Protein–RNA interactions for Protein: Q15413

RYR3, Ryanodine receptor 3, humanhuman

Predictions only

Length 4,870 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RYR3Q15413 AL391119.1-201ENST00000416563 271 ntTSL 5 BASIC10.29□□□□□ -0.76
RYR3Q15413 HMGA1P2-201ENST00000430198 324 ntBASIC10.29□□□□□ -0.76
RYR3Q15413 AL035413.1-201ENST00000437898 507 ntTSL 2 BASIC10.29□□□□□ -0.76
RYR3Q15413 AC093627.2-201ENST00000497017 568 ntTSL 4 BASIC10.29□□□□□ -0.76
RYR3Q15413 AC093510.1-202ENST00000546238 442 ntTSL 3 BASIC10.29□□□□□ -0.76
RYR3Q15413 AC078814.4-201ENST00000546650 327 ntBASIC10.29□□□□□ -0.76
RYR3Q15413 TROAP-209ENST00000549275 348 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC10.29□□□□□ -0.76
RYR3Q15413 TROAP-210ENST00000549534 839 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC10.29□□□□□ -0.76
RYR3Q15413 AC093503.1-201ENST00000593888 495 ntTSL 3 BASIC10.29□□□□□ -0.76
RYR3Q15413 AL136040.2-201ENST00000618431 1130 ntTSL 1 (best) BASIC10.29□□□□□ -0.76
RYR3Q15413 KRTAP10-4-203ENST00000622352 1244 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.29□□□□□ -0.76
RYR3Q15413 SNRNP27-202ENST00000409116 1339 ntTSL 5 BASIC10.29□□□□□ -0.76
RYR3Q15413 XRCC1-202ENST00000543982 1994 ntTSL 2 BASIC10.29□□□□□ -0.76
RYR3Q15413 SLC43A2-202ENST00000412517 1658 ntTSL 2 BASIC10.29□□□□□ -0.76
RYR3Q15413 PMPCB-202ENST00000428154 1714 ntTSL 1 (best) BASIC10.29□□□□□ -0.76
RYR3Q15413 ZNRD1-204ENST00000376785 754 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.29□□□□□ -0.76
RYR3Q15413 OR10N1P-201ENST00000392758 869 ntBASIC10.29□□□□□ -0.76
RYR3Q15413 CHTF8-202ENST00000398235 1073 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.29□□□□□ -0.76
RYR3Q15413 LAMA4-208ENST00000431543 1080 ntTSL 1 (best) BASIC10.29□□□□□ -0.76
RYR3Q15413 AC027612.2-202ENST00000445955 1199 ntBASIC10.29□□□□□ -0.76
RYR3Q15413 GPX3-202ENST00000517973 612 ntTSL 3 BASIC10.29□□□□□ -0.76
RYR3Q15413 CACNA1C-IT3-201ENST00000542680 622 ntTSL 3 BASIC10.29□□□□□ -0.76
RYR3Q15413 ANKRD20A21P-201ENST00000611282 517 ntTSL 1 (best) BASIC10.29□□□□□ -0.76
RYR3Q15413 LINC01451-201ENST00000623792 534 ntBASIC10.29□□□□□ -0.76
RYR3Q15413 AC044802.1-201ENST00000501143 2894 ntTSL 1 (best) BASIC10.29□□□□□ -0.76
RYR3Q15413 PDZD3-202ENST00000355547 2252 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.29□□□□□ -0.76
RYR3Q15413 MSR1-201ENST00000262101 2132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.29□□□□□ -0.76
RYR3Q15413 SPAAR-203ENST00000636776 1538 ntAPPRIS P1 BASIC10.29□□□□□ -0.76
RYR3Q15413 EEF1D-205ENST00000442189 2207 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC10.29□□□□□ -0.76
RYR3Q15413 C11orf16-201ENST00000326053 1908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.29□□□□□ -0.76
RYR3Q15413 FNBP1-201ENST00000355681 1977 ntTSL 2 BASIC10.29□□□□□ -0.76
RYR3Q15413 RIC8B-213ENST00000638198 1611 ntTSL 5 BASIC10.29□□□□□ -0.76
RYR3Q15413 TSPY25P-201ENST00000429463 745 ntBASIC10.29□□□□□ -0.76
RYR3Q15413 AL355537.2-201ENST00000453367 375 ntTSL 2 BASIC10.29□□□□□ -0.76
RYR3Q15413 PHKG1P2-201ENST00000457537 863 ntBASIC10.29□□□□□ -0.76
RYR3Q15413 HLA-J-204ENST00000495278 958 ntBASIC10.29□□□□□ -0.76
RYR3Q15413 LINC01598-205ENST00000508763 719 ntTSL 5 BASIC10.29□□□□□ -0.76
RYR3Q15413 ACTN1-AS1-202ENST00000553961 599 ntTSL 4 BASIC10.29□□□□□ -0.76
RYR3Q15413 LINC01229-201ENST00000561510 1494 ntTSL 5 BASIC10.29□□□□□ -0.76
RYR3Q15413 LETM2-201ENST00000297720 1693 ntTSL 2 BASIC10.29□□□□□ -0.76
RYR3Q15413 HOTTIP-202ENST00000472494 2285 ntTSL 2 BASIC10.29□□□□□ -0.76
RYR3Q15413 PCGF1-201ENST00000233630 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.29□□□□□ -0.76
RYR3Q15413 BRMS1-201ENST00000359957 1445 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.29□□□□□ -0.76
RYR3Q15413 CPNE7-201ENST00000268720 2657 ntTSL 1 (best) BASIC10.29□□□□□ -0.76
RYR3Q15413 CELF2-206ENST00000608830 1892 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC10.29□□□□□ -0.76
RYR3Q15413 AC133963.1-201ENST00000504166 1679 ntBASIC10.29□□□□□ -0.76
RYR3Q15413 TMSB15A-201ENST00000289373 685 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.29□□□□□ -0.76
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RYR3Q15413 SELENOW-212ENST00000601048 888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.29□□□□□ -0.76
RYR3Q15413 SIGLEC18P-201ENST00000602271 909 ntBASIC10.29□□□□□ -0.76
RYR3Q15413 RAB17-201ENST00000264601 1966 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.29□□□□□ -0.76
RYR3Q15413 GTF2H2C-201ENST00000380729 1803 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.29□□□□□ -0.76
RYR3Q15413 C16orf45-209ENST00000566490 1854 ntTSL 5 BASIC10.28□□□□□ -0.76
RYR3Q15413 AL355312.1-201ENST00000407115 2176 ntBASIC10.28□□□□□ -0.76
RYR3Q15413 CCL24-202ENST00000416943 585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.28□□□□□ -0.76
RYR3Q15413 AP000358.1-201ENST00000456260 156 ntBASIC10.28□□□□□ -0.76
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RYR3Q15413 AC044839.1-204ENST00000634777 1058 ntTSL 5 BASIC10.28□□□□□ -0.76
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RYR3Q15413 CYP21A2-221ENST00000418967 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.28□□□□□ -0.76
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RYR3Q15413 EIF4E3-201ENST00000295612 2764 ntTSL 1 (best) BASIC10.28□□□□□ -0.76
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RYR3Q15413 MRPL23-204ENST00000397297 613 ntTSL 2 BASIC10.28□□□□□ -0.76
RYR3Q15413 RN7SKP109-201ENST00000410592 316 ntBASIC10.28□□□□□ -0.76
RYR3Q15413 AP001062.3-202ENST00000444409 619 ntTSL 2 BASIC10.28□□□□□ -0.76
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RYR3Q15413 EVPLL-201ENST00000399134 2095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.28□□□□□ -0.76
RYR3Q15413 CORO1C-204ENST00000541050 2487 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.28□□□□□ -0.76
RYR3Q15413 SARAF-201ENST00000256255 2154 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.28□□□□□ -0.76
RYR3Q15413 CCDC40-202ENST00000374876 2010 ntTSL 1 (best) BASIC10.28□□□□□ -0.76
RYR3Q15413 KRTAP1-3-201ENST00000344363 972 ntAPPRIS P1 BASIC10.28□□□□□ -0.76
RYR3Q15413 NCR3-202ENST00000376071 541 ntTSL 5 BASIC10.28□□□□□ -0.76
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RYR3Q15413 LINC00483-202ENST00000419688 558 ntTSL 3 BASIC10.28□□□□□ -0.76
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RYR3Q15413 AC009119.3-202ENST00000566773 196 ntTSL 3 BASIC10.28□□□□□ -0.76
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RYR3Q15413 HIC1-202ENST00000399849 3156 ntTSL 1 (best) BASIC10.28□□□□□ -0.76
RYR3Q15413 CYP2A7-201ENST00000291764 2128 ntTSL 5 BASIC10.28□□□□□ -0.76
RYR3Q15413 AK1-203ENST00000373176 2266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.28□□□□□ -0.76
RYR3Q15413 SNX16-201ENST00000345957 1853 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.28□□□□□ -0.76
RYR3Q15413 CRYGC-201ENST00000282141 629 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.28□□□□□ -0.76
RYR3Q15413 MIR1301-201ENST00000408518 82 ntBASIC10.28□□□□□ -0.76
RYR3Q15413 AC010141.1-201ENST00000411585 623 ntBASIC10.28□□□□□ -0.76
RYR3Q15413 AC126696.1-201ENST00000561567 756 ntTSL 3 BASIC10.28□□□□□ -0.76
RYR3Q15413 SNRPD2-206ENST00000588301 702 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC10.28□□□□□ -0.76
RYR3Q15413 TMEM250-205ENST00000561457 2804 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.28□□□□□ -0.76
RYR3Q15413 HSD17B7P2-202ENST00000494540 1401 ntTSL 1 (best) BASIC10.28□□□□□ -0.76
RYR3Q15413 ARFGAP3-201ENST00000263245 2857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.28□□□□□ -0.76
RYR3Q15413 KCTD6-202ENST00000404589 1533 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.28□□□□□ -0.76
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