Protein–RNA interactions for Protein: Q9UGU0

TCF20, Transcription factor 20, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 1,960 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TCF20Q9UGU0 CD47-202ENST00000361309 1285 ntTSL 1 (best) BASIC24.89■■□□□ 1.57
TCF20Q9UGU0 LTB4R-202ENST00000396782 1627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.89■■□□□ 1.57
TCF20Q9UGU0 FBXO7-206ENST00000452138 1535 ntTSL 2 BASIC24.88■■□□□ 1.57
TCF20Q9UGU0 FEV-201ENST00000295727 1879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.88■■□□□ 1.57
TCF20Q9UGU0 AC034268.1-201ENST00000441047 882 ntBASIC24.88■■□□□ 1.57
TCF20Q9UGU0 CT47B1-201ENST00000371311 1328 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.88■■□□□ 1.57
TCF20Q9UGU0 TRAF4-217ENST00000618771 543 ntTSL 5 BASIC24.87■■□□□ 1.57
TCF20Q9UGU0 CAMK1D-203ENST00000615792 1725 ntTSL 5 BASIC24.87■■□□□ 1.57
TCF20Q9UGU0 ID1-201ENST00000376105 1233 ntBASIC24.87■■□□□ 1.57
TCF20Q9UGU0 PTMA-205ENST00000410064 814 ntTSL 2 BASIC24.87■■□□□ 1.57
TCF20Q9UGU0 REXO4-201ENST00000371935 1899 ntTSL 3 BASIC24.86■■□□□ 1.57
TCF20Q9UGU0 MEN1-204ENST00000377313 1871 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC24.86■■□□□ 1.57
TCF20Q9UGU0 FGD5-AS1-204ENST00000430166 1184 ntTSL 2 BASIC24.86■■□□□ 1.57
TCF20Q9UGU0 PQLC1-203ENST00000397778 2555 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.86■■□□□ 1.57
TCF20Q9UGU0 C8orf58-202ENST00000409586 2021 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.86■■□□□ 1.57
TCF20Q9UGU0 LRRC1-201ENST00000370882 808 ntTSL 3 BASIC24.85■■□□□ 1.57
TCF20Q9UGU0 SMARCA5-AS1-201ENST00000500800 945 ntTSL 1 (best) BASIC24.85■■□□□ 1.57
TCF20Q9UGU0 RABL6-204ENST00000371671 1580 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.85■■□□□ 1.57
TCF20Q9UGU0 TMEM150A-201ENST00000306353 1484 ntTSL 1 (best) BASIC24.85■■□□□ 1.57
TCF20Q9UGU0 SMARCD3-203ENST00000392811 2018 ntTSL 1 (best) BASIC24.85■■□□□ 1.57
TCF20Q9UGU0 CTF1-202ENST00000395019 1617 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.85■■□□□ 1.57
TCF20Q9UGU0 SERPING1-205ENST00000403558 2231 ntTSL 5 BASIC24.84■■□□□ 1.57
TCF20Q9UGU0 CCDC166-201ENST00000542437 1320 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.84■■□□□ 1.57
TCF20Q9UGU0 FRMD8-208ENST00000531296 366 ntTSL 1 (best) BASIC24.84■■□□□ 1.57
TCF20Q9UGU0 LACTB-201ENST00000261893 1972 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.84■■□□□ 1.57
TCF20Q9UGU0 ANKRD65-205ENST00000537107 2190 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.84■■□□□ 1.57
TCF20Q9UGU0 HACD1-201ENST00000326961 773 ntTSL 2 BASIC24.84■■□□□ 1.57
TCF20Q9UGU0 NAA38-201ENST00000333775 999 ntTSL 1 (best) BASIC24.84■■□□□ 1.57
TCF20Q9UGU0 CD6-206ENST00000452451 1782 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.83■■□□□ 1.57
TCF20Q9UGU0 LLGL2-202ENST00000375227 1374 ntTSL 1 (best) BASIC24.83■■□□□ 1.57
TCF20Q9UGU0 AC009690.3-201ENST00000569547 1902 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.83■■□□□ 1.57
TCF20Q9UGU0 MNX1-201ENST00000252971 2174 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.83■■□□□ 1.57
TCF20Q9UGU0 C11orf80-218ENST00000540737 1786 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.83■■□□□ 1.57
TCF20Q9UGU0 SLC16A3-214ENST00000582743 2002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.83■■□□□ 1.56
TCF20Q9UGU0 CENPVL1-201ENST00000602548 1620 ntAPPRIS P1 BASIC24.82■■□□□ 1.56
TCF20Q9UGU0 CENPVL2-201ENST00000634648 1620 ntAPPRIS P1 BASIC24.82■■□□□ 1.56
TCF20Q9UGU0 AC116614.1-201ENST00000456949 539 ntTSL 2 BASIC24.82■■□□□ 1.56
TCF20Q9UGU0 AC080013.1-202ENST00000465477 674 ntTSL 5 BASIC24.82■■□□□ 1.56
TCF20Q9UGU0 PEX7-201ENST00000318471 1464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.82■■□□□ 1.56
TCF20Q9UGU0 TRADD-201ENST00000345057 1877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.82■■□□□ 1.56
TCF20Q9UGU0 CPTP-201ENST00000343938 2190 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.82■■□□□ 1.56
TCF20Q9UGU0 GDNF-203ENST00000381826 778 ntTSL 1 (best) BASIC24.82■■□□□ 1.56
TCF20Q9UGU0 GDNF-204ENST00000427982 856 ntTSL 1 (best) BASIC24.82■■□□□ 1.56
TCF20Q9UGU0 MAG-206ENST00000597035 542 ntTSL 4 BASIC24.82■■□□□ 1.56
TCF20Q9UGU0 SHOX2-201ENST00000389589 2072 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.81■■□□□ 1.56
TCF20Q9UGU0 LY6E-201ENST00000292494 1181 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.81■■□□□ 1.56
TCF20Q9UGU0 TCF24-201ENST00000563496 2450 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.81■■□□□ 1.56
TCF20Q9UGU0 CYC1-201ENST00000318911 1240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.8■■□□□ 1.56
TCF20Q9UGU0 AC022517.1-201ENST00000592429 346 ntBASIC24.8■■□□□ 1.56
TCF20Q9UGU0 AC119427.1-201ENST00000633182 556 ntTSL 4 BASIC24.8■■□□□ 1.56
TCF20Q9UGU0 GRAMD1B-217ENST00000640939 1212 ntTSL 5 BASIC24.8■■□□□ 1.56
TCF20Q9UGU0 BCKDHB-202ENST00000356489 1514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.8■■□□□ 1.56
TCF20Q9UGU0 CRYAA-201ENST00000291554 1139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.8■■□□□ 1.56
TCF20Q9UGU0 FAM174B-207ENST00000555748 866 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC24.8■■□□□ 1.56
TCF20Q9UGU0 TSGA13-204ENST00000456951 2046 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC24.79■■□□□ 1.56
TCF20Q9UGU0 JTB-203ENST00000368589 1216 ntTSL 2 BASIC24.79■■□□□ 1.56
TCF20Q9UGU0 CLTA-206ENST00000466396 695 ntTSL 2 BASIC24.79■■□□□ 1.56
TCF20Q9UGU0 FOXF2-201ENST00000259806 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.79■■□□□ 1.56
TCF20Q9UGU0 APLP1-201ENST00000221891 2495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.78■■□□□ 1.56
TCF20Q9UGU0 PXDC1-202ENST00000380283 2190 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.78■■□□□ 1.56
TCF20Q9UGU0 GPR75-ASB3-201ENST00000406625 2113 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.78■■□□□ 1.56
TCF20Q9UGU0 AC008105.3-201ENST00000586376 844 ntTSL 3 BASIC24.78■■□□□ 1.56
TCF20Q9UGU0 SF1-220ENST00000626028 704 ntTSL 2 BASIC24.78■■□□□ 1.56
TCF20Q9UGU0 AC011446.1-201ENST00000591825 458 ntTSL 2 BASIC24.77■■□□□ 1.56
TCF20Q9UGU0 ESRRAP2-201ENST00000418437 1549 ntBASIC24.77■■□□□ 1.56
TCF20Q9UGU0 ARPC5L-201ENST00000259477 1325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.77■■□□□ 1.56
TCF20Q9UGU0 CRTAP-202ENST00000449224 1811 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.77■■□□□ 1.56
TCF20Q9UGU0 GLTPD2-201ENST00000331264 1023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.76■■□□□ 1.55
TCF20Q9UGU0 RHOF-204ENST00000537265 699 ntTSL 2 BASIC24.76■■□□□ 1.55
TCF20Q9UGU0 AC011551.1-201ENST00000614101 683 ntBASIC24.76■■□□□ 1.55
TCF20Q9UGU0 AF131216.4-201ENST00000638924 1588 ntBASIC24.76■■□□□ 1.55
TCF20Q9UGU0 SHF-206ENST00000560471 2499 ntTSL 5 BASIC24.76■■□□□ 1.55
TCF20Q9UGU0 ZNF639-209ENST00000496856 2033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.76■■□□□ 1.55
TCF20Q9UGU0 ZFPL1-203ENST00000525509 478 ntTSL 2 BASIC24.76■■□□□ 1.55
TCF20Q9UGU0 FBRSL1-201ENST00000434748 5568 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.76■■□□□ 1.55
TCF20Q9UGU0 MADCAM1-202ENST00000346144 1309 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.76■■□□□ 1.55
TCF20Q9UGU0 BX255925.1-201ENST00000566954 1854 ntBASIC24.75■■□□□ 1.55
TCF20Q9UGU0 ST7L-206ENST00000369666 1815 ntTSL 1 (best) BASIC24.75■■□□□ 1.55
TCF20Q9UGU0 YPEL1-202ENST00000403503 466 ntTSL 3 BASIC24.75■■□□□ 1.55
TCF20Q9UGU0 AL137784.2-201ENST00000607332 1000 ntBASIC24.75■■□□□ 1.55
TCF20Q9UGU0 CCDC136-206ENST00000464832 1720 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.75■■□□□ 1.55
TCF20Q9UGU0 TNFRSF6B-201ENST00000369996 1124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.74■■□□□ 1.55
TCF20Q9UGU0 AC092437.1-201ENST00000624794 1048 ntBASIC24.74■■□□□ 1.55
TCF20Q9UGU0 FGF22-201ENST00000215530 1311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.74■■□□□ 1.55
TCF20Q9UGU0 ST6GALNAC6-203ENST00000373142 2448 ntTSL 1 (best) BASIC24.74■■□□□ 1.55
TCF20Q9UGU0 EXOC3L4-201ENST00000380069 2293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.74■■□□□ 1.55
TCF20Q9UGU0 BCL2L12-201ENST00000246784 990 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.74■■□□□ 1.55
TCF20Q9UGU0 NKX2-8-201ENST00000258829 1261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.74■■□□□ 1.55
TCF20Q9UGU0 PPA1-202ENST00000373232 1295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.74■■□□□ 1.55
TCF20Q9UGU0 NEBL-AS1-202ENST00000439097 661 ntTSL 2 BASIC24.74■■□□□ 1.55
TCF20Q9UGU0 ERRFI1-203ENST00000469499 995 ntTSL 3 BASIC24.74■■□□□ 1.55
TCF20Q9UGU0 HDHD5-202ENST00000336737 1799 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.73■■□□□ 1.55
TCF20Q9UGU0 MTCH1-201ENST00000373616 2006 ntTSL 1 (best) BASIC24.73■■□□□ 1.55
TCF20Q9UGU0 MFSD12-201ENST00000355415 2124 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.73■■□□□ 1.55
TCF20Q9UGU0 AC012313.1-204ENST00000444227 462 ntTSL 1 (best) BASIC24.73■■□□□ 1.55
TCF20Q9UGU0 EIF3J-203ENST00000535391 925 ntTSL 2 BASIC24.73■■□□□ 1.55
TCF20Q9UGU0 TSPOAP1-AS1-203ENST00000579527 2042 ntTSL 2 BASIC24.73■■□□□ 1.55
TCF20Q9UGU0 C17orf97-201ENST00000360127 1839 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.73■■□□□ 1.55
TCF20Q9UGU0 PRADC1-201ENST00000258083 1083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.73■■□□□ 1.55
TCF20Q9UGU0 BHLHA9-201ENST00000391429 902 ntAPPRIS P1 BASIC24.73■■□□□ 1.55
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 31.1 ms