Protein–RNA interactions for Protein: Q9NZQ3

NCKIPSD, NCK-interacting protein with SH3 domain, humanhuman

Predictions only

Length 722 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NCKIPSDQ9NZQ3 NDEL1-201ENST00000334527 2372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
NCKIPSDQ9NZQ3 AL357033.1-201ENST00000370520 1933 ntTSL 2 BASIC23.63■■□□□ 1.37
NCKIPSDQ9NZQ3 PCYT2-204ENST00000570388 1474 ntTSL 2 BASIC23.62■■□□□ 1.37
NCKIPSDQ9NZQ3 MPST-203ENST00000401419 1345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
NCKIPSDQ9NZQ3 SCTR-201ENST00000019103 1865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
NCKIPSDQ9NZQ3 D2HGDH-203ENST00000403782 2208 ntTSL 2 BASIC23.62■■□□□ 1.37
NCKIPSDQ9NZQ3 ZEB1-AS1-205ENST00000605946 382 ntTSL 5 BASIC23.62■■□□□ 1.37
NCKIPSDQ9NZQ3 REEP6-201ENST00000233596 1794 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
NCKIPSDQ9NZQ3 ITM2C-203ENST00000335005 1889 ntTSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
NCKIPSDQ9NZQ3 KLHDC9-203ENST00000392192 1333 ntTSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
NCKIPSDQ9NZQ3 MAPKAP1-207ENST00000394060 1586 ntTSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
NCKIPSDQ9NZQ3 RPIA-201ENST00000283646 1848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
NCKIPSDQ9NZQ3 AC113189.4-201ENST00000575331 5553 ntTSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
NCKIPSDQ9NZQ3 RBFA-201ENST00000262197 1219 ntTSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
NCKIPSDQ9NZQ3 LRP11-202ENST00000367368 1042 ntTSL 2 BASIC23.61■■□□□ 1.37
NCKIPSDQ9NZQ3 GUSBP5-201ENST00000418136 578 ntBASIC23.61■■□□□ 1.37
NCKIPSDQ9NZQ3 FXYD7-204ENST00000588265 636 ntTSL 2 BASIC23.61■■□□□ 1.37
NCKIPSDQ9NZQ3 FCRLB-205ENST00000367948 1977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
NCKIPSDQ9NZQ3 RDH14-201ENST00000381249 1587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
NCKIPSDQ9NZQ3 AC138932.3-201ENST00000567634 1902 ntBASIC23.61■■□□□ 1.37
NCKIPSDQ9NZQ3 SCN1B-201ENST00000262631 1670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
NCKIPSDQ9NZQ3 ANKRD20A11P-201ENST00000344693 1088 ntTSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
NCKIPSDQ9NZQ3 CENPX-202ENST00000392359 805 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.6■■□□□ 1.37
NCKIPSDQ9NZQ3 LONRF2P2-201ENST00000439212 571 ntBASIC23.6■■□□□ 1.37
NCKIPSDQ9NZQ3 AC022616.5-201ENST00000518796 181 ntBASIC23.6■■□□□ 1.37
NCKIPSDQ9NZQ3 ANKS3-204ENST00000585773 1946 ntTSL 2 BASIC23.6■■□□□ 1.37
NCKIPSDQ9NZQ3 PKIG-206ENST00000372892 1338 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.59■■□□□ 1.37
NCKIPSDQ9NZQ3 ARMC10-204ENST00000425331 2443 ntTSL 2 BASIC23.59■■□□□ 1.37
NCKIPSDQ9NZQ3 CT47A7-201ENST00000434883 1288 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.59■■□□□ 1.37
NCKIPSDQ9NZQ3 GPRC5B-202ENST00000535671 1215 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
NCKIPSDQ9NZQ3 TMPO-AS1-201ENST00000546421 738 ntTSL 5 BASIC23.59■■□□□ 1.37
NCKIPSDQ9NZQ3 EME2-205ENST00000568449 1234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
NCKIPSDQ9NZQ3 RCCD1-206ENST00000556618 1556 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC23.59■■□□□ 1.37
NCKIPSDQ9NZQ3 CHST13-201ENST00000319340 1789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
NCKIPSDQ9NZQ3 NR2F1-AS1-214ENST00000607831 1963 ntTSL 2 BASIC23.59■■□□□ 1.37
NCKIPSDQ9NZQ3 ZNF837-201ENST00000427624 2038 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
NCKIPSDQ9NZQ3 NAT14-201ENST00000205194 1536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
NCKIPSDQ9NZQ3 AL160276.1-201ENST00000636672 1312 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.59■■□□□ 1.37
NCKIPSDQ9NZQ3 FAM124A-204ENST00000615498 2383 ntTSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.37
NCKIPSDQ9NZQ3 AC010913.1-201ENST00000608612 420 ntTSL 2 BASIC23.58■■□□□ 1.37
NCKIPSDQ9NZQ3 MROH6-210ENST00000533679 1921 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.37
NCKIPSDQ9NZQ3 GGH-201ENST00000260118 1607 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.36
NCKIPSDQ9NZQ3 FOXF2-201ENST00000259806 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.36
NCKIPSDQ9NZQ3 APBA3-201ENST00000316757 2075 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.36
NCKIPSDQ9NZQ3 RRP9-201ENST00000232888 1578 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
NCKIPSDQ9NZQ3 FPGS-221ENST00000630236 2160 ntTSL 5 BASIC23.57■■□□□ 1.36
NCKIPSDQ9NZQ3 USP2-204ENST00000525735 1704 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
NCKIPSDQ9NZQ3 EVA1B-201ENST00000270824 1054 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.57■■□□□ 1.36
NCKIPSDQ9NZQ3 Z92544.1-202ENST00000571933 1220 ntBASIC23.57■■□□□ 1.36
NCKIPSDQ9NZQ3 PTPMT1-205ENST00000534775 1611 ntTSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
NCKIPSDQ9NZQ3 ITGB3-202ENST00000571680 1668 ntTSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
NCKIPSDQ9NZQ3 IFNL4-201ENST00000606380 1637 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
NCKIPSDQ9NZQ3 SH2B1-205ENST00000538342 1532 ntTSL 2 BASIC23.56■■□□□ 1.36
NCKIPSDQ9NZQ3 TK2-216ENST00000564917 1156 ntTSL 3 BASIC23.56■■□□□ 1.36
NCKIPSDQ9NZQ3 NDEL1-219ENST00000585098 454 ntTSL 3 BASIC23.56■■□□□ 1.36
NCKIPSDQ9NZQ3 LAT-217ENST00000630764 610 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.56■■□□□ 1.36
NCKIPSDQ9NZQ3 C4orf19-202ENST00000381980 1943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
NCKIPSDQ9NZQ3 HMGA2-201ENST00000354636 1529 ntTSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
NCKIPSDQ9NZQ3 KCNQ3-202ENST00000519445 2801 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.55■■□□□ 1.36
NCKIPSDQ9NZQ3 HSBP1L1-201ENST00000451882 771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
NCKIPSDQ9NZQ3 RNF146-205ENST00000477776 762 ntTSL 3 BASIC23.55■■□□□ 1.36
NCKIPSDQ9NZQ3 PARL-202ENST00000317096 1414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
NCKIPSDQ9NZQ3 PRDM13-202ENST00000369215 2429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
NCKIPSDQ9NZQ3 GAL3ST2-201ENST00000192314 1370 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
NCKIPSDQ9NZQ3 CAMK2N2-201ENST00000296238 1362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
NCKIPSDQ9NZQ3 ZNRF1-201ENST00000320619 2479 ntTSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
NCKIPSDQ9NZQ3 MDK-203ENST00000395566 828 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
NCKIPSDQ9NZQ3 OXLD1-203ENST00000571503 803 ntTSL 2 BASIC23.54■■□□□ 1.36
NCKIPSDQ9NZQ3 AC090241.2-201ENST00000602329 432 ntTSL 4 BASIC23.54■■□□□ 1.36
NCKIPSDQ9NZQ3 NHLRC4-201ENST00000424439 2097 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.54■■□□□ 1.36
NCKIPSDQ9NZQ3 TBL2-222ENST00000610724 2165 ntTSL 5 BASIC23.54■■□□□ 1.36
NCKIPSDQ9NZQ3 AL139125.2-201ENST00000623134 1869 ntBASIC23.53■■□□□ 1.36
NCKIPSDQ9NZQ3 UBE2E3-202ENST00000410062 1570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
NCKIPSDQ9NZQ3 NECTIN2-202ENST00000252485 2112 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
NCKIPSDQ9NZQ3 KISS1-201ENST00000367194 709 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
NCKIPSDQ9NZQ3 AC131212.1-201ENST00000613771 668 ntBASIC23.53■■□□□ 1.36
NCKIPSDQ9NZQ3 RILPL1-205ENST00000636882 2258 ntTSL 5 BASIC23.53■■□□□ 1.36
NCKIPSDQ9NZQ3 TOMM40-203ENST00000426677 1725 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
NCKIPSDQ9NZQ3 RBFOX2-209ENST00000438146 1356 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
NCKIPSDQ9NZQ3 BOD1-202ENST00000311086 1562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
NCKIPSDQ9NZQ3 LMTK3-201ENST00000270238 4972 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
NCKIPSDQ9NZQ3 SLC30A3-201ENST00000233535 2260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
NCKIPSDQ9NZQ3 SNCB-201ENST00000310112 1383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
NCKIPSDQ9NZQ3 LINC01342-201ENST00000416774 1620 ntTSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
NCKIPSDQ9NZQ3 EPCAM-201ENST00000263735 1724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
NCKIPSDQ9NZQ3 RIMKLB-205ENST00000535829 2236 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.51■■□□□ 1.35
NCKIPSDQ9NZQ3 TGFBRAP1-202ENST00000393359 5979 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
NCKIPSDQ9NZQ3 TNIP2-206ENST00000510267 2006 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.51■■□□□ 1.35
NCKIPSDQ9NZQ3 C5orf38-202ENST00000397835 681 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.51■■□□□ 1.35
NCKIPSDQ9NZQ3 CARMIL1-202ENST00000461945 1290 ntTSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
NCKIPSDQ9NZQ3 C15orf59-201ENST00000379822 1342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
NCKIPSDQ9NZQ3 SLC39A2-201ENST00000298681 1379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
NCKIPSDQ9NZQ3 FKBP1A-211ENST00000618612 1518 ntTSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
NCKIPSDQ9NZQ3 TMEM151B-201ENST00000438774 1140 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC23.5■■□□□ 1.35
NCKIPSDQ9NZQ3 LSM7-204ENST00000587502 575 ntTSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
NCKIPSDQ9NZQ3 AL121906.1-201ENST00000606866 440 ntTSL 3 BASIC23.5■■□□□ 1.35
NCKIPSDQ9NZQ3 R3HDM4-203ENST00000587975 1765 ntTSL 3 BASIC23.5■■□□□ 1.35
NCKIPSDQ9NZQ3 DYRK2-203ENST00000393555 2209 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
NCKIPSDQ9NZQ3 RGS19-201ENST00000332298 1510 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
NCKIPSDQ9NZQ3 CPSF4-207ENST00000451876 1644 ntTSL 5 BASIC23.49■■□□□ 1.35
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 41.4 ms