Protein–RNA interactions for Protein: P30049

ATP5D, ATP synthase subunit delta, mitochondrial, humanhuman

Predictions only

Length 168 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ATP5DP30049 LINC01503-203ENST00000436710 901 ntTSL 3 BASIC16.51■□□□□ 0.23
ATP5DP30049 VN2R19P-201ENST00000442399 1052 ntBASIC16.51■□□□□ 0.23
ATP5DP30049 FAM185BP-201ENST00000443595 716 ntBASIC16.51■□□□□ 0.23
ATP5DP30049 SUMO2P17-202ENST00000508743 738 ntTSL 3 BASIC16.51■□□□□ 0.23
ATP5DP30049 CCNG1-208ENST00000510664 994 ntTSL 5 BASIC16.51■□□□□ 0.23
ATP5DP30049 RCHY1-208ENST00000512706 1011 ntTSL 3 BASIC16.51■□□□□ 0.23
ATP5DP30049 FCHSD1-204ENST00000519800 802 ntTSL 2 BASIC16.51■□□□□ 0.23
ATP5DP30049 AL049869.3-201ENST00000554918 558 ntTSL 3 BASIC16.51■□□□□ 0.23
ATP5DP30049 C1QL3-202ENST00000619991 783 ntTSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
ATP5DP30049 CR381653.1-203ENST00000625153 577 ntTSL 5 BASIC16.51■□□□□ 0.23
ATP5DP30049 PLA2G16-206ENST00000639271 957 ntTSL 5 BASIC16.51■□□□□ 0.23
ATP5DP30049 DDX1-202ENST00000381341 2817 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.51■□□□□ 0.23
ATP5DP30049 TNFSF13-202ENST00000349228 2036 ntTSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
ATP5DP30049 CARNMT1-202ENST00000376834 4130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
ATP5DP30049 RASA4B-207ENST00000541662 2794 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC16.51■□□□□ 0.23
ATP5DP30049 USP36-201ENST00000312010 5234 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.51■□□□□ 0.23
ATP5DP30049 GABRA5-202ENST00000355395 2183 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.51■□□□□ 0.23
ATP5DP30049 ARFGAP2-202ENST00000426335 2937 ntTSL 2 BASIC16.51■□□□□ 0.23
ATP5DP30049 SLC18A1-207ENST00000519026 1980 ntTSL 5 BASIC16.51■□□□□ 0.23
ATP5DP30049 CYTH2-214ENST00000641098 2721 ntAPPRIS ALT1 BASIC16.51■□□□□ 0.23
ATP5DP30049 ITSN1-212ENST00000399367 5722 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
ATP5DP30049 MFSD14B-201ENST00000375344 3420 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
ATP5DP30049 SNX14-215ENST00000513865 2259 ntTSL 5 BASIC16.5■□□□□ 0.23
ATP5DP30049 LONP1-213ENST00000590729 2626 ntTSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
ATP5DP30049 RSRP1-201ENST00000243189 1502 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
ATP5DP30049 SMIM10-201ENST00000330288 1536 ntAPPRIS P1 BASIC16.5■□□□□ 0.23
ATP5DP30049 AP003680.1-201ENST00000598970 3660 ntBASIC16.5■□□□□ 0.23
ATP5DP30049 LINC01101-201ENST00000622953 1884 ntBASIC16.5■□□□□ 0.23
ATP5DP30049 TSC22D3-201ENST00000315660 2213 ntTSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
ATP5DP30049 ZFAND4-203ENST00000374366 3821 ntTSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
ATP5DP30049 SLC22A20-204ENST00000530038 1673 ntBASIC16.5■□□□□ 0.23
ATP5DP30049 PTPN13-203ENST00000427191 8487 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
ATP5DP30049 ZNF568-203ENST00000427117 1827 ntTSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
ATP5DP30049 AC007292.2-201ENST00000593524 1812 ntBASIC16.5■□□□□ 0.23
ATP5DP30049 PROZ-202ENST00000375547 1488 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
ATP5DP30049 GSN-206ENST00000394353 2311 ntTSL 2 BASIC16.5■□□□□ 0.23
ATP5DP30049 PKD2L2-205ENST00000508638 2333 ntTSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
ATP5DP30049 TCAF1-205ENST00000479870 5733 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
ATP5DP30049 AC026396.1-201ENST00000419388 421 ntBASIC16.5■□□□□ 0.23
ATP5DP30049 PMS2P1-201ENST00000431037 1228 ntBASIC16.5■□□□□ 0.23
ATP5DP30049 ACTL9-202ENST00000612068 1252 ntBASIC16.5■□□□□ 0.23
ATP5DP30049 CPEB1-211ENST00000615198 2112 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
ATP5DP30049 CDK5RAP2-202ENST00000360190 5985 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
ATP5DP30049 LINC00963-208ENST00000454968 1403 ntTSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
ATP5DP30049 TUBB8-201ENST00000561967 1413 ntTSL 5 BASIC16.5■□□□□ 0.23
ATP5DP30049 CBX3P2-201ENST00000579647 1429 ntTSL 2 BASIC16.5■□□□□ 0.23
ATP5DP30049 REEP2-211ENST00000613650 1944 ntTSL 5 BASIC16.5■□□□□ 0.23
ATP5DP30049 SLC35E2B-203ENST00000611123 5948 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.5■□□□□ 0.23
ATP5DP30049 PHYHD1-201ENST00000308941 1599 ntTSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
ATP5DP30049 DMPK-202ENST00000343373 3227 ntTSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
ATP5DP30049 SMARCA4-214ENST00000589677 5181 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.5■□□□□ 0.23
ATP5DP30049 CAMSAP3-202ENST00000446248 4179 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
ATP5DP30049 UBTF-201ENST00000302904 4997 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.5■□□□□ 0.23
ATP5DP30049 KRT82-201ENST00000257974 2664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
ATP5DP30049 AL162457.1-201ENST00000317652 2000 ntTSL 2 BASIC16.5■□□□□ 0.23
ATP5DP30049 HMGN1-204ENST00000380749 1383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
ATP5DP30049 URAHP-203ENST00000517889 1381 ntTSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
ATP5DP30049 CCDC6-201ENST00000263102 5811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
ATP5DP30049 HOXA5-201ENST00000222726 1657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
ATP5DP30049 DZIP1-204ENST00000376829 3738 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
ATP5DP30049 CRLS1-203ENST00000452938 3859 ntTSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
ATP5DP30049 DSEL-201ENST00000310045 9531 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.49■□□□□ 0.23
ATP5DP30049 FAM3D-201ENST00000358781 1319 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
ATP5DP30049 IGLL5-203ENST00000532223 1335 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
ATP5DP30049 REPIN1-209ENST00000479668 3182 ntTSL 2 BASIC16.49■□□□□ 0.23
ATP5DP30049 USP25-201ENST00000285679 3973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
ATP5DP30049 PRKD2-201ENST00000291281 3070 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
ATP5DP30049 APH1A-203ENST00000369109 1713 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
ATP5DP30049 DPM2-202ENST00000373110 738 ntTSL 2 BASIC16.49■□□□□ 0.23
ATP5DP30049 CLDN14-205ENST00000399139 1231 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
ATP5DP30049 AGTRAP-205ENST00000400895 786 ntTSL 2 BASIC16.49■□□□□ 0.23
ATP5DP30049 PQLC3-202ENST00000402361 696 ntTSL 2 BASIC16.49■□□□□ 0.23
ATP5DP30049 CXCL1P1-201ENST00000502804 216 ntBASIC16.49■□□□□ 0.23
ATP5DP30049 MMP17-203ENST00000535004 719 ntTSL 3 BASIC16.49■□□□□ 0.23
ATP5DP30049 RNPS1-220ENST00000566458 2037 ntTSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
ATP5DP30049 BX640515.1-201ENST00000617215 977 ntBASIC16.49■□□□□ 0.23
ATP5DP30049 CLEC11A-203ENST00000617718 1128 ntTSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
ATP5DP30049 PXDNL-201ENST00000356297 4805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
ATP5DP30049 LSS-202ENST00000397728 4936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
ATP5DP30049 FAM49B-202ENST00000517654 1817 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.49■□□□□ 0.23
ATP5DP30049 KLK3-202ENST00000360617 1664 ntTSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
ATP5DP30049 RASSF1-205ENST00000395126 1657 ntTSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
ATP5DP30049 ANKRD33-201ENST00000301190 1935 ntTSL 2 BASIC16.49■□□□□ 0.23
ATP5DP30049 CATSPER4-202ENST00000456354 1912 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
ATP5DP30049 C9orf78-201ENST00000372447 1795 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
ATP5DP30049 ISCA2-204ENST00000556816 2626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
ATP5DP30049 AHCYL2-202ENST00000446544 5026 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
ATP5DP30049 ATP2A3-204ENST00000397035 4182 ntTSL 5 BASIC16.48■□□□□ 0.23
ATP5DP30049 M6PR-202ENST00000536844 2305 ntTSL 3 BASIC16.48■□□□□ 0.23
ATP5DP30049 RSPH6A-202ENST00000597055 2306 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
ATP5DP30049 ARHGEF28-202ENST00000296799 4424 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.48■□□□□ 0.23
ATP5DP30049 CLN3-203ENST00000357806 1469 ntTSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
ATP5DP30049 SNPH-202ENST00000381873 4995 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
ATP5DP30049 STARD3NL-204ENST00000434197 1341 ntTSL 5 BASIC16.48■□□□□ 0.23
ATP5DP30049 MRS2-202ENST00000378353 1740 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
ATP5DP30049 RUSC1-209ENST00000471876 1749 ntTSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
ATP5DP30049 LMF2-201ENST00000216080 2658 ntTSL 2 BASIC16.48■□□□□ 0.23
ATP5DP30049 INPP5J-204ENST00000402238 1564 ntTSL 2 BASIC16.48■□□□□ 0.23
ATP5DP30049 CUL3-201ENST00000264414 6741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
ATP5DP30049 PCDHB13-201ENST00000341948 5061 ntAPPRIS P1 BASIC16.48■□□□□ 0.23
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 35.1 ms