Protein–RNA interactions for Protein: Q9ULT6

ZNRF3, E3 ubiquitin-protein ligase ZNRF3, humanhuman

Predictions only

Length 936 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ZNRF3Q9ULT6 CCNJL-201ENST00000257536 1848 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.67■■■□□ 2.18
ZNRF3Q9ULT6 RASGEF1B-208ENST00000510780 539 ntTSL 3 BASIC28.67■■■□□ 2.18
ZNRF3Q9ULT6 RASGEF1B-209ENST00000512343 498 ntTSL 3 BASIC28.67■■■□□ 2.18
ZNRF3Q9ULT6 CDKN2A-210ENST00000530628 748 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.67■■■□□ 2.18
ZNRF3Q9ULT6 TYROBP-203ENST00000544690 522 ntTSL 1 (best) BASIC28.67■■■□□ 2.18
ZNRF3Q9ULT6 ACBD4-216ENST00000619916 1276 ntTSL 5 BASIC28.67■■■□□ 2.18
ZNRF3Q9ULT6 SHISA9-205ENST00000639941 1135 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.67■■■□□ 2.18
ZNRF3Q9ULT6 LACTB-201ENST00000261893 1972 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.67■■■□□ 2.18
ZNRF3Q9ULT6 APLP1-201ENST00000221891 2495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.67■■■□□ 2.18
ZNRF3Q9ULT6 R3HCC1-201ENST00000265806 1773 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.67■■■□□ 2.18
ZNRF3Q9ULT6 KLC3-201ENST00000391946 1780 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.66■■■□□ 2.18
ZNRF3Q9ULT6 AL359317.1-201ENST00000556316 578 ntTSL 4 BASIC28.66■■■□□ 2.18
ZNRF3Q9ULT6 FOXO3B-201ENST00000395675 1928 ntBASIC28.66■■■□□ 2.18
ZNRF3Q9ULT6 PEX7-201ENST00000318471 1464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.66■■■□□ 2.18
ZNRF3Q9ULT6 ARL4D-201ENST00000320033 1612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.65■■■□□ 2.18
ZNRF3Q9ULT6 RAB33A-201ENST00000257017 1258 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.65■■■□□ 2.18
ZNRF3Q9ULT6 ZNF32-202ENST00000395797 1201 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.65■■■□□ 2.18
ZNRF3Q9ULT6 AC136475.3-202ENST00000534742 812 ntTSL 2 BASIC28.65■■■□□ 2.18
ZNRF3Q9ULT6 ZNF784-202ENST00000591479 1559 ntTSL 1 (best) BASIC28.64■■■□□ 2.18
ZNRF3Q9ULT6 SERPING1-205ENST00000403558 2231 ntTSL 5 BASIC28.64■■■□□ 2.18
ZNRF3Q9ULT6 CCZ1B-215ENST00000626257 2211 ntTSL 2 BASIC28.64■■■□□ 2.18
ZNRF3Q9ULT6 RALB-203ENST00000420510 1252 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.64■■■□□ 2.18
ZNRF3Q9ULT6 LGR4-203ENST00000480977 492 ntTSL 2 BASIC28.64■■■□□ 2.18
ZNRF3Q9ULT6 NEDD4L-237ENST00000617539 728 ntTSL 2 BASIC28.64■■■□□ 2.18
ZNRF3Q9ULT6 RRAD-201ENST00000299759 1569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.63■■■□□ 2.17
ZNRF3Q9ULT6 AC019163.1-201ENST00000512634 610 ntTSL 2 BASIC28.63■■■□□ 2.17
ZNRF3Q9ULT6 ATP10A-207ENST00000619904 988 ntTSL 5 BASIC28.63■■■□□ 2.17
ZNRF3Q9ULT6 MEIS3-204ENST00000558555 1715 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.63■■■□□ 2.17
ZNRF3Q9ULT6 CASP9-202ENST00000348549 1621 ntTSL 1 (best) BASIC28.62■■■□□ 2.17
ZNRF3Q9ULT6 LYPD2-201ENST00000359228 594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.62■■■□□ 2.17
ZNRF3Q9ULT6 FBXO33-202ENST00000554190 534 ntTSL 3 BASIC28.62■■■□□ 2.17
ZNRF3Q9ULT6 KRTAP5-4-202ENST00000616115 660 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.62■■■□□ 2.17
ZNRF3Q9ULT6 SH3BP2-221ENST00000511747 2351 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.62■■■□□ 2.17
ZNRF3Q9ULT6 FSD1-204ENST00000597590 1634 ntTSL 5 BASIC28.61■■■□□ 2.17
ZNRF3Q9ULT6 EDA-201ENST00000338901 1233 ntBASIC28.61■■■□□ 2.17
ZNRF3Q9ULT6 NOX4-204ENST00000393282 560 ntTSL 1 (best) BASIC28.61■■■□□ 2.17
ZNRF3Q9ULT6 AL355987.3-201ENST00000456614 735 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC28.61■■■□□ 2.17
ZNRF3Q9ULT6 CDKN2A-206ENST00000494262 989 ntTSL 3 BASIC28.61■■■□□ 2.17
ZNRF3Q9ULT6 CCDC166-201ENST00000542437 1320 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.61■■■□□ 2.17
ZNRF3Q9ULT6 PPP1CC-206ENST00000550991 1882 ntTSL 2 BASIC28.61■■■□□ 2.17
ZNRF3Q9ULT6 TMEM260-202ENST00000538838 1638 ntTSL 1 (best) BASIC28.61■■■□□ 2.17
ZNRF3Q9ULT6 ZDHHC20-203ENST00000400590 1869 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.6■■■□□ 2.17
ZNRF3Q9ULT6 AC243829.1-202ENST00000618848 486 ntTSL 3 BASIC28.6■■■□□ 2.17
ZNRF3Q9ULT6 AL355001.2-201ENST00000620617 1191 ntBASIC28.6■■■□□ 2.17
ZNRF3Q9ULT6 MRPL46-201ENST00000312475 1019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.59■■■□□ 2.17
ZNRF3Q9ULT6 HYI-206ENST00000372434 1025 ntTSL 5 BASIC28.59■■■□□ 2.17
ZNRF3Q9ULT6 SRD5A1P1-201ENST00000442297 786 ntBASIC28.59■■■□□ 2.17
ZNRF3Q9ULT6 AC024257.2-201ENST00000549699 147 ntBASIC28.59■■■□□ 2.17
ZNRF3Q9ULT6 MIR5787-201ENST00000611784 55 ntBASIC28.59■■■□□ 2.17
ZNRF3Q9ULT6 SLC30A5-201ENST00000380860 1317 ntTSL 1 (best) BASIC28.59■■■□□ 2.17
ZNRF3Q9ULT6 ACTR3B-201ENST00000256001 2216 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.59■■■□□ 2.17
ZNRF3Q9ULT6 FGF8-204ENST00000347978 823 ntTSL 1 (best) BASIC28.58■■■□□ 2.17
ZNRF3Q9ULT6 AC104564.3-201ENST00000582367 638 ntBASIC28.58■■■□□ 2.17
ZNRF3Q9ULT6 ZNF653-201ENST00000293771 2240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.57■■■□□ 2.16
ZNRF3Q9ULT6 GJD3-201ENST00000578689 885 ntAPPRIS P1 BASIC28.57■■■□□ 2.16
ZNRF3Q9ULT6 CRACR2B-202ENST00000525077 1578 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.57■■■□□ 2.16
ZNRF3Q9ULT6 AC090877.2-201ENST00000558441 1738 ntBASIC28.57■■■□□ 2.16
ZNRF3Q9ULT6 PRSS22-201ENST00000161006 1386 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.56■■■□□ 2.16
ZNRF3Q9ULT6 NR6A1-201ENST00000344523 1846 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.56■■■□□ 2.16
ZNRF3Q9ULT6 KAT5-208ENST00000530446 1697 ntTSL 1 (best) BASIC28.56■■■□□ 2.16
ZNRF3Q9ULT6 CRLF1-201ENST00000392386 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.55■■■□□ 2.16
ZNRF3Q9ULT6 USP2-204ENST00000525735 1704 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC28.55■■■□□ 2.16
ZNRF3Q9ULT6 C16orf87-201ENST00000285697 1585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.55■■■□□ 2.16
ZNRF3Q9ULT6 NAA38-201ENST00000333775 999 ntTSL 1 (best) BASIC28.55■■■□□ 2.16
ZNRF3Q9ULT6 PQLC1-202ENST00000357575 2475 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC28.54■■■□□ 2.16
ZNRF3Q9ULT6 MNX1-201ENST00000252971 2174 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.54■■■□□ 2.16
ZNRF3Q9ULT6 STX10-202ENST00000343587 1128 ntTSL 1 (best) BASIC28.54■■■□□ 2.16
ZNRF3Q9ULT6 SYT8-201ENST00000341958 1556 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.54■■■□□ 2.16
ZNRF3Q9ULT6 COMMD5-201ENST00000305103 1373 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.53■■■□□ 2.16
ZNRF3Q9ULT6 UCK1-204ENST00000372215 2167 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.53■■■□□ 2.16
ZNRF3Q9ULT6 CROT-202ENST00000412227 1213 ntTSL 1 (best) BASIC28.53■■■□□ 2.16
ZNRF3Q9ULT6 SMIM29-205ENST00000468145 903 ntTSL 2 BASIC28.53■■■□□ 2.16
ZNRF3Q9ULT6 SMIM29-207ENST00000481533 1053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.53■■■□□ 2.16
ZNRF3Q9ULT6 FAM174B-207ENST00000555748 866 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC28.53■■■□□ 2.16
ZNRF3Q9ULT6 GSX2-205ENST00000611459 1262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.53■■■□□ 2.16
ZNRF3Q9ULT6 CTSA-203ENST00000372459 1972 ntTSL 1 (best) BASIC28.53■■■□□ 2.16
ZNRF3Q9ULT6 RNF166-201ENST00000312838 1883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.53■■■□□ 2.16
ZNRF3Q9ULT6 TNFSF12-TNFSF13-201ENST00000293826 1816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.53■■■□□ 2.16
ZNRF3Q9ULT6 MPP5-205ENST00000556345 1163 ntTSL 2 BASIC28.52■■■□□ 2.16
ZNRF3Q9ULT6 AL136967.2-201ENST00000623968 743 ntBASIC28.52■■■□□ 2.16
ZNRF3Q9ULT6 FEV-201ENST00000295727 1879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.52■■■□□ 2.16
ZNRF3Q9ULT6 PORCN-202ENST00000355961 1848 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC28.52■■■□□ 2.16
ZNRF3Q9ULT6 MTCH1-201ENST00000373616 2006 ntTSL 1 (best) BASIC28.52■■■□□ 2.16
ZNRF3Q9ULT6 PAIP1-208ENST00000514514 1603 ntTSL 5 BASIC28.51■■■□□ 2.15
ZNRF3Q9ULT6 CCDC107-205ENST00000421582 1324 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC28.51■■■□□ 2.15
ZNRF3Q9ULT6 C19orf60-201ENST00000358607 839 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.51■■■□□ 2.15
ZNRF3Q9ULT6 LBH-205ENST00000407930 756 ntTSL 2 BASIC28.51■■■□□ 2.15
ZNRF3Q9ULT6 C19orf60-202ENST00000450195 702 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.51■■■□□ 2.15
ZNRF3Q9ULT6 AC105265.2-201ENST00000467189 838 ntBASIC28.51■■■□□ 2.15
ZNRF3Q9ULT6 SMARCA5-AS1-201ENST00000500800 945 ntTSL 1 (best) BASIC28.51■■■□□ 2.15
ZNRF3Q9ULT6 LRRC10B-201ENST00000378075 2219 ntAPPRIS P1 BASIC28.51■■■□□ 2.15
ZNRF3Q9ULT6 TOP1MT-208ENST00000519148 1868 ntTSL 2 BASIC28.51■■■□□ 2.15
ZNRF3Q9ULT6 RCE1-202ENST00000524506 1379 ntTSL 5 BASIC28.5■■■□□ 2.15
ZNRF3Q9ULT6 RDH14-201ENST00000381249 1587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.5■■■□□ 2.15
ZNRF3Q9ULT6 SHF-208ENST00000560734 1731 ntTSL 3 BASIC28.5■■■□□ 2.15
ZNRF3Q9ULT6 LAMTOR1-201ENST00000278671 1179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.5■■■□□ 2.15
ZNRF3Q9ULT6 LBX2-202ENST00000377566 1186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.5■■■□□ 2.15
ZNRF3Q9ULT6 FAIM-203ENST00000393034 927 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC28.5■■■□□ 2.15
ZNRF3Q9ULT6 KLRG2-202ENST00000393039 1148 ntTSL 5 BASIC28.5■■■□□ 2.15
ZNRF3Q9ULT6 GRAMD1B-217ENST00000640939 1212 ntTSL 5 BASIC28.5■■■□□ 2.15
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 20.3 ms