Protein–RNA interactions for Protein: Q9Y343

SNX24, Sorting nexin-24, humanhuman

Predictions only

Length 169 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SNX24Q9Y343 TCF15-201ENST00000246080 1555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.54■■■■□ 3.12
SNX24Q9Y343 SEPT3-204ENST00000406029 1866 ntTSL 5 BASIC34.4■■■■□ 3.1
SNX24Q9Y343 AC116565.1-201ENST00000610212 2421 ntAPPRIS P1 BASIC34.37■■■■□ 3.09
SNX24Q9Y343 FBLL1-201ENST00000338333 1519 ntAPPRIS P1 BASIC34.06■■■■□ 3.04
SNX24Q9Y343 HES6-203ENST00000409160 1600 ntTSL 2 BASIC33.9■■■■□ 3.02
SNX24Q9Y343 AL356512.1-201ENST00000607453 1739 ntBASIC33.82■■■■□ 3
SNX24Q9Y343 PRR5-217ENST00000617066 1726 ntTSL 5 BASIC33.62■■■□□ 2.97
SNX24Q9Y343 CSNK1E-204ENST00000403904 1580 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC33.51■■■□□ 2.96
SNX24Q9Y343 RAB12-201ENST00000329286 2137 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.41■■■□□ 2.94
SNX24Q9Y343 PRR5-216ENST00000611394 1843 ntTSL 2 BASIC33.19■■■□□ 2.9
SNX24Q9Y343 FBRSL1-201ENST00000434748 5568 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC33.09■■■□□ 2.89
SNX24Q9Y343 FOXD1-202ENST00000615637 2272 ntAPPRIS P1 BASIC33.05■■■□□ 2.88
SNX24Q9Y343 AES-202ENST00000327141 1608 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.02■■■□□ 2.88
SNX24Q9Y343 PPP2CB-201ENST00000221138 2006 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.97■■■□□ 2.87
SNX24Q9Y343 CYHR1-209ENST00000530374 1870 ntTSL 3 BASIC32.97■■■□□ 2.87
SNX24Q9Y343 FAM149A-205ENST00000502970 1990 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC32.85■■■□□ 2.85
SNX24Q9Y343 PHF10-201ENST00000339209 1719 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC32.77■■■□□ 2.84
SNX24Q9Y343 PPP1CA-203ENST00000376745 1476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.69■■■□□ 2.82
SNX24Q9Y343 ZNF358-202ENST00000597229 1954 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC32.58■■■□□ 2.81
SNX24Q9Y343 ACOT7-209ENST00000545482 1804 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC32.55■■■□□ 2.8
SNX24Q9Y343 TGIF1-202ENST00000343820 2076 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.44■■■□□ 2.78
SNX24Q9Y343 PTF1A-201ENST00000376504 1537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.41■■■□□ 2.78
SNX24Q9Y343 NECTIN3-201ENST00000319792 1549 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC32.33■■■□□ 2.77
SNX24Q9Y343 KHSRP-213ENST00000619396 2226 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC32.33■■■□□ 2.77
SNX24Q9Y343 C11orf63-202ENST00000307257 1964 ntTSL 2 BASIC32.3■■■□□ 2.76
SNX24Q9Y343 TRIP10-202ENST00000313285 2035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.16■■■□□ 2.74
SNX24Q9Y343 ZFYVE21-201ENST00000216602 1521 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC31.9■■■□□ 2.7
SNX24Q9Y343 CAPNS1-206ENST00000588815 1471 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC31.87■■■□□ 2.69
SNX24Q9Y343 MPND-207ENST00000599840 1611 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC31.85■■■□□ 2.69
SNX24Q9Y343 FAM149A-215ENST00000514153 2070 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC31.62■■■□□ 2.65
SNX24Q9Y343 SSSCA1-205ENST00000527920 806 ntTSL 3 BASIC31.61■■■□□ 2.65
SNX24Q9Y343 B4GALT2-203ENST00000372324 2203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.6■■■□□ 2.65
SNX24Q9Y343 INO80B-WBP1-202ENST00000452361 2040 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC31.57■■■□□ 2.64
SNX24Q9Y343 NT5DC2-203ENST00000459839 1639 ntTSL 1 (best) BASIC31.51■■■□□ 2.63
SNX24Q9Y343 MAPK3-201ENST00000263025 1861 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC31.44■■■□□ 2.62
SNX24Q9Y343 CCM2-219ENST00000544363 1620 ntTSL 3 BASIC31.42■■■□□ 2.62
SNX24Q9Y343 PABPN1-201ENST00000216727 2001 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC31.42■■■□□ 2.62
SNX24Q9Y343 GIPC1-205ENST00000586027 1386 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC31.27■■■□□ 2.6
SNX24Q9Y343 METRNL-201ENST00000320095 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.21■■■□□ 2.59
SNX24Q9Y343 CRIP2-201ENST00000329146 1857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.17■■■□□ 2.58
SNX24Q9Y343 MPND-201ENST00000262966 1567 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC31.13■■■□□ 2.57
SNX24Q9Y343 GPI-201ENST00000356487 2210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.12■■■□□ 2.57
SNX24Q9Y343 OLFM1-208ENST00000392991 1057 ntTSL 2 BASIC31.12■■■□□ 2.57
SNX24Q9Y343 SLC25A28-201ENST00000370495 1451 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.11■■■□□ 2.57
SNX24Q9Y343 SLC25A10-203ENST00000545862 1911 ntTSL 1 (best) BASIC31.08■■■□□ 2.57
SNX24Q9Y343 C11orf84-201ENST00000294244 2024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.07■■■□□ 2.56
SNX24Q9Y343 ADRA1D-201ENST00000379453 2728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.02■■■□□ 2.56
SNX24Q9Y343 SSBP3-204ENST00000371320 2077 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC30.99■■■□□ 2.55
SNX24Q9Y343 KIAA2013-203ENST00000616327 2170 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC30.9■■■□□ 2.54
SNX24Q9Y343 FEZF2-201ENST00000283268 2074 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.86■■■□□ 2.53
SNX24Q9Y343 HAPLN2-201ENST00000255039 1771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.84■■■□□ 2.53
SNX24Q9Y343 MAPK3-202ENST00000322266 1743 ntTSL 5 BASIC30.82■■■□□ 2.52
SNX24Q9Y343 HRAS-203ENST00000397596 1100 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC30.82■■■□□ 2.52
SNX24Q9Y343 PWWP2B-202ENST00000631148 2013 ntTSL 5 BASIC30.8■■■□□ 2.52
SNX24Q9Y343 IFNGR2-201ENST00000290219 2221 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC30.77■■■□□ 2.52
SNX24Q9Y343 SULT4A1-201ENST00000330884 2468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.77■■■□□ 2.52
SNX24Q9Y343 ILK-212ENST00000532063 1617 ntTSL 2 BASIC30.76■■■□□ 2.52
SNX24Q9Y343 TAF5L-202ENST00000366674 492 ntTSL 3 BASIC30.75■■■□□ 2.51
SNX24Q9Y343 NT5DC2-202ENST00000422318 1795 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC30.72■■■□□ 2.51
SNX24Q9Y343 UBE2M-201ENST00000253023 1508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.71■■■□□ 2.51
SNX24Q9Y343 LMO2-202ENST00000395833 1687 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.62■■■□□ 2.49
SNX24Q9Y343 CSNK1E-205ENST00000405675 2127 ntTSL 5 BASIC30.59■■■□□ 2.49
SNX24Q9Y343 ANKRD60-201ENST00000457363 1038 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC30.58■■■□□ 2.49
SNX24Q9Y343 CSNK1E-206ENST00000413574 1631 ntTSL 5 BASIC30.55■■■□□ 2.48
SNX24Q9Y343 CTDNEP1-208ENST00000573600 1724 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC30.44■■■□□ 2.46
SNX24Q9Y343 GRASP-206ENST00000552049 1688 ntTSL 1 (best) BASIC30.38■■■□□ 2.45
SNX24Q9Y343 AGAP1-204ENST00000409457 2165 ntTSL 1 (best) BASIC30.37■■■□□ 2.45
SNX24Q9Y343 TUBB6-201ENST00000317702 2064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.37■■■□□ 2.45
SNX24Q9Y343 FEZF2-203ENST00000486811 2001 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC30.35■■■□□ 2.45
SNX24Q9Y343 SERINC2-201ENST00000373709 1997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.32■■■□□ 2.44
SNX24Q9Y343 SDCCAG3-202ENST00000357365 2304 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC30.29■■■□□ 2.44
SNX24Q9Y343 NKAIN4-203ENST00000370316 1430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.26■■■□□ 2.43
SNX24Q9Y343 STK25-202ENST00000401869 2251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.25■■■□□ 2.43
SNX24Q9Y343 NADK2-202ENST00000381937 2243 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC30.24■■■□□ 2.43
SNX24Q9Y343 PPP2CB-204ENST00000518564 691 ntTSL 3 BASIC30.19■■■□□ 2.42
SNX24Q9Y343 SAMD1-202ENST00000533683 2164 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC30.19■■■□□ 2.42
SNX24Q9Y343 POU3F1-201ENST00000373012 2184 ntAPPRIS P1 BASIC30.18■■■□□ 2.42
SNX24Q9Y343 SH3GLB2-201ENST00000372554 1985 ntTSL 1 (best) BASIC30.14■■■□□ 2.41
SNX24Q9Y343 UBP1-201ENST00000283628 2074 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC30.13■■■□□ 2.41
SNX24Q9Y343 SDCCAG3-204ENST00000371725 2129 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC30.13■■■□□ 2.41
SNX24Q9Y343 HAGHL-201ENST00000341413 1701 ntTSL 2 BASIC30.12■■■□□ 2.41
SNX24Q9Y343 CHST12-204ENST00000618655 2131 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.1■■■□□ 2.41
SNX24Q9Y343 TPRG1L-201ENST00000344579 2189 ntTSL 1 (best) BASIC30.09■■■□□ 2.41
SNX24Q9Y343 ST7-208ENST00000393451 2110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.07■■■□□ 2.4
SNX24Q9Y343 C11orf68-202ENST00000449692 1559 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC30.03■■■□□ 2.4
SNX24Q9Y343 ADRA2C-201ENST00000330055 2129 ntAPPRIS P1 BASIC29.98■■■□□ 2.39
SNX24Q9Y343 C7orf50-202ENST00000397098 2131 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC29.96■■■□□ 2.39
SNX24Q9Y343 TFEB-204ENST00000373033 2331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.96■■■□□ 2.39
SNX24Q9Y343 NT5M-207ENST00000616989 1635 ntTSL 1 (best) BASIC29.94■■■□□ 2.38
SNX24Q9Y343 DPP6-204ENST00000406326 2012 ntTSL 1 (best) BASIC29.94■■■□□ 2.38
SNX24Q9Y343 ECHS1-201ENST00000368547 1617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.93■■■□□ 2.38
SNX24Q9Y343 AC145285.7-201ENST00000614819 1539 ntBASIC29.93■■■□□ 2.38
SNX24Q9Y343 SIAH1-203ENST00000394725 2147 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC29.92■■■□□ 2.38
SNX24Q9Y343 RAN-202ENST00000392369 1530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.91■■■□□ 2.38
SNX24Q9Y343 WSB2-211ENST00000544233 2503 ntTSL 2 BASIC29.89■■■□□ 2.38
SNX24Q9Y343 SLC15A4-201ENST00000266771 2779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.87■■■□□ 2.37
SNX24Q9Y343 C11orf68-201ENST00000438576 1619 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC29.86■■■□□ 2.37
SNX24Q9Y343 Z97634.1-201ENST00000412293 1715 ntTSL 1 (best) BASIC29.84■■■□□ 2.37
SNX24Q9Y343 CBX4-201ENST00000269397 2664 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC29.84■■■□□ 2.37
SNX24Q9Y343 CSPG5-205ENST00000610462 2073 ntTSL 5 BASIC29.83■■■□□ 2.37
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 34 ms