Protein–RNA interactions for Protein: P11230

CHRNB1, Acetylcholine receptor subunit beta, humanhuman

Predictions only

Length 501 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CHRNB1P11230 SYDE1-204ENST00000600440 3058 ntTSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
CHRNB1P11230 C1orf43-201ENST00000350592 1610 ntTSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
CHRNB1P11230 UNC119-204ENST00000470125 2050 ntTSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
CHRNB1P11230 CYP4F11-203ENST00000402119 3161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
CHRNB1P11230 NINL-201ENST00000278886 4969 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
CHRNB1P11230 TBC1D28-201ENST00000345096 2789 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.12■□□□□ 0.17
CHRNB1P11230 PMS1-212ENST00000432292 3234 ntTSL 2 BASIC16.12■□□□□ 0.17
CHRNB1P11230 ACSS1-201ENST00000323482 3680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
CHRNB1P11230 CFLAR-214ENST00000443227 1679 ntTSL 2 BASIC16.12■□□□□ 0.17
CHRNB1P11230 SLC29A1-206ENST00000371755 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
CHRNB1P11230 AGFG1-201ENST00000310078 8668 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
CHRNB1P11230 HR-201ENST00000312841 5351 ntTSL 5 BASIC16.12■□□□□ 0.17
CHRNB1P11230 PPIF-201ENST00000225174 2190 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
CHRNB1P11230 SMCHD1-201ENST00000320876 8821 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.12■□□□□ 0.17
CHRNB1P11230 TACR2-203ENST00000619173 1713 ntTSL 5 BASIC16.12■□□□□ 0.17
CHRNB1P11230 RNF19A-201ENST00000341084 4285 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.12■□□□□ 0.17
CHRNB1P11230 SPAG11B-203ENST00000359758 612 ntTSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
CHRNB1P11230 ATP5D-202ENST00000395633 704 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
CHRNB1P11230 AC243836.1-201ENST00000416696 438 ntTSL 3 BASIC16.12■□□□□ 0.17
CHRNB1P11230 H2AFV-206ENST00000437072 589 ntTSL 4 BASIC16.12■□□□□ 0.17
CHRNB1P11230 CXorf40A-211ENST00000450602 1204 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC16.12■□□□□ 0.17
CHRNB1P11230 AL157834.2-201ENST00000451737 663 ntTSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
CHRNB1P11230 PFN1P12-201ENST00000455938 534 ntBASIC16.12■□□□□ 0.17
CHRNB1P11230 FTH1P14-201ENST00000482930 551 ntBASIC16.12■□□□□ 0.17
CHRNB1P11230 RPL13AP25-201ENST00000484130 612 ntBASIC16.12■□□□□ 0.17
CHRNB1P11230 CRYGN-205ENST00000491928 698 ntTSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
CHRNB1P11230 AC093904.3-201ENST00000492300 368 ntTSL 2 BASIC16.12■□□□□ 0.17
CHRNB1P11230 LINC01585-201ENST00000500496 1295 ntTSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
CHRNB1P11230 AC116456.1-201ENST00000526646 815 ntTSL 3 BASIC16.12■□□□□ 0.17
CHRNB1P11230 AC090099.4-201ENST00000527671 1027 ntTSL 5 BASIC16.12■□□□□ 0.17
CHRNB1P11230 TAPBPL-205ENST00000544021 772 ntTSL 3 BASIC16.12■□□□□ 0.17
CHRNB1P11230 C12orf49-204ENST00000548356 923 ntTSL 2 BASIC16.12■□□□□ 0.17
CHRNB1P11230 AP3S2-204ENST00000558011 738 ntTSL 3 BASIC16.12■□□□□ 0.17
CHRNB1P11230 GCHFR-203ENST00000558670 412 ntTSL 3 BASIC16.12■□□□□ 0.17
CHRNB1P11230 AC108134.3-202ENST00000571404 1207 ntTSL 5 BASIC16.12■□□□□ 0.17
CHRNB1P11230 CLUHP6-201ENST00000580789 941 ntBASIC16.12■□□□□ 0.17
CHRNB1P11230 COX6B1-204ENST00000592141 660 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.12■□□□□ 0.17
CHRNB1P11230 SFTA2-203ENST00000634371 815 ntTSL 5 BASIC16.12■□□□□ 0.17
CHRNB1P11230 PLCH2-203ENST00000378486 4837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
CHRNB1P11230 PLCH2-204ENST00000419816 4837 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.12■□□□□ 0.17
CHRNB1P11230 TRAF3-204ENST00000539721 1786 ntTSL 2 BASIC16.12■□□□□ 0.17
CHRNB1P11230 CARD10-201ENST00000251973 3934 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
CHRNB1P11230 KCNAB2-212ENST00000458166 1336 ntTSL 2 BASIC16.12■□□□□ 0.17
CHRNB1P11230 CEACAM16-201ENST00000405314 1583 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.12■□□□□ 0.17
CHRNB1P11230 ZFAND6-211ENST00000559157 1559 ntTSL 2 BASIC16.12■□□□□ 0.17
CHRNB1P11230 LRP11-201ENST00000239367 3260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
CHRNB1P11230 GTF2H2C-201ENST00000380729 1803 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
CHRNB1P11230 TBXAS1-210ENST00000458722 2057 ntTSL 2 BASIC16.12■□□□□ 0.17
CHRNB1P11230 IGSF8-201ENST00000314485 2343 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
CHRNB1P11230 ZGLP1-202ENST00000403903 2303 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
CHRNB1P11230 BMPER-201ENST00000297161 5031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
CHRNB1P11230 MAPT-205ENST00000351559 5811 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
CHRNB1P11230 GOLIM4-201ENST00000309027 2100 ntTSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
CHRNB1P11230 LOX-206ENST00000639739 1626 ntTSL 5 BASIC16.12■□□□□ 0.17
CHRNB1P11230 GNA13-201ENST00000439174 4922 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
CHRNB1P11230 SPINT1-202ENST00000562057 2456 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
CHRNB1P11230 RIF1-204ENST00000430328 7992 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
CHRNB1P11230 FTSJ1-201ENST00000019019 1986 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC16.11■□□□□ 0.17
CHRNB1P11230 CTCFL-215ENST00000608158 1984 ntTSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
CHRNB1P11230 GSKIP-207ENST00000556095 3834 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.11■□□□□ 0.17
CHRNB1P11230 CCNA2-202ENST00000618014 2797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
CHRNB1P11230 SLC25A19-202ENST00000375261 1486 ntTSL 5 BASIC16.11■□□□□ 0.17
CHRNB1P11230 PHKA1-201ENST00000339490 6121 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
CHRNB1P11230 ERICH5-201ENST00000318528 1761 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
CHRNB1P11230 PAX3-207ENST00000409551 1782 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
CHRNB1P11230 CD34-202ENST00000356522 2874 ntTSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
CHRNB1P11230 BCS1L-203ENST00000392110 1525 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.11■□□□□ 0.17
CHRNB1P11230 KDSR-202ENST00000406396 5447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
CHRNB1P11230 NFATC2-205ENST00000609507 2662 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
CHRNB1P11230 DNM2-201ENST00000355667 3541 ntTSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
CHRNB1P11230 UEVLD-201ENST00000300038 995 ntTSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
CHRNB1P11230 SETD4-205ENST00000399208 1165 ntTSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
CHRNB1P11230 MPV17-206ENST00000402722 827 ntTSL 3 BASIC16.11■□□□□ 0.17
CHRNB1P11230 BAATP1-201ENST00000412284 1225 ntBASIC16.11■□□□□ 0.17
CHRNB1P11230 AC099548.2-209ENST00000480264 625 ntBASIC16.11■□□□□ 0.17
CHRNB1P11230 C4orf3-202ENST00000504110 667 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
CHRNB1P11230 ROPN1B-210ENST00000514116 1088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
CHRNB1P11230 ZNF7-206ENST00000528130 1134 ntTSL 5 BASIC16.11■□□□□ 0.17
CHRNB1P11230 LINC02279-201ENST00000553435 737 ntTSL 5 BASIC16.11■□□□□ 0.17
CHRNB1P11230 IGHV3OR16-16-201ENST00000563644 343 ntBASIC16.11■□□□□ 0.17
CHRNB1P11230 ANXA2R-202ENST00000616064 1265 ntAPPRIS P1 BASIC16.11■□□□□ 0.17
CHRNB1P11230 ZNF211-201ENST00000240731 2440 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC16.11■□□□□ 0.17
CHRNB1P11230 C1RL-210ENST00000544702 1569 ntTSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
CHRNB1P11230 ARMC6-203ENST00000392336 1866 ntTSL 2 BASIC16.11■□□□□ 0.17
CHRNB1P11230 TMEM222-211ENST00000611517 1613 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
CHRNB1P11230 HIBCH-201ENST00000359678 1939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
CHRNB1P11230 MAPK14-201ENST00000229794 3779 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
CHRNB1P11230 ITGB2-AS1-202ENST00000441379 2282 ntTSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
CHRNB1P11230 PRDM5-212ENST00000515109 2259 ntTSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
CHRNB1P11230 SCOC-211ENST00000614192 1959 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
CHRNB1P11230 KLK3-202ENST00000360617 1664 ntTSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
CHRNB1P11230 ATP4B-201ENST00000335288 1488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
CHRNB1P11230 TTC13-202ENST00000366662 3112 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
CHRNB1P11230 KLHL21-202ENST00000377663 6445 ntTSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
CHRNB1P11230 CSF1-204ENST00000369802 2484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
CHRNB1P11230 AL662844.4-201ENST00000606367 2838 ntBASIC16.1■□□□□ 0.17
CHRNB1P11230 RAB15-203ENST00000533601 3515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
CHRNB1P11230 MYB-242ENST00000618728 3545 ntTSL 5 BASIC16.1■□□□□ 0.17
CHRNB1P11230 ABCA1-203ENST00000423487 1540 ntTSL 2 BASIC16.1■□□□□ 0.17
CHRNB1P11230 ADCYAP1R1-203ENST00000409363 1889 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 56 ms