Protein–RNA interactions for Protein: Q13185

CBX3, Chromobox protein homolog 3, humanhuman

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Length 183 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CBX3Q13185 FIG4-201ENST00000230124 3011 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.36□□□□□ -0.11
CBX3Q13185 DYRK3-201ENST00000367106 2329 ntTSL 1 (best) BASIC14.36□□□□□ -0.11
CBX3Q13185 CSNK1D-202ENST00000314028 3712 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.36□□□□□ -0.11
CBX3Q13185 CCNB1-201ENST00000256442 2169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.36□□□□□ -0.11
CBX3Q13185 CNN2-201ENST00000263097 2179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.36□□□□□ -0.11
CBX3Q13185 CNN2-205ENST00000562958 2194 ntTSL 2 BASIC14.36□□□□□ -0.11
CBX3Q13185 RAI2-203ENST00000415486 2037 ntTSL 2 BASIC14.36□□□□□ -0.11
CBX3Q13185 ADAMTSL1-202ENST00000327883 1864 ntTSL 1 (best) BASIC14.36□□□□□ -0.11
CBX3Q13185 P2RY1-201ENST00000305097 6747 ntAPPRIS P1 BASIC14.36□□□□□ -0.11
CBX3Q13185 PLTP-203ENST00000372431 1743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.36□□□□□ -0.11
CBX3Q13185 TOM1L2-207ENST00000535933 1748 ntTSL 2 BASIC14.36□□□□□ -0.11
CBX3Q13185 TVP23C-CDRT4-203ENST00000522212 2833 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.36□□□□□ -0.11
CBX3Q13185 PPME1-201ENST00000328257 2677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.36□□□□□ -0.11
CBX3Q13185 AL512306.2-201ENST00000444037 2219 ntTSL 2 BASIC14.36□□□□□ -0.11
CBX3Q13185 PYDC1-201ENST00000302964 813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.36□□□□□ -0.11
CBX3Q13185 PIEZO1-202ENST00000327397 1246 ntTSL 2 BASIC14.36□□□□□ -0.11
CBX3Q13185 NDUFA1-201ENST00000371437 766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.36□□□□□ -0.11
CBX3Q13185 COMTD1-201ENST00000372538 976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.36□□□□□ -0.11
CBX3Q13185 PLCB1-204ENST00000404098 1260 ntTSL 3 BASIC14.36□□□□□ -0.11
CBX3Q13185 AC092597.1-201ENST00000487352 616 ntBASIC14.36□□□□□ -0.11
CBX3Q13185 GUSBP12-201ENST00000513727 720 ntBASIC14.36□□□□□ -0.11
CBX3Q13185 TMEM64-204ENST00000519519 873 ntTSL 1 (best) BASIC14.36□□□□□ -0.11
CBX3Q13185 MOK-234ENST00000524370 1165 ntTSL 1 (best) BASIC14.36□□□□□ -0.11
CBX3Q13185 ULK4P3-205ENST00000568486 1158 ntTSL 1 (best) BASIC14.36□□□□□ -0.11
CBX3Q13185 DCTN5-208ENST00000568589 772 ntTSL 2 BASIC14.36□□□□□ -0.11
CBX3Q13185 TMED1-207ENST00000591695 809 ntTSL 5 BASIC14.36□□□□□ -0.11
CBX3Q13185 ZMIZ1-AS1-203ENST00000456353 2878 ntTSL 2 BASIC14.36□□□□□ -0.11
CBX3Q13185 ZNF786-202ENST00000491431 2874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.36□□□□□ -0.11
CBX3Q13185 DYNC1I2-203ENST00000409197 2572 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.36□□□□□ -0.11
CBX3Q13185 DYNC1I2-206ENST00000409773 2583 ntTSL 2 BASIC14.36□□□□□ -0.11
CBX3Q13185 STK32B-201ENST00000282908 3582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.36□□□□□ -0.11
CBX3Q13185 AC100830.1-201ENST00000560387 1609 ntTSL 2 BASIC14.36□□□□□ -0.11
CBX3Q13185 WTAP-205ENST00000614346 1623 ntTSL 2 BASIC14.36□□□□□ -0.11
CBX3Q13185 TNRC18-203ENST00000399537 10572 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.36□□□□□ -0.11
CBX3Q13185 TNRC18-205ENST00000430969 10562 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.36□□□□□ -0.11
CBX3Q13185 FUK-201ENST00000288078 4081 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.36□□□□□ -0.11
CBX3Q13185 HDAC11-213ENST00000437379 2766 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.36□□□□□ -0.11
CBX3Q13185 IFNLR1-205ENST00000374421 1476 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.36□□□□□ -0.11
CBX3Q13185 GNPDA1-204ENST00000503794 2622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.36□□□□□ -0.11
CBX3Q13185 EIF5A-204ENST00000416016 1336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.36□□□□□ -0.11
CBX3Q13185 ARFIP2-204ENST00000445086 1300 ntTSL 2 BASIC14.36□□□□□ -0.11
CBX3Q13185 VPS37D-202ENST00000451519 1303 ntTSL 5 BASIC14.36□□□□□ -0.11
CBX3Q13185 APBB3-201ENST00000354402 1810 ntTSL 5 BASIC14.36□□□□□ -0.11
CBX3Q13185 OS9-206ENST00000435406 2346 ntTSL 2 BASIC14.36□□□□□ -0.11
CBX3Q13185 BRF1-203ENST00000379937 3314 ntTSL 1 (best) BASIC14.36□□□□□ -0.11
CBX3Q13185 EXOC3-201ENST00000315013 2682 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.36□□□□□ -0.11
CBX3Q13185 SLC52A3-205ENST00000632431 2694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.36□□□□□ -0.11
CBX3Q13185 PTGES3L-AARSD1-204ENST00000421990 2150 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.36□□□□□ -0.11
CBX3Q13185 WASHC2A-202ENST00000314664 4519 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.36□□□□□ -0.11
CBX3Q13185 MAGI1-218ENST00000621418 6225 ntTSL 1 (best) BASIC14.36□□□□□ -0.11
CBX3Q13185 TCAF1-205ENST00000479870 5733 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.36□□□□□ -0.11
CBX3Q13185 ZBTB49-201ENST00000337872 2889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.36□□□□□ -0.11
CBX3Q13185 SEC16A-202ENST00000290037 8982 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.36□□□□□ -0.11
CBX3Q13185 TBC1D3P5-201ENST00000579401 1545 ntBASIC14.36□□□□□ -0.11
CBX3Q13185 SREBF1-202ENST00000355815 4253 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.35□□□□□ -0.11
CBX3Q13185 CLEC4G-201ENST00000328853 1360 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.35□□□□□ -0.11
CBX3Q13185 UPP1-203ENST00000395564 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.35□□□□□ -0.11
CBX3Q13185 COX6B2-210ENST00000593184 2083 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.35□□□□□ -0.11
CBX3Q13185 RPS6KC1-207ENST00000543470 4227 ntTSL 2 BASIC14.35□□□□□ -0.11
CBX3Q13185 LARGE1-201ENST00000354992 4409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.35□□□□□ -0.11
CBX3Q13185 CD22-209ENST00000594250 2107 ntTSL 1 (best) BASIC14.35□□□□□ -0.11
CBX3Q13185 GRK6-202ENST00000355958 1789 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.35□□□□□ -0.11
CBX3Q13185 NFE2-202ENST00000435572 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.35□□□□□ -0.11
CBX3Q13185 RSBN1-204ENST00000612242 6592 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.35□□□□□ -0.11
CBX3Q13185 FGD2-201ENST00000274963 3046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.35□□□□□ -0.11
CBX3Q13185 ATP6V0A1-203ENST00000393829 3028 ntTSL 1 (best) BASIC14.35□□□□□ -0.11
CBX3Q13185 SDCBP2-201ENST00000339987 1404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.35□□□□□ -0.11
CBX3Q13185 SLCO4A1-AS1-202ENST00000433126 1420 ntTSL 1 (best) BASIC14.35□□□□□ -0.11
CBX3Q13185 UBE2D4-201ENST00000222402 3974 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.35□□□□□ -0.11
CBX3Q13185 ATP6V0C-201ENST00000330398 1175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.35□□□□□ -0.11
CBX3Q13185 HBZP1-201ENST00000354915 429 ntBASIC14.35□□□□□ -0.11
CBX3Q13185 AC211429.1-201ENST00000415277 523 ntBASIC14.35□□□□□ -0.11
CBX3Q13185 AC103564.1-201ENST00000437330 562 ntTSL 5 BASIC14.35□□□□□ -0.11
CBX3Q13185 MTCL1P1-201ENST00000446207 792 ntBASIC14.35□□□□□ -0.11
CBX3Q13185 ZNF655-218ENST00000454654 571 ntTSL 4 BASIC14.35□□□□□ -0.11
CBX3Q13185 AP003396.3-201ENST00000530918 778 ntTSL 5 BASIC14.35□□□□□ -0.11
CBX3Q13185 LINC02317-201ENST00000555413 426 ntTSL 3 BASIC14.35□□□□□ -0.11
CBX3Q13185 AC009084.1-201ENST00000566869 317 ntTSL 5 BASIC14.35□□□□□ -0.11
CBX3Q13185 CD1E-213ENST00000444681 1820 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.35□□□□□ -0.11
CBX3Q13185 EGFR-206ENST00000454757 5464 ntTSL 1 (best) BASIC14.35□□□□□ -0.11
CBX3Q13185 LRRC29-201ENST00000393992 1468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.35□□□□□ -0.11
CBX3Q13185 STARD4-203ENST00000502322 1467 ntTSL 1 (best) BASIC14.35□□□□□ -0.11
CBX3Q13185 LAPTM5-201ENST00000294507 2223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.35□□□□□ -0.11
CBX3Q13185 SWAP70-201ENST00000318950 4882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.35□□□□□ -0.11
CBX3Q13185 SH3BP5-203ENST00000408919 1880 ntTSL 1 (best) BASIC14.35□□□□□ -0.11
CBX3Q13185 PLCXD2-201ENST00000393934 2063 ntTSL 1 (best) BASIC14.35□□□□□ -0.11
CBX3Q13185 CAB39-203ENST00000410084 1324 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.35□□□□□ -0.11
CBX3Q13185 NOX5-204ENST00000455873 2277 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.35□□□□□ -0.11
CBX3Q13185 KDM1B-201ENST00000297792 3811 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.35□□□□□ -0.11
CBX3Q13185 PPP1R13L-201ENST00000360957 3104 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.35□□□□□ -0.11
CBX3Q13185 AKR1A1-214ENST00000621846 1360 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.34□□□□□ -0.11
CBX3Q13185 IGF2-207ENST00000434045 1583 ntTSL 1 (best) BASIC14.34□□□□□ -0.11
CBX3Q13185 ACTN2-206ENST00000542672 4906 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.34□□□□□ -0.11
CBX3Q13185 HTR1A-201ENST00000323865 1778 ntAPPRIS P1 BASIC14.34□□□□□ -0.11
CBX3Q13185 DKK1-201ENST00000373970 1790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.34□□□□□ -0.11
CBX3Q13185 GFAP-203ENST00000435360 1779 ntTSL 2 BASIC14.34□□□□□ -0.11
CBX3Q13185 PPEF2-207ENST00000621010 1797 ntTSL 1 (best) BASIC14.34□□□□□ -0.11
CBX3Q13185 DNM1P41-201ENST00000623634 3350 ntBASIC14.34□□□□□ -0.11
CBX3Q13185 HTR3A-203ENST00000375498 2235 ntTSL 1 (best) BASIC14.34□□□□□ -0.11
CBX3Q13185 SLC5A9-210ENST00000533824 2219 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.34□□□□□ -0.11
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