Protein–RNA interactions for Protein: Q9Y343

SNX24, Sorting nexin-24, humanhuman

Predictions only

Length 169 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SNX24Q9Y343 CAPNS1-216ENST00000628306 1389 ntTSL 5 BASIC24.24■■□□□ 1.47
SNX24Q9Y343 C16orf87-201ENST00000285697 1585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
SNX24Q9Y343 GRAMD1A-201ENST00000317991 2695 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
SNX24Q9Y343 PCMT1-202ENST00000367380 1628 ntTSL 2 BASIC24.24■■□□□ 1.47
SNX24Q9Y343 PCMT1-211ENST00000544496 1628 ntTSL 2 BASIC24.24■■□□□ 1.47
SNX24Q9Y343 TAF10-201ENST00000299424 1215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
SNX24Q9Y343 TBX2-AS1-202ENST00000589814 539 ntTSL 3 BASIC24.23■■□□□ 1.47
SNX24Q9Y343 MIR1-1HG-202ENST00000624914 1220 ntTSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
SNX24Q9Y343 KLC1-201ENST00000246489 2294 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.22■■□□□ 1.47
SNX24Q9Y343 KLC1-224ENST00000557450 2265 ntTSL 5 BASIC24.22■■□□□ 1.47
SNX24Q9Y343 DPF1-206ENST00000420980 2227 ntTSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
SNX24Q9Y343 RNF223-201ENST00000453464 1902 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.22■■□□□ 1.47
SNX24Q9Y343 CCR10-201ENST00000332438 1773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
SNX24Q9Y343 RAD51-208ENST00000532743 1515 ntTSL 2 BASIC24.22■■□□□ 1.47
SNX24Q9Y343 AC025884.2-201ENST00000553429 711 ntBASIC24.22■■□□□ 1.47
SNX24Q9Y343 CEBPD-201ENST00000408965 2178 ntAPPRIS P1 BASIC24.22■■□□□ 1.47
SNX24Q9Y343 HOXD9-201ENST00000249499 1870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
SNX24Q9Y343 DAZAP1-201ENST00000233078 2160 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
SNX24Q9Y343 KCNS1-202ENST00000537075 2136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
SNX24Q9Y343 HRH3-202ENST00000340177 2659 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
SNX24Q9Y343 CEBPB-AS1-201ENST00000613921 2648 ntTSL 3 BASIC24.21■■□□□ 1.47
SNX24Q9Y343 FAM193A-211ENST00000637812 4885 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.21■■□□□ 1.47
SNX24Q9Y343 DTNB-201ENST00000288642 2464 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.21■■□□□ 1.47
SNX24Q9Y343 DTNB-208ENST00000406818 2474 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
SNX24Q9Y343 DACT3-202ENST00000391916 2834 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.2■■□□□ 1.47
SNX24Q9Y343 FAM107B-211ENST00000468747 2633 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.47
SNX24Q9Y343 TMEM51-205ENST00000434578 1861 ntTSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
SNX24Q9Y343 KLHL21-203ENST00000463043 667 ntTSL 5 BASIC24.2■■□□□ 1.46
SNX24Q9Y343 MOB2-207ENST00000614710 705 ntTSL 5 BASIC24.2■■□□□ 1.46
SNX24Q9Y343 MIR6089-201ENST00000616698 64 ntBASIC24.2■■□□□ 1.46
SNX24Q9Y343 AL118558.1-203ENST00000553701 447 ntTSL 3 BASIC24.19■■□□□ 1.46
SNX24Q9Y343 UBA52-204ENST00000595158 743 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.19■■□□□ 1.46
SNX24Q9Y343 SCRT2-201ENST00000246104 3577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
SNX24Q9Y343 DUSP8P5-201ENST00000422884 1815 ntBASIC24.19■■□□□ 1.46
SNX24Q9Y343 PAOX-203ENST00000357296 1633 ntTSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
SNX24Q9Y343 LINC01918-201ENST00000436841 797 ntTSL 2 BASIC24.18■■□□□ 1.46
SNX24Q9Y343 LTC4S-205ENST00000486713 496 ntTSL 2 BASIC24.18■■□□□ 1.46
SNX24Q9Y343 TTC39C-209ENST00000584250 1048 ntTSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
SNX24Q9Y343 PDS5A-202ENST00000503396 2685 ntTSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
SNX24Q9Y343 ARSB-202ENST00000396151 2316 ntTSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
SNX24Q9Y343 RUNX2-211ENST00000625924 1458 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
SNX24Q9Y343 ARMC6-201ENST00000269932 2412 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.18■■□□□ 1.46
SNX24Q9Y343 CDK2AP1-201ENST00000261692 1625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
SNX24Q9Y343 PNCK-204ENST00000370150 1612 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.17■■□□□ 1.46
SNX24Q9Y343 BDH1-207ENST00000441275 1605 ntTSL 5 BASIC24.17■■□□□ 1.46
SNX24Q9Y343 PTH1R-207ENST00000449590 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
SNX24Q9Y343 PRMT5-213ENST00000553897 1857 ntTSL 2 BASIC24.17■■□□□ 1.46
SNX24Q9Y343 DTNBP1-212ENST00000622898 1305 ntTSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
SNX24Q9Y343 BAX-202ENST00000345358 793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
SNX24Q9Y343 HSBP1L1-201ENST00000451882 771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
SNX24Q9Y343 KAT5-208ENST00000530446 1697 ntTSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
SNX24Q9Y343 DGAT2-201ENST00000228027 2453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
SNX24Q9Y343 LTB4R2-205ENST00000543919 1560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
SNX24Q9Y343 HOMER2-201ENST00000304231 1990 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC24.16■■□□□ 1.46
SNX24Q9Y343 SHD-204ENST00000599689 1729 ntTSL 5 BASIC24.16■■□□□ 1.46
SNX24Q9Y343 HSF1-201ENST00000400780 2105 ntTSL 5 BASIC24.16■■□□□ 1.46
SNX24Q9Y343 CTDSPL-206ENST00000443503 4640 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
SNX24Q9Y343 GPR137-202ENST00000377702 1478 ntTSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
SNX24Q9Y343 MIR3960-201ENST00000583311 91 ntBASIC24.16■■□□□ 1.46
SNX24Q9Y343 AC016575.1-201ENST00000607026 382 ntBASIC24.16■■□□□ 1.46
SNX24Q9Y343 AC013394.1-201ENST00000629685 808 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.16■■□□□ 1.46
SNX24Q9Y343 PLEK2-201ENST00000216446 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
SNX24Q9Y343 RFC2-201ENST00000055077 1695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
SNX24Q9Y343 AK8-201ENST00000298545 2072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
SNX24Q9Y343 CCSER2-202ENST00000359979 2066 ntTSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.46
SNX24Q9Y343 ABHD17AP4-201ENST00000411545 909 ntBASIC24.14■■□□□ 1.45
SNX24Q9Y343 MDFIC-203ENST00000423503 474 ntTSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.45
SNX24Q9Y343 AC009041.3-201ENST00000564390 879 ntTSL 5 BASIC24.14■■□□□ 1.45
SNX24Q9Y343 C16orf95-205ENST00000567970 1031 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.14■■□□□ 1.45
SNX24Q9Y343 U2AF2-206ENST00000590551 1104 ntTSL 3 BASIC24.14■■□□□ 1.45
SNX24Q9Y343 PEBP1-201ENST00000261313 1697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.45
SNX24Q9Y343 NSMCE4A-202ENST00000369023 1394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.45
SNX24Q9Y343 HSD17B12-202ENST00000395700 994 ntTSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
SNX24Q9Y343 MACF1-219ENST00000484793 834 ntTSL 2 BASIC24.13■■□□□ 1.45
SNX24Q9Y343 ME2-208ENST00000638937 2471 ntTSL 5 BASIC24.13■■□□□ 1.45
SNX24Q9Y343 ZNF444-211ENST00000592949 1906 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
SNX24Q9Y343 HLA-L-211ENST00000482052 1765 ntBASIC24.13■■□□□ 1.45
SNX24Q9Y343 SMPD5-203ENST00000639008 1464 ntBASIC24.13■■□□□ 1.45
SNX24Q9Y343 AC060814.1-201ENST00000554326 538 ntBASIC24.12■■□□□ 1.45
SNX24Q9Y343 LTB4R-202ENST00000396782 1627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
SNX24Q9Y343 ADSSL1-202ENST00000332972 1969 ntTSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
SNX24Q9Y343 FAM168B-201ENST00000389915 944 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.11■■□□□ 1.45
SNX24Q9Y343 HSPB6-202ENST00000587965 711 ntTSL 2 BASIC24.11■■□□□ 1.45
SNX24Q9Y343 KRT72-203ENST00000537672 1813 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.1■■□□□ 1.45
SNX24Q9Y343 FAM86JP-203ENST00000485843 2012 ntTSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
SNX24Q9Y343 FAAP20-202ENST00000378546 729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
SNX24Q9Y343 RBMXL2-201ENST00000306904 1874 ntAPPRIS P1 BASIC24.1■■□□□ 1.45
SNX24Q9Y343 YWHAH-201ENST00000248975 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
SNX24Q9Y343 LDHB-203ENST00000396076 1538 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.1■■□□□ 1.45
SNX24Q9Y343 ZDHHC3-203ENST00000342790 1336 ntTSL 5 BASIC24.1■■□□□ 1.45
SNX24Q9Y343 STRBP-202ENST00000360998 2990 ntTSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
SNX24Q9Y343 ALKAL1-201ENST00000358543 1217 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
SNX24Q9Y343 NKIRAS2-208ENST00000462043 585 ntTSL 4 BASIC24.09■■□□□ 1.45
SNX24Q9Y343 MBLAC1-201ENST00000398075 1502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
SNX24Q9Y343 C3orf80-201ENST00000326474 2718 ntAPPRIS P1 BASIC24.09■■□□□ 1.45
SNX24Q9Y343 PKIG-205ENST00000372891 1443 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.09■■□□□ 1.45
SNX24Q9Y343 MYO10-205ENST00000507288 1677 ntTSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.45
SNX24Q9Y343 KRT18-201ENST00000388835 1562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.45
SNX24Q9Y343 PMS1-220ENST00000618056 1468 ntTSL 5 BASIC24.08■■□□□ 1.45
SNX24Q9Y343 MCCD1-201ENST00000376191 955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.45
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 27.8 ms