Protein–RNA interactions for Protein: Q9P2X8

LINC00474, Putative uncharacterized protein encoded by LINC00474, humanhuman

Predictions only

Length 69 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LINC00474Q9P2X8 AC092902.6-201ENST00000641783 218 ntBASIC10.5□□□□□ -0.73
LINC00474Q9P2X8 RFPL2-203ENST00000400237 2407 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC10.5□□□□□ -0.73
LINC00474Q9P2X8 LINC00942-201ENST00000515614 2417 ntTSL 5 BASIC10.5□□□□□ -0.73
LINC00474Q9P2X8 TBL2-205ENST00000432538 1573 ntTSL 2 BASIC10.5□□□□□ -0.73
LINC00474Q9P2X8 AL009178.2-201ENST00000597278 2719 ntBASIC10.5□□□□□ -0.73
LINC00474Q9P2X8 KRT12-201ENST00000251643 1867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.5□□□□□ -0.73
LINC00474Q9P2X8 SRPX-201ENST00000378533 1874 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.5□□□□□ -0.73
LINC00474Q9P2X8 TARSL2-201ENST00000335968 3610 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.5□□□□□ -0.73
LINC00474Q9P2X8 TRPM1-203ENST00000542188 6004 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.5□□□□□ -0.73
LINC00474Q9P2X8 AC092919.2-201ENST00000623631 1645 ntBASIC10.5□□□□□ -0.73
LINC00474Q9P2X8 DEF6-201ENST00000316637 2262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.5□□□□□ -0.73
LINC00474Q9P2X8 CALU-205ENST00000535011 3210 ntTSL 1 (best) BASIC10.5□□□□□ -0.73
LINC00474Q9P2X8 TMEM40-202ENST00000314124 2308 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC10.5□□□□□ -0.73
LINC00474Q9P2X8 ADGRE2-208ENST00000595839 2046 ntTSL 5 BASIC10.5□□□□□ -0.73
LINC00474Q9P2X8 TACR2-202ENST00000373307 1740 ntTSL 2 BASIC10.5□□□□□ -0.73
LINC00474Q9P2X8 CALCR-207ENST00000426151 1741 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.5□□□□□ -0.73
LINC00474Q9P2X8 TOM1-210ENST00000449058 2389 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.5□□□□□ -0.73
LINC00474Q9P2X8 CLU-215ENST00000523500 2381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.5□□□□□ -0.73
LINC00474Q9P2X8 DUOXA2-201ENST00000323030 1760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.49□□□□□ -0.73
LINC00474Q9P2X8 MSMO1-202ENST00000393766 1789 ntTSL 2 BASIC10.49□□□□□ -0.73
LINC00474Q9P2X8 C1orf115-201ENST00000294889 3413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.49□□□□□ -0.73
LINC00474Q9P2X8 ZFYVE19-203ENST00000355341 2775 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.49□□□□□ -0.73
LINC00474Q9P2X8 CLDN14-201ENST00000342108 1453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.49□□□□□ -0.73
LINC00474Q9P2X8 MYOD1-201ENST00000250003 1801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.49□□□□□ -0.73
LINC00474Q9P2X8 REEP3-201ENST00000373758 5205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.49□□□□□ -0.73
LINC00474Q9P2X8 LTBR-201ENST00000228918 2260 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.49□□□□□ -0.73
LINC00474Q9P2X8 P3H1-201ENST00000236040 2993 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC10.49□□□□□ -0.73
LINC00474Q9P2X8 KLHDC3-202ENST00000326974 1909 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.49□□□□□ -0.73
LINC00474Q9P2X8 RAB7A-203ENST00000482525 1589 ntTSL 1 (best) BASIC10.49□□□□□ -0.73
LINC00474Q9P2X8 CENPM-201ENST00000215980 966 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.49□□□□□ -0.73
LINC00474Q9P2X8 C11orf88-201ENST00000332814 795 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC10.49□□□□□ -0.73
LINC00474Q9P2X8 ELK1-202ENST00000343894 736 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.49□□□□□ -0.73
LINC00474Q9P2X8 BLZF1-202ENST00000367807 1295 ntTSL 1 (best) BASIC10.49□□□□□ -0.73
LINC00474Q9P2X8 MRPS18A-202ENST00000372133 1062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.49□□□□□ -0.73
LINC00474Q9P2X8 TCEAL3-203ENST00000372628 1221 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.49□□□□□ -0.73
LINC00474Q9P2X8 NDUFA4L2-201ENST00000393825 1186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.49□□□□□ -0.73
LINC00474Q9P2X8 AL162231.1-204ENST00000423809 477 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC10.49□□□□□ -0.73
LINC00474Q9P2X8 AFG3L1P-209ENST00000429663 458 ntTSL 3 BASIC10.49□□□□□ -0.73
LINC00474Q9P2X8 SS18L2-202ENST00000447630 1047 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.49□□□□□ -0.73
LINC00474Q9P2X8 AC245100.5-201ENST00000452108 331 ntBASIC10.49□□□□□ -0.73
LINC00474Q9P2X8 TIMM8BP1-201ENST00000452384 211 ntBASIC10.49□□□□□ -0.73
LINC00474Q9P2X8 NDUFS7-216ENST00000546283 1060 ntTSL 2 BASIC10.49□□□□□ -0.73
LINC00474Q9P2X8 TSFM-210ENST00000550559 897 ntTSL 5 BASIC10.49□□□□□ -0.73
LINC00474Q9P2X8 AC090515.4-201ENST00000558042 450 ntTSL 3 BASIC10.49□□□□□ -0.73
LINC00474Q9P2X8 AC092718.3-202ENST00000564536 1032 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC10.49□□□□□ -0.73
LINC00474Q9P2X8 LINC01842-201ENST00000588275 768 ntTSL 1 (best) BASIC10.49□□□□□ -0.73
LINC00474Q9P2X8 PRELID3A-208ENST00000590956 777 ntTSL 2 BASIC10.49□□□□□ -0.73
LINC00474Q9P2X8 ZNF773-202ENST00000593916 548 ntTSL 3 BASIC10.49□□□□□ -0.73
LINC00474Q9P2X8 AC004835.2-201ENST00000603762 682 ntBASIC10.49□□□□□ -0.73
LINC00474Q9P2X8 AC099522.2-201ENST00000607001 744 ntBASIC10.49□□□□□ -0.73
LINC00474Q9P2X8 PSMA8-202ENST00000343848 1675 ntTSL 1 (best) BASIC10.49□□□□□ -0.73
LINC00474Q9P2X8 GCM2-201ENST00000379491 2441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.49□□□□□ -0.73
LINC00474Q9P2X8 AICDA-201ENST00000229335 2819 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.49□□□□□ -0.73
LINC00474Q9P2X8 ELP5-201ENST00000354429 1304 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC10.49□□□□□ -0.73
LINC00474Q9P2X8 RHD-207ENST00000454452 1303 ntTSL 1 (best) BASIC10.49□□□□□ -0.73
LINC00474Q9P2X8 TRIP6-209ENST00000619988 1303 ntTSL 1 (best) BASIC10.49□□□□□ -0.73
LINC00474Q9P2X8 RTN4RL1-201ENST00000331238 3625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.49□□□□□ -0.73
LINC00474Q9P2X8 MYH6-202ENST00000405093 5941 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.49□□□□□ -0.73
LINC00474Q9P2X8 FADS1-216ENST00000542506 1725 ntTSL 2 BASIC10.49□□□□□ -0.73
LINC00474Q9P2X8 GFOD2-201ENST00000268797 2126 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.49□□□□□ -0.73
LINC00474Q9P2X8 AGGF1P2-201ENST00000426656 2106 ntBASIC10.49□□□□□ -0.73
LINC00474Q9P2X8 WDR74-206ENST00000529106 1366 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.49□□□□□ -0.73
LINC00474Q9P2X8 NOL4L-210ENST00000616976 1376 ntTSL 5 BASIC10.49□□□□□ -0.73
LINC00474Q9P2X8 KIF26B-202ENST00000407071 7287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.49□□□□□ -0.73
LINC00474Q9P2X8 COMMD6-203ENST00000377615 1793 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.49□□□□□ -0.73
LINC00474Q9P2X8 AC073439.1-201ENST00000624121 1774 ntBASIC10.49□□□□□ -0.73
LINC00474Q9P2X8 CGN-201ENST00000271636 5091 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.49□□□□□ -0.73
LINC00474Q9P2X8 PRR30-202ENST00000432962 1440 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC10.49□□□□□ -0.73
LINC00474Q9P2X8 TCP10-201ENST00000366827 2250 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.49□□□□□ -0.73
LINC00474Q9P2X8 ZDHHC3-201ENST00000296127 3101 ntTSL 1 (best) BASIC10.49□□□□□ -0.73
LINC00474Q9P2X8 PPP1R3B-202ENST00000519699 2334 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.49□□□□□ -0.73
LINC00474Q9P2X8 UGT3A2-204ENST00000513300 1924 ntTSL 2 BASIC10.48□□□□□ -0.73
LINC00474Q9P2X8 FARP1-214ENST00000595437 4926 ntTSL 1 (best) BASIC10.48□□□□□ -0.73
LINC00474Q9P2X8 USP47-207ENST00000527733 4525 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.48□□□□□ -0.73
LINC00474Q9P2X8 TTC8-216ENST00000614125 2377 ntTSL 5 BASIC10.48□□□□□ -0.73
LINC00474Q9P2X8 PSMD5-203ENST00000373904 1538 ntTSL 2 BASIC10.48□□□□□ -0.73
LINC00474Q9P2X8 ZMYM3-202ENST00000373978 1511 ntTSL 5 BASIC10.48□□□□□ -0.73
LINC00474Q9P2X8 GATB-209ENST00000512306 1519 ntTSL 1 (best) BASIC10.48□□□□□ -0.73
LINC00474Q9P2X8 TRPC6-202ENST00000348423 2448 ntTSL 1 (best) BASIC10.48□□□□□ -0.73
LINC00474Q9P2X8 ZMYND15-202ENST00000433935 2411 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.48□□□□□ -0.73
LINC00474Q9P2X8 EIF4G3-204ENST00000374935 5567 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.48□□□□□ -0.73
LINC00474Q9P2X8 PKLR-202ENST00000392414 2479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.48□□□□□ -0.73
LINC00474Q9P2X8 ALDH2-202ENST00000416293 1572 ntTSL 2 BASIC10.48□□□□□ -0.73
LINC00474Q9P2X8 ZCCHC3-201ENST00000500893 3354 ntAPPRIS P1 BASIC10.48□□□□□ -0.73
LINC00474Q9P2X8 SGK3-206ENST00000520976 2483 ntTSL 2 BASIC10.48□□□□□ -0.73
LINC00474Q9P2X8 KPNA2-202ENST00000537025 2456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.48□□□□□ -0.73
LINC00474Q9P2X8 HNF1A-212ENST00000544413 2014 ntTSL 1 (best) BASIC10.48□□□□□ -0.73
LINC00474Q9P2X8 TNFRSF13C-201ENST00000291232 3944 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.48□□□□□ -0.73
LINC00474Q9P2X8 AC096667.1-201ENST00000640078 3465 ntTSL 5 BASIC10.48□□□□□ -0.73
LINC00474Q9P2X8 MYO15B-237ENST00000642007 4893 ntBASIC10.48□□□□□ -0.73
LINC00474Q9P2X8 PIK3CG-201ENST00000359195 5377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.48□□□□□ -0.73
LINC00474Q9P2X8 USP31-203ENST00000567975 2142 ntTSL 2 BASIC10.48□□□□□ -0.73
LINC00474Q9P2X8 SNX18-202ENST00000343017 3140 ntBASIC10.48□□□□□ -0.73
LINC00474Q9P2X8 MBD4-206ENST00000507208 2194 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC10.48□□□□□ -0.73
LINC00474Q9P2X8 AC005622.1-201ENST00000636801 1703 ntBASIC10.48□□□□□ -0.73
LINC00474Q9P2X8 AC110813.1-201ENST00000507934 2209 ntTSL 2 BASIC10.48□□□□□ -0.73
LINC00474Q9P2X8 TIGAR-201ENST00000179259 2782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.48□□□□□ -0.73
LINC00474Q9P2X8 DMTN-202ENST00000358242 2772 ntTSL 5 BASIC10.48□□□□□ -0.73
LINC00474Q9P2X8 CCDC12-201ENST00000292314 1017 ntTSL 5 BASIC10.48□□□□□ -0.73
LINC00474Q9P2X8 MIR1233-2-201ENST00000408138 82 ntBASIC10.48□□□□□ -0.73
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 43.7 ms