Protein–RNA interactions for Protein: Q9UH64

CDKN2A-AS1, Susceptibility protein NSG-x, humanhuman

Predictions only

Length 79 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CDKN2A-AS1Q9UH64 BAZ1A-201ENST00000358716 5920 ntTSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
CDKN2A-AS1Q9UH64 SLC30A2-201ENST00000374276 2494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
CDKN2A-AS1Q9UH64 PELI3-201ENST00000320740 2740 ntTSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
CDKN2A-AS1Q9UH64 EBPL-201ENST00000242827 914 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
CDKN2A-AS1Q9UH64 USF3-203ENST00000491165 2133 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
CDKN2A-AS1Q9UH64 PLEKHF2-202ENST00000519516 1144 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.02■□□□□ 0.16
CDKN2A-AS1Q9UH64 ATP8B2-201ENST00000368487 1523 ntTSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
CDKN2A-AS1Q9UH64 KCNT1-201ENST00000263604 5245 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.02■□□□□ 0.15
CDKN2A-AS1Q9UH64 LDB1-201ENST00000361198 2285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
CDKN2A-AS1Q9UH64 NAPRT-204ENST00000449291 1965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
CDKN2A-AS1Q9UH64 ST8SIA6-201ENST00000377602 2276 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
CDKN2A-AS1Q9UH64 AC099805.1-201ENST00000523987 1797 ntTSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
CDKN2A-AS1Q9UH64 HMGA2-201ENST00000354636 1529 ntTSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
CDKN2A-AS1Q9UH64 RYK-208ENST00000620660 2942 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
CDKN2A-AS1Q9UH64 ANKRD20A11P-201ENST00000344693 1088 ntTSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
CDKN2A-AS1Q9UH64 COPRS-202ENST00000378634 1041 ntTSL 2 BASIC16.01■□□□□ 0.15
CDKN2A-AS1Q9UH64 LINC01896-206ENST00000575722 1256 ntTSL 2 BASIC16.01■□□□□ 0.15
CDKN2A-AS1Q9UH64 COPZ2-210ENST00000621465 895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
CDKN2A-AS1Q9UH64 ZSCAN18-202ENST00000421612 1488 ntTSL 4 BASIC16.01■□□□□ 0.15
CDKN2A-AS1Q9UH64 PTH1R-206ENST00000430002 1947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
CDKN2A-AS1Q9UH64 LHX2-201ENST00000373615 2554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
CDKN2A-AS1Q9UH64 C9orf163-202ENST00000624034 2573 ntBASIC16.01■□□□□ 0.15
CDKN2A-AS1Q9UH64 NKX6-3-202ENST00000524115 1683 ntTSL 2 BASIC16.01■□□□□ 0.15
CDKN2A-AS1Q9UH64 ANKRD28-201ENST00000399451 6564 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
CDKN2A-AS1Q9UH64 RBM4B-203ENST00000525754 2339 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.01■□□□□ 0.15
CDKN2A-AS1Q9UH64 AK8-201ENST00000298545 2072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
CDKN2A-AS1Q9UH64 CAPNS1-216ENST00000628306 1389 ntTSL 5 BASIC16■□□□□ 0.15
CDKN2A-AS1Q9UH64 HOMER2-201ENST00000304231 1990 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC16■□□□□ 0.15
CDKN2A-AS1Q9UH64 TMEM102-201ENST00000323206 1973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
CDKN2A-AS1Q9UH64 HTATSF1-201ENST00000218364 2775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
CDKN2A-AS1Q9UH64 WHAMM-201ENST00000286760 5101 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
CDKN2A-AS1Q9UH64 PTPRM-211ENST00000580170 5941 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
CDKN2A-AS1Q9UH64 AKT1-201ENST00000349310 2866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
CDKN2A-AS1Q9UH64 DENND1A-201ENST00000373618 3003 ntTSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
CDKN2A-AS1Q9UH64 SLAIN1-213ENST00000466548 2637 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16■□□□□ 0.15
CDKN2A-AS1Q9UH64 KCNK13-201ENST00000282146 2522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
CDKN2A-AS1Q9UH64 PROCA1-201ENST00000301039 1566 ntTSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
CDKN2A-AS1Q9UH64 DONSON-201ENST00000303071 2170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
CDKN2A-AS1Q9UH64 MAGED2-206ENST00000375068 2189 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
CDKN2A-AS1Q9UH64 PLEKHO1-202ENST00000369126 1809 ntTSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
CDKN2A-AS1Q9UH64 PTGES2-202ENST00000338961 2331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
CDKN2A-AS1Q9UH64 PPP1R35-201ENST00000292330 1031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
CDKN2A-AS1Q9UH64 HLA-V-202ENST00000446817 847 ntBASIC15.99■□□□□ 0.15
CDKN2A-AS1Q9UH64 WNT5A-AS1-201ENST00000469484 500 ntTSL 3 BASIC15.99■□□□□ 0.15
CDKN2A-AS1Q9UH64 CAAP1-205ENST00000520187 773 ntTSL 5 BASIC15.99■□□□□ 0.15
CDKN2A-AS1Q9UH64 MED25-210ENST00000612854 801 ntTSL 5 BASIC15.99■□□□□ 0.15
CDKN2A-AS1Q9UH64 MED25-213ENST00000620467 1293 ntTSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
CDKN2A-AS1Q9UH64 MED25-214ENST00000622402 642 ntTSL 5 BASIC15.99■□□□□ 0.15
CDKN2A-AS1Q9UH64 HAUS3-202ENST00000443786 2430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
CDKN2A-AS1Q9UH64 SHD-204ENST00000599689 1729 ntTSL 5 BASIC15.99■□□□□ 0.15
CDKN2A-AS1Q9UH64 PCYT2-201ENST00000331285 2147 ntTSL 2 BASIC15.98■□□□□ 0.15
CDKN2A-AS1Q9UH64 POLR3H-201ENST00000337566 1330 ntTSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
CDKN2A-AS1Q9UH64 BDH1-207ENST00000441275 1605 ntTSL 5 BASIC15.98■□□□□ 0.15
CDKN2A-AS1Q9UH64 HSD17B1-201ENST00000225929 1265 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.98■□□□□ 0.15
CDKN2A-AS1Q9UH64 PNKP-201ENST00000322344 2041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
CDKN2A-AS1Q9UH64 HGH1-207ENST00000628266 258 ntTSL 5 BASIC15.98■□□□□ 0.15
CDKN2A-AS1Q9UH64 PARD3-202ENST00000346874 5894 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
CDKN2A-AS1Q9UH64 PARD3-203ENST00000350537 5867 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
CDKN2A-AS1Q9UH64 HOXC9-201ENST00000303450 1516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
CDKN2A-AS1Q9UH64 CHODL-201ENST00000299295 2548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
CDKN2A-AS1Q9UH64 CAPN12-212ENST00000601953 2381 ntTSL 5 BASIC15.98■□□□□ 0.15
CDKN2A-AS1Q9UH64 C1orf122-202ENST00000373043 2229 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
CDKN2A-AS1Q9UH64 ZNF707-222ENST00000532158 2218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
CDKN2A-AS1Q9UH64 CCDC151-203ENST00000591179 1943 ntTSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
CDKN2A-AS1Q9UH64 TMEM8B-203ENST00000377996 2473 ntTSL 2 BASIC15.97■□□□□ 0.15
CDKN2A-AS1Q9UH64 LSR-205ENST00000427250 1606 ntTSL 2 BASIC15.97■□□□□ 0.15
CDKN2A-AS1Q9UH64 STOML1-201ENST00000316900 2169 ntTSL 2 BASIC15.97■□□□□ 0.15
CDKN2A-AS1Q9UH64 MAP6D1-201ENST00000318631 2111 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
CDKN2A-AS1Q9UH64 PARD3-209ENST00000374790 5825 ntTSL 5 BASIC15.97■□□□□ 0.15
CDKN2A-AS1Q9UH64 PARD3-213ENST00000545260 5740 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
CDKN2A-AS1Q9UH64 CTXN1-201ENST00000318978 1274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
CDKN2A-AS1Q9UH64 NPHS2-202ENST00000367616 1670 ntTSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
CDKN2A-AS1Q9UH64 GRK4-202ENST00000398051 2068 ntTSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
CDKN2A-AS1Q9UH64 INPPL1-201ENST00000298229 4733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
CDKN2A-AS1Q9UH64 DLL3-201ENST00000205143 2332 ntTSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
CDKN2A-AS1Q9UH64 SLC25A42-201ENST00000318596 3120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
CDKN2A-AS1Q9UH64 C1QL3-201ENST00000298943 2493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
CDKN2A-AS1Q9UH64 HADH-209ENST00000603302 2032 ntTSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
CDKN2A-AS1Q9UH64 HIRA-201ENST00000263208 4053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
CDKN2A-AS1Q9UH64 RANBP1-202ENST00000402752 1132 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
CDKN2A-AS1Q9UH64 MIR6089-201ENST00000616698 64 ntBASIC15.96■□□□□ 0.15
CDKN2A-AS1Q9UH64 TMEM51-205ENST00000434578 1861 ntTSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
CDKN2A-AS1Q9UH64 GNB2-203ENST00000393926 1641 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.96■□□□□ 0.15
CDKN2A-AS1Q9UH64 AFDN-AS1-201ENST00000359760 2238 ntTSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
CDKN2A-AS1Q9UH64 NFE2L3P1-201ENST00000588207 1959 ntBASIC15.96■□□□□ 0.15
CDKN2A-AS1Q9UH64 HAS1-201ENST00000222115 2087 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
CDKN2A-AS1Q9UH64 CCNJL-201ENST00000257536 1848 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.96■□□□□ 0.14
CDKN2A-AS1Q9UH64 DMRT2-209ENST00000635183 2190 ntTSL 5 BASIC15.96■□□□□ 0.14
CDKN2A-AS1Q9UH64 ST3GAL5-214ENST00000638178 2034 ntTSL 5 BASIC15.95■□□□□ 0.14
CDKN2A-AS1Q9UH64 PQLC3-204ENST00000441908 1784 ntTSL 2 BASIC15.95■□□□□ 0.14
CDKN2A-AS1Q9UH64 DONSON-210ENST00000453626 2332 ntTSL 5 BASIC15.95■□□□□ 0.14
CDKN2A-AS1Q9UH64 ASRGL1-202ENST00000415229 2270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
CDKN2A-AS1Q9UH64 AC126177.7-201ENST00000547904 679 ntBASIC15.95■□□□□ 0.14
CDKN2A-AS1Q9UH64 LINGO3-201ENST00000585527 2241 ntAPPRIS P1 BASIC15.95■□□□□ 0.14
CDKN2A-AS1Q9UH64 P2RX5-201ENST00000225328 2309 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
CDKN2A-AS1Q9UH64 RFC2-201ENST00000055077 1695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
CDKN2A-AS1Q9UH64 PTPRJ-201ENST00000418331 5122 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
CDKN2A-AS1Q9UH64 PHACTR2-208ENST00000440869 2569 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.94■□□□□ 0.14
CDKN2A-AS1Q9UH64 ZNF444-211ENST00000592949 1906 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
CDKN2A-AS1Q9UH64 CAMK2N1-201ENST00000375078 2336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 20.5 ms