Protein–RNA interactions for Protein: Q13835

PKP1, Plakophilin-1, humanhuman

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Length 747 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PKP1Q13835 LINC01978-202ENST00000574526 1540 ntTSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
PKP1Q13835 FBP1-201ENST00000375326 1462 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
PKP1Q13835 ZFP1-209ENST00000570010 1457 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.6■□□□□ 0.57
PKP1Q13835 SLC6A11-201ENST00000254488 4296 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
PKP1Q13835 AGAP4-208ENST00000618171 2387 ntTSL 5 BASIC18.6■□□□□ 0.57
PKP1Q13835 AC013726.1-201ENST00000563747 2285 ntBASIC18.6■□□□□ 0.57
PKP1Q13835 NR1H3-204ENST00000407404 1330 ntTSL 5 BASIC18.6■□□□□ 0.57
PKP1Q13835 BCAR1-209ENST00000546196 1340 ntBASIC18.6■□□□□ 0.57
PKP1Q13835 MAPK7-203ENST00000395602 3059 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
PKP1Q13835 RNF222-202ENST00000399398 3062 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.6■□□□□ 0.57
PKP1Q13835 MAL-203ENST00000353004 873 ntTSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
PKP1Q13835 PLD3-204ENST00000409281 2115 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.6■□□□□ 0.57
PKP1Q13835 AL049612.1-201ENST00000427017 694 ntTSL 5 BASIC18.6■□□□□ 0.57
PKP1Q13835 ARSK-202ENST00000504763 1088 ntTSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
PKP1Q13835 AC025674.2-201ENST00000522622 2971 ntTSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
PKP1Q13835 RAB1B-202ENST00000527397 991 ntTSL 3 BASIC18.6■□□□□ 0.57
PKP1Q13835 C9orf172-201ENST00000436881 4387 ntAPPRIS P1 BASIC18.6■□□□□ 0.57
PKP1Q13835 DUOXA1-210ENST00000559014 1965 ntTSL 2 BASIC18.6■□□□□ 0.57
PKP1Q13835 CFAP53-201ENST00000398545 1851 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
PKP1Q13835 ADAM23-201ENST00000264377 6330 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
PKP1Q13835 FABP1-202ENST00000393750 1839 ntTSL 2 BASIC18.6■□□□□ 0.57
PKP1Q13835 SNRPD3-201ENST00000215829 1763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
PKP1Q13835 KAT7-210ENST00000509773 1774 ntTSL 2 BASIC18.6■□□□□ 0.57
PKP1Q13835 NDUFA11-202ENST00000418389 2406 ntTSL 2 BASIC18.6■□□□□ 0.57
PKP1Q13835 UBE2D3-207ENST00000394801 2368 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
PKP1Q13835 ZNF219-203ENST00000451119 2918 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.6■□□□□ 0.57
PKP1Q13835 F10-202ENST00000375559 1517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
PKP1Q13835 AMPD2-218ENST00000528454 2728 ntTSL 2 BASIC18.59■□□□□ 0.57
PKP1Q13835 MYH14-203ENST00000425460 6811 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.59■□□□□ 0.57
PKP1Q13835 ABHD11-201ENST00000222800 1483 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
PKP1Q13835 ZNF706-201ENST00000311212 2615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
PKP1Q13835 TLCD2-201ENST00000330676 5971 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.59■□□□□ 0.57
PKP1Q13835 BCR-201ENST00000305877 7082 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
PKP1Q13835 NFE2L1-214ENST00000582155 1998 ntTSL 2 BASIC18.59■□□□□ 0.57
PKP1Q13835 ZXDA-201ENST00000358697 4113 ntAPPRIS P1 BASIC18.59■□□□□ 0.57
PKP1Q13835 KLC4-204ENST00000453940 1945 ntTSL 2 BASIC18.59■□□□□ 0.57
PKP1Q13835 TBC1D10A-203ENST00000403362 1833 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.59■□□□□ 0.57
PKP1Q13835 PPP1R3G-201ENST00000405617 4907 ntAPPRIS P1 BASIC18.59■□□□□ 0.57
PKP1Q13835 BRCC3-202ENST00000340647 1101 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC18.59■□□□□ 0.57
PKP1Q13835 ASTL-201ENST00000342380 1296 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
PKP1Q13835 CRIP1-203ENST00000409393 677 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.59■□□□□ 0.57
PKP1Q13835 MIR503HG-203ENST00000441492 649 ntTSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
PKP1Q13835 AGBL5-AS1-201ENST00000444217 407 ntTSL 5 BASIC18.59■□□□□ 0.57
PKP1Q13835 GSTK1-207ENST00000479303 1185 ntTSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
PKP1Q13835 C8orf46-213ENST00000521495 557 ntTSL 4 BASIC18.59■□□□□ 0.57
PKP1Q13835 YPEL3-209ENST00000566595 796 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.59■□□□□ 0.57
PKP1Q13835 FAM71E1-202ENST00000595790 1225 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
PKP1Q13835 PGLYRP1-201ENST00000008938 720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
PKP1Q13835 IL18BP-204ENST00000393703 1788 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC18.59■□□□□ 0.57
PKP1Q13835 SNX11-202ENST00000393405 2733 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.59■□□□□ 0.57
PKP1Q13835 UNC5C-203ENST00000506749 2220 ntTSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
PKP1Q13835 TTC29-208ENST00000513335 2226 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.59■□□□□ 0.57
PKP1Q13835 MAGEA2B-202ENST00000370293 1714 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.59■□□□□ 0.57
PKP1Q13835 SLC52A3-205ENST00000632431 2694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
PKP1Q13835 CDH16-207ENST00000568632 2526 ntTSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
PKP1Q13835 PTPRN2-201ENST00000389413 4723 ntTSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
PKP1Q13835 FAM110C-201ENST00000327669 3760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
PKP1Q13835 CYB561D1-204ENST00000420578 3326 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
PKP1Q13835 AC005912.2-201ENST00000619492 2400 ntBASIC18.59■□□□□ 0.57
PKP1Q13835 CCDC28A-202ENST00000611852 1505 ntTSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
PKP1Q13835 GIT2-202ENST00000354574 5387 ntTSL 5 BASIC18.59■□□□□ 0.57
PKP1Q13835 CTBP1-AS2-205ENST00000578730 2757 ntTSL 2 BASIC18.59■□□□□ 0.57
PKP1Q13835 DOK5-202ENST00000395939 1453 ntTSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.57
PKP1Q13835 MITF-204ENST00000352241 4814 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.57
PKP1Q13835 TMEM53-203ENST00000372242 1846 ntTSL 3 BASIC18.58■□□□□ 0.57
PKP1Q13835 NOL4L-211ENST00000621426 6577 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.58■□□□□ 0.57
PKP1Q13835 GPI-205ENST00000586425 1799 ntTSL 5 BASIC18.58■□□□□ 0.57
PKP1Q13835 PBX3-203ENST00000373487 2902 ntTSL 5 BASIC18.58■□□□□ 0.57
PKP1Q13835 NIPAL3-204ENST00000374399 1711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.57
PKP1Q13835 LPAR1-203ENST00000374431 3637 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.57
PKP1Q13835 AJ011931.1-201ENST00000618749 2492 ntBASIC18.58■□□□□ 0.57
PKP1Q13835 THAP3-202ENST00000307896 1046 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.58■□□□□ 0.56
PKP1Q13835 KCNIP2-208ENST00000370046 923 ntTSL 5 BASIC18.58■□□□□ 0.56
PKP1Q13835 AL049869.3-201ENST00000554918 558 ntTSL 3 BASIC18.58■□□□□ 0.56
PKP1Q13835 AC099522.2-201ENST00000607001 744 ntBASIC18.58■□□□□ 0.56
PKP1Q13835 IGF2-204ENST00000381406 5179 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC18.58■□□□□ 0.56
PKP1Q13835 ALG1-204ENST00000588623 2671 ntTSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.56
PKP1Q13835 C4orf19-201ENST00000284437 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.56
PKP1Q13835 USH1C-207ENST00000527720 2278 ntTSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.56
PKP1Q13835 KIF25-202ENST00000354419 1510 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.56
PKP1Q13835 MFSD2B-202ENST00000406420 1528 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.58■□□□□ 0.56
PKP1Q13835 AC126365.1-201ENST00000578585 1514 ntBASIC18.58■□□□□ 0.56
PKP1Q13835 CASP2-201ENST00000310447 4225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.56
PKP1Q13835 ARF6-201ENST00000298316 3865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.56
PKP1Q13835 CYB561A3-203ENST00000447532 1803 ntTSL 5 BASIC18.58■□□□□ 0.56
PKP1Q13835 RAPSN-203ENST00000524487 1462 ntTSL 5 BASIC18.58■□□□□ 0.56
PKP1Q13835 MRPS21-201ENST00000581066 1462 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.56
PKP1Q13835 GTF3C5-204ENST00000372108 2110 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.56
PKP1Q13835 PDE4C-202ENST00000355502 5979 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC18.58■□□□□ 0.56
PKP1Q13835 PDE7A-203ENST00000401827 3673 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.56
PKP1Q13835 KAT5-202ENST00000352980 2059 ntTSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.56
PKP1Q13835 PCCB-204ENST00000462637 1715 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC18.57■□□□□ 0.56
PKP1Q13835 CNTNAP3-201ENST00000297668 5064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
PKP1Q13835 AZI2-205ENST00000420543 1366 ntTSL 3 BASIC18.57■□□□□ 0.56
PKP1Q13835 GTPBP8-208ENST00000619116 1378 ntTSL 5 BASIC18.57■□□□□ 0.56
PKP1Q13835 PPOX-201ENST00000352210 1686 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
PKP1Q13835 SLC22A16-202ENST00000368919 1987 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
PKP1Q13835 STRN-202ENST00000379213 2254 ntTSL 5 BASIC18.57■□□□□ 0.56
PKP1Q13835 MDFIC-202ENST00000393486 4393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
PKP1Q13835 HSPA1B-201ENST00000375650 2521 ntAPPRIS P1 BASIC18.57■□□□□ 0.56
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