Protein–RNA interactions for Protein: A2IDD5

CCDC78, Coiled-coil domain-containing protein 78, humanhuman

Predictions only

Length 438 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CCDC78A2IDD5 ZFPM2-201ENST00000407775 4700 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
CCDC78A2IDD5 RIPK1-201ENST00000259808 4160 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.2■□□□□ 0.18
CCDC78A2IDD5 GCK-203ENST00000395796 2539 ntTSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
CCDC78A2IDD5 CDC25C-207ENST00000513970 1968 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.2■□□□□ 0.18
CCDC78A2IDD5 POLR2J4-203ENST00000326391 1422 ntTSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
CCDC78A2IDD5 CHID1-215ENST00000528581 1431 ntTSL 2 BASIC16.2■□□□□ 0.18
CCDC78A2IDD5 DCTN1-203ENST00000409240 4365 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
CCDC78A2IDD5 TRIM13-204ENST00000420995 2607 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
CCDC78A2IDD5 XRRA1-202ENST00000340360 5681 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.2■□□□□ 0.18
CCDC78A2IDD5 NELFA-203ENST00000411638 2199 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
CCDC78A2IDD5 TLE3-215ENST00000559048 2918 ntTSL 2 BASIC16.2■□□□□ 0.18
CCDC78A2IDD5 COL5A1-208ENST00000618395 8437 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.2■□□□□ 0.18
CCDC78A2IDD5 DEPDC5-203ENST00000400242 2395 ntTSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
CCDC78A2IDD5 AC091100.1-201ENST00000558424 2354 ntTSL 2 BASIC16.2■□□□□ 0.18
CCDC78A2IDD5 FUT7-201ENST00000314412 2584 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
CCDC78A2IDD5 PRICKLE1-211ENST00000639566 3341 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.2■□□□□ 0.18
CCDC78A2IDD5 SYNRG-222ENST00000614941 3406 ntTSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
CCDC78A2IDD5 CCDC12-201ENST00000292314 1017 ntTSL 5 BASIC16.2■□□□□ 0.18
CCDC78A2IDD5 FIGLA-201ENST00000332372 722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
CCDC78A2IDD5 ZNF135-202ENST00000359978 2120 ntTSL 2 BASIC16.2■□□□□ 0.18
CCDC78A2IDD5 TSTD1-203ENST00000368024 457 ntTSL 2 BASIC16.2■□□□□ 0.18
CCDC78A2IDD5 PTMS-202ENST00000389462 773 ntTSL 2 BASIC16.2■□□□□ 0.18
CCDC78A2IDD5 MAPK15-202ENST00000395107 834 ntTSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
CCDC78A2IDD5 COA5-202ENST00000409997 557 ntTSL 4 BASIC16.2■□□□□ 0.18
CCDC78A2IDD5 C6orf47-AS1-203ENST00000422049 673 ntTSL 2 BASIC16.2■□□□□ 0.18
CCDC78A2IDD5 AL158071.2-201ENST00000423380 815 ntTSL 3 BASIC16.2■□□□□ 0.18
CCDC78A2IDD5 SEC24B-AS1-201ENST00000499359 957 ntTSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
CCDC78A2IDD5 SEC24B-AS1-204ENST00000510971 554 ntTSL 4 BASIC16.2■□□□□ 0.18
CCDC78A2IDD5 GNAO1-210ENST00000569295 930 ntTSL 2 BASIC16.2■□□□□ 0.18
CCDC78A2IDD5 PFN1-203ENST00000574872 1173 ntTSL 2 BASIC16.2■□□□□ 0.18
CCDC78A2IDD5 RAMP2-205ENST00000589683 858 ntTSL 3 BASIC16.2■□□□□ 0.18
CCDC78A2IDD5 AC005256.1-202ENST00000592934 415 ntTSL 2 BASIC16.2■□□□□ 0.18
CCDC78A2IDD5 AC055717.3-201ENST00000622967 595 ntBASIC16.2■□□□□ 0.18
CCDC78A2IDD5 AC105339.1-204ENST00000636249 355 ntBASIC16.2■□□□□ 0.18
CCDC78A2IDD5 CKAP4-201ENST00000378026 3093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
CCDC78A2IDD5 NEK7-202ENST00000367385 4149 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.2■□□□□ 0.18
CCDC78A2IDD5 OPA1-201ENST00000361150 6330 ntTSL 5 BASIC16.2■□□□□ 0.18
CCDC78A2IDD5 AC092127.1-201ENST00000567093 3455 ntBASIC16.2■□□□□ 0.18
CCDC78A2IDD5 PRMT1-217ENST00000532489 1686 ntTSL 5 BASIC16.2■□□□□ 0.18
CCDC78A2IDD5 FAM192A-201ENST00000309137 2848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
CCDC78A2IDD5 CCDC59-201ENST00000256151 1983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
CCDC78A2IDD5 BANP-201ENST00000286122 2368 ntTSL 5 BASIC16.2■□□□□ 0.18
CCDC78A2IDD5 ADCY2-201ENST00000338316 6575 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
CCDC78A2IDD5 TFAP2C-201ENST00000201031 2866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
CCDC78A2IDD5 TTC6-206ENST00000553443 5833 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.2■□□□□ 0.18
CCDC78A2IDD5 OPCML-202ENST00000374778 1302 ntTSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
CCDC78A2IDD5 AKR1B15-202ENST00000457545 1621 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.19■□□□□ 0.18
CCDC78A2IDD5 GK2-201ENST00000358842 1942 ntAPPRIS P1 BASIC16.19■□□□□ 0.18
CCDC78A2IDD5 SLC3A2-204ENST00000377891 2222 ntTSL 2 BASIC16.19■□□□□ 0.18
CCDC78A2IDD5 LRRFIP1P1-201ENST00000498774 2246 ntBASIC16.19■□□□□ 0.18
CCDC78A2IDD5 AK4-202ENST00000395334 6998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
CCDC78A2IDD5 NR4A1-204ENST00000394825 2528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
CCDC78A2IDD5 SPOCK1-202ENST00000394945 4846 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
CCDC78A2IDD5 PRLHR-201ENST00000239032 5446 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
CCDC78A2IDD5 CDH1-202ENST00000422392 2567 ntTSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
CCDC78A2IDD5 DBNDD1-202ENST00000304733 2081 ntTSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
CCDC78A2IDD5 PFN4-201ENST00000313213 974 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
CCDC78A2IDD5 C11orf88-201ENST00000332814 795 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC16.19■□□□□ 0.18
CCDC78A2IDD5 C9orf116-202ENST00000371789 1278 ntTSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
CCDC78A2IDD5 CBR1-202ENST00000399191 838 ntTSL 3 BASIC16.19■□□□□ 0.18
CCDC78A2IDD5 RPSAP43-201ENST00000402237 625 ntBASIC16.19■□□□□ 0.18
CCDC78A2IDD5 UPF3AP3-201ENST00000420996 769 ntBASIC16.19■□□□□ 0.18
CCDC78A2IDD5 AC062015.1-201ENST00000423838 1134 ntTSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
CCDC78A2IDD5 AFG3L1P-209ENST00000429663 458 ntTSL 3 BASIC16.19■□□□□ 0.18
CCDC78A2IDD5 AC078942.1-201ENST00000448698 589 ntTSL 4 BASIC16.19■□□□□ 0.18
CCDC78A2IDD5 AL355140.1-201ENST00000457328 398 ntTSL 5 BASIC16.19■□□□□ 0.18
CCDC78A2IDD5 KIAA0930-215ENST00000496226 589 ntTSL 5 BASIC16.19■□□□□ 0.18
CCDC78A2IDD5 SPINK2-203ENST00000506738 763 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.19■□□□□ 0.18
CCDC78A2IDD5 SERF1A-207ENST00000512649 846 ntTSL 2 BASIC16.19■□□□□ 0.18
CCDC78A2IDD5 ASXL1-206ENST00000542461 1068 ntTSL 5 BASIC16.19■□□□□ 0.18
CCDC78A2IDD5 SSH2-211ENST00000590153 570 ntTSL 4 BASIC16.19■□□□□ 0.18
CCDC78A2IDD5 FSTL3-207ENST00000605925 748 ntTSL 4 BASIC16.19■□□□□ 0.18
CCDC78A2IDD5 LINC01128-208ENST00000608189 824 ntTSL 5 BASIC16.19■□□□□ 0.18
CCDC78A2IDD5 P4HA2-201ENST00000166534 2230 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
CCDC78A2IDD5 STAT5B-201ENST00000293328 5103 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
CCDC78A2IDD5 MBD1-224ENST00000591416 4905 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.19■□□□□ 0.18
CCDC78A2IDD5 BRD2-202ENST00000374831 4807 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
CCDC78A2IDD5 FAM151A-201ENST00000302250 2005 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
CCDC78A2IDD5 PLXNB1-202ENST00000358536 7308 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
CCDC78A2IDD5 CES1-202ENST00000361503 1835 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
CCDC78A2IDD5 ALOX15B-205ENST00000573359 1809 ntTSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
CCDC78A2IDD5 ATP6V1B2-201ENST00000276390 2875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
CCDC78A2IDD5 KIF3A-202ENST00000378746 6325 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.19■□□□□ 0.18
CCDC78A2IDD5 AL136982.4-201ENST00000437689 1740 ntBASIC16.19■□□□□ 0.18
CCDC78A2IDD5 CD14-202ENST00000401743 1648 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.19■□□□□ 0.18
CCDC78A2IDD5 MSI2-204ENST00000442934 1624 ntTSL 2 BASIC16.19■□□□□ 0.18
CCDC78A2IDD5 ARHGAP39-201ENST00000276826 4697 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.19■□□□□ 0.18
CCDC78A2IDD5 SMIM5-201ENST00000375215 1546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
CCDC78A2IDD5 PTHLH-209ENST00000545234 1544 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.19■□□□□ 0.18
CCDC78A2IDD5 AP002360.1-202ENST00000530460 2462 ntAPPRIS ALT2 BASIC16.19■□□□□ 0.18
CCDC78A2IDD5 PDP1-201ENST00000297598 4272 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
CCDC78A2IDD5 APBA2-205ENST00000558330 3349 ntTSL 2 BASIC16.19■□□□□ 0.18
CCDC78A2IDD5 NLRX1-202ENST00000409109 4092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
CCDC78A2IDD5 NEDD4-202ENST00000435532 5869 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
CCDC78A2IDD5 TANK-202ENST00000392749 2171 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
CCDC78A2IDD5 RUSC1-203ENST00000368349 1968 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
CCDC78A2IDD5 PHTF1-201ENST00000357783 2747 ntTSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
CCDC78A2IDD5 PIGT-201ENST00000279035 1880 ntTSL 2 BASIC16.18■□□□□ 0.18
CCDC78A2IDD5 SPDEF-202ENST00000544425 1866 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC16.18■□□□□ 0.18
CCDC78A2IDD5 RBCK1-201ENST00000353660 2511 ntTSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 34.5 ms