Protein–RNA interactions for Protein: Q9UBM4

OPTC, Opticin, humanhuman

Predictions only

Length 332 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
OPTCQ9UBM4 LSR-205ENST00000427250 1606 ntTSL 2 BASIC22.85■■□□□ 1.25
OPTCQ9UBM4 SLBP-206ENST00000489418 1977 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
OPTCQ9UBM4 ZNF767P-202ENST00000472212 2100 ntTSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
OPTCQ9UBM4 SPCS2P3-201ENST00000500401 656 ntBASIC22.84■■□□□ 1.25
OPTCQ9UBM4 NKX2-5-204ENST00000521848 1027 ntTSL 2 BASIC22.84■■□□□ 1.25
OPTCQ9UBM4 GJC1-209ENST00000592524 1837 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.84■■□□□ 1.25
OPTCQ9UBM4 SH2D3A-202ENST00000437152 2013 ntTSL 2 BASIC22.84■■□□□ 1.25
OPTCQ9UBM4 LURAP1L-201ENST00000319264 1753 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
OPTCQ9UBM4 SYNGR3-201ENST00000248121 2051 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
OPTCQ9UBM4 PLEKHA8-202ENST00000396257 1907 ntTSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
OPTCQ9UBM4 RPS2P7-201ENST00000447334 885 ntBASIC22.83■■□□□ 1.25
OPTCQ9UBM4 RBM42-205ENST00000589871 1487 ntTSL 5 BASIC22.83■■□□□ 1.25
OPTCQ9UBM4 CACNA1H-201ENST00000348261 8208 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.24
OPTCQ9UBM4 AP2M1-202ENST00000382456 2091 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.24
OPTCQ9UBM4 LIME1-206ENST00000487026 805 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.82■■□□□ 1.24
OPTCQ9UBM4 U85056.1-201ENST00000616429 682 ntBASIC22.82■■□□□ 1.24
OPTCQ9UBM4 KRT10-201ENST00000269576 2124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
OPTCQ9UBM4 CCND3-223ENST00000616010 2047 ntTSL 5 BASIC22.82■■□□□ 1.24
OPTCQ9UBM4 PTPN2-202ENST00000327283 1706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
OPTCQ9UBM4 LDHB-203ENST00000396076 1538 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.82■■□□□ 1.24
OPTCQ9UBM4 RHOBTB3-206ENST00000506817 1432 ntTSL 2 BASIC22.82■■□□□ 1.24
OPTCQ9UBM4 AKT1-203ENST00000407796 2710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
OPTCQ9UBM4 GP1BB-201ENST00000366425 1553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
OPTCQ9UBM4 C20orf24-201ENST00000342422 896 ntTSL 2 BASIC22.81■■□□□ 1.24
OPTCQ9UBM4 C20orf24-202ENST00000344795 1114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
OPTCQ9UBM4 AC007383.2-202ENST00000435627 482 ntTSL 2 BASIC22.81■■□□□ 1.24
OPTCQ9UBM4 MIR6765-201ENST00000614092 87 ntBASIC22.81■■□□□ 1.24
OPTCQ9UBM4 GNAS-AS1_1.1-201ENST00000621898 103 ntBASIC22.81■■□□□ 1.24
OPTCQ9UBM4 INPP5J-206ENST00000404453 1613 ntTSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
OPTCQ9UBM4 CRIM1-201ENST00000280527 5912 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
OPTCQ9UBM4 DUX4L9-201ENST00000449051 1259 ntBASIC22.8■■□□□ 1.24
OPTCQ9UBM4 FAM222B-205ENST00000577682 549 ntTSL 4 BASIC22.8■■□□□ 1.24
OPTCQ9UBM4 ANO8-204ENST00000630631 1905 ntTSL 5 BASIC22.8■■□□□ 1.24
OPTCQ9UBM4 PREB-201ENST00000260643 2166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
OPTCQ9UBM4 TMEM191C-206ENST00000432134 1129 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.79■■□□□ 1.24
OPTCQ9UBM4 LINC01233-202ENST00000598832 568 ntTSL 2 BASIC22.79■■□□□ 1.24
OPTCQ9UBM4 BRD4-212ENST00000630599 726 ntTSL 2 BASIC22.79■■□□□ 1.24
OPTCQ9UBM4 TSPAN4-203ENST00000397397 1423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
OPTCQ9UBM4 RRAD-201ENST00000299759 1569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
OPTCQ9UBM4 MEIS3-201ENST00000331559 2104 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.79■■□□□ 1.24
OPTCQ9UBM4 CBLN2-209ENST00000585159 2406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
OPTCQ9UBM4 TMEM51-205ENST00000434578 1861 ntTSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
OPTCQ9UBM4 JMJD8-201ENST00000412368 2038 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
OPTCQ9UBM4 DUSP22-201ENST00000344450 1485 ntTSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
OPTCQ9UBM4 UXS1-201ENST00000283148 2099 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC22.78■■□□□ 1.24
OPTCQ9UBM4 IDNK-203ENST00000405990 629 ntTSL 2 BASIC22.78■■□□□ 1.24
OPTCQ9UBM4 ABHD8-201ENST00000247706 2090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
OPTCQ9UBM4 LINC00543-201ENST00000567234 1845 ntBASIC22.78■■□□□ 1.24
OPTCQ9UBM4 RFC2-201ENST00000055077 1695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
OPTCQ9UBM4 RAB20-201ENST00000267328 1518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
OPTCQ9UBM4 FAM193A-211ENST00000637812 4885 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.77■■□□□ 1.24
OPTCQ9UBM4 KLF15-201ENST00000296233 2574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
OPTCQ9UBM4 AP000802.1-201ENST00000500537 1934 ntTSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
OPTCQ9UBM4 ARMC10-202ENST00000323716 2635 ntTSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
OPTCQ9UBM4 FAM136A-202ENST00000430566 885 ntTSL 3 BASIC22.77■■□□□ 1.24
OPTCQ9UBM4 UBE2I-213ENST00000566587 1098 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.77■■□□□ 1.24
OPTCQ9UBM4 GPR160-201ENST00000355897 2039 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
OPTCQ9UBM4 NECTIN2-202ENST00000252485 2112 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
OPTCQ9UBM4 SHISA8-202ENST00000621082 1405 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.76■■□□□ 1.23
OPTCQ9UBM4 ATG16L2-205ENST00000534905 1614 ntTSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
OPTCQ9UBM4 RCC2-201ENST00000375433 2030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
OPTCQ9UBM4 AL590677.1-201ENST00000438431 380 ntTSL 5 BASIC22.76■■□□□ 1.23
OPTCQ9UBM4 TMED2-201ENST00000262225 2560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
OPTCQ9UBM4 RARA-AS1-201ENST00000581080 1790 ntTSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
OPTCQ9UBM4 AC141586.4-201ENST00000624558 1573 ntBASIC22.76■■□□□ 1.23
OPTCQ9UBM4 GOLGA7-201ENST00000357743 2027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
OPTCQ9UBM4 NRXN1-205ENST00000401710 2873 ntTSL 5 BASIC22.75■■□□□ 1.23
OPTCQ9UBM4 AC087393.1-201ENST00000582896 145 ntBASIC22.75■■□□□ 1.23
OPTCQ9UBM4 FGF22-202ENST00000586042 1288 ntTSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
OPTCQ9UBM4 NOCT-201ENST00000280614 1952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
OPTCQ9UBM4 PRR35-201ENST00000409413 2216 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
OPTCQ9UBM4 PTPRM-201ENST00000332175 6095 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
OPTCQ9UBM4 DVL3-201ENST00000313143 5254 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
OPTCQ9UBM4 ZFYVE28-202ENST00000503000 1874 ntTSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
OPTCQ9UBM4 ALDH16A1-203ENST00000540132 2174 ntTSL 2 BASIC22.74■■□□□ 1.23
OPTCQ9UBM4 NKAIN3-202ENST00000523211 1988 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.74■■□□□ 1.23
OPTCQ9UBM4 ESR2-202ENST00000341099 2060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
OPTCQ9UBM4 PTH1R-201ENST00000313049 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
OPTCQ9UBM4 HNRNPD-203ENST00000353341 1585 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
OPTCQ9UBM4 MPST-203ENST00000401419 1345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
OPTCQ9UBM4 BDH1-207ENST00000441275 1605 ntTSL 5 BASIC22.74■■□□□ 1.23
OPTCQ9UBM4 THRA-202ENST00000394121 2260 ntTSL 2 BASIC22.74■■□□□ 1.23
OPTCQ9UBM4 ID2-201ENST00000234091 2041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
OPTCQ9UBM4 TXNRD2-201ENST00000334363 1893 ntTSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
OPTCQ9UBM4 DOK3-205ENST00000501403 1872 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.73■■□□□ 1.23
OPTCQ9UBM4 UBE2E3-202ENST00000410062 1570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
OPTCQ9UBM4 KRT18P60-201ENST00000312876 1297 ntBASIC22.73■■□□□ 1.23
OPTCQ9UBM4 PSMG4-207ENST00000451246 824 ntTSL 3 BASIC22.73■■□□□ 1.23
OPTCQ9UBM4 HERC2P9-201ENST00000507787 1023 ntTSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
OPTCQ9UBM4 ABHD17AP5-201ENST00000580133 923 ntBASIC22.73■■□□□ 1.23
OPTCQ9UBM4 AC129492.7-201ENST00000622992 756 ntBASIC22.73■■□□□ 1.23
OPTCQ9UBM4 CBARP-202ENST00000382477 2453 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.73■■□□□ 1.23
OPTCQ9UBM4 RBFOX2-209ENST00000438146 1356 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
OPTCQ9UBM4 MTERF3-204ENST00000523821 1529 ntTSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
OPTCQ9UBM4 PCOLCE2-201ENST00000295992 2021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
OPTCQ9UBM4 CTF1-201ENST00000279804 1664 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
OPTCQ9UBM4 SLC52A2-202ENST00000402965 1777 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.72■■□□□ 1.23
OPTCQ9UBM4 YPEL1-202ENST00000403503 466 ntTSL 3 BASIC22.72■■□□□ 1.23
OPTCQ9UBM4 IFI30-201ENST00000407280 1134 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
OPTCQ9UBM4 TRIM52-AS1-202ENST00000507434 672 ntTSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 38.6 ms