Protein–RNA interactions for Protein: Q6NT89

TRNP1, TMF-regulated nuclear protein 1, humanhuman

Predictions only

Length 227 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TRNP1Q6NT89 NMRAL1-201ENST00000283429 1376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
TRNP1Q6NT89 GATA4-206ENST00000528712 2614 ntTSL 2 BASIC16.52■□□□□ 0.24
TRNP1Q6NT89 VARS-215ENST00000375663 4312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
TRNP1Q6NT89 ANKMY2-201ENST00000306999 2555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
TRNP1Q6NT89 RHOT1-203ENST00000358365 3297 ntTSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
TRNP1Q6NT89 PGR-210ENST00000619228 3038 ntTSL 5 BASIC16.52■□□□□ 0.24
TRNP1Q6NT89 ARHGAP45-212ENST00000590577 3218 ntTSL 2 BASIC16.52■□□□□ 0.24
TRNP1Q6NT89 EFR3B-203ENST00000402191 3685 ntTSL 5 BASIC16.52■□□□□ 0.24
TRNP1Q6NT89 EIF4E-201ENST00000280892 1097 ntTSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
TRNP1Q6NT89 NECTIN1-202ENST00000340882 1059 ntTSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
TRNP1Q6NT89 HDAC8-202ENST00000373556 704 ntTSL 2 BASIC16.52■□□□□ 0.24
TRNP1Q6NT89 CCDC107-204ENST00000378409 1173 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
TRNP1Q6NT89 TMEM239-202ENST00000380585 571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
TRNP1Q6NT89 EEF1B2-202ENST00000392221 880 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.52■□□□□ 0.24
TRNP1Q6NT89 MRPS18AP1-201ENST00000414458 589 ntBASIC16.52■□□□□ 0.24
TRNP1Q6NT89 AC241585.1-201ENST00000433527 519 ntBASIC16.52■□□□□ 0.24
TRNP1Q6NT89 AC092809.2-202ENST00000436706 790 ntTSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
TRNP1Q6NT89 RPL13P2-201ENST00000440687 659 ntBASIC16.52■□□□□ 0.24
TRNP1Q6NT89 IGHV3-42-201ENST00000520410 361 ntBASIC16.52■□□□□ 0.24
TRNP1Q6NT89 RHBDL2-203ENST00000540558 697 ntTSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
TRNP1Q6NT89 NDUFA4L2-206ENST00000556732 883 ntTSL 3 BASIC16.52■□□□□ 0.24
TRNP1Q6NT89 AC133919.2-202ENST00000563515 416 ntTSL 3 BASIC16.52■□□□□ 0.24
TRNP1Q6NT89 AC027796.2-201ENST00000575326 344 ntBASIC16.52■□□□□ 0.24
TRNP1Q6NT89 ZNF550-208ENST00000601415 515 ntTSL 4 BASIC16.52■□□□□ 0.24
TRNP1Q6NT89 AC004790.1-201ENST00000612686 536 ntBASIC16.52■□□□□ 0.24
TRNP1Q6NT89 AC105277.1-203ENST00000635492 1293 ntTSL 5 BASIC16.52■□□□□ 0.24
TRNP1Q6NT89 CACNA1A-214ENST00000614285 8410 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.52■□□□□ 0.24
TRNP1Q6NT89 HDAC8-209ENST00000373589 1740 ntTSL 2 BASIC16.52■□□□□ 0.24
TRNP1Q6NT89 MUTYH-209ENST00000448481 1706 ntTSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
TRNP1Q6NT89 COX6B2-201ENST00000326529 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.23
TRNP1Q6NT89 ZFAND5-205ENST00000376962 2785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.23
TRNP1Q6NT89 ACSM2B-207ENST00000565232 2322 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.52■□□□□ 0.23
TRNP1Q6NT89 ATP6V0E1-203ENST00000519374 1433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.23
TRNP1Q6NT89 HSPA12B-201ENST00000254963 3151 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.23
TRNP1Q6NT89 ZNF662-201ENST00000328199 3186 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.52■□□□□ 0.23
TRNP1Q6NT89 NCAPD2-201ENST00000315579 5548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.23
TRNP1Q6NT89 MYB-209ENST00000442647 3304 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.23
TRNP1Q6NT89 SNAPC1-201ENST00000216294 2656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.23
TRNP1Q6NT89 RDH10-201ENST00000240285 3949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
TRNP1Q6NT89 MC1R-202ENST00000555147 3099 ntAPPRIS P1 BASIC16.51■□□□□ 0.23
TRNP1Q6NT89 RBM33-205ENST00000392759 1580 ntTSL 5 BASIC16.51■□□□□ 0.23
TRNP1Q6NT89 HPSE-206ENST00000512196 1571 ntTSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
TRNP1Q6NT89 BSG-204ENST00000545507 1795 ntTSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
TRNP1Q6NT89 AMZ2P1-202ENST00000430983 3425 ntTSL 2 BASIC16.51■□□□□ 0.23
TRNP1Q6NT89 AC007182.1-201ENST00000455232 2159 ntTSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
TRNP1Q6NT89 PLCB2-201ENST00000260402 4616 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.51■□□□□ 0.23
TRNP1Q6NT89 PTGES3-202ENST00000414274 1547 ntTSL 2 BASIC16.51■□□□□ 0.23
TRNP1Q6NT89 SGSH-203ENST00000570923 1546 ntTSL 2 BASIC16.51■□□□□ 0.23
TRNP1Q6NT89 TSG101-204ENST00000536719 2101 ntTSL 5 BASIC16.51■□□□□ 0.23
TRNP1Q6NT89 LTF-203ENST00000426532 2494 ntTSL 2 BASIC16.51■□□□□ 0.23
TRNP1Q6NT89 CHRNG-202ENST00000389494 2262 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.51■□□□□ 0.23
TRNP1Q6NT89 CRY2-201ENST00000417225 2053 ntTSL 2 BASIC16.51■□□□□ 0.23
TRNP1Q6NT89 ACTL8-201ENST00000375406 1861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
TRNP1Q6NT89 AC073349.1-201ENST00000340779 1062 ntTSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
TRNP1Q6NT89 FAM19A3-202ENST00000369630 1282 ntTSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
TRNP1Q6NT89 AP001056.1-201ENST00000411956 821 ntTSL 3 BASIC16.51■□□□□ 0.23
TRNP1Q6NT89 XXYLT1-204ENST00000429994 865 ntTSL 3 BASIC16.51■□□□□ 0.23
TRNP1Q6NT89 LINC01160-202ENST00000450155 894 ntTSL 3 BASIC16.51■□□□□ 0.23
TRNP1Q6NT89 NSUN5P1-208ENST00000473960 500 ntTSL 3 BASIC16.51■□□□□ 0.23
TRNP1Q6NT89 SPDYE18-201ENST00000510091 1050 ntBASIC16.51■□□□□ 0.23
TRNP1Q6NT89 AC064807.1-203ENST00000520357 575 ntTSL 5 BASIC16.51■□□□□ 0.23
TRNP1Q6NT89 SLC1A4-205ENST00000531327 1217 ntTSL 2 BASIC16.51■□□□□ 0.23
TRNP1Q6NT89 AC040162.1-202ENST00000573493 573 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.51■□□□□ 0.23
TRNP1Q6NT89 AC243964.2-202ENST00000591312 752 ntTSL 2 BASIC16.51■□□□□ 0.23
TRNP1Q6NT89 AC008738.7-201ENST00000609744 511 ntBASIC16.51■□□□□ 0.23
TRNP1Q6NT89 AL136531.2-202ENST00000617804 573 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC16.51■□□□□ 0.23
TRNP1Q6NT89 HSPA4L-204ENST00000508776 3020 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.51■□□□□ 0.23
TRNP1Q6NT89 LINC00554-201ENST00000564841 3011 ntBASIC16.51■□□□□ 0.23
TRNP1Q6NT89 ANKS1A-201ENST00000360359 6347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
TRNP1Q6NT89 API5-202ENST00000420461 2009 ntTSL 2 BASIC16.51■□□□□ 0.23
TRNP1Q6NT89 MARK3-204ENST00000416682 2969 ntTSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
TRNP1Q6NT89 DTD2-202ENST00000356180 1400 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
TRNP1Q6NT89 AMHR2-202ENST00000379791 1437 ntTSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
TRNP1Q6NT89 PRICKLE1-211ENST00000639566 3341 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.51■□□□□ 0.23
TRNP1Q6NT89 LTBP4-205ENST00000396819 4764 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
TRNP1Q6NT89 AKT1-214ENST00000555528 3066 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
TRNP1Q6NT89 CDC42-203ENST00000400259 2274 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.5■□□□□ 0.23
TRNP1Q6NT89 TRIM13-204ENST00000420995 2607 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
TRNP1Q6NT89 SPRY1-207ENST00000610581 2608 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.5■□□□□ 0.23
TRNP1Q6NT89 ABTB1-206ENST00000468137 2065 ntTSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
TRNP1Q6NT89 UBA5-213ENST00000494238 2997 ntTSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
TRNP1Q6NT89 LDLR-204ENST00000545707 2429 ntTSL 2 BASIC16.5■□□□□ 0.23
TRNP1Q6NT89 MANBAL-204ENST00000397151 1503 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.5■□□□□ 0.23
TRNP1Q6NT89 MANBAL-205ENST00000397152 1539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
TRNP1Q6NT89 SHC3-202ENST00000375835 9768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
TRNP1Q6NT89 BBS5-201ENST00000295240 3475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
TRNP1Q6NT89 TMED7-TICAM2-202ENST00000333314 3453 ntTSL 2 BASIC16.5■□□□□ 0.23
TRNP1Q6NT89 TBRG4-201ENST00000258770 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
TRNP1Q6NT89 CDH1-202ENST00000422392 2567 ntTSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
TRNP1Q6NT89 NR2E3-204ENST00000621736 2032 ntTSL 2 BASIC16.5■□□□□ 0.23
TRNP1Q6NT89 MAPK7-201ENST00000299612 2715 ntTSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
TRNP1Q6NT89 PTBP1-202ENST00000350092 3069 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
TRNP1Q6NT89 HNRNPF-201ENST00000337970 2186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
TRNP1Q6NT89 PHYH-203ENST00000396920 1829 ntTSL 5 BASIC16.5■□□□□ 0.23
TRNP1Q6NT89 ZNF568-203ENST00000427117 1827 ntTSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
TRNP1Q6NT89 SYNM-202ENST00000336292 7394 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
TRNP1Q6NT89 DNASE2-201ENST00000222219 1955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
TRNP1Q6NT89 SLC18A1-207ENST00000519026 1980 ntTSL 5 BASIC16.5■□□□□ 0.23
TRNP1Q6NT89 SEC14L4-204ENST00000381982 1603 ntTSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
TRNP1Q6NT89 EPHX2-202ENST00000517536 1600 ntTSL 5 BASIC16.5■□□□□ 0.23
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 42.9 ms