Protein–RNA interactions for Protein: P55008

AIF1, Allograft inflammatory factor 1, humanhuman

Predictions only

Length 147 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
AIF1P55008 RXRA-202ENST00000481739 1846 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
AIF1P55008 AMHR2-202ENST00000379791 1437 ntTSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
AIF1P55008 PRAL-201ENST00000624952 3286 ntBASIC16.38■□□□□ 0.21
AIF1P55008 NEO1-207ENST00000560262 4315 ntTSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
AIF1P55008 HNRNPU-205ENST00000444376 6827 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
AIF1P55008 WARS-232ENST00000556645 2508 ntTSL 5 BASIC16.38■□□□□ 0.21
AIF1P55008 BTBD7P1-201ENST00000447253 1453 ntBASIC16.38■□□□□ 0.21
AIF1P55008 FBXO22-202ENST00000453211 1486 ntTSL 2 BASIC16.38■□□□□ 0.21
AIF1P55008 PCNP-201ENST00000265260 2342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
AIF1P55008 NMU-201ENST00000264218 816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
AIF1P55008 TM4SF19-201ENST00000273695 1022 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
AIF1P55008 HDAC8-203ENST00000373559 632 ntTSL 2 BASIC16.38■□□□□ 0.21
AIF1P55008 HDAC8-208ENST00000373583 434 ntTSL 5 BASIC16.38■□□□□ 0.21
AIF1P55008 CCDC107-204ENST00000378409 1173 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
AIF1P55008 CIB3-202ENST00000379859 467 ntTSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
AIF1P55008 PSMB8-203ENST00000395339 1025 ntTSL 3 BASIC16.38■□□□□ 0.21
AIF1P55008 HNRNPA3P1-201ENST00000401429 1139 ntBASIC16.38■□□□□ 0.21
AIF1P55008 AC018685.2-201ENST00000414065 547 ntTSL 4 BASIC16.38■□□□□ 0.21
AIF1P55008 RFX3-AS1-201ENST00000423112 552 ntTSL 3 BASIC16.38■□□□□ 0.21
AIF1P55008 USP40-206ENST00000443711 628 ntTSL 2 BASIC16.38■□□□□ 0.21
AIF1P55008 HNRNPA3P5-201ENST00000455201 833 ntBASIC16.38■□□□□ 0.21
AIF1P55008 SWI5-205ENST00000495313 466 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC16.38■□□□□ 0.21
AIF1P55008 SLED1-202ENST00000512051 380 ntBASIC16.38■□□□□ 0.21
AIF1P55008 RHBDL2-203ENST00000540558 697 ntTSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
AIF1P55008 WDR25-203ENST00000542471 1214 ntTSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
AIF1P55008 AC004803.1-204ENST00000543290 512 ntTSL 4 BASIC16.38■□□□□ 0.21
AIF1P55008 DUX4L27-201ENST00000554796 1261 ntBASIC16.38■□□□□ 0.21
AIF1P55008 C1QTNF1-212ENST00000583904 1129 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC16.38■□□□□ 0.21
AIF1P55008 AL844908.2-201ENST00000609461 460 ntBASIC16.38■□□□□ 0.21
AIF1P55008 ORC5-208ENST00000626700 344 ntTSL 3 BASIC16.38■□□□□ 0.21
AIF1P55008 STK24-203ENST00000397517 4578 ntTSL 2 BASIC16.38■□□□□ 0.21
AIF1P55008 OLIG2-201ENST00000333337 3262 ntAPPRIS P1 BASIC16.38■□□□□ 0.21
AIF1P55008 EHD3-201ENST00000322054 4636 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
AIF1P55008 GREB1-205ENST00000389825 1315 ntTSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
AIF1P55008 AL583722.1-201ENST00000540171 1307 ntTSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
AIF1P55008 PRSS54-204ENST00000567164 1799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
AIF1P55008 MOB3B-201ENST00000262244 6454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
AIF1P55008 ADAMTS13-206ENST00000371929 4934 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
AIF1P55008 AC141586.1-201ENST00000399702 2748 ntTSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
AIF1P55008 TDRD6-203ENST00000544460 8887 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.38■□□□□ 0.21
AIF1P55008 NFE2-203ENST00000540264 1833 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
AIF1P55008 AC097376.2-201ENST00000608661 2510 ntTSL 5 BASIC16.38■□□□□ 0.21
AIF1P55008 PITPNA-201ENST00000313486 3912 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.38■□□□□ 0.21
AIF1P55008 TGFB1I1-203ENST00000394863 1898 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
AIF1P55008 ACE-202ENST00000290866 4959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
AIF1P55008 TRPM2-208ENST00000621064 1669 ntTSL 5 BASIC16.37■□□□□ 0.21
AIF1P55008 TSPAN3-201ENST00000267970 6467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
AIF1P55008 SLC35C2-202ENST00000317734 2175 ntTSL 2 BASIC16.37■□□□□ 0.21
AIF1P55008 VPS26A-201ENST00000263559 2697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
AIF1P55008 ZNF628-201ENST00000391718 3177 ntAPPRIS ALT2 BASIC16.37■□□□□ 0.21
AIF1P55008 CCDC28A-201ENST00000332797 1496 ntTSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
AIF1P55008 RAPSN-202ENST00000352508 1452 ntTSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
AIF1P55008 RDM1-227ENST00000619876 1491 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.37■□□□□ 0.21
AIF1P55008 C2orf68-202ENST00000409734 1722 ntTSL 2 BASIC16.37■□□□□ 0.21
AIF1P55008 TMBIM7P-203ENST00000641617 1718 ntBASIC16.37■□□□□ 0.21
AIF1P55008 ADD1-201ENST00000264758 4045 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.37■□□□□ 0.21
AIF1P55008 TCP10-201ENST00000366827 2250 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.37■□□□□ 0.21
AIF1P55008 AP1M2-207ENST00000590923 1757 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
AIF1P55008 MANBAL-204ENST00000397151 1503 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.37■□□□□ 0.21
AIF1P55008 MANBAL-205ENST00000397152 1539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
AIF1P55008 JTB-201ENST00000271843 1287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
AIF1P55008 MRPL43-201ENST00000299179 747 ntTSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
AIF1P55008 POP5-202ENST00000357500 801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
AIF1P55008 POLR3GL-202ENST00000369314 1165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
AIF1P55008 C11orf88-202ENST00000375618 712 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
AIF1P55008 AC093702.1-201ENST00000423433 367 ntTSL 3 BASIC16.37■□□□□ 0.21
AIF1P55008 LINC01160-201ENST00000441004 768 ntTSL 3 BASIC16.37■□□□□ 0.21
AIF1P55008 LEKR1-211ENST00000498839 616 ntTSL 3 BASIC16.37■□□□□ 0.21
AIF1P55008 C4orf3-202ENST00000504110 667 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
AIF1P55008 IGHV3-42-201ENST00000520410 361 ntBASIC16.37■□□□□ 0.21
AIF1P55008 KLK15-203ENST00000596931 692 ntTSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
AIF1P55008 FAM92A-219ENST00000620645 1014 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.37■□□□□ 0.21
AIF1P55008 C11orf53-203ENST00000637637 1049 ntTSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
AIF1P55008 YTHDF2-209ENST00000542507 2825 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.37■□□□□ 0.21
AIF1P55008 PNLDC1-202ENST00000392167 1816 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.37■□□□□ 0.21
AIF1P55008 BRF1-206ENST00000446501 2858 ntTSL 2 BASIC16.37■□□□□ 0.21
AIF1P55008 SCRN1-205ENST00000425819 1552 ntTSL 2 BASIC16.37■□□□□ 0.21
AIF1P55008 AC104407.1-201ENST00000511017 1568 ntTSL 3 BASIC16.37■□□□□ 0.21
AIF1P55008 SLC43A1-204ENST00000528450 2358 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
AIF1P55008 LILRB5-202ENST00000345866 1864 ntTSL 2 BASIC16.37■□□□□ 0.21
AIF1P55008 CYP4F22-202ENST00000601005 2445 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.37■□□□□ 0.21
AIF1P55008 MSI2-206ENST00000579180 1635 ntTSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
AIF1P55008 CDKN2B-AS1-208ENST00000580576 2175 ntTSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
AIF1P55008 KLC1-206ENST00000389744 3250 ntTSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
AIF1P55008 MUTYH-211ENST00000456914 1692 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
AIF1P55008 TMEM5-205ENST00000537373 1966 ntTSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
AIF1P55008 AHSA1-201ENST00000216479 1402 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
AIF1P55008 SELENOV-201ENST00000335426 1704 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
AIF1P55008 SELENOV-205ENST00000622070 1704 ntTSL 5 BASIC16.36■□□□□ 0.21
AIF1P55008 TAF15-205ENST00000603777 2011 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.36■□□□□ 0.21
AIF1P55008 TRIM45-203ENST00000369464 3495 ntTSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
AIF1P55008 C9orf172-201ENST00000436881 4387 ntAPPRIS P1 BASIC16.36■□□□□ 0.21
AIF1P55008 RIBC2-202ENST00000614167 1479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
AIF1P55008 PTPRN2-201ENST00000389413 4723 ntTSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
AIF1P55008 AC127383.1-201ENST00000444697 1800 ntBASIC16.36■□□□□ 0.21
AIF1P55008 SH3RF1-201ENST00000284637 5272 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
AIF1P55008 SLC29A1-209ENST00000427851 2171 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
AIF1P55008 HERPUD1-201ENST00000300302 1862 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
AIF1P55008 STEAP3-202ENST00000393107 1871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
AIF1P55008 SLC4A3-204ENST00000373760 4134 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.36■□□□□ 0.21
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 27.2 ms