Protein–RNA interactions for Protein: Q9H6D3

XKR8, XK-related protein 8, humanhuman

Predictions only

Length 395 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
XKR8Q9H6D3 SLC22A16-202ENST00000368919 1987 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
XKR8Q9H6D3 CAMTA1-201ENST00000303635 8444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
XKR8Q9H6D3 RIMS1-210ENST00000491071 5047 ntTSL 5 BASIC15.51■□□□□ 0.07
XKR8Q9H6D3 CPEB2-203ENST00000382395 5524 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
XKR8Q9H6D3 MPP3-201ENST00000398389 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
XKR8Q9H6D3 PPP1R15A-201ENST00000200453 2378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
XKR8Q9H6D3 CPEB2-201ENST00000259997 5612 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.5■□□□□ 0.07
XKR8Q9H6D3 ATP5B-201ENST00000262030 1839 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
XKR8Q9H6D3 AP1M1-202ENST00000429941 1578 ntTSL 2 BASIC15.5■□□□□ 0.07
XKR8Q9H6D3 CAAP1-201ENST00000333916 2791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
XKR8Q9H6D3 ARFGAP1-201ENST00000353546 2776 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
XKR8Q9H6D3 GDF6-201ENST00000287020 3701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
XKR8Q9H6D3 RGS7-203ENST00000366564 2295 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
XKR8Q9H6D3 EFR3B-203ENST00000402191 3685 ntTSL 5 BASIC15.5■□□□□ 0.07
XKR8Q9H6D3 IL18BP-204ENST00000393703 1788 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC15.5■□□□□ 0.07
XKR8Q9H6D3 PTGES3-202ENST00000414274 1547 ntTSL 2 BASIC15.5■□□□□ 0.07
XKR8Q9H6D3 FAM19A3-202ENST00000369630 1282 ntTSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
XKR8Q9H6D3 PSMB8-203ENST00000395339 1025 ntTSL 3 BASIC15.5■□□□□ 0.07
XKR8Q9H6D3 CYSRT1-201ENST00000409414 1297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
XKR8Q9H6D3 EFHD1-202ENST00000409613 1156 ntTSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
XKR8Q9H6D3 TSPY16P-201ENST00000449843 468 ntBASIC15.5■□□□□ 0.07
XKR8Q9H6D3 SSBP1-214ENST00000498107 636 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
XKR8Q9H6D3 MIR210HG-203ENST00000533920 816 ntTSL 2 BASIC15.5■□□□□ 0.07
XKR8Q9H6D3 PPHLN1-221ENST00000552761 1095 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
XKR8Q9H6D3 MIR4745-201ENST00000577608 62 ntBASIC15.5■□□□□ 0.07
XKR8Q9H6D3 AC008481.3-201ENST00000585656 727 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.5■□□□□ 0.07
XKR8Q9H6D3 PTPRS-208ENST00000590509 893 ntTSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
XKR8Q9H6D3 AC008738.7-201ENST00000609744 511 ntBASIC15.5■□□□□ 0.07
XKR8Q9H6D3 NSMF-205ENST00000371474 3571 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
XKR8Q9H6D3 NSMF-208ENST00000437259 3577 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.5■□□□□ 0.07
XKR8Q9H6D3 TRIM17-205ENST00000456946 1731 ntTSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
XKR8Q9H6D3 AC069224.1-201ENST00000566372 1715 ntBASIC15.5■□□□□ 0.07
XKR8Q9H6D3 DIABLO-208ENST00000464942 2569 ntTSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
XKR8Q9H6D3 GSKIP-201ENST00000438650 2140 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.5■□□□□ 0.07
XKR8Q9H6D3 SLCO2B1-205ENST00000525650 2121 ntTSL 2 BASIC15.5■□□□□ 0.07
XKR8Q9H6D3 AL603832.2-201ENST00000566195 2125 ntBASIC15.5■□□□□ 0.07
XKR8Q9H6D3 KLHL24-201ENST00000242810 2345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
XKR8Q9H6D3 BANP-204ENST00000393208 2283 ntTSL 2 BASIC15.5■□□□□ 0.07
XKR8Q9H6D3 CACFD1-201ENST00000291722 2688 ntTSL 2 BASIC15.5■□□□□ 0.07
XKR8Q9H6D3 WDR81-202ENST00000409644 6733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
XKR8Q9H6D3 TM2D3-207ENST00000559107 1353 ntTSL 3 BASIC15.49■□□□□ 0.07
XKR8Q9H6D3 ADAMTS1-201ENST00000284984 5191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
XKR8Q9H6D3 PIPOX-201ENST00000323372 2414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
XKR8Q9H6D3 SSH1-201ENST00000326470 2432 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.49■□□□□ 0.07
XKR8Q9H6D3 LOXL3-203ENST00000409249 2431 ntTSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
XKR8Q9H6D3 XRCC1-202ENST00000543982 1994 ntTSL 2 BASIC15.49■□□□□ 0.07
XKR8Q9H6D3 TMUB2-209ENST00000587989 1969 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC15.49■□□□□ 0.07
XKR8Q9H6D3 REXO1L1P-202ENST00000608646 1974 ntBASIC15.49■□□□□ 0.07
XKR8Q9H6D3 LCK-201ENST00000333070 2166 ntTSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
XKR8Q9H6D3 GRB7-205ENST00000445327 2197 ntTSL 2 BASIC15.49■□□□□ 0.07
XKR8Q9H6D3 C15orf62-201ENST00000344320 2370 ntAPPRIS P1 BASIC15.49■□□□□ 0.07
XKR8Q9H6D3 SLC19A2-202ENST00000367804 2976 ntTSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
XKR8Q9H6D3 LMX1B-204ENST00000561065 1300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
XKR8Q9H6D3 GPR89B-201ENST00000314163 1934 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
XKR8Q9H6D3 DZIP1L-204ENST00000469243 2107 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.49■□□□□ 0.07
XKR8Q9H6D3 FGFR4-201ENST00000292408 3122 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
XKR8Q9H6D3 FAM83C-201ENST00000374408 3145 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
XKR8Q9H6D3 SURF4-208ENST00000613129 3148 ntTSL 2 BASIC15.49■□□□□ 0.07
XKR8Q9H6D3 RWDD1-202ENST00000466444 5522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
XKR8Q9H6D3 IFRD1-202ENST00000403825 2290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
XKR8Q9H6D3 HMGA1-204ENST00000401473 1887 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
XKR8Q9H6D3 CMKLR1-206ENST00000552995 1890 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
XKR8Q9H6D3 LCE5A-201ENST00000334269 819 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.49■□□□□ 0.07
XKR8Q9H6D3 MUC1-201ENST00000337604 859 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
XKR8Q9H6D3 FCRLB-204ENST00000367946 1152 ntTSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
XKR8Q9H6D3 MIR661-201ENST00000384842 89 ntBASIC15.49■□□□□ 0.07
XKR8Q9H6D3 AL161785.2-201ENST00000427080 966 ntTSL 3 BASIC15.49■□□□□ 0.07
XKR8Q9H6D3 AC009477.1-201ENST00000452936 217 ntBASIC15.49■□□□□ 0.07
XKR8Q9H6D3 AL627443.1-201ENST00000456477 1035 ntTSL 3 BASIC15.49■□□□□ 0.07
XKR8Q9H6D3 AC008406.2-201ENST00000507058 532 ntTSL 3 BASIC15.49■□□□□ 0.07
XKR8Q9H6D3 TMEM63A-209ENST00000537914 1018 ntTSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
XKR8Q9H6D3 RHBDL2-203ENST00000540558 697 ntTSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
XKR8Q9H6D3 ARL6IP1-202ENST00000546206 1107 ntTSL 2 BASIC15.49■□□□□ 0.07
XKR8Q9H6D3 AC004846.2-201ENST00000556578 777 ntTSL 3 BASIC15.49■□□□□ 0.07
XKR8Q9H6D3 PSMD7-204ENST00000567958 692 ntTSL 3 BASIC15.49■□□□□ 0.07
XKR8Q9H6D3 AC087645.2-202ENST00000586583 643 ntTSL 4 BASIC15.49■□□□□ 0.07
XKR8Q9H6D3 AC092364.2-202ENST00000597012 1073 ntBASIC15.49■□□□□ 0.07
XKR8Q9H6D3 MRNIP-225ENST00000610475 810 ntTSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
XKR8Q9H6D3 MIR6069-201ENST00000620069 79 ntBASIC15.49■□□□□ 0.07
XKR8Q9H6D3 HOTAIRM1_1.1-201ENST00000622675 125 ntBASIC15.49■□□□□ 0.07
XKR8Q9H6D3 AC105277.1-203ENST00000635492 1293 ntTSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
XKR8Q9H6D3 ARL8B-201ENST00000256496 3005 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
XKR8Q9H6D3 PARP9-204ENST00000471785 3040 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.49■□□□□ 0.07
XKR8Q9H6D3 FAM192A-201ENST00000309137 2848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
XKR8Q9H6D3 KLC4-202ENST00000347162 2404 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
XKR8Q9H6D3 LRRC57-204ENST00000563454 2407 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.49■□□□□ 0.07
XKR8Q9H6D3 CLEC18A-209ENST00000615430 2215 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
XKR8Q9H6D3 CLEC18C-211ENST00000618957 2215 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
XKR8Q9H6D3 CLEC18B-205ENST00000619275 2215 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
XKR8Q9H6D3 SMG1P3-206ENST00000522841 2774 ntTSL 2 BASIC15.49■□□□□ 0.07
XKR8Q9H6D3 CC2D1B-202ENST00000371586 5642 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
XKR8Q9H6D3 MDM2-209ENST00000393412 1404 ntTSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
XKR8Q9H6D3 KCNJ12-201ENST00000331718 2198 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
XKR8Q9H6D3 PRDM1-203ENST00000369096 5164 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
XKR8Q9H6D3 PKP4-AS1-203ENST00000629904 1951 ntTSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
XKR8Q9H6D3 TRIML1-201ENST00000332517 1797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
XKR8Q9H6D3 UBXN11-205ENST00000374221 1792 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC15.49■□□□□ 0.07
XKR8Q9H6D3 ASAH1-240ENST00000636997 1774 ntTSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
XKR8Q9H6D3 RASGRP2-201ENST00000354024 2310 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
XKR8Q9H6D3 GBA2-203ENST00000378103 3611 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 54.4 ms