ntTSL 1 (best) BASIC10.78□□□□□ -0.68
SLC25A20O43772 FAM98B-202ENST00000397609 4388 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC10.78□□□□□ -0.68
SLC25A20O43772 APLP1-202ENST00000537454 2266 ntTSL 2 BASIC10.78□□□□□ -0.68
SLC25A20O43772 UBFD1-207ENST00000567212 4727 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC10.78□□□□□ -0.68
SLC25A20O43772 ITPK1-207ENST00000555495 3035 ntTSL 1 (best) BASIC10.78□□□□□ -0.68
SLC25A20O43772 ARID3B-201ENST00000346246 4271 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.78□□□□□ -0.68
SLC25A20O43772 SMARCA4-205ENST00000450717 5506 ntTSL 5 BASIC10.78□□□□□ -0.68
SLC25A20O43772 UNC13B-206ENST00000617908 6432 ntTSL 5 BASIC10.78□□□□□ -0.68
SLC25A20O43772 UNC13B-207ENST00000619578 6426 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.78□□□□□ -0.68
SLC25A20O43772 TUBB3-206ENST00000554444 1978 ntTSL 2 BASIC10.78□□□□□ -0.68
SLC25A20O43772 SLC26A11-202ENST00000411502 2872 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.78□□□□□ -0.68
SLC25A20O43772 TCF23-201ENST00000296096 4882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.78□□□□□ -0.68
SLC25A20O43772 FADS3-207ENST00000527697 1640 ntTSL 5 BASIC10.78□□□□□ -0.68
SLC25A20O43772 CRLS1-201ENST00000378863 3958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.78□□□□□ -0.68
SLC25A20O43772 ZBED1-202ENST00000381222 4507 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.78□□□□□ -0.68
SLC25A20O43772 SLC35C2-202ENST00000317734 2175 ntTSL 2 BASIC10.78□□□□□ -0.68
SLC25A20O43772 HNRNPF-201ENST00000337970 2186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.78□□□□□ -0.68
SLC25A20O43772 LDB3-202ENST00000361373 5297 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.78□□□□□ -0.68
SLC25A20O43772 UPK3B-201ENST00000257632 1296 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC10.78□□□□□ -0.68
SLC25A20O43772 NDUFS6-201ENST00000274137 1082 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.78□□□□□ -0.68
SLC25A20O43772 SPDYE2-201ENST00000341656 1219 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.78□□□□□ -0.68
SLC25A20O43772 SFTPD-201ENST00000372292 1281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.78□□□□□ -0.68
SLC25A20O43772 SZT2-202ENST00000372450 1191 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.78□□□□□ -0.68
SLC25A20O43772 HES2-202ENST00000377836 507 ntTSL 2 BASIC10.78□□□□□ -0.68
SLC25A20O43772 MIR1238-201ENST00000408483 83 ntBASIC10.78□□□□□ -0.68
SLC25A20O43772 HYAL3-203ENST00000415204 959 ntTSL 1 (best) BASIC10.78□□□□□ -0.68
SLC25A20O43772 HSD11B1L-205ENST00000422535 730 ntTSL 1 (best) BASIC10.78□□□□□ -0.68
SLC25A20O43772 AL390719.1-201ENST00000427998 977 ntTSL 1 (best) BASIC10.78□□□□□ -0.68
SLC25A20O43772 SPDYE2B-202ENST00000455020 1219 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.78□□□□□ -0.68
SLC25A20O43772 IKBKB-210ENST00000518983 447 ntTSL 2 BASIC10.78□□□□□ -0.68
SLC25A20O43772 PSMD9-208ENST00000542602 516 ntTSL 3 BASIC10.78□□□□□ -0.68
SLC25A20O43772 AC134349.1-201ENST00000543969 385 ntTSL 3 BASIC10.78□□□□□ -0.68
SLC25A20O43772 GCHFR-205ENST00000559932 695 ntTSL 2 BASIC10.78□□□□□ -0.68
SLC25A20O43772 LINC02256-201ENST00000561999 366 ntTSL 3 BASIC10.78□□□□□ -0.68
SLC25A20O43772 BCL2L12-208ENST00000600947 633 ntTSL 1 (best) BASIC10.78□□□□□ -0.68
SLC25A20O43772 AP000525.1-201ENST00000608286 694 ntBASIC10.78□□□□□ -0.68
SLC25A20O43772 DYRK1B-205ENST00000597639 1806 ntTSL 5 BASIC10.78□□□□□ -0.68
SLC25A20O43772 SPOCK3-202ENST00000357545 2936 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.78□□□□□ -0.68
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