Protein–RNA interactions for Protein: Q99417

MYCBP, c-Myc-binding protein, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 103 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
MYCBPQ99417 PPOX-214ENST00000535223 664 ntTSL 3 BASIC15.56■□□□□ 0.08
MYCBPQ99417 SLC39A2-203ENST00000554422 1259 ntTSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
MYCBPQ99417 AC097641.1-201ENST00000580671 588 ntTSL 4 BASIC15.56■□□□□ 0.08
MYCBPQ99417 AC004076.1-201ENST00000596831 664 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.56■□□□□ 0.08
MYCBPQ99417 AC064834.1-201ENST00000606986 503 ntTSL 3 BASIC15.56■□□□□ 0.08
MYCBPQ99417 C6orf48-210ENST00000614363 748 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.56■□□□□ 0.08
MYCBPQ99417 AC009477.2-201ENST00000635976 171 ntAPPRIS P1 BASIC15.56■□□□□ 0.08
MYCBPQ99417 CLN3-259ENST00000637551 1083 ntTSL 5 BASIC15.56■□□□□ 0.08
MYCBPQ99417 ANKRD11-203ENST00000378330 9132 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
MYCBPQ99417 ARHGAP45-206ENST00000586866 4120 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
MYCBPQ99417 OGFOD3-201ENST00000313056 4287 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.56■□□□□ 0.08
MYCBPQ99417 TMEM106C-203ENST00000449758 1414 ntTSL 2 BASIC15.56■□□□□ 0.08
MYCBPQ99417 ZNF559-202ENST00000393883 5095 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.56■□□□□ 0.08
MYCBPQ99417 ATP5B-201ENST00000262030 1839 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
MYCBPQ99417 ARSH-201ENST00000381130 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
MYCBPQ99417 TRNT1-205ENST00000402675 1935 ntTSL 2 BASIC15.56■□□□□ 0.08
MYCBPQ99417 TBPL2-201ENST00000247219 2037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
MYCBPQ99417 TBC1D3P2-203ENST00000581291 2088 ntTSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
MYCBPQ99417 BCKDHA-201ENST00000269980 2103 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
MYCBPQ99417 USH1C-207ENST00000527720 2278 ntTSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
MYCBPQ99417 MX1-202ENST00000398598 2850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
MYCBPQ99417 AP5Z1-201ENST00000348624 2901 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.56■□□□□ 0.08
MYCBPQ99417 GPR4-201ENST00000323040 3048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
MYCBPQ99417 DENND3-202ENST00000424248 4740 ntTSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
MYCBPQ99417 AMER2-201ENST00000357816 10055 ntTSL 2 BASIC15.55■□□□□ 0.08
MYCBPQ99417 KCNT1-212ENST00000628528 7057 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.55■□□□□ 0.08
MYCBPQ99417 BRSK2-207ENST00000528710 3528 ntTSL 2 BASIC15.55■□□□□ 0.08
MYCBPQ99417 CMIP-208ENST00000566462 3512 ntTSL 4 BASIC15.55■□□□□ 0.08
MYCBPQ99417 SLC26A8-201ENST00000355574 3463 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.55■□□□□ 0.08
MYCBPQ99417 SETD6-203ENST00000394266 3423 ntTSL 5 BASIC15.55■□□□□ 0.08
MYCBPQ99417 SLC35F2-203ENST00000525071 3331 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.55■□□□□ 0.08
MYCBPQ99417 SYNE3-201ENST00000334258 3275 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
MYCBPQ99417 SFSWAP-201ENST00000261674 3246 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
MYCBPQ99417 FAM30A-205ENST00000630242 9612 ntTSL 2 BASIC15.55■□□□□ 0.08
MYCBPQ99417 INSIG1-201ENST00000340368 3010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
MYCBPQ99417 C19orf44-203ENST00000594035 2609 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
MYCBPQ99417 ARAF-203ENST00000377045 2458 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
MYCBPQ99417 C1orf109-201ENST00000358011 2355 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.55■□□□□ 0.08
MYCBPQ99417 CCDC116-201ENST00000292779 2260 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
MYCBPQ99417 PDE9A-201ENST00000291539 2058 ntTSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
MYCBPQ99417 CFAP100-201ENST00000352312 2086 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC15.55■□□□□ 0.08
MYCBPQ99417 RAPGEF3-205ENST00000449771 6061 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.55■□□□□ 0.08
MYCBPQ99417 MEF2D-201ENST00000348159 5965 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
MYCBPQ99417 PATL2-207ENST00000560775 1913 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.55■□□□□ 0.08
MYCBPQ99417 BX640514.1-201ENST00000583223 1918 ntBASIC15.55■□□□□ 0.08
MYCBPQ99417 USP37-202ENST00000338465 1771 ntTSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
MYCBPQ99417 ISYNA1-202ENST00000457269 1703 ntTSL 2 BASIC15.55■□□□□ 0.08
MYCBPQ99417 CAB39-202ENST00000409788 1626 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.55■□□□□ 0.08
MYCBPQ99417 FP565260.6-204ENST00000620528 1640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
MYCBPQ99417 PRDX3-201ENST00000298510 1591 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
MYCBPQ99417 WNT8A-204ENST00000506684 1543 ntTSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
MYCBPQ99417 NFIX-209ENST00000587760 1487 ntTSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
MYCBPQ99417 RPL3-201ENST00000216146 1442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
MYCBPQ99417 CPEB2-209ENST00000538197 6878 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC15.55■□□□□ 0.08
MYCBPQ99417 KLK14-201ENST00000156499 1060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
MYCBPQ99417 HAUS1-201ENST00000282058 1125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
MYCBPQ99417 NKAIN4-201ENST00000370307 793 ntTSL 5 BASIC15.55■□□□□ 0.08
MYCBPQ99417 TMEM53-201ENST00000372235 890 ntTSL 2 BASIC15.55■□□□□ 0.08
MYCBPQ99417 UHRF2-202ENST00000381373 802 ntTSL 3 BASIC15.55■□□□□ 0.08
MYCBPQ99417 TFPT-203ENST00000391759 1205 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
MYCBPQ99417 KLK14-202ENST00000391802 1133 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.55■□□□□ 0.08
MYCBPQ99417 Z99916.2-201ENST00000604037 246 ntBASIC15.55■□□□□ 0.08
MYCBPQ99417 PITPNB-211ENST00000634017 1017 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC15.55■□□□□ 0.08
MYCBPQ99417 CLN6-221ENST00000637494 765 ntTSL 5 BASIC15.55■□□□□ 0.08
MYCBPQ99417 AL031432.5-201ENST00000641059 760 ntBASIC15.55■□□□□ 0.08
MYCBPQ99417 AC005324.3-201ENST00000455584 5514 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.55■□□□□ 0.08
MYCBPQ99417 MLXIPL-203ENST00000354613 3215 ntTSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
MYCBPQ99417 GDPD5-209ENST00000529721 3222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
MYCBPQ99417 NOTCH4-201ENST00000375023 6745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
MYCBPQ99417 DAGLB-201ENST00000297056 2897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
MYCBPQ99417 EPB41L3-201ENST00000341928 4706 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
MYCBPQ99417 POLR2E-213ENST00000615234 2831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
MYCBPQ99417 NUCB1-201ENST00000405315 2668 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
MYCBPQ99417 ENO2-211ENST00000541477 2549 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.55■□□□□ 0.08
MYCBPQ99417 ACP2-201ENST00000256997 2203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
MYCBPQ99417 HS6ST3-201ENST00000376705 7804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
MYCBPQ99417 AC016245.1-201ENST00000570335 3204 ntTSL 2 BASIC15.55■□□□□ 0.08
MYCBPQ99417 NRBF2-201ENST00000277746 1853 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
MYCBPQ99417 PFKM-201ENST00000312352 3078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
MYCBPQ99417 SEZ6L-202ENST00000343706 2898 ntTSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
MYCBPQ99417 CSPG4-201ENST00000308508 8290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
MYCBPQ99417 ALKBH5-201ENST00000399138 2748 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.54■□□□□ 0.08
MYCBPQ99417 SRP9-203ENST00000366839 1596 ntTSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
MYCBPQ99417 AC242426.3-201ENST00000440377 1571 ntTSL 2 BASIC15.54■□□□□ 0.08
MYCBPQ99417 TBC1D3P5-201ENST00000579401 1545 ntBASIC15.54■□□□□ 0.08
MYCBPQ99417 SERBP1-204ENST00000370995 3482 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
MYCBPQ99417 HOXA3-207ENST00000612286 3396 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.54■□□□□ 0.08
MYCBPQ99417 PIGH-201ENST00000216452 1420 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
MYCBPQ99417 TGOLN2-203ENST00000398263 6138 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
MYCBPQ99417 TTC14-202ENST00000382584 2274 ntTSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
MYCBPQ99417 MST1P2-201ENST00000457982 2291 ntBASIC15.54■□□□□ 0.08
MYCBPQ99417 ZKSCAN2-201ENST00000328086 7523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
MYCBPQ99417 UBE3B-202ENST00000342494 5722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
MYCBPQ99417 SUV39H2-201ENST00000313519 3087 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
MYCBPQ99417 DNAJC2-203ENST00000379263 2167 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
MYCBPQ99417 MYADM-201ENST00000336967 3047 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.54■□□□□ 0.08
MYCBPQ99417 KANK2-205ENST00000589359 3048 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.54■□□□□ 0.08
MYCBPQ99417 SSSCA1-201ENST00000309328 698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
MYCBPQ99417 CKS1B-203ENST00000368439 912 ntTSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
MYCBPQ99417 SZT2-202ENST00000372450 1191 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 36.5 ms