Protein–RNA interactions for Protein: Q9P2Q2

FRMD4A, FERM domain-containing protein 4A, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 1,039 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
FRMD4AQ9P2Q2 GSK3A-201ENST00000222330 2188 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.72■■■□□ 2.03
FRMD4AQ9P2Q2 HOXB3-201ENST00000311626 2642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.71■■■□□ 2.03
FRMD4AQ9P2Q2 LRRC1-201ENST00000370882 808 ntTSL 3 BASIC27.71■■■□□ 2.03
FRMD4AQ9P2Q2 AC110285.6-201ENST00000617652 491 ntBASIC27.71■■■□□ 2.03
FRMD4AQ9P2Q2 RASSF1-AS1-201ENST00000629828 790 ntBASIC27.71■■■□□ 2.03
FRMD4AQ9P2Q2 PICK1-201ENST00000356976 2055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.71■■■□□ 2.03
FRMD4AQ9P2Q2 CCR10-201ENST00000332438 1773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.71■■■□□ 2.03
FRMD4AQ9P2Q2 NR6A1-201ENST00000344523 1846 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.7■■■□□ 2.02
FRMD4AQ9P2Q2 NPW-201ENST00000329610 498 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.7■■■□□ 2.02
FRMD4AQ9P2Q2 TMEM80-201ENST00000397510 1094 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC27.7■■■□□ 2.02
FRMD4AQ9P2Q2 KRAS-204ENST00000557334 1052 ntTSL 5 BASIC27.7■■■□□ 2.02
FRMD4AQ9P2Q2 TMC6-218ENST00000591436 1155 ntTSL 1 (best) BASIC27.7■■■□□ 2.02
FRMD4AQ9P2Q2 KLC3-201ENST00000391946 1780 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.7■■■□□ 2.02
FRMD4AQ9P2Q2 ZNF784-202ENST00000591479 1559 ntTSL 1 (best) BASIC27.69■■■□□ 2.02
FRMD4AQ9P2Q2 TST-202ENST00000403892 1797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.69■■■□□ 2.02
FRMD4AQ9P2Q2 EMC9-201ENST00000216799 835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.69■■■□□ 2.02
FRMD4AQ9P2Q2 FEZ1-205ENST00000524435 750 ntTSL 2 BASIC27.69■■■□□ 2.02
FRMD4AQ9P2Q2 NKPD1-202ENST00000589776 1950 ntAPPRIS P1 BASIC27.69■■■□□ 2.02
FRMD4AQ9P2Q2 FAAH-201ENST00000243167 2094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.69■■■□□ 2.02
FRMD4AQ9P2Q2 IHH-201ENST00000295731 2023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.68■■■□□ 2.02
FRMD4AQ9P2Q2 ST6GALNAC6-205ENST00000373146 2460 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.68■■■□□ 2.02
FRMD4AQ9P2Q2 PYCARD-202ENST00000350605 696 ntTSL 1 (best) BASIC27.68■■■□□ 2.02
FRMD4AQ9P2Q2 AC079305.3-201ENST00000455416 218 ntTSL 5 BASIC27.68■■■□□ 2.02
FRMD4AQ9P2Q2 MCRIP1-202ENST00000457257 942 ntTSL 3 BASIC27.68■■■□□ 2.02
FRMD4AQ9P2Q2 FAM228B-208ENST00000613899 1238 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.68■■■□□ 2.02
FRMD4AQ9P2Q2 P2RX4-203ENST00000359949 1836 ntTSL 5 BASIC27.68■■■□□ 2.02
FRMD4AQ9P2Q2 MOB4-204ENST00000409360 1447 ntTSL 5 BASIC27.67■■■□□ 2.02
FRMD4AQ9P2Q2 NKX2-8-201ENST00000258829 1261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.67■■■□□ 2.02
FRMD4AQ9P2Q2 IL15RA-209ENST00000397255 759 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.67■■■□□ 2.02
FRMD4AQ9P2Q2 IL15RA-216ENST00000530685 660 ntTSL 5 BASIC27.67■■■□□ 2.02
FRMD4AQ9P2Q2 AL512631.2-201ENST00000604634 923 ntBASIC27.67■■■□□ 2.02
FRMD4AQ9P2Q2 EXOG-217ENST00000630638 197 ntTSL 5 BASIC27.67■■■□□ 2.02
FRMD4AQ9P2Q2 RRAD-201ENST00000299759 1569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.67■■■□□ 2.02
FRMD4AQ9P2Q2 PEX26-202ENST00000399744 1672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.67■■■□□ 2.02
FRMD4AQ9P2Q2 DNMT3A-206ENST00000406659 1775 ntTSL 1 (best) BASIC27.67■■■□□ 2.02
FRMD4AQ9P2Q2 KAT8-202ENST00000448516 1789 ntTSL 1 (best) BASIC27.67■■■□□ 2.02
FRMD4AQ9P2Q2 FRAT2-201ENST00000371019 2213 ntAPPRIS P1 BASIC27.67■■■□□ 2.02
FRMD4AQ9P2Q2 PPP1CC-206ENST00000550991 1882 ntTSL 2 BASIC27.66■■■□□ 2.02
FRMD4AQ9P2Q2 CD72-202ENST00000378430 585 ntTSL 3 BASIC27.66■■■□□ 2.02
FRMD4AQ9P2Q2 ERRFI1-204ENST00000474874 479 ntTSL 3 BASIC27.66■■■□□ 2.02
FRMD4AQ9P2Q2 AC119427.1-201ENST00000633182 556 ntTSL 4 BASIC27.66■■■□□ 2.02
FRMD4AQ9P2Q2 CAMKK1-201ENST00000158166 2459 ntTSL 1 (best) BASIC27.66■■■□□ 2.02
FRMD4AQ9P2Q2 TTBK2-205ENST00000567274 1777 ntTSL 5 BASIC27.65■■■□□ 2.02
FRMD4AQ9P2Q2 C1QTNF1-206ENST00000579760 1672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.65■■■□□ 2.02
FRMD4AQ9P2Q2 CDH24-206ENST00000610348 2037 ntTSL 1 (best) BASIC27.65■■■□□ 2.02
FRMD4AQ9P2Q2 ARTN-203ENST00000414809 1943 ntAPPRIS P4 TSL 3 BASIC27.65■■■□□ 2.02
FRMD4AQ9P2Q2 EEF1D-203ENST00000419152 1452 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.64■■■□□ 2.02
FRMD4AQ9P2Q2 SPOCK3-221ENST00000512648 1456 ntTSL 1 (best) BASIC27.64■■■□□ 2.02
FRMD4AQ9P2Q2 RNF166-201ENST00000312838 1883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.64■■■□□ 2.02
FRMD4AQ9P2Q2 CEND1-201ENST00000330106 1649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.64■■■□□ 2.02
FRMD4AQ9P2Q2 ATP6V0A2-209ENST00000613625 1620 ntTSL 1 (best) BASIC27.64■■■□□ 2.02
FRMD4AQ9P2Q2 AC096631.2-201ENST00000436136 790 ntBASIC27.64■■■□□ 2.02
FRMD4AQ9P2Q2 AC092807.3-205ENST00000467666 531 ntTSL 3 BASIC27.64■■■□□ 2.02
FRMD4AQ9P2Q2 AC092343.1-201ENST00000500224 729 ntTSL 3 BASIC27.64■■■□□ 2.02
FRMD4AQ9P2Q2 LY6H-205ENST00000615409 980 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.64■■■□□ 2.02
FRMD4AQ9P2Q2 RASSF5-204ENST00000580449 1932 ntTSL 1 (best) BASIC27.64■■■□□ 2.02
FRMD4AQ9P2Q2 ZDHHC16-204ENST00000370842 1877 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC27.64■■■□□ 2.01
FRMD4AQ9P2Q2 AK3-203ENST00000447596 705 ntTSL 2 BASIC27.63■■■□□ 2.01
FRMD4AQ9P2Q2 CHTF8-208ENST00000522091 863 ntTSL 2 BASIC27.63■■■□□ 2.01
FRMD4AQ9P2Q2 RCCD1-203ENST00000555155 1871 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC27.63■■■□□ 2.01
FRMD4AQ9P2Q2 AL356740.2-201ENST00000601559 647 ntBASIC27.62■■■□□ 2.01
FRMD4AQ9P2Q2 ARL4D-201ENST00000320033 1612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.62■■■□□ 2.01
FRMD4AQ9P2Q2 KAT5-208ENST00000530446 1697 ntTSL 1 (best) BASIC27.62■■■□□ 2.01
FRMD4AQ9P2Q2 PHF23-212ENST00000576955 1944 ntTSL 2 BASIC27.61■■■□□ 2.01
FRMD4AQ9P2Q2 TNIP2-201ENST00000315423 1974 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.61■■■□□ 2.01
FRMD4AQ9P2Q2 KDELR3-202ENST00000409006 931 ntTSL 1 (best) BASIC27.61■■■□□ 2.01
FRMD4AQ9P2Q2 EIF3J-203ENST00000535391 925 ntTSL 2 BASIC27.61■■■□□ 2.01
FRMD4AQ9P2Q2 SSSCA1-AS1-201ENST00000567594 614 ntBASIC27.61■■■□□ 2.01
FRMD4AQ9P2Q2 SURF2-201ENST00000371964 842 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.6■■■□□ 2.01
FRMD4AQ9P2Q2 AC004540.2-202ENST00000451264 508 ntTSL 2 BASIC27.6■■■□□ 2.01
FRMD4AQ9P2Q2 POLR2F-211ENST00000488684 564 ntTSL 2 BASIC27.6■■■□□ 2.01
FRMD4AQ9P2Q2 EPHA10-211ENST00000540011 720 ntTSL 5 BASIC27.6■■■□□ 2.01
FRMD4AQ9P2Q2 PHF11-202ENST00000378319 1359 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.6■■■□□ 2.01
FRMD4AQ9P2Q2 IFNL4-201ENST00000606380 1637 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC27.59■■■□□ 2.01
FRMD4AQ9P2Q2 PCGF3-202ENST00000400151 1175 ntTSL 2 BASIC27.59■■■□□ 2.01
FRMD4AQ9P2Q2 RUNDC3A-201ENST00000225441 1821 ntTSL 1 (best) BASIC27.59■■■□□ 2.01
FRMD4AQ9P2Q2 SERF1A-202ENST00000354833 1889 ntTSL 1 (best) BASIC27.59■■■□□ 2.01
FRMD4AQ9P2Q2 SERF1B-201ENST00000380750 1889 ntTSL 1 (best) BASIC27.59■■■□□ 2.01
FRMD4AQ9P2Q2 BTBD6-205ENST00000536364 1973 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC27.59■■■□□ 2.01
FRMD4AQ9P2Q2 HES4-201ENST00000304952 899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.58■■■□□ 2.01
FRMD4AQ9P2Q2 CLTA-206ENST00000466396 695 ntTSL 2 BASIC27.58■■■□□ 2.01
FRMD4AQ9P2Q2 SENCR-201ENST00000526269 1298 ntTSL 1 (best) BASIC27.58■■■□□ 2.01
FRMD4AQ9P2Q2 TOLLIP-208ENST00000527938 549 ntTSL 4 BASIC27.58■■■□□ 2.01
FRMD4AQ9P2Q2 PPP1R14A-205ENST00000591585 949 ntTSL 2 BASIC27.58■■■□□ 2.01
FRMD4AQ9P2Q2 MROH6-211ENST00000534459 1789 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC27.57■■■□□ 2
FRMD4AQ9P2Q2 CA9-204ENST00000617161 1374 ntTSL 1 (best) BASIC27.57■■■□□ 2
FRMD4AQ9P2Q2 LYPLA1-215ENST00000618914 2482 ntTSL 5 BASIC27.57■■■□□ 2
FRMD4AQ9P2Q2 AP003068.2-202ENST00000526623 1662 ntTSL 2 BASIC27.56■■■□□ 2
FRMD4AQ9P2Q2 TWF2-201ENST00000305533 1718 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.56■■■□□ 2
FRMD4AQ9P2Q2 TRIM7-202ENST00000334421 1228 ntTSL 1 (best) BASIC27.56■■■□□ 2
FRMD4AQ9P2Q2 ZNRF1-205ENST00000566250 1069 ntTSL 1 (best) BASIC27.56■■■□□ 2
FRMD4AQ9P2Q2 ZNRF1-206ENST00000567962 1234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.56■■■□□ 2
FRMD4AQ9P2Q2 PLSCR3-202ENST00000535512 2067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.56■■■□□ 2
FRMD4AQ9P2Q2 SUMF1-202ENST00000383843 1447 ntTSL 2 BASIC27.56■■■□□ 2
FRMD4AQ9P2Q2 SNX5-217ENST00000606557 1087 ntBASIC27.55■■■□□ 2
FRMD4AQ9P2Q2 GNB2-203ENST00000393926 1641 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.55■■■□□ 2
FRMD4AQ9P2Q2 AC090877.2-201ENST00000558441 1738 ntBASIC27.55■■■□□ 2
FRMD4AQ9P2Q2 LCNL1-201ENST00000408973 1839 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.55■■■□□ 2
FRMD4AQ9P2Q2 BIN1-211ENST00000409400 2143 ntTSL 1 (best) BASIC27.55■■■□□ 2
FRMD4AQ9P2Q2 PIP4K2B-204ENST00000619039 5734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.54■■■□□ 2
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 65.3 ms