Protein–RNA interactions for Protein: Q06609

RAD51, DNA repair protein RAD51 homolog 1, humanhuman

Predictions only

Length 339 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RAD51Q06609 H1FOO-201ENST00000324382 1067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
RAD51Q06609 AL080243.2-201ENST00000418783 582 ntBASIC16.25■□□□□ 0.19
RAD51Q06609 BCRP1-201ENST00000444246 691 ntBASIC16.25■□□□□ 0.19
RAD51Q06609 LINC01160-202ENST00000450155 894 ntTSL 3 BASIC16.25■□□□□ 0.19
RAD51Q06609 AL359815.1-201ENST00000457706 821 ntTSL 2 BASIC16.25■□□□□ 0.19
RAD51Q06609 NECAP2-203ENST00000457722 935 ntTSL 2 BASIC16.25■□□□□ 0.19
RAD51Q06609 FXR1-221ENST00000491674 365 ntTSL 2 BASIC16.25■□□□□ 0.19
RAD51Q06609 TMEM161B-AS1-202ENST00000501715 1101 ntTSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
RAD51Q06609 FBXO4-206ENST00000509134 1284 ntTSL 5 BASIC16.25■□□□□ 0.19
RAD51Q06609 CCDC85C-204ENST00000555822 930 ntTSL 5 BASIC16.25■□□□□ 0.19
RAD51Q06609 PSMD7-204ENST00000567958 692 ntTSL 3 BASIC16.25■□□□□ 0.19
RAD51Q06609 NAA60-208ENST00000570819 833 ntTSL 2 BASIC16.25■□□□□ 0.19
RAD51Q06609 ZMYND11-208ENST00000397962 2150 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
RAD51Q06609 COL4A1-204ENST00000543140 2547 ntTSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
RAD51Q06609 CLCNKA-203ENST00000439316 1997 ntTSL 2 BASIC16.25■□□□□ 0.19
RAD51Q06609 ST3GAL2-201ENST00000342907 4450 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.25■□□□□ 0.19
RAD51Q06609 SSFA2-205ENST00000431877 5150 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
RAD51Q06609 CXCL14-202ENST00000512158 1760 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
RAD51Q06609 SLC39A1-202ENST00000356205 2084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
RAD51Q06609 OCLN-202ENST00000396442 1748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
RAD51Q06609 AC063926.3-201ENST00000624734 5658 ntBASIC16.25■□□□□ 0.19
RAD51Q06609 PITPNA-201ENST00000313486 3912 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.25■□□□□ 0.19
RAD51Q06609 TPD52L2-201ENST00000217121 2362 ntTSL 2 BASIC16.24■□□□□ 0.19
RAD51Q06609 AC025165.1-201ENST00000356672 2355 ntTSL 5 BASIC16.24■□□□□ 0.19
RAD51Q06609 FAM227B-201ENST00000299338 2008 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.24■□□□□ 0.19
RAD51Q06609 KRT8-215ENST00000552150 1687 ntTSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
RAD51Q06609 TMEM161A-206ENST00000587583 1654 ntTSL 5 BASIC16.24■□□□□ 0.19
RAD51Q06609 TGIF1-201ENST00000330513 1980 ntTSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
RAD51Q06609 U73166.1-201ENST00000439898 2625 ntTSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
RAD51Q06609 ZNF671-201ENST00000317398 2431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
RAD51Q06609 PDCD2-208ENST00000541970 3378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
RAD51Q06609 SHQ1-201ENST00000325599 2879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
RAD51Q06609 COPS7B-206ENST00000410017 2051 ntTSL 3 BASIC16.24■□□□□ 0.19
RAD51Q06609 POLR2A-201ENST00000572844 2083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
RAD51Q06609 C2orf40-201ENST00000238044 789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
RAD51Q06609 MRPL13-201ENST00000306185 1086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
RAD51Q06609 LRRC28-202ENST00000331450 752 ntTSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
RAD51Q06609 DBNDD2-205ENST00000372717 1207 ntTSL 5 BASIC16.24■□□□□ 0.19
RAD51Q06609 LINC01121-201ENST00000378479 1095 ntTSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
RAD51Q06609 VCX3A-201ENST00000381089 995 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
RAD51Q06609 CENPM-206ENST00000407253 818 ntTSL 2 BASIC16.24■□□□□ 0.19
RAD51Q06609 AC008278.1-201ENST00000431117 568 ntTSL 4 BASIC16.24■□□□□ 0.19
RAD51Q06609 MSC-AS1-206ENST00000519751 596 ntTSL 4 BASIC16.24■□□□□ 0.19
RAD51Q06609 HCFC1R1-203ENST00000572355 610 ntTSL 3 BASIC16.24■□□□□ 0.19
RAD51Q06609 AC087392.4-201ENST00000574560 486 ntTSL 3 BASIC16.24■□□□□ 0.19
RAD51Q06609 AC067852.1-201ENST00000585572 594 ntTSL 4 BASIC16.24■□□□□ 0.19
RAD51Q06609 LIM2-202ENST00000596399 861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
RAD51Q06609 MYO3A-206ENST00000543632 2203 ntTSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
RAD51Q06609 HPN-201ENST00000262626 2363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
RAD51Q06609 TAP2-201ENST00000374897 5684 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
RAD51Q06609 ZBTB7C-204ENST00000586438 4899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
RAD51Q06609 TGOLN2-203ENST00000398263 6138 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
RAD51Q06609 RAB40B-206ENST00000571995 3859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
RAD51Q06609 TMEM237-202ENST00000409444 5592 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.24■□□□□ 0.19
RAD51Q06609 TM9SF1-201ENST00000261789 2452 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
RAD51Q06609 LINC01502-201ENST00000445997 2471 ntTSL 2 BASIC16.24■□□□□ 0.19
RAD51Q06609 USP27X-201ENST00000621775 2618 ntAPPRIS P1 BASIC16.24■□□□□ 0.19
RAD51Q06609 FBLIM1-206ENST00000441801 1543 ntTSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
RAD51Q06609 PTHLH-209ENST00000545234 1544 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.24■□□□□ 0.19
RAD51Q06609 PARVB-210ENST00000619710 1530 ntTSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
RAD51Q06609 CD40-207ENST00000620709 1522 ntTSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
RAD51Q06609 JMJD1C-202ENST00000399262 8666 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.24■□□□□ 0.19
RAD51Q06609 MSI2-201ENST00000284073 6364 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
RAD51Q06609 KRT73-201ENST00000305748 2284 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
RAD51Q06609 ZDHHC13-201ENST00000399351 2283 ntTSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
RAD51Q06609 SCYL1-214ENST00000533862 2570 ntTSL 5 BASIC16.24■□□□□ 0.19
RAD51Q06609 ARSI-201ENST00000328668 3161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
RAD51Q06609 FAM83C-201ENST00000374408 3145 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
RAD51Q06609 ZNF418-208ENST00000599852 2501 ntTSL 2 BASIC16.23■□□□□ 0.19
RAD51Q06609 AL365203.3-201ENST00000609742 2057 ntBASIC16.23■□□□□ 0.19
RAD51Q06609 FAM83G-201ENST00000345041 2929 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.23■□□□□ 0.19
RAD51Q06609 DYRK3-201ENST00000367106 2329 ntTSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
RAD51Q06609 SAE1-202ENST00000392776 1851 ntTSL 3 BASIC16.23■□□□□ 0.19
RAD51Q06609 AC022144.1-201ENST00000602255 1580 ntBASIC16.23■□□□□ 0.19
RAD51Q06609 GIT2-220ENST00000553118 2424 ntTSL 5 BASIC16.23■□□□□ 0.19
RAD51Q06609 MDM2-209ENST00000393412 1404 ntTSL 5 BASIC16.23■□□□□ 0.19
RAD51Q06609 SHISA5-208ENST00000442747 2250 ntTSL 2 BASIC16.23■□□□□ 0.19
RAD51Q06609 ASAH1-223ENST00000636171 2283 ntTSL 5 BASIC16.23■□□□□ 0.19
RAD51Q06609 TTC6-206ENST00000553443 5833 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.23■□□□□ 0.19
RAD51Q06609 BATF2-201ENST00000301887 2142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
RAD51Q06609 PDSS2-201ENST00000369031 1236 ntTSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
RAD51Q06609 CIB3-202ENST00000379859 467 ntTSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
RAD51Q06609 METTL21A-202ENST00000406927 1103 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
RAD51Q06609 RBM43-202ENST00000409092 579 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.23■□□□□ 0.19
RAD51Q06609 AC008443.3-201ENST00000412295 549 ntTSL 4 BASIC16.23■□□□□ 0.19
RAD51Q06609 FAM8A3P-201ENST00000427218 844 ntBASIC16.23■□□□□ 0.19
RAD51Q06609 ELP6-209ENST00000446787 894 ntTSL 3 BASIC16.23■□□□□ 0.19
RAD51Q06609 AC004890.2-204ENST00000481968 304 ntBASIC16.23■□□□□ 0.19
RAD51Q06609 AC008406.2-201ENST00000507058 532 ntTSL 3 BASIC16.23■□□□□ 0.19
RAD51Q06609 MIR210HG-203ENST00000533920 816 ntTSL 2 BASIC16.23■□□□□ 0.19
RAD51Q06609 AP006333.1-201ENST00000543817 575 ntTSL 4 BASIC16.23■□□□□ 0.19
RAD51Q06609 AC087741.1-203ENST00000576824 820 ntTSL 3 BASIC16.23■□□□□ 0.19
RAD51Q06609 AC105277.1-203ENST00000635492 1293 ntTSL 5 BASIC16.23■□□□□ 0.19
RAD51Q06609 AL033527.5-202ENST00000641632 1098 ntBASIC16.23■□□□□ 0.19
RAD51Q06609 CCDC187-205ENST00000638797 10126 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.23■□□□□ 0.19
RAD51Q06609 PEPD-202ENST00000397032 1754 ntTSL 2 BASIC16.23■□□□□ 0.19
RAD51Q06609 CASP2-201ENST00000310447 4225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
RAD51Q06609 PLXNB1-202ENST00000358536 7308 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
RAD51Q06609 RCN2-203ENST00000394885 6347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
RAD51Q06609 EGLN2-207ENST00000593726 2821 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 60.4 ms