Protein–RNA interactions for Protein: Q9Y5S2

CDC42BPB, Serine/threonine-protein kinase MRCK beta, humanhuman

Predictions only

Length 1,711 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CDC42BPBQ9Y5S2 C2CD4D-201ENST00000454109 1757 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC36.19■■■■□ 3.38
CDC42BPBQ9Y5S2 TSPAN10-203ENST00000574882 1837 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC36.19■■■■□ 3.38
CDC42BPBQ9Y5S2 ESRRA-201ENST00000000442 2215 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC36.19■■■■□ 3.38
CDC42BPBQ9Y5S2 EPHA10-211ENST00000540011 720 ntTSL 5 BASIC36.19■■■■□ 3.38
CDC42BPBQ9Y5S2 UNCX-201ENST00000316333 2048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.18■■■■□ 3.38
CDC42BPBQ9Y5S2 PICSAR-201ENST00000615826 733 ntTSL 1 (best) BASIC36.18■■■■□ 3.38
CDC42BPBQ9Y5S2 FOXO3B-201ENST00000395675 1928 ntBASIC36.18■■■■□ 3.38
CDC42BPBQ9Y5S2 PTOV1-220ENST00000601675 1587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.18■■■■□ 3.38
CDC42BPBQ9Y5S2 SUMF1-202ENST00000383843 1447 ntTSL 2 BASIC36.17■■■■□ 3.38
CDC42BPBQ9Y5S2 KRTAP5-4-201ENST00000399682 1181 ntAPPRIS P5 BASIC36.17■■■■□ 3.38
CDC42BPBQ9Y5S2 NRL-205ENST00000560550 788 ntTSL 1 (best) BASIC36.17■■■■□ 3.38
CDC42BPBQ9Y5S2 TMEM240-203ENST00000624426 796 ntTSL 3 BASIC36.17■■■■□ 3.38
CDC42BPBQ9Y5S2 RTN2-202ENST00000344680 2063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.17■■■■□ 3.38
CDC42BPBQ9Y5S2 FOXB2-201ENST00000376708 1299 ntAPPRIS P1 BASIC36.17■■■■□ 3.38
CDC42BPBQ9Y5S2 AP006621.1-201ENST00000532946 536 ntTSL 5 BASIC36.17■■■■□ 3.38
CDC42BPBQ9Y5S2 NEDD4L-237ENST00000617539 728 ntTSL 2 BASIC36.17■■■■□ 3.38
CDC42BPBQ9Y5S2 GTF2E2-201ENST00000355904 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.16■■■■□ 3.38
CDC42BPBQ9Y5S2 CBX4-201ENST00000269397 2664 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC36.16■■■■□ 3.38
CDC42BPBQ9Y5S2 STMN4-201ENST00000265770 1250 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.16■■■■□ 3.38
CDC42BPBQ9Y5S2 AC243829.1-202ENST00000618848 486 ntTSL 3 BASIC36.16■■■■□ 3.38
CDC42BPBQ9Y5S2 HYAL2-202ENST00000395139 2136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.16■■■■□ 3.38
CDC42BPBQ9Y5S2 BIN1-204ENST00000348750 2074 ntTSL 1 (best) BASIC36.15■■■■□ 3.38
CDC42BPBQ9Y5S2 AC026271.2-201ENST00000428091 497 ntBASIC36.15■■■■□ 3.38
CDC42BPBQ9Y5S2 USP2-204ENST00000525735 1704 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC36.14■■■■□ 3.38
CDC42BPBQ9Y5S2 MYL5-208ENST00000511290 781 ntTSL 1 (best) BASIC36.14■■■■□ 3.38
CDC42BPBQ9Y5S2 PLSCR3-209ENST00000574401 2032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.14■■■■□ 3.38
CDC42BPBQ9Y5S2 C16orf87-201ENST00000285697 1585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.14■■■■□ 3.38
CDC42BPBQ9Y5S2 C7orf25-205ENST00000438029 1743 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC36.14■■■■□ 3.38
CDC42BPBQ9Y5S2 EBPL-204ENST00000378272 766 ntTSL 3 BASIC36.14■■■■□ 3.38
CDC42BPBQ9Y5S2 CCR10-201ENST00000332438 1773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.13■■■■□ 3.37
CDC42BPBQ9Y5S2 TCF24-201ENST00000563496 2450 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC36.12■■■■□ 3.37
CDC42BPBQ9Y5S2 KCNJ4-201ENST00000303592 2065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.12■■■■□ 3.37
CDC42BPBQ9Y5S2 PORCN-202ENST00000355961 1848 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC36.12■■■■□ 3.37
CDC42BPBQ9Y5S2 ERRFI1-203ENST00000469499 995 ntTSL 3 BASIC36.11■■■■□ 3.37
CDC42BPBQ9Y5S2 PPP1CC-206ENST00000550991 1882 ntTSL 2 BASIC36.11■■■■□ 3.37
CDC42BPBQ9Y5S2 CNNM2-201ENST00000369875 2059 ntTSL 1 (best) BASIC36.11■■■■□ 3.37
CDC42BPBQ9Y5S2 ARL4D-201ENST00000320033 1612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.11■■■■□ 3.37
CDC42BPBQ9Y5S2 MPP5-205ENST00000556345 1163 ntTSL 2 BASIC36.11■■■■□ 3.37
CDC42BPBQ9Y5S2 TSPOAP1-AS1-203ENST00000579527 2042 ntTSL 2 BASIC36.1■■■■□ 3.37
CDC42BPBQ9Y5S2 NDUFS3-206ENST00000528192 561 ntTSL 5 BASIC36.1■■■■□ 3.37
CDC42BPBQ9Y5S2 C11orf80-210ENST00000527634 1666 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC36.1■■■■□ 3.37
CDC42BPBQ9Y5S2 TESK1-206ENST00000620767 2438 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC36.09■■■■□ 3.37
CDC42BPBQ9Y5S2 NOX4-204ENST00000393282 560 ntTSL 1 (best) BASIC36.09■■■■□ 3.37
CDC42BPBQ9Y5S2 DHFR-203ENST00000505337 1719 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC36.09■■■■□ 3.37
CDC42BPBQ9Y5S2 SUSD3-202ENST00000375472 1195 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC36.08■■■■□ 3.37
CDC42BPBQ9Y5S2 RDH14-201ENST00000381249 1587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.08■■■■□ 3.37
CDC42BPBQ9Y5S2 TCEA1-211ENST00000522635 1432 ntTSL 2 BASIC36.08■■■■□ 3.37
CDC42BPBQ9Y5S2 EEF1D-201ENST00000317198 1458 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC36.07■■■■□ 3.37
CDC42BPBQ9Y5S2 CLPSL2-201ENST00000360454 488 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC36.06■■■■□ 3.36
CDC42BPBQ9Y5S2 FBXO33-202ENST00000554190 534 ntTSL 3 BASIC36.06■■■■□ 3.36
CDC42BPBQ9Y5S2 PARD6B-202ENST00000396039 522 ntTSL 1 (best) BASIC36.05■■■■□ 3.36
CDC42BPBQ9Y5S2 RAB33A-201ENST00000257017 1258 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.05■■■■□ 3.36
CDC42BPBQ9Y5S2 HIST1H2AL-201ENST00000613174 393 ntAPPRIS P1 BASIC36.05■■■■□ 3.36
CDC42BPBQ9Y5S2 C19orf47-202ENST00000392035 2126 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC36.05■■■■□ 3.36
CDC42BPBQ9Y5S2 SLC30A5-201ENST00000380860 1317 ntTSL 1 (best) BASIC36.05■■■■□ 3.36
CDC42BPBQ9Y5S2 AC142086.6-201ENST00000621154 1765 ntBASIC36.04■■■■□ 3.36
CDC42BPBQ9Y5S2 IL20RA-202ENST00000367746 1244 ntTSL 2 BASIC36.04■■■■□ 3.36
CDC42BPBQ9Y5S2 RASGEF1B-208ENST00000510780 539 ntTSL 3 BASIC36.04■■■■□ 3.36
CDC42BPBQ9Y5S2 RASGEF1B-209ENST00000512343 498 ntTSL 3 BASIC36.04■■■■□ 3.36
CDC42BPBQ9Y5S2 AC096887.2-201ENST00000623443 1957 ntBASIC36.04■■■■□ 3.36
CDC42BPBQ9Y5S2 CRYAA-201ENST00000291554 1139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.03■■■■□ 3.36
CDC42BPBQ9Y5S2 AC105935.1-201ENST00000424174 422 ntTSL 3 BASIC36.03■■■■□ 3.36
CDC42BPBQ9Y5S2 IFNL4-201ENST00000606380 1637 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC36.03■■■■□ 3.36
CDC42BPBQ9Y5S2 COMMD5-201ENST00000305103 1373 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.03■■■■□ 3.36
CDC42BPBQ9Y5S2 C6orf89-201ENST00000355190 1309 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC36.02■■■■□ 3.36
CDC42BPBQ9Y5S2 FLT1-202ENST00000539099 1911 ntTSL 1 (best) BASIC36.02■■■■□ 3.36
CDC42BPBQ9Y5S2 MIR6722-201ENST00000617286 78 ntBASIC36.02■■■■□ 3.36
CDC42BPBQ9Y5S2 PWWP2B-201ENST00000305233 2651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.02■■■■□ 3.36
CDC42BPBQ9Y5S2 LGR4-203ENST00000480977 492 ntTSL 2 BASIC36.01■■■■□ 3.36
CDC42BPBQ9Y5S2 SMARCA5-AS1-201ENST00000500800 945 ntTSL 1 (best) BASIC36.01■■■■□ 3.36
CDC42BPBQ9Y5S2 AL359317.1-201ENST00000556316 578 ntTSL 4 BASIC36.01■■■■□ 3.36
CDC42BPBQ9Y5S2 AP2S1-201ENST00000263270 935 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC36■■■■□ 3.35
CDC42BPBQ9Y5S2 TTBK2-205ENST00000567274 1777 ntTSL 5 BASIC35.99■■■■□ 3.35
CDC42BPBQ9Y5S2 AC135279.3-201ENST00000610945 1311 ntBASIC35.99■■■■□ 3.35
CDC42BPBQ9Y5S2 CDKN2D-201ENST00000335766 1086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.99■■■■□ 3.35
CDC42BPBQ9Y5S2 PBX2P1-201ENST00000493219 1291 ntBASIC35.99■■■■□ 3.35
CDC42BPBQ9Y5S2 AC136475.3-202ENST00000534742 812 ntTSL 2 BASIC35.99■■■■□ 3.35
CDC42BPBQ9Y5S2 RPRD1A-207ENST00000588737 1264 ntTSL 2 BASIC35.99■■■■□ 3.35
CDC42BPBQ9Y5S2 GNB2-203ENST00000393926 1641 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC35.98■■■■□ 3.35
CDC42BPBQ9Y5S2 PNCK-215ENST00000447676 1585 ntTSL 2 BASIC35.98■■■■□ 3.35
CDC42BPBQ9Y5S2 EVA1C-201ENST00000300255 1998 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC35.98■■■■□ 3.35
CDC42BPBQ9Y5S2 ACBD4-216ENST00000619916 1276 ntTSL 5 BASIC35.98■■■■□ 3.35
CDC42BPBQ9Y5S2 TST-202ENST00000403892 1797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.98■■■■□ 3.35
CDC42BPBQ9Y5S2 AC090877.2-201ENST00000558441 1738 ntBASIC35.98■■■■□ 3.35
CDC42BPBQ9Y5S2 SERGEF-219ENST00000532265 1124 ntTSL 2 BASIC35.97■■■■□ 3.35
CDC42BPBQ9Y5S2 AC142381.2-201ENST00000566120 298 ntBASIC35.97■■■■□ 3.35
CDC42BPBQ9Y5S2 CRLF1-201ENST00000392386 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.96■■■■□ 3.35
CDC42BPBQ9Y5S2 PEX7-201ENST00000318471 1464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.96■■■■□ 3.35
CDC42BPBQ9Y5S2 RNF166-201ENST00000312838 1883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.96■■■■□ 3.35
CDC42BPBQ9Y5S2 DNPH1-201ENST00000230431 657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.96■■■■□ 3.35
CDC42BPBQ9Y5S2 UNC93B3-201ENST00000308076 687 ntBASIC35.96■■■■□ 3.35
CDC42BPBQ9Y5S2 CARD19-201ENST00000375464 855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.96■■■■□ 3.35
CDC42BPBQ9Y5S2 CCDC107-203ENST00000378407 899 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC35.96■■■■□ 3.35
CDC42BPBQ9Y5S2 AC009097.2-201ENST00000562763 465 ntTSL 2 BASIC35.96■■■■□ 3.35
CDC42BPBQ9Y5S2 SLIT1-203ENST00000371041 1695 ntTSL 2 BASIC35.96■■■■□ 3.35
CDC42BPBQ9Y5S2 FAM66E-202ENST00000533615 2087 ntTSL 2 BASIC35.96■■■■□ 3.35
CDC42BPBQ9Y5S2 KAT8-202ENST00000448516 1789 ntTSL 1 (best) BASIC35.95■■■■□ 3.35
CDC42BPBQ9Y5S2 NR6A1-203ENST00000416460 1898 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC35.95■■■■□ 3.35
CDC42BPBQ9Y5S2 LBH-205ENST00000407930 756 ntTSL 2 BASIC35.95■■■■□ 3.35
CDC42BPBQ9Y5S2 CAPNS1-205ENST00000588780 1035 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC35.95■■■■□ 3.35
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 15.2 ms