Protein–RNA interactions for Protein: C9JPN9

USP17L12, Ubiquitin carboxyl-terminal hydrolase 17-like protein 12, humanhuman

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Length 530 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
USP17L12C9JPN9 ARL6IP4-207ENST00000426960 910 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC18.73■□□□□ 0.59
USP17L12C9JPN9 WBP2-203ENST00000433525 928 ntTSL 2 BASIC18.73■□□□□ 0.59
USP17L12C9JPN9 VCX3B-204ENST00000453306 868 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.73■□□□□ 0.59
USP17L12C9JPN9 GABARAPL2-202ENST00000563744 791 ntTSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
USP17L12C9JPN9 TMEM261P1-201ENST00000604899 340 ntBASIC18.73■□□□□ 0.59
USP17L12C9JPN9 TOMM40-207ENST00000592434 3415 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.73■□□□□ 0.59
USP17L12C9JPN9 CHST11-205ENST00000549260 5696 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
USP17L12C9JPN9 DRG2-201ENST00000225729 1964 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
USP17L12C9JPN9 PJA1-201ENST00000361478 2755 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
USP17L12C9JPN9 PTPRN2-205ENST00000409483 4711 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.73■□□□□ 0.59
USP17L12C9JPN9 ACE-203ENST00000413513 2237 ntTSL 2 BASIC18.73■□□□□ 0.59
USP17L12C9JPN9 LETM2-205ENST00000519476 2240 ntTSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
USP17L12C9JPN9 RNF169-201ENST00000299563 7823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
USP17L12C9JPN9 SNX6-202ENST00000396526 3398 ntTSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
USP17L12C9JPN9 MFF-202ENST00000337110 1760 ntTSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
USP17L12C9JPN9 LRP4-201ENST00000378623 8076 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
USP17L12C9JPN9 CPEB2-204ENST00000382401 5509 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
USP17L12C9JPN9 CCDC136-212ENST00000487361 2268 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.72■□□□□ 0.59
USP17L12C9JPN9 RAI1-201ENST00000353383 7662 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
USP17L12C9JPN9 PHKA1-205ENST00000541944 5944 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
USP17L12C9JPN9 CCNC-209ENST00000520371 2186 ntTSL 5 BASIC18.72■□□□□ 0.59
USP17L12C9JPN9 SEMA5B-202ENST00000357599 4792 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
USP17L12C9JPN9 CPA1-201ENST00000011292 1487 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
USP17L12C9JPN9 UVSSA-208ENST00000511563 1494 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.72■□□□□ 0.59
USP17L12C9JPN9 RAB31-207ENST00000578921 4055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
USP17L12C9JPN9 LRRC57-204ENST00000563454 2407 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.72■□□□□ 0.59
USP17L12C9JPN9 GRIN2C-202ENST00000347612 2929 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
USP17L12C9JPN9 PDXK-202ENST00000327574 2583 ntTSL 2 BASIC18.72■□□□□ 0.59
USP17L12C9JPN9 DIABLO-208ENST00000464942 2569 ntTSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
USP17L12C9JPN9 CTD-2194D22.4-201ENST00000514569 1635 ntTSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
USP17L12C9JPN9 CLIP4-201ENST00000320081 4293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
USP17L12C9JPN9 MLLT6-210ENST00000620609 2714 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
USP17L12C9JPN9 SCAND1-201ENST00000305978 902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
USP17L12C9JPN9 BANF1-201ENST00000312175 1155 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
USP17L12C9JPN9 SPATC1L-202ENST00000330205 1182 ntTSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
USP17L12C9JPN9 SPATS2L-202ENST00000360760 2119 ntTSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
USP17L12C9JPN9 PKIG-203ENST00000372887 769 ntTSL 3 BASIC18.72■□□□□ 0.59
USP17L12C9JPN9 AP006294.1-201ENST00000415407 339 ntBASIC18.72■□□□□ 0.59
USP17L12C9JPN9 RPUSD3-204ENST00000424438 1005 ntTSL 2 BASIC18.72■□□□□ 0.59
USP17L12C9JPN9 AL845321.1-202ENST00000432011 786 ntTSL 5 BASIC18.72■□□□□ 0.59
USP17L12C9JPN9 TMEM247-204ENST00000434431 680 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.72■□□□□ 0.59
USP17L12C9JPN9 AC096536.1-201ENST00000443284 440 ntTSL 2 BASIC18.72■□□□□ 0.59
USP17L12C9JPN9 GALT-202ENST00000450095 1280 ntTSL 2 BASIC18.72■□□□□ 0.59
USP17L12C9JPN9 CMC2-214ENST00000565925 640 ntTSL 5 BASIC18.72■□□□□ 0.59
USP17L12C9JPN9 AC138474.1-201ENST00000586630 523 ntTSL 3 BASIC18.72■□□□□ 0.59
USP17L12C9JPN9 TRAPPC6A-204ENST00000588062 695 ntTSL 2 BASIC18.72■□□□□ 0.59
USP17L12C9JPN9 PRF1-203ENST00000638674 1080 ntTSL 5 BASIC18.72■□□□□ 0.59
USP17L12C9JPN9 MSC-AS1-208ENST00000522519 1537 ntTSL 2 BASIC18.72■□□□□ 0.59
USP17L12C9JPN9 AL513523.2-202ENST00000427283 2040 ntBASIC18.72■□□□□ 0.59
USP17L12C9JPN9 GPR161-204ENST00000367838 2676 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
USP17L12C9JPN9 MCM4-201ENST00000262105 4183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
USP17L12C9JPN9 VEZF1-202ENST00000581208 2321 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
USP17L12C9JPN9 SAMD4A-208ENST00000555192 1337 ntTSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
USP17L12C9JPN9 MMP2-201ENST00000219070 3741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
USP17L12C9JPN9 AC006019.1-201ENST00000425591 2470 ntTSL 2 BASIC18.72■□□□□ 0.59
USP17L12C9JPN9 PPP4R3A-205ENST00000554684 4108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
USP17L12C9JPN9 ALOX12-AS1-201ENST00000399540 1730 ntTSL 2 BASIC18.71■□□□□ 0.59
USP17L12C9JPN9 NPNT-201ENST00000305572 3003 ntTSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
USP17L12C9JPN9 CDS1-201ENST00000295887 4461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
USP17L12C9JPN9 AMT-233ENST00000636522 1620 ntTSL 2 BASIC18.71■□□□□ 0.59
USP17L12C9JPN9 MIOS-202ENST00000405785 3095 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.71■□□□□ 0.59
USP17L12C9JPN9 PCDHA1-201ENST00000378133 2726 ntBASIC18.71■□□□□ 0.59
USP17L12C9JPN9 KIAA1586-203ENST00000545356 2883 ntTSL 2 BASIC18.71■□□□□ 0.59
USP17L12C9JPN9 SEC14L4-201ENST00000255858 2499 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
USP17L12C9JPN9 ZNF789-201ENST00000331410 1654 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
USP17L12C9JPN9 LCE3A-201ENST00000335674 270 ntAPPRIS P1 BASIC18.71■□□□□ 0.59
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USP17L12C9JPN9 C9orf41-AS1-201ENST00000455609 719 ntTSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
USP17L12C9JPN9 INE1-201ENST00000456273 945 ntBASIC18.71■□□□□ 0.59
USP17L12C9JPN9 RN7SL752P-201ENST00000463779 287 ntBASIC18.71■□□□□ 0.59
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USP17L12C9JPN9 AC010327.1-201ENST00000587871 975 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.71■□□□□ 0.59
USP17L12C9JPN9 WFDC1-204ENST00000613603 549 ntBASIC18.71■□□□□ 0.59
USP17L12C9JPN9 HIST1H2AB-201ENST00000615868 393 ntAPPRIS P1 BASIC18.71■□□□□ 0.59
USP17L12C9JPN9 FAM76B-201ENST00000358780 3952 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
USP17L12C9JPN9 NUP153-202ENST00000537253 6030 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.71■□□□□ 0.59
USP17L12C9JPN9 FDPS-202ENST00000368356 1431 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC18.71■□□□□ 0.59
USP17L12C9JPN9 FKBP1C-201ENST00000370659 1579 ntAPPRIS P1 BASIC18.71■□□□□ 0.59
USP17L12C9JPN9 GINS2-201ENST00000253462 2673 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
USP17L12C9JPN9 NFATC4-222ENST00000555590 2830 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
USP17L12C9JPN9 PCDHGA11-202ENST00000518882 2263 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
USP17L12C9JPN9 EI24-214ENST00000620753 1718 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.71■□□□□ 0.59
USP17L12C9JPN9 TIPRL-202ENST00000367833 3032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
USP17L12C9JPN9 RAB40B-206ENST00000571995 3859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.58
USP17L12C9JPN9 SPAAR-202ENST00000443779 1612 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.71■□□□□ 0.58
USP17L12C9JPN9 PRKD2-216ENST00000601806 2906 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.7■□□□□ 0.58
USP17L12C9JPN9 PLEKHB1-202ENST00000354190 2380 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
USP17L12C9JPN9 MGRN1-201ENST00000262370 3968 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
USP17L12C9JPN9 CBFB-201ENST00000290858 3136 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
USP17L12C9JPN9 ZP3-204ENST00000416245 1846 ntTSL 2 BASIC18.7■□□□□ 0.58
USP17L12C9JPN9 KDM6A-213ENST00000611820 5924 ntTSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
USP17L12C9JPN9 GOLIM4-201ENST00000309027 2100 ntTSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
USP17L12C9JPN9 ZNF135-202ENST00000359978 2120 ntTSL 2 BASIC18.7■□□□□ 0.58
USP17L12C9JPN9 NR4A3-202ENST00000338488 2588 ntTSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
USP17L12C9JPN9 VGLL2-202ENST00000352536 1709 ntTSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
USP17L12C9JPN9 H2BFM-201ENST00000355016 1882 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.7■□□□□ 0.58
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