Protein–RNA interactions for Protein: Q2VYF4

LETM2, LETM1 domain-containing protein LETM2, mitochondrial, humanhuman

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Length 491 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LETM2Q2VYF4 CDIP1-206ENST00000563507 1463 ntTSL 2 BASIC18.16■□□□□ 0.5
LETM2Q2VYF4 TBC1D2-205ENST00000465784 3349 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
LETM2Q2VYF4 ARNTL2-208ENST00000544915 6785 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.16■□□□□ 0.5
LETM2Q2VYF4 SHISA2-201ENST00000319420 2860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
LETM2Q2VYF4 TRIM17-205ENST00000456946 1731 ntTSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
LETM2Q2VYF4 SPAG7-201ENST00000206020 1058 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
LETM2Q2VYF4 DYNLL1-201ENST00000242577 720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
LETM2Q2VYF4 MRPL43-201ENST00000299179 747 ntTSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
LETM2Q2VYF4 DBNDD2-205ENST00000372717 1207 ntTSL 5 BASIC18.16■□□□□ 0.5
LETM2Q2VYF4 RETN-202ENST00000381324 249 ntTSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
LETM2Q2VYF4 AL365255.1-202ENST00000413887 363 ntTSL 5 BASIC18.16■□□□□ 0.5
LETM2Q2VYF4 AL391069.3-201ENST00000455503 618 ntTSL 2 BASIC18.16■□□□□ 0.5
LETM2Q2VYF4 SUOX-214ENST00000551841 906 ntTSL 3 BASIC18.16■□□□□ 0.5
LETM2Q2VYF4 CCDC85C-204ENST00000555822 930 ntTSL 5 BASIC18.16■□□□□ 0.5
LETM2Q2VYF4 AC138207.8-201ENST00000579692 739 ntTSL 3 BASIC18.16■□□□□ 0.5
LETM2Q2VYF4 AC005498.2-205ENST00000593218 784 ntBASIC18.16■□□□□ 0.5
LETM2Q2VYF4 AL450472.2-201ENST00000603663 1156 ntBASIC18.16■□□□□ 0.5
LETM2Q2VYF4 AC010507.1-202ENST00000633286 381 ntTSL 3 BASIC18.16■□□□□ 0.5
LETM2Q2VYF4 AL359644.1-202ENST00000637541 571 ntTSL 3 BASIC18.16■□□□□ 0.5
LETM2Q2VYF4 FOXO3-201ENST00000343882 7308 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
LETM2Q2VYF4 CADPS2-204ENST00000412584 4308 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
LETM2Q2VYF4 RBPMS-204ENST00000397323 2941 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
LETM2Q2VYF4 MANBAL-204ENST00000397151 1503 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.16■□□□□ 0.5
LETM2Q2VYF4 MANBAL-205ENST00000397152 1539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
LETM2Q2VYF4 PIP4K2C-207ENST00000550465 1532 ntTSL 2 BASIC18.16■□□□□ 0.5
LETM2Q2VYF4 SNRPD3-201ENST00000215829 1763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
LETM2Q2VYF4 KEAP1-201ENST00000171111 2955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
LETM2Q2VYF4 COL26A1-201ENST00000313669 3033 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
LETM2Q2VYF4 C1orf43-202ENST00000362076 1551 ntTSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
LETM2Q2VYF4 ANKRD20A5P-207ENST00000581935 2089 ntTSL 2 BASIC18.16■□□□□ 0.5
LETM2Q2VYF4 PIGT-201ENST00000279035 1880 ntTSL 2 BASIC18.16■□□□□ 0.5
LETM2Q2VYF4 NPBWR2-201ENST00000369768 1352 ntAPPRIS P1 BASIC18.16■□□□□ 0.5
LETM2Q2VYF4 AKAP9-205ENST00000394564 1356 ntTSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
LETM2Q2VYF4 HMGA1-204ENST00000401473 1887 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
LETM2Q2VYF4 GLMP-213ENST00000612353 1365 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.16■□□□□ 0.5
LETM2Q2VYF4 GLMP-215ENST00000622703 1364 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.16■□□□□ 0.5
LETM2Q2VYF4 SCPEP1-201ENST00000262288 1942 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
LETM2Q2VYF4 AC006063.2-201ENST00000640161 1696 ntTSL 5 BASIC18.15■□□□□ 0.5
LETM2Q2VYF4 PHTF1-205ENST00000393357 3244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
LETM2Q2VYF4 PMS1-212ENST00000432292 3234 ntTSL 2 BASIC18.15■□□□□ 0.5
LETM2Q2VYF4 PMS1-213ENST00000441310 3225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
LETM2Q2VYF4 ATP6V0E1-203ENST00000519374 1433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
LETM2Q2VYF4 RGR-202ENST00000359452 2247 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
LETM2Q2VYF4 ZSCAN2-214ENST00000546148 2242 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC18.15■□□□□ 0.5
LETM2Q2VYF4 AL353608.3-201ENST00000603200 2211 ntTSL 5 BASIC18.15■□□□□ 0.5
LETM2Q2VYF4 CCNA2-201ENST00000274026 2797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
LETM2Q2VYF4 AC005906.2-217ENST00000639573 1711 ntTSL 5 BASIC18.15■□□□□ 0.5
LETM2Q2VYF4 WASHC2C-202ENST00000359860 4471 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.15■□□□□ 0.5
LETM2Q2VYF4 KDM4B-203ENST00000536461 5027 ntTSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
LETM2Q2VYF4 H1F0-201ENST00000340857 2344 ntAPPRIS P1 BASIC18.15■□□□□ 0.5
LETM2Q2VYF4 RBFOX3-212ENST00000584778 1547 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.15■□□□□ 0.5
LETM2Q2VYF4 PDE4C-202ENST00000355502 5979 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC18.15■□□□□ 0.5
LETM2Q2VYF4 SCNN1A-221ENST00000543768 2361 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.15■□□□□ 0.5
LETM2Q2VYF4 FEZF1-AS1-202ENST00000428449 2653 ntTSL 2 BASIC18.15■□□□□ 0.5
LETM2Q2VYF4 PACS1-201ENST00000320580 4392 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
LETM2Q2VYF4 CLPP-201ENST00000245816 1155 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
LETM2Q2VYF4 CIB3-201ENST00000269878 711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
LETM2Q2VYF4 NDUFS8-201ENST00000313468 791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
LETM2Q2VYF4 ACRV1-201ENST00000315608 1042 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
LETM2Q2VYF4 LCE5A-201ENST00000334269 819 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.15■□□□□ 0.5
LETM2Q2VYF4 PHKG1P2-201ENST00000457537 863 ntBASIC18.15■□□□□ 0.5
LETM2Q2VYF4 NECAP2-203ENST00000457722 935 ntTSL 2 BASIC18.15■□□□□ 0.5
LETM2Q2VYF4 SSBP1-214ENST00000498107 636 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
LETM2Q2VYF4 MTFR1L-218ENST00000526894 733 ntTSL 4 BASIC18.15■□□□□ 0.5
LETM2Q2VYF4 CFL1-212ENST00000531413 636 ntTSL 3 BASIC18.15■□□□□ 0.5
LETM2Q2VYF4 TRMT112-206ENST00000544844 1106 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
LETM2Q2VYF4 AL583722.3-202ENST00000554954 486 ntTSL 4 BASIC18.15■□□□□ 0.5
LETM2Q2VYF4 TGIF2-C20orf24-201ENST00000558530 918 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.15■□□□□ 0.5
LETM2Q2VYF4 MPI-209ENST00000564003 1195 ntTSL 2 BASIC18.15■□□□□ 0.5
LETM2Q2VYF4 SALL3-206ENST00000616649 2958 ntTSL 5 BASIC18.15■□□□□ 0.5
LETM2Q2VYF4 AL590560.3-201ENST00000623350 461 ntBASIC18.15■□□□□ 0.5
LETM2Q2VYF4 CLN3-246ENST00000636228 1224 ntTSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
LETM2Q2VYF4 OCIAD1-202ENST00000381473 1594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
LETM2Q2VYF4 CHID1-201ENST00000323578 3374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
LETM2Q2VYF4 STARD7-201ENST00000337288 3368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
LETM2Q2VYF4 TMPO-AS1-202ENST00000548760 3357 ntTSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
LETM2Q2VYF4 ATP6AP2-233ENST00000638153 1303 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.15■□□□□ 0.5
LETM2Q2VYF4 CACNA1A-240ENST00000637432 7809 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.15■□□□□ 0.5
LETM2Q2VYF4 CACNA1A-258ENST00000638029 7814 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.15■□□□□ 0.5
LETM2Q2VYF4 SALL4-203ENST00000395997 1918 ntTSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
LETM2Q2VYF4 IL12RB2-205ENST00000541374 3849 ntTSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
LETM2Q2VYF4 CCT6A-201ENST00000275603 2719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.5
LETM2Q2VYF4 SUN2-203ENST00000406622 2725 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.14■□□□□ 0.5
LETM2Q2VYF4 NT5C3A-204ENST00000405342 1759 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.5
LETM2Q2VYF4 HHIP-202ENST00000434550 1770 ntTSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.5
LETM2Q2VYF4 SPATA21-205ENST00000540400 1773 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.5
LETM2Q2VYF4 TJP1-201ENST00000346128 7950 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.5
LETM2Q2VYF4 FDPS-201ENST00000356657 1478 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.5
LETM2Q2VYF4 GPR61-206ENST00000616874 2459 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.14■□□□□ 0.5
LETM2Q2VYF4 TSSK2-201ENST00000399635 1816 ntAPPRIS P1 BASIC18.14■□□□□ 0.5
LETM2Q2VYF4 NELFA-203ENST00000411638 2199 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
LETM2Q2VYF4 KLHL36-204ENST00000564996 2173 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
LETM2Q2VYF4 NCOA1-205ENST00000406961 7289 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC18.14■□□□□ 0.49
LETM2Q2VYF4 NEO1-202ENST00000339362 7342 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.14■□□□□ 0.49
LETM2Q2VYF4 CTPS2-201ENST00000359276 3629 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
LETM2Q2VYF4 RGS7-203ENST00000366564 2295 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
LETM2Q2VYF4 VWA2-203ENST00000603594 2600 ntTSL 2 BASIC18.14■□□□□ 0.49
LETM2Q2VYF4 EFEMP1-202ENST00000394555 3024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
LETM2Q2VYF4 USE1-201ENST00000263897 843 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
LETM2Q2VYF4 POP5-202ENST00000357500 801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
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