Protein–RNA interactions for Protein: Q9UL33

TRAPPC2L, Trafficking protein particle complex subunit 2-like protein, humanhuman

Predictions only

Length 140 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TRAPPC2LQ9UL33 ZFPM2-206ENST00000520492 3960 ntTSL 2 BASIC13.5□□□□□ -0.25
TRAPPC2LQ9UL33 RASAL1-207ENST00000548055 2502 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
TRAPPC2LQ9UL33 CCHCR1-202ENST00000396263 2490 ntTSL 5 BASIC13.5□□□□□ -0.25
TRAPPC2LQ9UL33 RFPL2-203ENST00000400237 2407 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC13.5□□□□□ -0.25
TRAPPC2LQ9UL33 KCP-203ENST00000610776 5108 ntTSL 5 BASIC13.5□□□□□ -0.25
TRAPPC2LQ9UL33 XPO6-201ENST00000304658 4422 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
TRAPPC2LQ9UL33 ASNS-201ENST00000175506 2356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
TRAPPC2LQ9UL33 OASL-204ENST00000620239 1695 ntTSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
TRAPPC2LQ9UL33 RASAL2-AS1-202ENST00000421505 2329 ntTSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
TRAPPC2LQ9UL33 EGFR-203ENST00000344576 2864 ntTSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
TRAPPC2LQ9UL33 FAM149B1-201ENST00000242505 5408 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.5□□□□□ -0.25
TRAPPC2LQ9UL33 SPIN3-224ENST00000639583 2245 ntTSL 5 BASIC13.49□□□□□ -0.25
TRAPPC2LQ9UL33 COL4A3BP-204ENST00000405807 2843 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.49□□□□□ -0.25
TRAPPC2LQ9UL33 ABHD18-202ENST00000398965 2177 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.49□□□□□ -0.25
TRAPPC2LQ9UL33 NELFA-203ENST00000411638 2199 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
TRAPPC2LQ9UL33 WDR70-202ENST00000504564 1526 ntTSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
TRAPPC2LQ9UL33 PRICKLE1-211ENST00000639566 3341 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.49□□□□□ -0.25
TRAPPC2LQ9UL33 ZNF559-202ENST00000393883 5095 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC13.49□□□□□ -0.25
TRAPPC2LQ9UL33 ELFN1-201ENST00000424383 3845 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.49□□□□□ -0.25
TRAPPC2LQ9UL33 USP27X-201ENST00000621775 2618 ntAPPRIS P1 BASIC13.49□□□□□ -0.25
TRAPPC2LQ9UL33 MRPL49-201ENST00000279242 2019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
TRAPPC2LQ9UL33 C2orf54-202ENST00000388934 1911 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC13.49□□□□□ -0.25
TRAPPC2LQ9UL33 ARMCX4-202ENST00000423738 7424 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.49□□□□□ -0.25
TRAPPC2LQ9UL33 SORCS1-201ENST00000263054 7272 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
TRAPPC2LQ9UL33 RTEL1-205ENST00000370018 4955 ntTSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
TRAPPC2LQ9UL33 AC092384.3-202ENST00000564646 2873 ntBASIC13.49□□□□□ -0.25
TRAPPC2LQ9UL33 PRLH-201ENST00000165524 264 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
TRAPPC2LQ9UL33 AL591424.1-201ENST00000442569 1213 ntBASIC13.49□□□□□ -0.25
TRAPPC2LQ9UL33 AC034213.1-201ENST00000507681 806 ntTSL 3 BASIC13.49□□□□□ -0.25
TRAPPC2LQ9UL33 AC087276.3-201ENST00000526220 787 ntTSL 3 BASIC13.49□□□□□ -0.25
TRAPPC2LQ9UL33 TPD52L1-211ENST00000532429 1022 ntTSL 2 BASIC13.49□□□□□ -0.25
TRAPPC2LQ9UL33 AHSA1-202ENST00000535854 1173 ntTSL 2 BASIC13.49□□□□□ -0.25
TRAPPC2LQ9UL33 RPL18-208ENST00000549920 1004 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
TRAPPC2LQ9UL33 RPL18-209ENST00000550645 463 ntTSL 5 BASIC13.49□□□□□ -0.25
TRAPPC2LQ9UL33 RPL18-214ENST00000552588 559 ntTSL 3 BASIC13.49□□□□□ -0.25
TRAPPC2LQ9UL33 AL359317.2-203ENST00000557409 538 ntTSL 4 BASIC13.49□□□□□ -0.25
TRAPPC2LQ9UL33 KCNMA1-262ENST00000639489 4302 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.49□□□□□ -0.25
TRAPPC2LQ9UL33 SMAD2-202ENST00000356825 10445 ntTSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
TRAPPC2LQ9UL33 CBWD1-201ENST00000314367 1771 ntTSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
TRAPPC2LQ9UL33 AC012507.2-203ENST00000415628 1765 ntTSL 3 BASIC13.49□□□□□ -0.25
TRAPPC2LQ9UL33 MTMR6-201ENST00000381801 5659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
TRAPPC2LQ9UL33 LRP8-201ENST00000306052 7648 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
TRAPPC2LQ9UL33 USP47-207ENST00000527733 4525 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
TRAPPC2LQ9UL33 ZNF398-203ENST00000483892 2121 ntTSL 5 BASIC13.49□□□□□ -0.25
TRAPPC2LQ9UL33 PCDHGB2-202ENST00000622527 2588 ntAPPRIS P1 BASIC13.49□□□□□ -0.25
TRAPPC2LQ9UL33 TIPRL-202ENST00000367833 3032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
TRAPPC2LQ9UL33 P2RY1-201ENST00000305097 6747 ntAPPRIS P1 BASIC13.49□□□□□ -0.25
TRAPPC2LQ9UL33 ZFY-201ENST00000155093 5239 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
TRAPPC2LQ9UL33 PSMF1-201ENST00000246015 2042 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC13.49□□□□□ -0.25
TRAPPC2LQ9UL33 FAM227B-201ENST00000299338 2008 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC13.49□□□□□ -0.25
TRAPPC2LQ9UL33 GDF2-201ENST00000581492 1955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
TRAPPC2LQ9UL33 MRPS22-212ENST00000495075 1547 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
TRAPPC2LQ9UL33 TUSC3-204ENST00000506802 1546 ntTSL 5 BASIC13.49□□□□□ -0.25
TRAPPC2LQ9UL33 PIP4K2C-207ENST00000550465 1532 ntTSL 2 BASIC13.49□□□□□ -0.25
TRAPPC2LQ9UL33 SLC43A1-204ENST00000528450 2358 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
TRAPPC2LQ9UL33 C19orf54-201ENST00000378313 2753 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.49□□□□□ -0.25
TRAPPC2LQ9UL33 FES-204ENST00000414248 2327 ntTSL 2 BASIC13.48□□□□□ -0.25
TRAPPC2LQ9UL33 MAP3K4-201ENST00000348824 5295 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.48□□□□□ -0.25
TRAPPC2LQ9UL33 AP001282.1-201ENST00000531301 1499 ntBASIC13.48□□□□□ -0.25
TRAPPC2LQ9UL33 FRA10AC1-201ENST00000359204 3089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
TRAPPC2LQ9UL33 NTNG1-203ENST00000370066 1443 ntTSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
TRAPPC2LQ9UL33 TMEM220-202ENST00000455996 1402 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
TRAPPC2LQ9UL33 ALOX15B-205ENST00000573359 1809 ntTSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
TRAPPC2LQ9UL33 CEP19-202ENST00000409690 2201 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
TRAPPC2LQ9UL33 NIPA1-201ENST00000337435 6567 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
TRAPPC2LQ9UL33 TMEM181-201ENST00000367090 5390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
TRAPPC2LQ9UL33 ACOXL-201ENST00000340561 2188 ntTSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
TRAPPC2LQ9UL33 Z98749.3-201ENST00000400206 1770 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.48□□□□□ -0.25
TRAPPC2LQ9UL33 RNPS1-223ENST00000568631 1792 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.48□□□□□ -0.25
TRAPPC2LQ9UL33 SLC4A2-202ENST00000413384 4142 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
TRAPPC2LQ9UL33 BCL11B-201ENST00000345514 7603 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
TRAPPC2LQ9UL33 HSPB7-204ENST00000411503 2128 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
TRAPPC2LQ9UL33 SLC43A2-204ENST00000571650 3261 ntTSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
TRAPPC2LQ9UL33 TONSL-203ENST00000613741 1713 ntTSL 5 BASIC13.48□□□□□ -0.25
TRAPPC2LQ9UL33 AP002360.1-202ENST00000530460 2462 ntAPPRIS ALT2 BASIC13.48□□□□□ -0.25
TRAPPC2LQ9UL33 MFGE8-215ENST00000566497 1689 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.48□□□□□ -0.25
TRAPPC2LQ9UL33 CNOT3-204ENST00000447684 2765 ntTSL 2 BASIC13.48□□□□□ -0.25
TRAPPC2LQ9UL33 CCNA2-202ENST00000618014 2797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
TRAPPC2LQ9UL33 PF4-201ENST00000296029 604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
TRAPPC2LQ9UL33 NPB-201ENST00000333383 704 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
TRAPPC2LQ9UL33 NEK7-201ENST00000367383 586 ntTSL 2 BASIC13.48□□□□□ -0.25
TRAPPC2LQ9UL33 GSTO1-202ENST00000369713 972 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
TRAPPC2LQ9UL33 TNNC2-202ENST00000372557 780 ntTSL 3 BASIC13.48□□□□□ -0.25
TRAPPC2LQ9UL33 CST3-201ENST00000376925 873 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
TRAPPC2LQ9UL33 HMGN4-201ENST00000377575 1225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
TRAPPC2LQ9UL33 MED15P5-201ENST00000423150 992 ntBASIC13.48□□□□□ -0.25
TRAPPC2LQ9UL33 PITPNA-AS1-201ENST00000425081 542 ntTSL 2 BASIC13.48□□□□□ -0.25
TRAPPC2LQ9UL33 KRT18P3-201ENST00000451602 1288 ntBASIC13.48□□□□□ -0.25
TRAPPC2LQ9UL33 AC012363.1-201ENST00000455707 575 ntTSL 4 BASIC13.48□□□□□ -0.25
TRAPPC2LQ9UL33 LRRC28-210ENST00000558879 581 ntTSL 4 BASIC13.48□□□□□ -0.25
TRAPPC2LQ9UL33 RARRES2P8-201ENST00000566335 367 ntBASIC13.48□□□□□ -0.25
TRAPPC2LQ9UL33 AP002472.1-201ENST00000577490 586 ntBASIC13.48□□□□□ -0.25
TRAPPC2LQ9UL33 AC011530.1-201ENST00000593999 558 ntTSL 2 BASIC13.48□□□□□ -0.25
TRAPPC2LQ9UL33 ZEB1-AS1-206ENST00000606250 573 ntTSL 5 BASIC13.48□□□□□ -0.25
TRAPPC2LQ9UL33 AC027601.4-201ENST00000611259 610 ntBASIC13.48□□□□□ -0.25
TRAPPC2LQ9UL33 AL513190.1-201ENST00000621254 727 ntBASIC13.48□□□□□ -0.25
TRAPPC2LQ9UL33 TMEM114-205ENST00000624696 560 ntTSL 2 BASIC13.48□□□□□ -0.25
TRAPPC2LQ9UL33 C1QTNF6-202ENST00000397110 1647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
TRAPPC2LQ9UL33 NUP98-203ENST00000359171 7023 ntTSL 5 BASIC13.48□□□□□ -0.25
TRAPPC2LQ9UL33 POM121-203ENST00000434423 3750 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.48□□□□□ -0.25
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 60.7 ms