Protein–RNA interactions for Protein: Q3LI58

KRTAP21-1, Keratin-associated protein 21-1, humanhuman

Predictions only

Length 79 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
KRTAP21-1Q3LI58 ECE2-201ENST00000324557 1823 ntTSL 1 (best) BASIC2.46□□□□□ -2.02
KRTAP21-1Q3LI58 ADAMTS7-201ENST00000388820 5490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.46□□□□□ -2.02
KRTAP21-1Q3LI58 UBE2I-207ENST00000406620 1842 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC2.46□□□□□ -2.02
KRTAP21-1Q3LI58 CDK2AP1-205ENST00000542174 1812 ntTSL 2 BASIC2.46□□□□□ -2.02
KRTAP21-1Q3LI58 HMOX2-217ENST00000619528 1829 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC2.46□□□□□ -2.02
KRTAP21-1Q3LI58 AL139300.1-201ENST00000472726 2505 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC2.46□□□□□ -2.02
KRTAP21-1Q3LI58 TMEM25-204ENST00000359862 2395 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC2.46□□□□□ -2.02
KRTAP21-1Q3LI58 EGFLAM-204ENST00000397202 2398 ntTSL 1 (best) BASIC2.46□□□□□ -2.02
KRTAP21-1Q3LI58 AC009053.1-204ENST00000429810 2355 ntTSL 2 BASIC2.46□□□□□ -2.02
KRTAP21-1Q3LI58 SIGLEC5-201ENST00000534261 2360 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC2.46□□□□□ -2.02
KRTAP21-1Q3LI58 KCNAB2-219ENST00000602612 2396 ntTSL 2 BASIC2.46□□□□□ -2.02
KRTAP21-1Q3LI58 SPRY1-208ENST00000622283 2352 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC2.46□□□□□ -2.02
KRTAP21-1Q3LI58 GRB10-201ENST00000335866 5032 ntTSL 1 (best) BASIC2.46□□□□□ -2.02
KRTAP21-1Q3LI58 SMARCD3-202ENST00000356800 1669 ntTSL 1 (best) BASIC2.46□□□□□ -2.02
KRTAP21-1Q3LI58 ACVR1B-202ENST00000415850 1665 ntTSL 2 BASIC2.46□□□□□ -2.02
KRTAP21-1Q3LI58 JOSD1-201ENST00000216039 3648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.46□□□□□ -2.02
KRTAP21-1Q3LI58 OFD1-201ENST00000340096 3611 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC2.46□□□□□ -2.02
KRTAP21-1Q3LI58 EHD1-202ENST00000359393 3618 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC2.46□□□□□ -2.02
KRTAP21-1Q3LI58 RNF145-202ENST00000424310 3613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.46□□□□□ -2.02
KRTAP21-1Q3LI58 COBLL1-201ENST00000342193 4898 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC2.46□□□□□ -2.02
KRTAP21-1Q3LI58 BTNL8-201ENST00000231229 2229 ntTSL 1 (best) BASIC2.46□□□□□ -2.02
KRTAP21-1Q3LI58 LAPTM5-201ENST00000294507 2223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.46□□□□□ -2.02
KRTAP21-1Q3LI58 HTR3A-203ENST00000375498 2235 ntTSL 1 (best) BASIC2.46□□□□□ -2.02
KRTAP21-1Q3LI58 CNNM1-201ENST00000356713 5959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.46□□□□□ -2.02
KRTAP21-1Q3LI58 HNRNPUL2-BSCL2-201ENST00000403734 4001 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC2.46□□□□□ -2.02
KRTAP21-1Q3LI58 PRKN-202ENST00000366892 1505 ntTSL 5 BASIC2.46□□□□□ -2.02
KRTAP21-1Q3LI58 LITAF-202ENST00000381810 1527 ntTSL 5 BASIC2.46□□□□□ -2.02
KRTAP21-1Q3LI58 STEAP1B-201ENST00000404369 1515 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC2.46□□□□□ -2.02
KRTAP21-1Q3LI58 CXorf40A-208ENST00000434353 1524 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC2.46□□□□□ -2.02
KRTAP21-1Q3LI58 AL390860.1-201ENST00000449298 1541 ntTSL 1 (best) BASIC2.46□□□□□ -2.02
KRTAP21-1Q3LI58 AL589669.1-201ENST00000639829 1506 ntTSL 5 BASIC2.46□□□□□ -2.02
KRTAP21-1Q3LI58 GABRA1-201ENST00000023897 2083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.46□□□□□ -2.02
KRTAP21-1Q3LI58 LILRB3-201ENST00000245620 2066 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC2.46□□□□□ -2.02
KRTAP21-1Q3LI58 AGAP7P-201ENST00000582299 2062 ntBASIC2.46□□□□□ -2.02
KRTAP21-1Q3LI58 AL022323.5-201ENST00000624101 2059 ntBASIC2.46□□□□□ -2.02
KRTAP21-1Q3LI58 SIM2-201ENST00000290399 4442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.46□□□□□ -2.02
KRTAP21-1Q3LI58 RGL4-209ENST00000612432 2649 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC2.46□□□□□ -2.02
KRTAP21-1Q3LI58 MGAT1-205ENST00000446023 3175 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC2.46□□□□□ -2.02
KRTAP21-1Q3LI58 AC004943.2-201ENST00000563328 4842 ntTSL 3 BASIC2.46□□□□□ -2.02
KRTAP21-1Q3LI58 EIF5-201ENST00000216554 5945 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.46□□□□□ -2.02
KRTAP21-1Q3LI58 PGRMC1-201ENST00000217971 1911 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.46□□□□□ -2.02
KRTAP21-1Q3LI58 PNKD-203ENST00000273077 3021 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC2.46□□□□□ -2.02
KRTAP21-1Q3LI58 SAFB-201ENST00000292123 3042 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC2.46□□□□□ -2.02
KRTAP21-1Q3LI58 ZNF420-201ENST00000304239 1945 ntTSL 2 BASIC2.46□□□□□ -2.02
KRTAP21-1Q3LI58 ZBTB33-201ENST00000326624 5211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.46□□□□□ -2.02
KRTAP21-1Q3LI58 CSF1-203ENST00000369801 1364 ntTSL 1 (best) BASIC2.46□□□□□ -2.02
KRTAP21-1Q3LI58 ELL2P1-201ENST00000413990 1906 ntBASIC2.46□□□□□ -2.02
KRTAP21-1Q3LI58 SLC12A9-202ENST00000415287 1912 ntTSL 1 (best) BASIC2.46□□□□□ -2.02
KRTAP21-1Q3LI58 ABAT-203ENST00000425191 1923 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC2.46□□□□□ -2.02
KRTAP21-1Q3LI58 B9D1-209ENST00000477478 1353 ntTSL 3 BASIC2.46□□□□□ -2.02
KRTAP21-1Q3LI58 CNTN1-203ENST00000547702 3033 ntTSL 2 BASIC2.46□□□□□ -2.02
KRTAP21-1Q3LI58 AC233702.3-201ENST00000578656 1387 ntBASIC2.46□□□□□ -2.02
KRTAP21-1Q3LI58 AKR1A1-214ENST00000621846 1360 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC2.46□□□□□ -2.02
KRTAP21-1Q3LI58 AC002310.6-201ENST00000624451 1377 ntBASIC2.46□□□□□ -2.02
KRTAP21-1Q3LI58 AMT-239ENST00000636865 1914 ntTSL 5 BASIC2.46□□□□□ -2.02
KRTAP21-1Q3LI58 USP25-201ENST00000285679 3973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.46□□□□□ -2.02
KRTAP21-1Q3LI58 PCDHB5-201ENST00000231134 3408 ntAPPRIS P1 BASIC2.46□□□□□ -2.02
KRTAP21-1Q3LI58 DAGLB-201ENST00000297056 2897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.46□□□□□ -2.02
KRTAP21-1Q3LI58 LTBP4-203ENST00000308370 4948 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC2.46□□□□□ -2.02
KRTAP21-1Q3LI58 SMAD6-201ENST00000288840 3835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.46□□□□□ -2.02
KRTAP21-1Q3LI58 ACVR1C-204ENST00000409680 1786 ntTSL 1 (best) BASIC2.46□□□□□ -2.02
KRTAP21-1Q3LI58 C9orf152-201ENST00000400613 2717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.46□□□□□ -2.02
KRTAP21-1Q3LI58 C3orf20-202ENST00000412910 2744 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC2.46□□□□□ -2.02
KRTAP21-1Q3LI58 FFAR4-202ENST00000371483 3653 ntTSL 1 (best) BASIC2.46□□□□□ -2.02
KRTAP21-1Q3LI58 ATP2C1-224ENST00000533801 3690 ntTSL 1 (best) BASIC2.46□□□□□ -2.02
KRTAP21-1Q3LI58 ASTN2-205ENST00000361209 4622 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC2.46□□□□□ -2.02
KRTAP21-1Q3LI58 CCDC144B-202ENST00000445752 2197 ntTSL 2 BASIC2.46□□□□□ -2.02
KRTAP21-1Q3LI58 MTSS1-216ENST00000524090 2166 ntTSL 2 BASIC2.46□□□□□ -2.02
KRTAP21-1Q3LI58 TJAP1-207ENST00000436109 2572 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC2.46□□□□□ -2.02
KRTAP21-1Q3LI58 AC004223.3-201ENST00000593039 1638 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC2.46□□□□□ -2.02
KRTAP21-1Q3LI58 ZW10-201ENST00000200135 2992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.46□□□□□ -2.02
KRTAP21-1Q3LI58 PIDD1-201ENST00000347755 2998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.46□□□□□ -2.02
KRTAP21-1Q3LI58 ABCG1-205ENST00000398449 2998 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC2.46□□□□□ -2.02
KRTAP21-1Q3LI58 GPRC5B-209ENST00000569479 2984 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC2.46□□□□□ -2.02
KRTAP21-1Q3LI58 CCDC40-202ENST00000374876 2010 ntTSL 1 (best) BASIC2.46□□□□□ -2.02
KRTAP21-1Q3LI58 MLPH-203ENST00000409373 2031 ntTSL 1 (best) BASIC2.46□□□□□ -2.02
KRTAP21-1Q3LI58 NR4A1-213ENST00000550082 2029 ntTSL 5 BASIC2.46□□□□□ -2.02
KRTAP21-1Q3LI58 RNPS1-220ENST00000566458 2037 ntTSL 1 (best) BASIC2.46□□□□□ -2.02
KRTAP21-1Q3LI58 FAM156A-221ENST00000622447 3757 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC2.46□□□□□ -2.02
KRTAP21-1Q3LI58 FAM189A2-201ENST00000257515 2423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.46□□□□□ -2.02
KRTAP21-1Q3LI58 LGALS8-203ENST00000341872 2437 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC2.46□□□□□ -2.02
KRTAP21-1Q3LI58 ANO10-203ENST00000396091 2419 ntTSL 2 BASIC2.46□□□□□ -2.02
KRTAP21-1Q3LI58 AC004241.5-201ENST00000623870 2448 ntBASIC2.46□□□□□ -2.02
KRTAP21-1Q3LI58 AC020658.7-201ENST00000624274 2442 ntBASIC2.46□□□□□ -2.02
KRTAP21-1Q3LI58 TKT-203ENST00000423525 2831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.46□□□□□ -2.02
KRTAP21-1Q3LI58 GGA1-206ENST00000406772 3205 ntTSL 2 BASIC2.46□□□□□ -2.02
KRTAP21-1Q3LI58 FAM117B-201ENST00000392238 5763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.46□□□□□ -2.02
KRTAP21-1Q3LI58 EEF1AKMT2-201ENST00000368836 1462 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.45□□□□□ -2.02
KRTAP21-1Q3LI58 SLC25A19-202ENST00000375261 1486 ntTSL 5 BASIC2.45□□□□□ -2.02
KRTAP21-1Q3LI58 BPIFB3-201ENST00000375494 1454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.45□□□□□ -2.02
KRTAP21-1Q3LI58 PSMC5-202ENST00000375812 1494 ntTSL 2 BASIC2.45□□□□□ -2.02
KRTAP21-1Q3LI58 TSC22D4-202ENST00000393991 1469 ntTSL 2 BASIC2.45□□□□□ -2.02
KRTAP21-1Q3LI58 LETM2-208ENST00000524874 1459 ntTSL 5 BASIC2.45□□□□□ -2.02
KRTAP21-1Q3LI58 KRT13-208ENST00000587544 1456 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC2.45□□□□□ -2.02
KRTAP21-1Q3LI58 CCNA1-201ENST00000255465 1879 ntTSL 1 (best) BASIC2.45□□□□□ -2.02
KRTAP21-1Q3LI58 POC1A-201ENST00000296484 1898 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC2.45□□□□□ -2.02
KRTAP21-1Q3LI58 SLC2A9-202ENST00000309065 1866 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC2.45□□□□□ -2.02
KRTAP21-1Q3LI58 SCP2-201ENST00000371509 1889 ntTSL 1 (best) BASIC2.45□□□□□ -2.02
KRTAP21-1Q3LI58 FAM230B-201ENST00000415376 1859 ntTSL 2 BASIC2.45□□□□□ -2.02
KRTAP21-1Q3LI58 AC008079.1-201ENST00000434390 1859 ntTSL 5 BASIC2.45□□□□□ -2.02
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 30.3 ms