Protein–RNA interactions for Protein: Q13748

TUBA3C, Tubulin alpha-3C/D chain, humanhuman

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Length 450 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TUBA3CQ13748 OSR2-209ENST00000522510 1528 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.33■□□□□ 0.05
TUBA3CQ13748 SSFA2-202ENST00000409001 4987 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.05
TUBA3CQ13748 PRKD2-201ENST00000291281 3070 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.05
TUBA3CQ13748 CHCHD3-201ENST00000262570 1598 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.05
TUBA3CQ13748 PLAA-205ENST00000520884 2041 ntTSL 2 BASIC15.33■□□□□ 0.04
TUBA3CQ13748 RRM1-214ENST00000534285 2075 ntTSL 5 BASIC15.33■□□□□ 0.04
TUBA3CQ13748 KCTD14-201ENST00000353172 1691 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
TUBA3CQ13748 SNHG11-201ENST00000359074 1031 ntTSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
TUBA3CQ13748 NKAIN2-201ENST00000368416 1106 ntTSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
TUBA3CQ13748 MAPK15-202ENST00000395107 834 ntTSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
TUBA3CQ13748 RPL30-202ENST00000396070 440 ntTSL 2 BASIC15.33■□□□□ 0.04
TUBA3CQ13748 PLA2G16-203ENST00000415826 1099 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.33■□□□□ 0.04
TUBA3CQ13748 ARHGAP11B-201ENST00000428041 1017 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
TUBA3CQ13748 GPS2P2-201ENST00000430745 888 ntBASIC15.33■□□□□ 0.04
TUBA3CQ13748 BAALC-AS2-201ENST00000436771 496 ntTSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
TUBA3CQ13748 RBPMS2P1-201ENST00000437762 623 ntBASIC15.33■□□□□ 0.04
TUBA3CQ13748 LAMTOR4-206ENST00000473459 720 ntTSL 2 BASIC15.33■□□□□ 0.04
TUBA3CQ13748 AL391335.1-201ENST00000504583 535 ntTSL 4 BASIC15.33■□□□□ 0.04
TUBA3CQ13748 VPS29-207ENST00000549970 818 ntTSL 3 BASIC15.33■□□□□ 0.04
TUBA3CQ13748 AC138304.1-201ENST00000563841 424 ntTSL 3 BASIC15.33■□□□□ 0.04
TUBA3CQ13748 AC015911.4-201ENST00000588022 1070 ntBASIC15.33■□□□□ 0.04
TUBA3CQ13748 AC021097.1-201ENST00000607902 574 ntBASIC15.33■□□□□ 0.04
TUBA3CQ13748 AC243571.2-201ENST00000615265 628 ntTSL 3 BASIC15.33■□□□□ 0.04
TUBA3CQ13748 GAK-222ENST00000618573 1248 ntTSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
TUBA3CQ13748 NNAT-201ENST00000062104 1297 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
TUBA3CQ13748 PLA2G16-206ENST00000639271 957 ntTSL 5 BASIC15.33■□□□□ 0.04
TUBA3CQ13748 GPM6A-210ENST00000506894 2614 ntTSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
TUBA3CQ13748 MVB12B-201ENST00000361171 4819 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.33■□□□□ 0.04
TUBA3CQ13748 SYT17-201ENST00000355377 3081 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
TUBA3CQ13748 RAB3IP-207ENST00000483530 1755 ntTSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
TUBA3CQ13748 TRIP10-210ENST00000600428 2249 ntTSL 5 BASIC15.33■□□□□ 0.04
TUBA3CQ13748 GPR161-204ENST00000367838 2676 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
TUBA3CQ13748 WDR74-206ENST00000529106 1366 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.33■□□□□ 0.04
TUBA3CQ13748 ZNF252P-AS1-201ENST00000527067 3236 ntBASIC15.33■□□□□ 0.04
TUBA3CQ13748 HGSNAT-207ENST00000521576 2332 ntTSL 2 BASIC15.33■□□□□ 0.04
TUBA3CQ13748 CACNA1A-238ENST00000637276 7135 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.33■□□□□ 0.04
TUBA3CQ13748 CALD1-204ENST00000417172 1915 ntTSL 5 BASIC15.33■□□□□ 0.04
TUBA3CQ13748 SHISA6-202ENST00000409168 7262 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
TUBA3CQ13748 DNAH14-206ENST00000400952 1984 ntTSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
TUBA3CQ13748 CCDC85A-201ENST00000407595 3982 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
TUBA3CQ13748 TBCD-202ENST00000539345 3975 ntTSL 5 BASIC15.33■□□□□ 0.04
TUBA3CQ13748 RER1-209ENST00000605895 3044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
TUBA3CQ13748 NDUFV1-216ENST00000529927 1503 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
TUBA3CQ13748 RPS5-202ENST00000596046 1520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
TUBA3CQ13748 MC1R-202ENST00000555147 3099 ntAPPRIS P1 BASIC15.32■□□□□ 0.04
TUBA3CQ13748 SLC25A36-203ENST00000446041 4638 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.32■□□□□ 0.04
TUBA3CQ13748 NPY5R-203ENST00000515560 3183 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.32■□□□□ 0.04
TUBA3CQ13748 ZNF398-203ENST00000483892 2121 ntTSL 5 BASIC15.32■□□□□ 0.04
TUBA3CQ13748 GABARAPL1-205ENST00000539170 1700 ntTSL 3 BASIC15.32■□□□□ 0.04
TUBA3CQ13748 PSMD9-201ENST00000261817 2307 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC15.32■□□□□ 0.04
TUBA3CQ13748 ZNF804B-201ENST00000333190 4659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
TUBA3CQ13748 KRT35-201ENST00000246639 1778 ntTSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
TUBA3CQ13748 NPM1-201ENST00000296930 1758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
TUBA3CQ13748 GPSM1-205ENST00000440944 3633 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.32■□□□□ 0.04
TUBA3CQ13748 GCK-202ENST00000345378 2421 ntTSL 2 BASIC15.32■□□□□ 0.04
TUBA3CQ13748 NCOA1-205ENST00000406961 7289 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC15.32■□□□□ 0.04
TUBA3CQ13748 SCP2-201ENST00000371509 1889 ntTSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
TUBA3CQ13748 SP100-204ENST00000409341 1898 ntTSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
TUBA3CQ13748 MRGPRD-201ENST00000309106 966 ntAPPRIS P1 BASIC15.32■□□□□ 0.04
TUBA3CQ13748 TPM2-201ENST00000329305 1018 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC15.32■□□□□ 0.04
TUBA3CQ13748 SUMO1-201ENST00000392244 831 ntTSL 2 BASIC15.32■□□□□ 0.04
TUBA3CQ13748 SUMO1-209ENST00000409712 761 ntTSL 2 BASIC15.32■□□□□ 0.04
TUBA3CQ13748 CNN2P2-201ENST00000443536 909 ntBASIC15.32■□□□□ 0.04
TUBA3CQ13748 CNN2P3-201ENST00000450201 906 ntBASIC15.32■□□□□ 0.04
TUBA3CQ13748 AC067863.1-201ENST00000494933 530 ntBASIC15.32■□□□□ 0.04
TUBA3CQ13748 TIMM17B-208ENST00000495490 939 ntTSL 5 BASIC15.32■□□□□ 0.04
TUBA3CQ13748 APBB2-208ENST00000504305 1274 ntTSL 5 BASIC15.32■□□□□ 0.04
TUBA3CQ13748 WDR25-203ENST00000542471 1214 ntTSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
TUBA3CQ13748 AL512356.2-201ENST00000546955 174 ntBASIC15.32■□□□□ 0.04
TUBA3CQ13748 LINC01481-203ENST00000549651 883 ntTSL 2 BASIC15.32■□□□□ 0.04
TUBA3CQ13748 COX5A-203ENST00000564811 568 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
TUBA3CQ13748 WNT1-202ENST00000613114 1278 ntTSL 5 BASIC15.32■□□□□ 0.04
TUBA3CQ13748 AL136317.3-201ENST00000618497 906 ntBASIC15.32■□□□□ 0.04
TUBA3CQ13748 AP001059.3-201ENST00000619053 235 ntBASIC15.32■□□□□ 0.04
TUBA3CQ13748 AC008267.7-201ENST00000624570 1194 ntBASIC15.32■□□□□ 0.04
TUBA3CQ13748 STARD3NL-204ENST00000434197 1341 ntTSL 5 BASIC15.32■□□□□ 0.04
TUBA3CQ13748 LRCH1-202ENST00000389797 3314 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
TUBA3CQ13748 CDCP2-201ENST00000371330 2723 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC15.32■□□□□ 0.04
TUBA3CQ13748 AC009242.1-201ENST00000634300 2706 ntTSL 5 BASIC15.32■□□□□ 0.04
TUBA3CQ13748 TSSK3-201ENST00000373534 1368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
TUBA3CQ13748 CICP13-201ENST00000422015 2789 ntBASIC15.32■□□□□ 0.04
TUBA3CQ13748 POLR2J4-203ENST00000326391 1422 ntTSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
TUBA3CQ13748 NELFA-203ENST00000411638 2199 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
TUBA3CQ13748 SALL3-206ENST00000616649 2958 ntTSL 5 BASIC15.32■□□□□ 0.04
TUBA3CQ13748 IL12RB2-206ENST00000544434 3782 ntTSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
TUBA3CQ13748 RGN-203ENST00000397180 2257 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.32■□□□□ 0.04
TUBA3CQ13748 RBFOX1-205ENST00000436368 1530 ntTSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
TUBA3CQ13748 BX276092.9-201ENST00000636797 1563 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.32■□□□□ 0.04
TUBA3CQ13748 GLMP-201ENST00000362007 1604 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
TUBA3CQ13748 CDIP1-207ENST00000564828 1636 ntTSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
TUBA3CQ13748 HOXA5-201ENST00000222726 1657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
TUBA3CQ13748 UBAC2-202ENST00000376440 2525 ntTSL 2 BASIC15.32■□□□□ 0.04
TUBA3CQ13748 PCK2-203ENST00000545054 2505 ntTSL 2 BASIC15.32■□□□□ 0.04
TUBA3CQ13748 SNX6-202ENST00000396526 3398 ntTSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
TUBA3CQ13748 GGT4P-201ENST00000623672 1708 ntBASIC15.31■□□□□ 0.04
TUBA3CQ13748 FMR1-203ENST00000370470 1774 ntTSL 5 BASIC15.31■□□□□ 0.04
TUBA3CQ13748 PDCD5-203ENST00000419343 1799 ntTSL 2 BASIC15.31■□□□□ 0.04
TUBA3CQ13748 GLIDR-204ENST00000638724 1765 ntTSL 5 BASIC15.31■□□□□ 0.04
TUBA3CQ13748 AC092198.1-201ENST00000447651 2691 ntTSL 2 BASIC15.31■□□□□ 0.04
TUBA3CQ13748 RNF150-201ENST00000306799 4535 ntTSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
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