Protein–RNA interactions for Protein: Q12952

FOXL1, Forkhead box protein L1, humanhuman

Predictions only

Length 345 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
FOXL1Q12952 NPNT-201ENST00000305572 3003 ntTSL 1 (best) BASIC13.16□□□□□ -0.3
FOXL1Q12952 TPD52L2-201ENST00000217121 2362 ntTSL 2 BASIC13.16□□□□□ -0.3
FOXL1Q12952 AIFM3-202ENST00000399167 2387 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC13.16□□□□□ -0.3
FOXL1Q12952 AIFM3-207ENST00000440238 2368 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.16□□□□□ -0.3
FOXL1Q12952 CSAD-208ENST00000444623 2122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.16□□□□□ -0.3
FOXL1Q12952 ALMS1P1-202ENST00000450720 1601 ntTSL 1 (best) BASIC13.16□□□□□ -0.3
FOXL1Q12952 AL035456.1-201ENST00000456064 1369 ntBASIC13.16□□□□□ -0.3
FOXL1Q12952 AKR1B15-202ENST00000457545 1621 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.16□□□□□ -0.3
FOXL1Q12952 JPT1-209ENST00000482348 1614 ntTSL 1 (best) BASIC13.16□□□□□ -0.3
FOXL1Q12952 PARP16-201ENST00000261888 2731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.16□□□□□ -0.3
FOXL1Q12952 AC005064.1-201ENST00000422488 2725 ntTSL 1 (best) BASIC13.16□□□□□ -0.3
FOXL1Q12952 ABLIM2-202ENST00000361581 2472 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.16□□□□□ -0.3
FOXL1Q12952 FAM153A-203ENST00000440605 1966 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.16□□□□□ -0.3
FOXL1Q12952 DKC1-213ENST00000620277 3079 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.16□□□□□ -0.3
FOXL1Q12952 PCDHA3-201ENST00000522353 5260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.16□□□□□ -0.3
FOXL1Q12952 ACTN2-207ENST00000546208 5103 ntTSL 1 (best) BASIC13.16□□□□□ -0.3
FOXL1Q12952 CLDN4-201ENST00000340958 1831 ntAPPRIS P1 BASIC13.16□□□□□ -0.3
FOXL1Q12952 ZFP64-205ENST00000371518 1841 ntTSL 1 (best) BASIC13.16□□□□□ -0.3
FOXL1Q12952 SYT6-201ENST00000369547 4369 ntTSL 1 (best) BASIC13.16□□□□□ -0.3
FOXL1Q12952 AC012485.3-201ENST00000637634 2424 ntTSL 5 BASIC13.15□□□□□ -0.3
FOXL1Q12952 AGTPBP1-201ENST00000337006 4473 ntTSL 5 BASIC13.15□□□□□ -0.3
FOXL1Q12952 TMC7-201ENST00000304381 3640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.3
FOXL1Q12952 RTN4RL1-201ENST00000331238 3625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.3
FOXL1Q12952 LMX1B-204ENST00000561065 1300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.3
FOXL1Q12952 RAD51C-215ENST00000583539 1319 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.15□□□□□ -0.3
FOXL1Q12952 POLI-208ENST00000579534 6133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.3
FOXL1Q12952 AC016027.1-202ENST00000607927 1699 ntBASIC13.15□□□□□ -0.3
FOXL1Q12952 TRPM2-208ENST00000621064 1669 ntTSL 5 BASIC13.15□□□□□ -0.3
FOXL1Q12952 GRID2IP-201ENST00000435185 3215 ntTSL 5 BASIC13.15□□□□□ -0.3
FOXL1Q12952 TUBB2B-201ENST00000259818 2020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.3
FOXL1Q12952 CTCF-201ENST00000264010 3939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.3
FOXL1Q12952 XK-201ENST00000378616 5206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.3
FOXL1Q12952 PCDHA12-201ENST00000398631 5233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.3
FOXL1Q12952 DNAAF5-201ENST00000297440 3410 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.3
FOXL1Q12952 BTN3A1-204ENST00000425234 1882 ntTSL 2 BASIC13.15□□□□□ -0.3
FOXL1Q12952 ZNF197-203ENST00000383744 1989 ntTSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.3
FOXL1Q12952 SCLT1-205ENST00000503401 1604 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC13.15□□□□□ -0.3
FOXL1Q12952 TMEM147-AS1-203ENST00000589137 1627 ntTSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.3
FOXL1Q12952 GLIPR2-205ENST00000619700 1645 ntTSL 3 BASIC13.15□□□□□ -0.3
FOXL1Q12952 ALG5-201ENST00000239891 1154 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.3
FOXL1Q12952 MORN4-202ENST00000370635 419 ntTSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.3
FOXL1Q12952 KRTAP6-3-201ENST00000391624 636 ntAPPRIS P1 BASIC13.15□□□□□ -0.3
FOXL1Q12952 AL353779.1-201ENST00000434793 351 ntBASIC13.15□□□□□ -0.3
FOXL1Q12952 AL031283.3-201ENST00000439788 727 ntTSL 3 BASIC13.15□□□□□ -0.3
FOXL1Q12952 DICER1-AS1-202ENST00000439819 810 ntTSL 3 BASIC13.15□□□□□ -0.3
FOXL1Q12952 SPTLC1P1-201ENST00000447199 261 ntBASIC13.15□□□□□ -0.3
FOXL1Q12952 KRT18P34-201ENST00000488218 1270 ntBASIC13.15□□□□□ -0.3
FOXL1Q12952 SLC25A30-AS1-201ENST00000506633 701 ntTSL 3 BASIC13.15□□□□□ -0.3
FOXL1Q12952 LINC01605-204ENST00000522718 1093 ntTSL 3 BASIC13.15□□□□□ -0.3
FOXL1Q12952 AL139349.1-201ENST00000530479 577 ntTSL 4 BASIC13.15□□□□□ -0.3
FOXL1Q12952 COMMD4-207ENST00000562789 746 ntTSL 2 BASIC13.15□□□□□ -0.3
FOXL1Q12952 MPI-209ENST00000564003 1195 ntTSL 2 BASIC13.15□□□□□ -0.3
FOXL1Q12952 TNFRSF13B-206ENST00000583789 859 ntTSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.3
FOXL1Q12952 FOLR3-204ENST00000611028 820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.3
FOXL1Q12952 GPER1-207ENST00000619052 571 ntTSL 2 BASIC13.15□□□□□ -0.3
FOXL1Q12952 CDK18-201ENST00000360066 3141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.3
FOXL1Q12952 MYCBPAP-203ENST00000436259 3102 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.15□□□□□ -0.3
FOXL1Q12952 TFAP2B-202ENST00000393655 5773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.3
FOXL1Q12952 PPP3CB-201ENST00000342558 2418 ntTSL 5 BASIC13.15□□□□□ -0.3
FOXL1Q12952 CHN1-205ENST00000409900 2447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.3
FOXL1Q12952 AC010642.2-201ENST00000634676 2413 ntTSL 5 BASIC13.15□□□□□ -0.3
FOXL1Q12952 TXNDC2-206ENST00000611534 2066 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.15□□□□□ -0.3
FOXL1Q12952 CLN5-208ENST00000636183 6664 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.3
FOXL1Q12952 WDR74-205ENST00000525752 1724 ntTSL 5 BASIC13.15□□□□□ -0.3
FOXL1Q12952 CUX1-213ENST00000549414 4452 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.15□□□□□ -0.3
FOXL1Q12952 TOP3BP1-201ENST00000420768 1380 ntBASIC13.15□□□□□ -0.3
FOXL1Q12952 GALNT16-202ENST00000448469 2270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.3
FOXL1Q12952 MARCH4-201ENST00000273067 4447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.3
FOXL1Q12952 SALL4-203ENST00000395997 1918 ntTSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.3
FOXL1Q12952 TERF1-201ENST00000276602 3268 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.3
FOXL1Q12952 CISH-201ENST00000348721 2043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.3
FOXL1Q12952 DYSF-207ENST00000409762 6727 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.3
FOXL1Q12952 DYSF-211ENST00000429174 6739 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.3
FOXL1Q12952 ANKRD23-201ENST00000318357 2597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.3
FOXL1Q12952 CYP2U1-201ENST00000332884 4944 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.3
FOXL1Q12952 BMP7-201ENST00000395863 4013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.3
FOXL1Q12952 C4A-243ENST00000428956 5460 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.3
FOXL1Q12952 C4B-202ENST00000435363 5460 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.3
FOXL1Q12952 SLC29A1-205ENST00000371740 2219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.31
FOXL1Q12952 CD55-204ENST00000367064 2760 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.31
FOXL1Q12952 EIF2B4-212ENST00000622434 1771 ntTSL 5 BASIC13.15□□□□□ -0.31
FOXL1Q12952 MYRIP-202ENST00000396217 4877 ntTSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
FOXL1Q12952 DTNB-228ENST00000496972 2328 ntTSL 2 BASIC13.14□□□□□ -0.31
FOXL1Q12952 SULT1C4-201ENST00000272452 1860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
FOXL1Q12952 C12orf65-201ENST00000253233 2073 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
FOXL1Q12952 PGAP3-201ENST00000300658 2737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
FOXL1Q12952 DNAJC10-210ENST00000616986 5783 ntTSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
FOXL1Q12952 CYP46A1-201ENST00000261835 2181 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
FOXL1Q12952 MYZAP-202ENST00000380565 2181 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
FOXL1Q12952 ATP2A3-205ENST00000397041 4675 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
FOXL1Q12952 CDKN1A-203ENST00000405375 2267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
FOXL1Q12952 IL6ST-209ENST00000502326 3007 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.14□□□□□ -0.31
FOXL1Q12952 TSC22D4-201ENST00000300181 2383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
FOXL1Q12952 SRPK3-201ENST00000370100 1717 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.14□□□□□ -0.31
FOXL1Q12952 APH1A-204ENST00000414276 1718 ntTSL 2 BASIC13.14□□□□□ -0.31
FOXL1Q12952 TGFBR2-201ENST00000295754 4621 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
FOXL1Q12952 GPS1-226ENST00000623691 1839 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC13.14□□□□□ -0.31
FOXL1Q12952 MAGEA2B-201ENST00000331220 1946 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.14□□□□□ -0.31
FOXL1Q12952 MAGEA2-207ENST00000620710 1947 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.14□□□□□ -0.31
FOXL1Q12952 HLA-DQB2-231ENST00000435145 2026 ntBASIC13.14□□□□□ -0.31
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 42.7 ms