Protein–RNA interactions for Protein: Q86WH2

RASSF3, Ras association domain-containing protein 3, humanhuman

Predictions only

Length 238 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RASSF3Q86WH2 DHFR-201ENST00000439211 3917 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
RASSF3Q86WH2 DNAJB8-AS1-201ENST00000471626 1798 ntTSL 2 BASIC16.72■□□□□ 0.27
RASSF3Q86WH2 RB1CC1-202ENST00000435644 6614 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
RASSF3Q86WH2 GFOD2-201ENST00000268797 2126 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
RASSF3Q86WH2 RALGPS1-203ENST00000373434 2466 ntTSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
RASSF3Q86WH2 TMEM101-201ENST00000206380 1536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
RASSF3Q86WH2 CMKLR1-204ENST00000550402 1893 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
RASSF3Q86WH2 C1orf43-201ENST00000350592 1610 ntTSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
RASSF3Q86WH2 THOC7-201ENST00000295899 990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
RASSF3Q86WH2 HFE-208ENST00000397022 1280 ntTSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
RASSF3Q86WH2 PP14571-201ENST00000404327 934 ntTSL 2 BASIC16.72■□□□□ 0.27
RASSF3Q86WH2 PLA2G16-203ENST00000415826 1099 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.72■□□□□ 0.27
RASSF3Q86WH2 COX5BP8-201ENST00000416911 349 ntBASIC16.72■□□□□ 0.27
RASSF3Q86WH2 LINC00475-203ENST00000417983 703 ntTSL 2 BASIC16.72■□□□□ 0.27
RASSF3Q86WH2 UFL1-AS1-201ENST00000430796 548 ntTSL 3 BASIC16.72■□□□□ 0.27
RASSF3Q86WH2 SHBG-204ENST00000441599 973 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
RASSF3Q86WH2 LINC00473-201ENST00000444465 798 ntTSL 3 BASIC16.72■□□□□ 0.27
RASSF3Q86WH2 HFE-214ENST00000488199 781 ntTSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
RASSF3Q86WH2 FKBP11-208ENST00000550765 1030 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
RASSF3Q86WH2 MPI-209ENST00000564003 1195 ntTSL 2 BASIC16.72■□□□□ 0.27
RASSF3Q86WH2 TPGS2-215ENST00000590842 1239 ntTSL 2 BASIC16.72■□□□□ 0.27
RASSF3Q86WH2 FAM66A-202ENST00000602658 546 ntTSL 5 BASIC16.72■□□□□ 0.27
RASSF3Q86WH2 PLA2G16-206ENST00000639271 957 ntTSL 5 BASIC16.72■□□□□ 0.27
RASSF3Q86WH2 SMAP1-201ENST00000316999 2403 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
RASSF3Q86WH2 FBLN1-202ENST00000327858 2896 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
RASSF3Q86WH2 CLPTM1L-209ENST00000507807 1740 ntTSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
RASSF3Q86WH2 SURF4-207ENST00000545297 2863 ntTSL 2 BASIC16.72■□□□□ 0.27
RASSF3Q86WH2 PLEKHA2-208ENST00000616927 1748 ntTSL 5 BASIC16.72■□□□□ 0.27
RASSF3Q86WH2 AL136379.1-201ENST00000623471 2642 ntBASIC16.72■□□□□ 0.27
RASSF3Q86WH2 SHISA5-208ENST00000442747 2250 ntTSL 2 BASIC16.72■□□□□ 0.27
RASSF3Q86WH2 MCM4-201ENST00000262105 4183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
RASSF3Q86WH2 ZNF7-207ENST00000528372 2905 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
RASSF3Q86WH2 ABCB6-201ENST00000265316 3016 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
RASSF3Q86WH2 ZNF514-201ENST00000295208 3011 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
RASSF3Q86WH2 RAB5C-201ENST00000346213 1671 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
RASSF3Q86WH2 SGSH-201ENST00000326317 2784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
RASSF3Q86WH2 VANGL2-201ENST00000368061 5340 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.72■□□□□ 0.27
RASSF3Q86WH2 DEF8-225ENST00000569453 1852 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC16.71■□□□□ 0.27
RASSF3Q86WH2 COL4A1-204ENST00000543140 2547 ntTSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
RASSF3Q86WH2 SPOCK1-202ENST00000394945 4846 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
RASSF3Q86WH2 RNF182-206ENST00000537388 3274 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.71■□□□□ 0.27
RASSF3Q86WH2 SDCBP2-202ENST00000360779 1519 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
RASSF3Q86WH2 GOLGA2P2Y-202ENST00000423852 1506 ntBASIC16.71■□□□□ 0.27
RASSF3Q86WH2 LTBR-201ENST00000228918 2260 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
RASSF3Q86WH2 ARPC5-201ENST00000294742 1637 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
RASSF3Q86WH2 TUBA1C-201ENST00000301072 3001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
RASSF3Q86WH2 EYA2-208ENST00000497062 2384 ntTSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
RASSF3Q86WH2 TMPO-203ENST00000343315 2465 ntTSL 5 BASIC16.71■□□□□ 0.27
RASSF3Q86WH2 DIABLO-208ENST00000464942 2569 ntTSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
RASSF3Q86WH2 KHDRBS1-202ENST00000327300 2757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
RASSF3Q86WH2 TRIM14-201ENST00000341469 4454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
RASSF3Q86WH2 POLR1C-201ENST00000304004 1280 ntTSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
RASSF3Q86WH2 DUPD1-201ENST00000338487 663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
RASSF3Q86WH2 AP1S3-202ENST00000396653 589 ntTSL 4 BASIC16.71■□□□□ 0.27
RASSF3Q86WH2 HNRNPA3P1-201ENST00000401429 1139 ntBASIC16.71■□□□□ 0.27
RASSF3Q86WH2 AL353597.1-201ENST00000414875 998 ntTSL 5 BASIC16.71■□□□□ 0.27
RASSF3Q86WH2 SNHG17-203ENST00000417578 880 ntTSL 2 BASIC16.71■□□□□ 0.27
RASSF3Q86WH2 PABPN1L-202ENST00000419291 1272 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
RASSF3Q86WH2 AL391069.2-202ENST00000447795 622 ntTSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
RASSF3Q86WH2 HNRNPA3P5-201ENST00000455201 833 ntBASIC16.71■□□□□ 0.27
RASSF3Q86WH2 AL606760.1-201ENST00000458151 1181 ntTSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
RASSF3Q86WH2 RAB3A-202ENST00000464076 1253 ntTSL 2 BASIC16.71■□□□□ 0.27
RASSF3Q86WH2 RN7SL692P-201ENST00000464677 288 ntBASIC16.71■□□□□ 0.27
RASSF3Q86WH2 GFM1-208ENST00000478576 2147 ntTSL 2 BASIC16.71■□□□□ 0.27
RASSF3Q86WH2 MEIS3P1-201ENST00000495167 958 ntBASIC16.71■□□□□ 0.27
RASSF3Q86WH2 LINC02437-201ENST00000505053 911 ntTSL 3 BASIC16.71■□□□□ 0.27
RASSF3Q86WH2 LACTB2-203ENST00000522447 1034 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.71■□□□□ 0.27
RASSF3Q86WH2 AP001107.2-202ENST00000528650 480 ntTSL 3 BASIC16.71■□□□□ 0.27
RASSF3Q86WH2 CD4-210ENST00000541982 1187 ntTSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
RASSF3Q86WH2 PPP1R14A-203ENST00000587515 607 ntTSL 2 BASIC16.71■□□□□ 0.27
RASSF3Q86WH2 TMEM114-205ENST00000624696 560 ntTSL 2 BASIC16.71■□□□□ 0.27
RASSF3Q86WH2 MAGI3-204ENST00000369617 3911 ntTSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
RASSF3Q86WH2 C14orf93-202ENST00000341470 2221 ntTSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
RASSF3Q86WH2 DHRS1-201ENST00000288111 1480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
RASSF3Q86WH2 AFF2-204ENST00000370458 1488 ntTSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
RASSF3Q86WH2 RTN3-205ENST00000356000 2645 ntTSL 2 BASIC16.71■□□□□ 0.27
RASSF3Q86WH2 HOXA5-201ENST00000222726 1657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
RASSF3Q86WH2 TULP2-201ENST00000221399 1754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
RASSF3Q86WH2 SCP2-201ENST00000371509 1889 ntTSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
RASSF3Q86WH2 SLC25A48-203ENST00000425402 2062 ntTSL 5 BASIC16.71■□□□□ 0.27
RASSF3Q86WH2 LITAF-201ENST00000339430 2356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.26
RASSF3Q86WH2 USP45-201ENST00000327681 6255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.26
RASSF3Q86WH2 ANKRD26-201ENST00000376087 6591 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.71■□□□□ 0.26
RASSF3Q86WH2 EGFR-203ENST00000344576 2864 ntTSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.26
RASSF3Q86WH2 MVB12B-201ENST00000361171 4819 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.71■□□□□ 0.26
RASSF3Q86WH2 JRK-210ENST00000614134 8932 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.26
RASSF3Q86WH2 FOXO1B-201ENST00000504678 1527 ntBASIC16.7■□□□□ 0.26
RASSF3Q86WH2 ATP2A3-205ENST00000397041 4675 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
RASSF3Q86WH2 SP100-205ENST00000409824 1802 ntTSL 5 BASIC16.7■□□□□ 0.26
RASSF3Q86WH2 ZBTB17-216ENST00000537142 2511 ntTSL 2 BASIC16.7■□□□□ 0.26
RASSF3Q86WH2 TUBB-206ENST00000330914 2632 ntTSL 2 BASIC16.7■□□□□ 0.26
RASSF3Q86WH2 SUSD4-204ENST00000366878 3025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
RASSF3Q86WH2 AC007495.1-201ENST00000501259 2678 ntTSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
RASSF3Q86WH2 GALNT14-201ENST00000324589 2169 ntTSL 2 BASIC16.7■□□□□ 0.26
RASSF3Q86WH2 RBM4-204ENST00000408993 1763 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.7■□□□□ 0.26
RASSF3Q86WH2 TEKT4P2-201ENST00000416067 1599 ntTSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
RASSF3Q86WH2 AL035456.1-201ENST00000456064 1369 ntBASIC16.7■□□□□ 0.26
RASSF3Q86WH2 PPP4R3A-205ENST00000554684 4108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
RASSF3Q86WH2 LIM2-201ENST00000221973 983 ntTSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
RASSF3Q86WH2 VCX2-201ENST00000317103 815 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 45.9 ms