Protein–RNA interactions for Protein: Q9BQI5

SGIP1, SH3-containing GRB2-like protein 3-interacting protein 1, humanhuman

Predictions only

Length 828 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SGIP1Q9BQI5 KCNMB4-201ENST00000258111 4731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
SGIP1Q9BQI5 FOXI3-201ENST00000428390 2804 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC19.29■□□□□ 0.68
SGIP1Q9BQI5 KRT15-203ENST00000393976 2394 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.29■□□□□ 0.68
SGIP1Q9BQI5 KRT6C-201ENST00000252250 2289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
SGIP1Q9BQI5 KRT6B-201ENST00000252252 2282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
SGIP1Q9BQI5 RDH5-201ENST00000257895 1269 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
SGIP1Q9BQI5 GON7-201ENST00000306954 1154 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
SGIP1Q9BQI5 HPGD-203ENST00000422112 805 ntTSL 2 BASIC19.29■□□□□ 0.68
SGIP1Q9BQI5 HCFC1-AS1-201ENST00000438219 350 ntTSL 3 BASIC19.29■□□□□ 0.68
SGIP1Q9BQI5 LINC01431-201ENST00000442440 514 ntTSL 3 BASIC19.29■□□□□ 0.68
SGIP1Q9BQI5 Metazoa_SRP.100-201ENST00000447610 282 ntBASIC19.29■□□□□ 0.68
SGIP1Q9BQI5 RBM8B-201ENST00000555532 525 ntBASIC19.29■□□□□ 0.68
SGIP1Q9BQI5 AC010531.4-203ENST00000561709 660 ntTSL 3 BASIC19.29■□□□□ 0.68
SGIP1Q9BQI5 AL031713.1-201ENST00000564813 661 ntBASIC19.29■□□□□ 0.68
SGIP1Q9BQI5 SNORD3B-2-202ENST00000571722 791 ntBASIC19.29■□□□□ 0.68
SGIP1Q9BQI5 HS3ST3A1-202ENST00000578576 750 ntTSL 3 BASIC19.29■□□□□ 0.68
SGIP1Q9BQI5 AC018761.2-201ENST00000585496 296 ntTSL 3 BASIC19.29■□□□□ 0.68
SGIP1Q9BQI5 RPL17P45-201ENST00000586289 509 ntBASIC19.29■□□□□ 0.68
SGIP1Q9BQI5 UBA52-208ENST00000596304 554 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.29■□□□□ 0.68
SGIP1Q9BQI5 AC009948.4-201ENST00000604692 675 ntBASIC19.29■□□□□ 0.68
SGIP1Q9BQI5 PSEN2-211ENST00000626989 1972 ntTSL 5 BASIC19.29■□□□□ 0.68
SGIP1Q9BQI5 MEIS3-206ENST00000559524 1828 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC19.29■□□□□ 0.68
SGIP1Q9BQI5 TAF4-201ENST00000252996 4628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
SGIP1Q9BQI5 AGAP6-201ENST00000374056 2703 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
SGIP1Q9BQI5 LONRF3-202ENST00000371628 2550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
SGIP1Q9BQI5 PLA1A-204ENST00000488919 1456 ntTSL 2 BASIC19.28■□□□□ 0.68
SGIP1Q9BQI5 UAP1-204ENST00000367926 2294 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
SGIP1Q9BQI5 SNAP47-AS1-201ENST00000413347 1708 ntTSL 2 BASIC19.28■□□□□ 0.68
SGIP1Q9BQI5 RBM17-201ENST00000379888 2755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
SGIP1Q9BQI5 SCRN1-205ENST00000425819 1552 ntTSL 2 BASIC19.28■□□□□ 0.68
SGIP1Q9BQI5 BLOC1S3-201ENST00000433642 2601 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.28■□□□□ 0.68
SGIP1Q9BQI5 CTSD-211ENST00000637387 1597 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.28■□□□□ 0.68
SGIP1Q9BQI5 ZFP69-202ENST00000372706 2871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
SGIP1Q9BQI5 UEVLD-203ENST00000379387 1848 ntTSL 2 BASIC19.28■□□□□ 0.68
SGIP1Q9BQI5 MAFF-201ENST00000338483 2490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
SGIP1Q9BQI5 TMEM170A-207ENST00000569540 2331 ntTSL 2 BASIC19.28■□□□□ 0.68
SGIP1Q9BQI5 INSR-201ENST00000302850 4721 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
SGIP1Q9BQI5 WDR54-201ENST00000348227 1147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
SGIP1Q9BQI5 CIDEC-202ENST00000383817 1199 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
SGIP1Q9BQI5 AL590093.1-201ENST00000416119 623 ntTSL 5 BASIC19.28■□□□□ 0.68
SGIP1Q9BQI5 AL356056.1-201ENST00000437899 369 ntTSL 5 BASIC19.28■□□□□ 0.68
SGIP1Q9BQI5 BX322559.1-201ENST00000456613 319 ntTSL 3 BASIC19.28■□□□□ 0.68
SGIP1Q9BQI5 UPK1B-205ENST00000497685 981 ntTSL 2 BASIC19.28■□□□□ 0.68
SGIP1Q9BQI5 FAM86B1-218ENST00000534520 808 ntTSL 2 BASIC19.28■□□□□ 0.68
SGIP1Q9BQI5 AC044839.1-204ENST00000634777 1058 ntTSL 5 BASIC19.28■□□□□ 0.68
SGIP1Q9BQI5 TXNRD2-218ENST00000542719 2024 ntTSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
SGIP1Q9BQI5 AP005717.1-201ENST00000500705 1899 ntTSL 5 BASIC19.28■□□□□ 0.68
SGIP1Q9BQI5 FAM153B-220ENST00000515817 1966 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC19.28■□□□□ 0.68
SGIP1Q9BQI5 SLC13A5-208ENST00000573648 1723 ntTSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
SGIP1Q9BQI5 ARHGAP22-206ENST00000435790 2595 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.28■□□□□ 0.68
SGIP1Q9BQI5 KRT6A-201ENST00000330722 2310 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
SGIP1Q9BQI5 AC067852.2-201ENST00000590513 2313 ntBASIC19.28■□□□□ 0.68
SGIP1Q9BQI5 MAP3K15-201ENST00000338883 4012 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.28■□□□□ 0.68
SGIP1Q9BQI5 PSMD13-215ENST00000621534 1572 ntTSL 5 BASIC19.27■□□□□ 0.68
SGIP1Q9BQI5 ACOXL-201ENST00000340561 2188 ntTSL 1 (best) BASIC19.27■□□□□ 0.68
SGIP1Q9BQI5 TMEM106A-202ENST00000541594 1330 ntTSL 2 BASIC19.27■□□□□ 0.68
SGIP1Q9BQI5 SH2D2A-202ENST00000368199 1658 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.27■□□□□ 0.68
SGIP1Q9BQI5 THEM4-201ENST00000368814 2377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.27■□□□□ 0.68
SGIP1Q9BQI5 ASB7-203ENST00000558747 2133 ntTSL 5 BASIC19.27■□□□□ 0.68
SGIP1Q9BQI5 TLE6-202ENST00000452088 1883 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.27■□□□□ 0.68
SGIP1Q9BQI5 RASA4B-201ENST00000306682 2589 ntTSL 1 (best) BASIC19.27■□□□□ 0.68
SGIP1Q9BQI5 IFNA1-201ENST00000276927 863 ntAPPRIS P1 BASIC19.27■□□□□ 0.68
SGIP1Q9BQI5 HFE-203ENST00000336625 804 ntTSL 1 (best) BASIC19.27■□□□□ 0.68
SGIP1Q9BQI5 TMEM239-202ENST00000380585 571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.27■□□□□ 0.68
SGIP1Q9BQI5 HNRNPA1P41-201ENST00000397777 928 ntBASIC19.27■□□□□ 0.68
SGIP1Q9BQI5 SERPINE3-201ENST00000400389 1218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.27■□□□□ 0.68
SGIP1Q9BQI5 IGF1-205ENST00000424202 612 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.27■□□□□ 0.68
SGIP1Q9BQI5 NAGK-204ENST00000443872 878 ntTSL 3 BASIC19.27■□□□□ 0.68
SGIP1Q9BQI5 AC092535.3-201ENST00000504969 468 ntTSL 3 BASIC19.27■□□□□ 0.68
SGIP1Q9BQI5 VDAC3-211ENST00000522572 799 ntTSL 5 BASIC19.27■□□□□ 0.68
SGIP1Q9BQI5 AP000808.2-201ENST00000542410 569 ntTSL 4 BASIC19.27■□□□□ 0.68
SGIP1Q9BQI5 CDIP1-202ENST00000562334 1205 ntTSL 2 BASIC19.27■□□□□ 0.68
SGIP1Q9BQI5 IRF3-215ENST00000596822 823 ntTSL 3 BASIC19.27■□□□□ 0.68
SGIP1Q9BQI5 AL132780.4-201ENST00000624870 1135 ntBASIC19.27■□□□□ 0.68
SGIP1Q9BQI5 AL606763.1-201ENST00000629535 462 ntTSL 3 BASIC19.27■□□□□ 0.68
SGIP1Q9BQI5 TRPV3-209ENST00000576742 2766 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.27■□□□□ 0.68
SGIP1Q9BQI5 HLA-DQB1-204ENST00000399084 1734 ntAPPRIS P1 BASIC19.27■□□□□ 0.68
SGIP1Q9BQI5 CALCOCO2-211ENST00000508679 1396 ntTSL 2 BASIC19.27■□□□□ 0.68
SGIP1Q9BQI5 CHTF18-202ENST00000317063 2988 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.27■□□□□ 0.68
SGIP1Q9BQI5 GPN3-201ENST00000228827 1468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.27■□□□□ 0.67
SGIP1Q9BQI5 EGFL6-202ENST00000380602 2385 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.27■□□□□ 0.67
SGIP1Q9BQI5 TRIM50-201ENST00000333149 2047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.27■□□□□ 0.67
SGIP1Q9BQI5 PGAP2-205ENST00000396993 1566 ntTSL 1 (best) BASIC19.27■□□□□ 0.67
SGIP1Q9BQI5 AJUBA-202ENST00000361265 2569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.27■□□□□ 0.67
SGIP1Q9BQI5 CYP2E1-201ENST00000252945 1667 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.27■□□□□ 0.67
SGIP1Q9BQI5 LMNA-203ENST00000368297 1679 ntTSL 2 BASIC19.27■□□□□ 0.67
SGIP1Q9BQI5 LGALS12-205ENST00000425950 1789 ntTSL 1 (best) BASIC19.27■□□□□ 0.67
SGIP1Q9BQI5 ALDH3A1-205ENST00000444455 1771 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.27■□□□□ 0.67
SGIP1Q9BQI5 TPD52-209ENST00000518937 2856 ntTSL 2 BASIC19.26■□□□□ 0.67
SGIP1Q9BQI5 SNRNP27-202ENST00000409116 1339 ntTSL 5 BASIC19.26■□□□□ 0.67
SGIP1Q9BQI5 ABCC3-202ENST00000427699 1881 ntTSL 1 (best) BASIC19.26■□□□□ 0.67
SGIP1Q9BQI5 FAM151A-202ENST00000371304 1444 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.26■□□□□ 0.67
SGIP1Q9BQI5 MBTD1-201ENST00000376381 1420 ntTSL 1 (best) BASIC19.26■□□□□ 0.67
SGIP1Q9BQI5 AC008764.6-201ENST00000595909 2069 ntBASIC19.26■□□□□ 0.67
SGIP1Q9BQI5 ARHGEF4-206ENST00000428230 2172 ntTSL 5 BASIC19.26■□□□□ 0.67
SGIP1Q9BQI5 MEG3-205ENST00000412736 1615 ntTSL 2 BASIC19.26■□□□□ 0.67
SGIP1Q9BQI5 DMAC2-210ENST00000592922 1622 ntTSL 2 BASIC19.26■□□□□ 0.67
SGIP1Q9BQI5 BID-201ENST00000317361 2495 ntTSL 1 (best) BASIC19.26■□□□□ 0.67
SGIP1Q9BQI5 ATP6V0E2-212ENST00000611515 2565 ntTSL 1 (best) BASIC19.26■□□□□ 0.67
SGIP1Q9BQI5 FOXD4L6-201ENST00000622588 2034 ntAPPRIS P1 BASIC19.26■□□□□ 0.67
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 37.1 ms