Protein–RNA interactions for Protein: Q9UMW8

USP18, Ubl carboxyl-terminal hydrolase 18, humanhuman

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Length 372 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
USP18Q9UMW8 FBXL5-201ENST00000341285 3385 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
USP18Q9UMW8 TOMM40-207ENST00000592434 3415 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.85■□□□□ 0.29
USP18Q9UMW8 RBPMS-204ENST00000397323 2941 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
USP18Q9UMW8 MCF2L2-208ENST00000473233 4748 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.85■□□□□ 0.29
USP18Q9UMW8 RAI2-206ENST00000545871 2421 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC16.85■□□□□ 0.29
USP18Q9UMW8 CRK-202ENST00000398970 3675 ntTSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
USP18Q9UMW8 SLC2A13-202ENST00000380858 3082 ntTSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
USP18Q9UMW8 SPDEF-202ENST00000544425 1866 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC16.85■□□□□ 0.29
USP18Q9UMW8 AXIN2-202ENST00000375702 2541 ntTSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
USP18Q9UMW8 COX6A1-201ENST00000229379 572 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
USP18Q9UMW8 USE1-201ENST00000263897 843 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
USP18Q9UMW8 FAM220BP-201ENST00000377689 816 ntBASIC16.85■□□□□ 0.29
USP18Q9UMW8 NDUFAF3-203ENST00000395458 808 ntTSL 2 BASIC16.85■□□□□ 0.29
USP18Q9UMW8 TMEM161B-AS1-212ENST00000513011 833 ntTSL 3 BASIC16.85■□□□□ 0.29
USP18Q9UMW8 RNA5SP410-201ENST00000516285 106 ntBASIC16.85■□□□□ 0.29
USP18Q9UMW8 AC027369.6-201ENST00000525520 931 ntBASIC16.85■□□□□ 0.29
USP18Q9UMW8 TMEM120B-206ENST00000540377 962 ntTSL 3 BASIC16.85■□□□□ 0.29
USP18Q9UMW8 AC012173.1-201ENST00000567942 430 ntTSL 3 BASIC16.85■□□□□ 0.29
USP18Q9UMW8 AC004233.1-201ENST00000570515 608 ntTSL 4 BASIC16.85■□□□□ 0.29
USP18Q9UMW8 IL11-202ENST00000585513 1201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
USP18Q9UMW8 AP005482.2-201ENST00000587889 310 ntTSL 5 BASIC16.85■□□□□ 0.29
USP18Q9UMW8 AL355974.2-201ENST00000614099 556 ntTSL 4 BASIC16.85■□□□□ 0.29
USP18Q9UMW8 AL355974.2-202ENST00000617298 936 ntTSL 3 BASIC16.85■□□□□ 0.29
USP18Q9UMW8 AC084121.4-201ENST00000641598 221 ntBASIC16.85■□□□□ 0.29
USP18Q9UMW8 AF228730.8-201ENST00000642140 221 ntBASIC16.85■□□□□ 0.29
USP18Q9UMW8 EFCAB14-201ENST00000371933 5767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
USP18Q9UMW8 SLC27A6-201ENST00000262462 3219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
USP18Q9UMW8 FEM1C-201ENST00000274457 5816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
USP18Q9UMW8 CRY1-201ENST00000008527 3267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
USP18Q9UMW8 ELMO1-209ENST00000448602 2621 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
USP18Q9UMW8 RASA4-204ENST00000462172 2634 ntTSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
USP18Q9UMW8 WDR81-204ENST00000419248 3315 ntTSL 2 BASIC16.85■□□□□ 0.29
USP18Q9UMW8 GINS2-201ENST00000253462 2673 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
USP18Q9UMW8 TMTC2-203ENST00000548305 2682 ntTSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
USP18Q9UMW8 PCBP4-202ENST00000355852 2015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
USP18Q9UMW8 SLC4A3-204ENST00000373760 4134 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.85■□□□□ 0.29
USP18Q9UMW8 CYP4F3-202ENST00000585846 2056 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
USP18Q9UMW8 CACFD1-202ENST00000316948 2794 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
USP18Q9UMW8 SPATA18-202ENST00000419395 2816 ntTSL 2 BASIC16.85■□□□□ 0.29
USP18Q9UMW8 BCS1L-212ENST00000439945 1483 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.85■□□□□ 0.29
USP18Q9UMW8 AP001282.1-201ENST00000531301 1499 ntBASIC16.85■□□□□ 0.29
USP18Q9UMW8 PIK3R6-203ENST00000614407 2265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
USP18Q9UMW8 RAP2C-201ENST00000342983 3896 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
USP18Q9UMW8 COG5-203ENST00000393603 5418 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
USP18Q9UMW8 EXD3-203ENST00000465160 1585 ntTSL 2 BASIC16.85■□□□□ 0.29
USP18Q9UMW8 PLPPR5-201ENST00000263177 3288 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
USP18Q9UMW8 RALGPS1-203ENST00000373434 2466 ntTSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
USP18Q9UMW8 NLE1-202ENST00000442241 2588 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
USP18Q9UMW8 AEBP1-206ENST00000450684 2571 ntTSL 2 BASIC16.84■□□□□ 0.29
USP18Q9UMW8 JMY-201ENST00000396137 9042 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.84■□□□□ 0.29
USP18Q9UMW8 AP003680.1-201ENST00000598970 3660 ntBASIC16.84■□□□□ 0.29
USP18Q9UMW8 PCDH1-203ENST00000394536 3827 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
USP18Q9UMW8 PBX1-215ENST00000559240 2866 ntTSL 5 BASIC16.84■□□□□ 0.29
USP18Q9UMW8 CDC25C-207ENST00000513970 1968 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.84■□□□□ 0.29
USP18Q9UMW8 AC134407.2-201ENST00000625089 1978 ntBASIC16.84■□□□□ 0.29
USP18Q9UMW8 PDE4C-202ENST00000355502 5979 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.84■□□□□ 0.29
USP18Q9UMW8 HLA-DQB2-231ENST00000435145 2026 ntBASIC16.84■□□□□ 0.29
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USP18Q9UMW8 MAGEA2-208ENST00000623438 2009 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.84■□□□□ 0.29
USP18Q9UMW8 APLN-201ENST00000429967 3205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
USP18Q9UMW8 FAM208B-201ENST00000328090 8626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
USP18Q9UMW8 TMPO-AS1-202ENST00000548760 3357 ntTSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
USP18Q9UMW8 AC096667.1-201ENST00000640078 3465 ntTSL 5 BASIC16.84■□□□□ 0.29
USP18Q9UMW8 ATP6AP2-217ENST00000636580 2337 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
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USP18Q9UMW8 AGGF1-204ENST00000506806 1142 ntTSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
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USP18Q9UMW8 EIF1B-AS1-206ENST00000631175 1303 ntTSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
USP18Q9UMW8 PPP4R3A-205ENST00000554684 4108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
USP18Q9UMW8 RGS6-210ENST00000553530 5685 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
USP18Q9UMW8 PPP2R5D-206ENST00000472118 2963 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.84■□□□□ 0.29
USP18Q9UMW8 TEKT2-201ENST00000207457 1509 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
USP18Q9UMW8 CNPY4-201ENST00000262932 1502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
USP18Q9UMW8 PYCR2-201ENST00000343818 1689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
USP18Q9UMW8 RNF34-202ENST00000392464 1722 ntTSL 5 BASIC16.84■□□□□ 0.29
USP18Q9UMW8 ADSL-220ENST00000636714 1734 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.84■□□□□ 0.29
USP18Q9UMW8 AC011477.6-201ENST00000604980 1927 ntBASIC16.84■□□□□ 0.29
USP18Q9UMW8 ADCY7-203ENST00000537579 2090 ntTSL 5 BASIC16.84■□□□□ 0.29
USP18Q9UMW8 ELOF1-203ENST00000586683 2154 ntTSL 2 BASIC16.84■□□□□ 0.29
USP18Q9UMW8 FAM104A-201ENST00000403627 2798 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.29
USP18Q9UMW8 AL162727.3-201ENST00000635661 2787 ntBASIC16.83■□□□□ 0.29
USP18Q9UMW8 LRP11-201ENST00000239367 3260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.29
USP18Q9UMW8 MMP2-201ENST00000219070 3741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.29
USP18Q9UMW8 PPP1R15A-201ENST00000200453 2378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.28
USP18Q9UMW8 PITPNA-201ENST00000313486 3912 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.83■□□□□ 0.28
USP18Q9UMW8 POLR2J4-203ENST00000326391 1422 ntTSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.28
USP18Q9UMW8 RNLS-201ENST00000331772 1447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.28
USP18Q9UMW8 CALY-202ENST00000368555 783 ntTSL 2 BASIC16.83■□□□□ 0.28
USP18Q9UMW8 RIMS3-201ENST00000372683 1408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.28
USP18Q9UMW8 SMIM5-201ENST00000375215 1546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.28
USP18Q9UMW8 HLA-H-201ENST00000383620 1096 ntBASIC16.83■□□□□ 0.28
USP18Q9UMW8 NT5C3A-204ENST00000405342 1759 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.28
USP18Q9UMW8 TAS2R41-201ENST00000408916 924 ntAPPRIS P1 BASIC16.83■□□□□ 0.28
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