Protein–RNA interactions for Protein: Q9UQ05

KCNH4, Potassium voltage-gated channel subfamily H member 4, humanhuman

Predictions only

Length 1,017 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
KCNH4Q9UQ05 KLC3-201ENST00000391946 1780 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.47■■□□□ 1.99
KCNH4Q9UQ05 PSKH1-202ENST00000570631 1509 ntTSL 1 (best) BASIC27.46■■□□□ 1.99
KCNH4Q9UQ05 TMEM260-202ENST00000538838 1638 ntTSL 1 (best) BASIC27.46■■□□□ 1.99
KCNH4Q9UQ05 MRPL41-201ENST00000371443 1262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.46■■□□□ 1.99
KCNH4Q9UQ05 NRL-205ENST00000560550 788 ntTSL 1 (best) BASIC27.46■■□□□ 1.99
KCNH4Q9UQ05 DUSP22-214ENST00000605315 867 ntTSL 5 BASIC27.46■■□□□ 1.99
KCNH4Q9UQ05 SDSL-202ENST00000403593 1449 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.46■■□□□ 1.99
KCNH4Q9UQ05 PORCN-202ENST00000355961 1848 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC27.46■■□□□ 1.99
KCNH4Q9UQ05 CBX4-201ENST00000269397 2664 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.45■■□□□ 1.99
KCNH4Q9UQ05 TOP1MT-208ENST00000519148 1868 ntTSL 2 BASIC27.45■■□□□ 1.99
KCNH4Q9UQ05 CAPNS1-205ENST00000588780 1035 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.45■■□□□ 1.98
KCNH4Q9UQ05 AL031432.3-201ENST00000607698 485 ntBASIC27.45■■□□□ 1.98
KCNH4Q9UQ05 PAIP1-208ENST00000514514 1603 ntTSL 5 BASIC27.45■■□□□ 1.98
KCNH4Q9UQ05 IFNL4-201ENST00000606380 1637 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC27.45■■□□□ 1.98
KCNH4Q9UQ05 HYAL2-202ENST00000395139 2136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.44■■□□□ 1.98
KCNH4Q9UQ05 USP2-204ENST00000525735 1704 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC27.44■■□□□ 1.98
KCNH4Q9UQ05 IL20RA-202ENST00000367746 1244 ntTSL 2 BASIC27.44■■□□□ 1.98
KCNH4Q9UQ05 AP006621.1-201ENST00000532946 536 ntTSL 5 BASIC27.44■■□□□ 1.98
KCNH4Q9UQ05 PPP1CC-206ENST00000550991 1882 ntTSL 2 BASIC27.44■■□□□ 1.98
KCNH4Q9UQ05 NOX4-204ENST00000393282 560 ntTSL 1 (best) BASIC27.43■■□□□ 1.98
KCNH4Q9UQ05 NDUFS3-206ENST00000528192 561 ntTSL 5 BASIC27.43■■□□□ 1.98
KCNH4Q9UQ05 C16orf87-201ENST00000285697 1585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.43■■□□□ 1.98
KCNH4Q9UQ05 RDH14-201ENST00000381249 1587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.43■■□□□ 1.98
KCNH4Q9UQ05 KAT5-208ENST00000530446 1697 ntTSL 1 (best) BASIC27.43■■□□□ 1.98
KCNH4Q9UQ05 GTF2E2-201ENST00000355904 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.43■■□□□ 1.98
KCNH4Q9UQ05 RAB33A-201ENST00000257017 1258 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.42■■□□□ 1.98
KCNH4Q9UQ05 CARD19-201ENST00000375464 855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.42■■□□□ 1.98
KCNH4Q9UQ05 PRICKLE4-201ENST00000394259 939 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.42■■□□□ 1.98
KCNH4Q9UQ05 SUDS3P1-201ENST00000505831 966 ntBASIC27.42■■□□□ 1.98
KCNH4Q9UQ05 AC142381.2-201ENST00000566120 298 ntBASIC27.42■■□□□ 1.98
KCNH4Q9UQ05 RARRES2P6-201ENST00000567333 442 ntBASIC27.42■■□□□ 1.98
KCNH4Q9UQ05 AC090877.2-201ENST00000558441 1738 ntBASIC27.41■■□□□ 1.98
KCNH4Q9UQ05 ESRRA-201ENST00000000442 2215 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.41■■□□□ 1.98
KCNH4Q9UQ05 C11orf80-210ENST00000527634 1666 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.41■■□□□ 1.98
KCNH4Q9UQ05 UNC93B3-201ENST00000308076 687 ntBASIC27.41■■□□□ 1.98
KCNH4Q9UQ05 CDKN2D-201ENST00000335766 1086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.41■■□□□ 1.98
KCNH4Q9UQ05 AC105935.1-201ENST00000424174 422 ntTSL 3 BASIC27.41■■□□□ 1.98
KCNH4Q9UQ05 SHISA9-205ENST00000639941 1135 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.41■■□□□ 1.98
KCNH4Q9UQ05 PLSCR3-209ENST00000574401 2032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.41■■□□□ 1.98
KCNH4Q9UQ05 TNFSF12-TNFSF13-201ENST00000293826 1816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.41■■□□□ 1.98
KCNH4Q9UQ05 RHEB-201ENST00000262187 2075 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.4■■□□□ 1.98
KCNH4Q9UQ05 CNNM2-201ENST00000369875 2059 ntTSL 1 (best) BASIC27.4■■□□□ 1.98
KCNH4Q9UQ05 P2RX2-202ENST00000348800 1222 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.4■■□□□ 1.98
KCNH4Q9UQ05 P2RX2-204ENST00000351222 1140 ntTSL 1 (best) BASIC27.4■■□□□ 1.98
KCNH4Q9UQ05 LINC00472-204ENST00000436803 667 ntTSL 5 BASIC27.4■■□□□ 1.98
KCNH4Q9UQ05 P2RX2-207ENST00000449132 1113 ntTSL 1 (best) BASIC27.4■■□□□ 1.98
KCNH4Q9UQ05 AC243829.1-202ENST00000618848 486 ntTSL 3 BASIC27.4■■□□□ 1.98
KCNH4Q9UQ05 HOXD13-201ENST00000392539 2240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.4■■□□□ 1.98
KCNH4Q9UQ05 TCF24-201ENST00000563496 2450 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.39■■□□□ 1.98
KCNH4Q9UQ05 RNF166-201ENST00000312838 1883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.39■■□□□ 1.98
KCNH4Q9UQ05 AC019163.1-201ENST00000512634 610 ntTSL 2 BASIC27.39■■□□□ 1.98
KCNH4Q9UQ05 NR6A1-201ENST00000344523 1846 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.39■■□□□ 1.97
KCNH4Q9UQ05 TSPAN10-203ENST00000574882 1837 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.39■■□□□ 1.97
KCNH4Q9UQ05 PEX7-201ENST00000318471 1464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.38■■□□□ 1.97
KCNH4Q9UQ05 CLPSL2-201ENST00000360454 488 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.38■■□□□ 1.97
KCNH4Q9UQ05 CCDC107-203ENST00000378407 899 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC27.38■■□□□ 1.97
KCNH4Q9UQ05 RALB-203ENST00000420510 1252 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.38■■□□□ 1.97
KCNH4Q9UQ05 AC136475.3-202ENST00000534742 812 ntTSL 2 BASIC27.38■■□□□ 1.97
KCNH4Q9UQ05 AC092902.2-206ENST00000625484 846 ntTSL 5 BASIC27.38■■□□□ 1.97
KCNH4Q9UQ05 AC011511.4-201ENST00000586529 1850 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.38■■□□□ 1.97
KCNH4Q9UQ05 ATP6V0A2-209ENST00000613625 1620 ntTSL 1 (best) BASIC27.38■■□□□ 1.97
KCNH4Q9UQ05 BIN1-204ENST00000348750 2074 ntTSL 1 (best) BASIC27.37■■□□□ 1.97
KCNH4Q9UQ05 PARD6B-202ENST00000396039 522 ntTSL 1 (best) BASIC27.37■■□□□ 1.97
KCNH4Q9UQ05 AC026271.2-201ENST00000428091 497 ntBASIC27.37■■□□□ 1.97
KCNH4Q9UQ05 CRACR2B-202ENST00000525077 1578 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.37■■□□□ 1.97
KCNH4Q9UQ05 AL136162.1-201ENST00000607711 1078 ntBASIC27.37■■□□□ 1.97
KCNH4Q9UQ05 AQP10-201ENST00000324978 1791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.37■■□□□ 1.97
KCNH4Q9UQ05 EEF1D-201ENST00000317198 1458 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.37■■□□□ 1.97
KCNH4Q9UQ05 SPOCK3-221ENST00000512648 1456 ntTSL 1 (best) BASIC27.37■■□□□ 1.97
KCNH4Q9UQ05 PLPPR3-204ENST00000520876 2328 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.36■■□□□ 1.97
KCNH4Q9UQ05 KRTAP5-4-202ENST00000616115 660 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.36■■□□□ 1.97
KCNH4Q9UQ05 GNB2-203ENST00000393926 1641 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.36■■□□□ 1.97
KCNH4Q9UQ05 UNCX-201ENST00000316333 2048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.36■■□□□ 1.97
KCNH4Q9UQ05 ZDHHC20-203ENST00000400590 1869 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.35■■□□□ 1.97
KCNH4Q9UQ05 CRLF1-201ENST00000392386 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.35■■□□□ 1.97
KCNH4Q9UQ05 LYPD2-201ENST00000359228 594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.34■■□□□ 1.97
KCNH4Q9UQ05 LBH-205ENST00000407930 756 ntTSL 2 BASIC27.34■■□□□ 1.97
KCNH4Q9UQ05 TYROBP-203ENST00000544690 522 ntTSL 1 (best) BASIC27.34■■□□□ 1.97
KCNH4Q9UQ05 AL359317.1-201ENST00000556316 578 ntTSL 4 BASIC27.34■■□□□ 1.97
KCNH4Q9UQ05 MPP5-205ENST00000556345 1163 ntTSL 2 BASIC27.34■■□□□ 1.97
KCNH4Q9UQ05 NEDD4L-237ENST00000617539 728 ntTSL 2 BASIC27.34■■□□□ 1.97
KCNH4Q9UQ05 LURAP1L-201ENST00000319264 1753 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.34■■□□□ 1.97
KCNH4Q9UQ05 CCDC166-201ENST00000542437 1320 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.34■■□□□ 1.97
KCNH4Q9UQ05 AC135279.3-201ENST00000610945 1311 ntBASIC27.34■■□□□ 1.97
KCNH4Q9UQ05 KCNJ4-201ENST00000303592 2065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.34■■□□□ 1.97
KCNH4Q9UQ05 AC142086.6-201ENST00000621154 1765 ntBASIC27.33■■□□□ 1.97
KCNH4Q9UQ05 ZNF32-202ENST00000395797 1201 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.33■■□□□ 1.97
KCNH4Q9UQ05 FBXO33-202ENST00000554190 534 ntTSL 3 BASIC27.33■■□□□ 1.97
KCNH4Q9UQ05 TCEA1-211ENST00000522635 1432 ntTSL 2 BASIC27.33■■□□□ 1.96
KCNH4Q9UQ05 C2CD4D-201ENST00000454109 1757 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.32■■□□□ 1.96
KCNH4Q9UQ05 EDA-201ENST00000338901 1233 ntBASIC27.32■■□□□ 1.96
KCNH4Q9UQ05 ACBD4-216ENST00000619916 1276 ntTSL 5 BASIC27.32■■□□□ 1.96
KCNH4Q9UQ05 COMMD5-201ENST00000305103 1373 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.32■■□□□ 1.96
KCNH4Q9UQ05 CCR10-201ENST00000332438 1773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.32■■□□□ 1.96
KCNH4Q9UQ05 TST-202ENST00000403892 1797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.32■■□□□ 1.96
KCNH4Q9UQ05 C19orf47-202ENST00000392035 2126 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.31■■□□□ 1.96
KCNH4Q9UQ05 SLC30A5-201ENST00000380860 1317 ntTSL 1 (best) BASIC27.31■■□□□ 1.96
KCNH4Q9UQ05 C7orf49-203ENST00000430372 1579 ntTSL 5 BASIC27.31■■□□□ 1.96
KCNH4Q9UQ05 HSPBP1-201ENST00000255631 1768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.3■■□□□ 1.96
KCNH4Q9UQ05 AP2S1-201ENST00000263270 935 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.3■■□□□ 1.96
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 24 ms