Protein–RNA interactions for Protein: Q15544

TAF11, Transcription initiation factor TFIID subunit 11, humanhuman

Predictions only

Length 211 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TAF11Q15544 AC016757.1-205ENST00000470346 1888 ntTSL 2 BASIC15.63■□□□□ 0.09
TAF11Q15544 C16orf58-201ENST00000327237 2793 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
TAF11Q15544 UBA1-202ENST00000377269 2497 ntTSL 2 BASIC15.62■□□□□ 0.09
TAF11Q15544 ABHD14B-204ENST00000461108 1397 ntTSL 2 BASIC15.62■□□□□ 0.09
TAF11Q15544 PHYHD1-201ENST00000308941 1599 ntTSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
TAF11Q15544 BCS1L-202ENST00000392109 1583 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
TAF11Q15544 BCS1L-204ENST00000392111 1584 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
TAF11Q15544 RSPH6A-203ENST00000600188 1751 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.62■□□□□ 0.09
TAF11Q15544 DUOXA1-210ENST00000559014 1965 ntTSL 2 BASIC15.62■□□□□ 0.09
TAF11Q15544 AHCYL2-202ENST00000446544 5026 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
TAF11Q15544 PRMT7-202ENST00000441236 2204 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
TAF11Q15544 KLHL25-201ENST00000337975 3758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
TAF11Q15544 SNRPA1-201ENST00000254193 1055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
TAF11Q15544 PTGDS-202ENST00000371625 807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
TAF11Q15544 NMRK1-202ENST00000376808 1121 ntTSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
TAF11Q15544 MIR648-201ENST00000385046 94 ntBASIC15.62■□□□□ 0.09
TAF11Q15544 EEF1D-202ENST00000395119 1249 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
TAF11Q15544 PLAC8-202ENST00000411416 786 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
TAF11Q15544 C12orf76-204ENST00000547573 607 ntTSL 3 BASIC15.62■□□□□ 0.09
TAF11Q15544 AL157871.1-202ENST00000556458 478 ntTSL 5 BASIC15.62■□□□□ 0.09
TAF11Q15544 NTF4-201ENST00000593537 932 ntAPPRIS P1 BASIC15.62■□□□□ 0.09
TAF11Q15544 GNAS-AS1-203ENST00000598163 548 ntTSL 4 BASIC15.62■□□□□ 0.09
TAF11Q15544 AC011467.2-201ENST00000598425 242 ntBASIC15.62■□□□□ 0.09
TAF11Q15544 HSP90B1-211ENST00000640977 1127 ntTSL 5 BASIC15.62■□□□□ 0.09
TAF11Q15544 DDX20-201ENST00000369702 4212 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
TAF11Q15544 IRAK4-212ENST00000551736 1684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
TAF11Q15544 PEX5-207ENST00000455147 2689 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.62■□□□□ 0.09
TAF11Q15544 NEDD4L-202ENST00000356462 3335 ntTSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
TAF11Q15544 GMPR-201ENST00000259727 1515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
TAF11Q15544 TSPAN32-201ENST00000182290 1318 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
TAF11Q15544 UBE2D4-201ENST00000222402 3974 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
TAF11Q15544 KRT18P1-202ENST00000452408 1331 ntBASIC15.62■□□□□ 0.09
TAF11Q15544 TSPAN32-217ENST00000612299 1301 ntTSL 5 BASIC15.62■□□□□ 0.09
TAF11Q15544 NPR1-202ENST00000368680 4236 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
TAF11Q15544 CCT3-201ENST00000295688 2150 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
TAF11Q15544 TRIP10-201ENST00000313244 2153 ntTSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
TAF11Q15544 HMOX2-205ENST00000458134 1797 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.62■□□□□ 0.09
TAF11Q15544 PTPN9-201ENST00000306726 3862 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.62■□□□□ 0.09
TAF11Q15544 ZBTB7C-213ENST00000588982 4949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
TAF11Q15544 NRDC-201ENST00000352171 3691 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
TAF11Q15544 CPSF7-202ENST00000394888 3650 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC15.62■□□□□ 0.09
TAF11Q15544 LINC00271-201ENST00000421378 1580 ntTSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
TAF11Q15544 ALDH3A1-212ENST00000494157 1572 ntTSL 3 BASIC15.62■□□□□ 0.09
TAF11Q15544 STAC3-206ENST00000554578 1580 ntTSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
TAF11Q15544 GLYCTK-201ENST00000305690 1371 ntTSL 5 BASIC15.62■□□□□ 0.09
TAF11Q15544 PORCN-205ENST00000367574 1368 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
TAF11Q15544 IER3-202ENST00000376377 1350 ntBASIC15.62■□□□□ 0.09
TAF11Q15544 AC011840.1-202ENST00000436477 1351 ntTSL 2 BASIC15.62■□□□□ 0.09
TAF11Q15544 PORCN-214ENST00000537758 1371 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
TAF11Q15544 IFNAR2-202ENST00000342136 2899 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
TAF11Q15544 MED4-201ENST00000258648 2022 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
TAF11Q15544 LINC00029-201ENST00000370341 1631 ntTSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
TAF11Q15544 AMT-204ENST00000427987 1646 ntTSL 5 BASIC15.61■□□□□ 0.09
TAF11Q15544 SAFB2-201ENST00000252542 3371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
TAF11Q15544 GNAO1-202ENST00000262494 5767 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
TAF11Q15544 AGAP7P-201ENST00000582299 2062 ntBASIC15.61■□□□□ 0.09
TAF11Q15544 AGAP14-201ENST00000624701 2060 ntBASIC15.61■□□□□ 0.09
TAF11Q15544 RAD1-208ENST00000628399 1678 ntTSL 3 BASIC15.61■□□□□ 0.09
TAF11Q15544 HELZ2-204ENST00000467148 8064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
TAF11Q15544 GJD2-201ENST00000290374 2889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
TAF11Q15544 FHDC1-202ENST00000511601 6583 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.61■□□□□ 0.09
TAF11Q15544 EIF4G1-201ENST00000342981 5667 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
TAF11Q15544 KHDC1-201ENST00000257765 1134 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
TAF11Q15544 ARMC10P1-201ENST00000313754 855 ntBASIC15.61■□□□□ 0.09
TAF11Q15544 BET1L-202ENST00000332865 533 ntTSL 5 BASIC15.61■□□□□ 0.09
TAF11Q15544 UBE2J2-204ENST00000400929 1057 ntTSL 3 BASIC15.61■□□□□ 0.09
TAF11Q15544 TRIM73-203ENST00000437796 1169 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
TAF11Q15544 PCAT7-201ENST00000452148 1164 ntTSL 2 BASIC15.61■□□□□ 0.09
TAF11Q15544 HOXB-AS3-203ENST00000465846 434 ntTSL 3 BASIC15.61■□□□□ 0.09
TAF11Q15544 AC113382.1-201ENST00000500267 1253 ntTSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
TAF11Q15544 KRT18P35-201ENST00000510488 1269 ntBASIC15.61■□□□□ 0.09
TAF11Q15544 RNASEH2C-202ENST00000527610 835 ntTSL 2 BASIC15.61■□□□□ 0.09
TAF11Q15544 AP001453.1-201ENST00000534988 923 ntTSL 3 BASIC15.61■□□□□ 0.09
TAF11Q15544 SHBG-211ENST00000574539 938 ntTSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
TAF11Q15544 KHDC1-207ENST00000610435 1101 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.61■□□□□ 0.09
TAF11Q15544 ELF2-207ENST00000510408 1965 ntTSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
TAF11Q15544 PBX3-203ENST00000373487 2902 ntTSL 5 BASIC15.61■□□□□ 0.09
TAF11Q15544 CLDN7-201ENST00000360325 1542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
TAF11Q15544 BBS2-201ENST00000245157 2963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
TAF11Q15544 ANK1-202ENST00000289734 8297 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
TAF11Q15544 AKIRIN1-201ENST00000372984 1330 ntTSL 2 BASIC15.61■□□□□ 0.09
TAF11Q15544 KCNMA1-202ENST00000286628 6233 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
TAF11Q15544 CYTH3-201ENST00000350796 4505 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
TAF11Q15544 CYTH3-202ENST00000396741 4508 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.61■□□□□ 0.09
TAF11Q15544 ADAMTS14-201ENST00000373207 5260 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
TAF11Q15544 GOPC-201ENST00000052569 4590 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
TAF11Q15544 C1orf43-201ENST00000350592 1610 ntTSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
TAF11Q15544 AL354714.1-201ENST00000356006 2136 ntTSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
TAF11Q15544 PPP1R13L-202ENST00000418234 3118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
TAF11Q15544 AC233702.3-201ENST00000578656 1387 ntBASIC15.61■□□□□ 0.09
TAF11Q15544 ELF4-201ENST00000308167 4165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
TAF11Q15544 PSEN2-203ENST00000422240 1947 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC15.6■□□□□ 0.09
TAF11Q15544 AL135999.2-201ENST00000622438 1686 ntBASIC15.6■□□□□ 0.09
TAF11Q15544 AC138969.2-201ENST00000532739 9932 ntBASIC15.6■□□□□ 0.09
TAF11Q15544 WASHC2A-202ENST00000314664 4519 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
TAF11Q15544 ACY1-206ENST00000476351 1409 ntTSL 3 BASIC15.6■□□□□ 0.09
TAF11Q15544 CFC1B-203ENST00000620207 1444 ntTSL 5 BASIC15.6■□□□□ 0.09
TAF11Q15544 CFC1-203ENST00000621673 1444 ntTSL 2 BASIC15.6■□□□□ 0.09
TAF11Q15544 TTC39A-208ENST00000413473 2718 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
TAF11Q15544 ADCY7-208ENST00000566433 2535 ntTSL 5 BASIC15.6■□□□□ 0.09
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 47.3 ms