Protein–RNA interactions for Protein: Q92878

RAD50, DNA repair protein RAD50, humanhuman

Predictions only

Length 1,312 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RAD50Q92878 GSN-206ENST00000394353 2311 ntTSL 2 BASIC19.13■□□□□ 0.65
RAD50Q92878 TPD52L2-210ENST00000615907 2310 ntTSL 4 BASIC19.13■□□□□ 0.65
RAD50Q92878 REPS1-208ENST00000450536 4537 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
RAD50Q92878 TMEM25-206ENST00000442938 2228 ntTSL 2 BASIC19.13■□□□□ 0.65
RAD50Q92878 MYOC-201ENST00000037502 2095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
RAD50Q92878 TMUB2-209ENST00000587989 1969 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC19.13■□□□□ 0.65
RAD50Q92878 HNF1B-207ENST00000621123 1971 ntTSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
RAD50Q92878 CRK-202ENST00000398970 3675 ntTSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
RAD50Q92878 AQP3-201ENST00000297991 1849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
RAD50Q92878 BBS5-201ENST00000295240 3475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
RAD50Q92878 OXCT1-AS1-201ENST00000508458 1731 ntTSL 3 BASIC19.13■□□□□ 0.65
RAD50Q92878 C17orf74-201ENST00000333870 1651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
RAD50Q92878 EIF4E1B-203ENST00000504597 1676 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.13■□□□□ 0.65
RAD50Q92878 HYMAI-201ENST00000635591 3347 ntBASIC19.13■□□□□ 0.65
RAD50Q92878 MRPL55-201ENST00000295008 632 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.13■□□□□ 0.65
RAD50Q92878 PAM16-201ENST00000318059 587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
RAD50Q92878 NUDT4P1-201ENST00000322209 1206 ntAPPRIS P1 BASIC19.13■□□□□ 0.65
RAD50Q92878 TNNC2-201ENST00000372555 710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
RAD50Q92878 HFE-208ENST00000397022 1280 ntTSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
RAD50Q92878 C2orf88-205ENST00000443551 692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
RAD50Q92878 AL121753.1-201ENST00000444717 529 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC19.13■□□□□ 0.65
RAD50Q92878 PTK7-212ENST00000476760 902 ntTSL 2 BASIC19.13■□□□□ 0.65
RAD50Q92878 HFE-214ENST00000488199 781 ntTSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
RAD50Q92878 CCDC85C-204ENST00000555822 930 ntTSL 5 BASIC19.13■□□□□ 0.65
RAD50Q92878 AC026803.2-201ENST00000599784 819 ntTSL 3 BASIC19.13■□□□□ 0.65
RAD50Q92878 RGL3-201ENST00000380456 2542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
RAD50Q92878 ABCB7-201ENST00000253577 2377 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
RAD50Q92878 ITGB4-201ENST00000200181 5919 ntTSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
RAD50Q92878 CDC42-203ENST00000400259 2274 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC19.13■□□□□ 0.65
RAD50Q92878 DNM1-201ENST00000341179 3254 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
RAD50Q92878 DDOST-201ENST00000375048 2079 ntTSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
RAD50Q92878 RNPS1-220ENST00000566458 2037 ntTSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
RAD50Q92878 ASXL1-202ENST00000375687 7031 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC19.13■□□□□ 0.65
RAD50Q92878 SLC18A1-207ENST00000519026 1980 ntTSL 5 BASIC19.13■□□□□ 0.65
RAD50Q92878 ILF3-AS1-201ENST00000591501 1983 ntBASIC19.13■□□□□ 0.65
RAD50Q92878 RASA4B-202ENST00000465829 2931 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
RAD50Q92878 ESR2-209ENST00000555278 1883 ntTSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
RAD50Q92878 RNF167-211ENST00000575111 1757 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
RAD50Q92878 SYT6-205ENST00000609117 4424 ntTSL 5 BASIC19.13■□□□□ 0.65
RAD50Q92878 TRIM17-205ENST00000456946 1731 ntTSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
RAD50Q92878 MMP15-201ENST00000219271 4250 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
RAD50Q92878 SLC4A3-204ENST00000373760 4134 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.12■□□□□ 0.65
RAD50Q92878 MAGI1-213ENST00000483466 4791 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
RAD50Q92878 SYN1-202ENST00000340666 3172 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
RAD50Q92878 KIAA0391-202ENST00000321130 1589 ntTSL 3 BASIC19.12■□□□□ 0.65
RAD50Q92878 ILDR1-202ENST00000344209 2226 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
RAD50Q92878 LDOC1-201ENST00000370526 1381 ntAPPRIS P1 BASIC19.12■□□□□ 0.65
RAD50Q92878 AP003397.1-201ENST00000525706 1387 ntTSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
RAD50Q92878 ENDOV-213ENST00000520367 2680 ntTSL 2 BASIC19.12■□□□□ 0.65
RAD50Q92878 ZDHHC19-201ENST00000296326 1306 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.12■□□□□ 0.65
RAD50Q92878 CNOT10-202ENST00000331889 2573 ntTSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
RAD50Q92878 SPAG7-201ENST00000206020 1058 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
RAD50Q92878 EIF4E-201ENST00000280892 1097 ntTSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
RAD50Q92878 UGGT2-202ENST00000376714 1233 ntTSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
RAD50Q92878 RBM3-202ENST00000376755 1130 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.12■□□□□ 0.65
RAD50Q92878 FAM8A3P-201ENST00000427218 844 ntBASIC19.12■□□□□ 0.65
RAD50Q92878 IQCF3-201ENST00000437810 1270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
RAD50Q92878 CTDSP1-204ENST00000443891 1109 ntTSL 3 BASIC19.12■□□□□ 0.65
RAD50Q92878 FAM86GP-201ENST00000448322 971 ntBASIC19.12■□□□□ 0.65
RAD50Q92878 HLA-V-204ENST00000476601 1289 ntBASIC19.12■□□□□ 0.65
RAD50Q92878 TIMM17B-208ENST00000495490 939 ntTSL 5 BASIC19.12■□□□□ 0.65
RAD50Q92878 SSBP1-214ENST00000498107 636 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
RAD50Q92878 CNOT8-210ENST00000519404 945 ntTSL 2 BASIC19.12■□□□□ 0.65
RAD50Q92878 CNOT8-214ENST00000520671 923 ntTSL 2 BASIC19.12■□□□□ 0.65
RAD50Q92878 CNOT8-218ENST00000521583 1151 ntTSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
RAD50Q92878 AL109827.1-203ENST00000541176 872 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC19.12■□□□□ 0.65
RAD50Q92878 LINC01089-211ENST00000543334 1282 ntTSL 4 BASIC19.12■□□□□ 0.65
RAD50Q92878 COMMD4-207ENST00000562789 746 ntTSL 2 BASIC19.12■□□□□ 0.65
RAD50Q92878 GRIFIN-202ENST00000614228 461 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.12■□□□□ 0.65
RAD50Q92878 UGGT2-212ENST00000621375 1004 ntTSL 5 BASIC19.12■□□□□ 0.65
RAD50Q92878 CBR3-AS1-216ENST00000624883 564 ntTSL 3 BASIC19.12■□□□□ 0.65
RAD50Q92878 STEAP3-202ENST00000393107 1871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
RAD50Q92878 CHMP1A-201ENST00000397901 2483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
RAD50Q92878 RRP1-207ENST00000497547 3022 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
RAD50Q92878 NCKIPSD-201ENST00000294129 2989 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
RAD50Q92878 KCNJ14-201ENST00000342291 2960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
RAD50Q92878 NPM1-201ENST00000296930 1758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
RAD50Q92878 TNIP1-217ENST00000523200 1743 ntTSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
RAD50Q92878 CROCCP1-201ENST00000426910 5675 ntBASIC19.12■□□□□ 0.65
RAD50Q92878 DMAC2-201ENST00000221943 1692 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.12■□□□□ 0.65
RAD50Q92878 YY1-201ENST00000262238 6697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
RAD50Q92878 CACNA1A-225ENST00000636389 8137 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.12■□□□□ 0.65
RAD50Q92878 BANK1-207ENST00000508653 2115 ntTSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
RAD50Q92878 CDH1-202ENST00000422392 2567 ntTSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
RAD50Q92878 C12orf42-201ENST00000378113 1513 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC19.12■□□□□ 0.65
RAD50Q92878 ZNF620-202ENST00000418905 2022 ntTSL 2 BASIC19.12■□□□□ 0.65
RAD50Q92878 TVP23C-210ENST00000584811 2989 ntTSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
RAD50Q92878 PCBP4-201ENST00000322099 1964 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
RAD50Q92878 TAF3-201ENST00000344293 4872 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
RAD50Q92878 PDZRN3-201ENST00000263666 4248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
RAD50Q92878 ZNF568-203ENST00000427117 1827 ntTSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
RAD50Q92878 ZC2HC1C-201ENST00000238686 2249 ntTSL 5 BASIC19.11■□□□□ 0.65
RAD50Q92878 EIF4A1-201ENST00000293831 1756 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
RAD50Q92878 DUOXA1-202ENST00000430224 1317 ntTSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
RAD50Q92878 MKRN3-203ENST00000568252 1312 ntTSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
RAD50Q92878 AC100803.3-201ENST00000606664 2961 ntTSL 5 BASIC19.11■□□□□ 0.65
RAD50Q92878 C1QA-201ENST00000374642 1143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
RAD50Q92878 EEF1B2-202ENST00000392221 880 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.11■□□□□ 0.65
RAD50Q92878 PSMA8-203ENST00000415576 1280 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
RAD50Q92878 MUSTN1-201ENST00000446157 721 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 27.8 ms