Protein–RNA interactions for Protein: Q9Y247

FAM50B, Protein FAM50B, humanhuman

Predictions only

Length 325 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
FAM50BQ9Y247 EPHA10-211ENST00000540011 720 ntTSL 5 BASIC24.93■■□□□ 1.58
FAM50BQ9Y247 ACAA1-220ENST00000627515 1862 ntTSL 5 BASIC24.93■■□□□ 1.58
FAM50BQ9Y247 CCND3-203ENST00000372991 2085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.93■■□□□ 1.58
FAM50BQ9Y247 CAMKK1-201ENST00000158166 2459 ntTSL 1 (best) BASIC24.93■■□□□ 1.58
FAM50BQ9Y247 CD6-206ENST00000452451 1782 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.93■■□□□ 1.58
FAM50BQ9Y247 SHF-208ENST00000560734 1731 ntTSL 3 BASIC24.92■■□□□ 1.58
FAM50BQ9Y247 AL359317.1-201ENST00000556316 578 ntTSL 4 BASIC24.92■■□□□ 1.58
FAM50BQ9Y247 AL031432.3-201ENST00000607698 485 ntBASIC24.92■■□□□ 1.58
FAM50BQ9Y247 NDEL1-202ENST00000380025 2181 ntTSL 5 BASIC24.92■■□□□ 1.58
FAM50BQ9Y247 MRPL4-207ENST00000590669 1423 ntTSL 1 (best) BASIC24.92■■□□□ 1.58
FAM50BQ9Y247 APLP1-201ENST00000221891 2495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.92■■□□□ 1.58
FAM50BQ9Y247 RTN2-202ENST00000344680 2063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.92■■□□□ 1.58
FAM50BQ9Y247 DNAJC21-201ENST00000342382 2309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.91■■□□□ 1.58
FAM50BQ9Y247 EEF1D-201ENST00000317198 1458 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.91■■□□□ 1.58
FAM50BQ9Y247 ANKRD20A6P-201ENST00000618763 204 ntBASIC24.91■■□□□ 1.58
FAM50BQ9Y247 RASSF1-AS1-201ENST00000629828 790 ntBASIC24.91■■□□□ 1.58
FAM50BQ9Y247 ZNF219-201ENST00000360947 3071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.9■■□□□ 1.58
FAM50BQ9Y247 UCK1-204ENST00000372215 2167 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.9■■□□□ 1.58
FAM50BQ9Y247 NPB-202ENST00000573081 2154 ntAPPRIS ALT2 BASIC24.9■■□□□ 1.58
FAM50BQ9Y247 PCMT1-201ENST00000367378 1293 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.9■■□□□ 1.58
FAM50BQ9Y247 FAM222B-208ENST00000581381 556 ntTSL 4 BASIC24.9■■□□□ 1.58
FAM50BQ9Y247 EPM2A-208ENST00000618445 1694 ntTSL 1 (best) BASIC24.9■■□□□ 1.58
FAM50BQ9Y247 POU3F3-201ENST00000361360 3064 ntAPPRIS P1 BASIC24.89■■□□□ 1.58
FAM50BQ9Y247 RABL6-204ENST00000371671 1580 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.89■■□□□ 1.58
FAM50BQ9Y247 GLI3-203ENST00000437480 451 ntTSL 2 BASIC24.89■■□□□ 1.58
FAM50BQ9Y247 AL355987.3-201ENST00000456614 735 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC24.89■■□□□ 1.58
FAM50BQ9Y247 ATP6V0B-204ENST00000471859 865 ntTSL 5 BASIC24.89■■□□□ 1.58
FAM50BQ9Y247 PURG-201ENST00000339382 2693 ntTSL 1 (best) BASIC24.89■■□□□ 1.58
FAM50BQ9Y247 CTSA-203ENST00000372459 1972 ntTSL 1 (best) BASIC24.89■■□□□ 1.57
FAM50BQ9Y247 RAB40C-204ENST00000538492 2569 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.89■■□□□ 1.57
FAM50BQ9Y247 ZNF768-201ENST00000380412 2315 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.89■■□□□ 1.57
FAM50BQ9Y247 CPTP-201ENST00000343938 2190 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.88■■□□□ 1.57
FAM50BQ9Y247 VIPR2-203ENST00000402066 1926 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.88■■□□□ 1.57
FAM50BQ9Y247 MAGI2-211ENST00000535697 6146 ntTSL 5 BASIC24.88■■□□□ 1.57
FAM50BQ9Y247 SUMF1-202ENST00000383843 1447 ntTSL 2 BASIC24.88■■□□□ 1.57
FAM50BQ9Y247 COMT-204ENST00000403710 1548 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC24.88■■□□□ 1.57
FAM50BQ9Y247 CDPF1-201ENST00000314567 1875 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.88■■□□□ 1.57
FAM50BQ9Y247 HMX2-201ENST00000339992 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.88■■□□□ 1.57
FAM50BQ9Y247 LAMTOR1-201ENST00000278671 1179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.88■■□□□ 1.57
FAM50BQ9Y247 FAIM-203ENST00000393034 927 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC24.88■■□□□ 1.57
FAM50BQ9Y247 CDKN2A-206ENST00000494262 989 ntTSL 3 BASIC24.88■■□□□ 1.57
FAM50BQ9Y247 AP006621.1-201ENST00000532946 536 ntTSL 5 BASIC24.88■■□□□ 1.57
FAM50BQ9Y247 HOXA11-AS1_1.1-201ENST00000613939 98 ntBASIC24.88■■□□□ 1.57
FAM50BQ9Y247 SDSL-201ENST00000345635 1397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.88■■□□□ 1.57
FAM50BQ9Y247 RAB3IL1-202ENST00000394836 2284 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.88■■□□□ 1.57
FAM50BQ9Y247 MADCAM1-202ENST00000346144 1309 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.87■■□□□ 1.57
FAM50BQ9Y247 CASP9-201ENST00000333868 2019 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.87■■□□□ 1.57
FAM50BQ9Y247 RAD21-AS1-201ENST00000521487 2010 ntTSL 1 (best) BASIC24.87■■□□□ 1.57
FAM50BQ9Y247 LYPD2-201ENST00000359228 594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.87■■□□□ 1.57
FAM50BQ9Y247 PRICKLE4-201ENST00000394259 939 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.87■■□□□ 1.57
FAM50BQ9Y247 AC105265.2-201ENST00000467189 838 ntBASIC24.87■■□□□ 1.57
FAM50BQ9Y247 MIR6821-201ENST00000617625 74 ntBASIC24.87■■□□□ 1.57
FAM50BQ9Y247 SLC30A5-201ENST00000380860 1317 ntTSL 1 (best) BASIC24.86■■□□□ 1.57
FAM50BQ9Y247 PLEK2-201ENST00000216446 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.86■■□□□ 1.57
FAM50BQ9Y247 SLC39A3-201ENST00000269740 1502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.86■■□□□ 1.57
FAM50BQ9Y247 PWWP2B-201ENST00000305233 2651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.86■■□□□ 1.57
FAM50BQ9Y247 CRYAA-201ENST00000291554 1139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.86■■□□□ 1.57
FAM50BQ9Y247 FAIM-202ENST00000360570 1157 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC24.86■■□□□ 1.57
FAM50BQ9Y247 AQP1-202ENST00000409611 1140 ntTSL 1 (best) BASIC24.86■■□□□ 1.57
FAM50BQ9Y247 HSPE1-203ENST00000409729 478 ntTSL 2 BASIC24.86■■□□□ 1.57
FAM50BQ9Y247 PPM1N-207ENST00000451287 1293 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.86■■□□□ 1.57
FAM50BQ9Y247 FBXO33-202ENST00000554190 534 ntTSL 3 BASIC24.86■■□□□ 1.57
FAM50BQ9Y247 FRAT2-201ENST00000371019 2213 ntAPPRIS P1 BASIC24.86■■□□□ 1.57
FAM50BQ9Y247 MOB4-204ENST00000409360 1447 ntTSL 5 BASIC24.86■■□□□ 1.57
FAM50BQ9Y247 CLK2-203ENST00000368361 2166 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.86■■□□□ 1.57
FAM50BQ9Y247 MRPL46-201ENST00000312475 1019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.85■■□□□ 1.57
FAM50BQ9Y247 STOML2-201ENST00000356493 1278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.85■■□□□ 1.57
FAM50BQ9Y247 SRD5A1P1-201ENST00000442297 786 ntBASIC24.85■■□□□ 1.57
FAM50BQ9Y247 PRELID2-204ENST00000505416 738 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC24.85■■□□□ 1.57
FAM50BQ9Y247 PIK3R2-207ENST00000617130 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.85■■□□□ 1.57
FAM50BQ9Y247 MXRA7-202ENST00000375036 1950 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.84■■□□□ 1.57
FAM50BQ9Y247 NKX2-8-201ENST00000258829 1261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.84■■□□□ 1.57
FAM50BQ9Y247 FGF8-204ENST00000347978 823 ntTSL 1 (best) BASIC24.84■■□□□ 1.57
FAM50BQ9Y247 NEDD4L-237ENST00000617539 728 ntTSL 2 BASIC24.84■■□□□ 1.57
FAM50BQ9Y247 C11orf80-204ENST00000525908 2135 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC24.83■■□□□ 1.57
FAM50BQ9Y247 ROM1-201ENST00000278833 1878 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.83■■□□□ 1.57
FAM50BQ9Y247 MCRIP1-202ENST00000457257 942 ntTSL 3 BASIC24.83■■□□□ 1.57
FAM50BQ9Y247 DUSP22-214ENST00000605315 867 ntTSL 5 BASIC24.83■■□□□ 1.57
FAM50BQ9Y247 MTMR1-202ENST00000370390 2755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.83■■□□□ 1.57
FAM50BQ9Y247 FGF22-201ENST00000215530 1311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.83■■□□□ 1.56
FAM50BQ9Y247 DACT2-202ENST00000366796 2028 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.83■■□□□ 1.56
FAM50BQ9Y247 FLJ37453-201ENST00000317122 2473 ntTSL 2 BASIC24.83■■□□□ 1.56
FAM50BQ9Y247 RCOR3-202ENST00000367006 2525 ntTSL 1 (best) BASIC24.82■■□□□ 1.56
FAM50BQ9Y247 TMUB1-203ENST00000462940 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.82■■□□□ 1.56
FAM50BQ9Y247 C14orf80-205ENST00000392523 1845 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.82■■□□□ 1.56
FAM50BQ9Y247 UBALD2-201ENST00000327490 1593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.82■■□□□ 1.56
FAM50BQ9Y247 ZDHHC16-205ENST00000370846 1280 ntTSL 3 BASIC24.82■■□□□ 1.56
FAM50BQ9Y247 SUSD3-202ENST00000375472 1195 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.82■■□□□ 1.56
FAM50BQ9Y247 PICSAR-201ENST00000615826 733 ntTSL 1 (best) BASIC24.82■■□□□ 1.56
FAM50BQ9Y247 FADD-201ENST00000301838 1841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.82■■□□□ 1.56
FAM50BQ9Y247 RNF19B-201ENST00000235150 2334 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.81■■□□□ 1.56
FAM50BQ9Y247 SYT8-201ENST00000341958 1556 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.81■■□□□ 1.56
FAM50BQ9Y247 TANGO2-214ENST00000447208 2086 ntTSL 3 BASIC24.81■■□□□ 1.56
FAM50BQ9Y247 DHRS13-201ENST00000378895 1921 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.81■■□□□ 1.56
FAM50BQ9Y247 SDSL-202ENST00000403593 1449 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.81■■□□□ 1.56
FAM50BQ9Y247 AC097381.1-201ENST00000429019 1296 ntBASIC24.81■■□□□ 1.56
FAM50BQ9Y247 AC092807.3-205ENST00000467666 531 ntTSL 3 BASIC24.81■■□□□ 1.56
FAM50BQ9Y247 ERRFI1-203ENST00000469499 995 ntTSL 3 BASIC24.81■■□□□ 1.56
FAM50BQ9Y247 AC024257.2-201ENST00000549699 147 ntBASIC24.81■■□□□ 1.56
FAM50BQ9Y247 EMID1-202ENST00000404755 2049 ntTSL 5 BASIC24.81■■□□□ 1.56
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 81 ms