Protein–RNA interactions for Protein: Q9NYL9

TMOD3, Tropomodulin-3, humanhuman

Predictions only

Length 352 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TMOD3Q9NYL9 AC011511.4-201ENST00000586529 1850 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC30.65■■■□□ 2.5
TMOD3Q9NYL9 MEX3D-201ENST00000402693 2850 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC30.64■■■□□ 2.5
TMOD3Q9NYL9 CBR3-201ENST00000290354 1169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.64■■■□□ 2.5
TMOD3Q9NYL9 LIN7B-202ENST00000391864 582 ntTSL 3 BASIC30.64■■■□□ 2.5
TMOD3Q9NYL9 PQLC1-203ENST00000397778 2555 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC30.63■■■□□ 2.49
TMOD3Q9NYL9 PPP1CC-206ENST00000550991 1882 ntTSL 2 BASIC30.63■■■□□ 2.49
TMOD3Q9NYL9 C19orf47-202ENST00000392035 2126 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC30.63■■■□□ 2.49
TMOD3Q9NYL9 SSR2-210ENST00000480567 895 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC30.63■■■□□ 2.49
TMOD3Q9NYL9 AC092343.1-201ENST00000500224 729 ntTSL 3 BASIC30.63■■■□□ 2.49
TMOD3Q9NYL9 AQP10-201ENST00000324978 1791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.63■■■□□ 2.49
TMOD3Q9NYL9 DUSP22-214ENST00000605315 867 ntTSL 5 BASIC30.62■■■□□ 2.49
TMOD3Q9NYL9 SNX5-217ENST00000606557 1087 ntBASIC30.62■■■□□ 2.49
TMOD3Q9NYL9 GPX4-213ENST00000622390 1002 ntTSL 5 BASIC30.62■■■□□ 2.49
TMOD3Q9NYL9 FAM66E-202ENST00000533615 2087 ntTSL 2 BASIC30.62■■■□□ 2.49
TMOD3Q9NYL9 ATP6V0A2-209ENST00000613625 1620 ntTSL 1 (best) BASIC30.62■■■□□ 2.49
TMOD3Q9NYL9 RNF166-201ENST00000312838 1883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.61■■■□□ 2.49
TMOD3Q9NYL9 DNPH1-201ENST00000230431 657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.61■■■□□ 2.49
TMOD3Q9NYL9 CLTA-206ENST00000466396 695 ntTSL 2 BASIC30.61■■■□□ 2.49
TMOD3Q9NYL9 PTOV1-220ENST00000601675 1587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.61■■■□□ 2.49
TMOD3Q9NYL9 IFNL4-201ENST00000606380 1637 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC30.61■■■□□ 2.49
TMOD3Q9NYL9 EFEMP2-201ENST00000307998 2034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.61■■■□□ 2.49
TMOD3Q9NYL9 SUSD3-202ENST00000375472 1195 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC30.6■■■□□ 2.49
TMOD3Q9NYL9 SUMF1-202ENST00000383843 1447 ntTSL 2 BASIC30.6■■■□□ 2.49
TMOD3Q9NYL9 BMP7-204ENST00000450594 1857 ntTSL 2 BASIC30.6■■■□□ 2.49
TMOD3Q9NYL9 MYL5-208ENST00000511290 781 ntTSL 1 (best) BASIC30.6■■■□□ 2.49
TMOD3Q9NYL9 CA9-204ENST00000617161 1374 ntTSL 1 (best) BASIC30.6■■■□□ 2.49
TMOD3Q9NYL9 NR6A1-201ENST00000344523 1846 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC30.59■■■□□ 2.49
TMOD3Q9NYL9 TMEM121-202ENST00000431372 1519 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC30.58■■■□□ 2.49
TMOD3Q9NYL9 TMEM240-203ENST00000624426 796 ntTSL 3 BASIC30.58■■■□□ 2.49
TMOD3Q9NYL9 C2CD4D-201ENST00000454109 1757 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC30.58■■■□□ 2.49
TMOD3Q9NYL9 AC090877.2-201ENST00000558441 1738 ntBASIC30.58■■■□□ 2.49
TMOD3Q9NYL9 ABL1-201ENST00000318560 5766 ntTSL 1 (best) BASIC30.58■■■□□ 2.49
TMOD3Q9NYL9 CCR10-201ENST00000332438 1773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.57■■■□□ 2.48
TMOD3Q9NYL9 CRYAA-201ENST00000291554 1139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.57■■■□□ 2.48
TMOD3Q9NYL9 MIR6722-201ENST00000617286 78 ntBASIC30.57■■■□□ 2.48
TMOD3Q9NYL9 KAT5-208ENST00000530446 1697 ntTSL 1 (best) BASIC30.57■■■□□ 2.48
TMOD3Q9NYL9 ITGA9-203ENST00000422441 2282 ntTSL 1 (best) BASIC30.56■■■□□ 2.48
TMOD3Q9NYL9 RAB33A-201ENST00000257017 1258 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.56■■■□□ 2.48
TMOD3Q9NYL9 LINC01632-201ENST00000615763 496 ntTSL 3 BASIC30.56■■■□□ 2.48
TMOD3Q9NYL9 NR6A1-203ENST00000416460 1898 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC30.56■■■□□ 2.48
TMOD3Q9NYL9 SPOCK3-221ENST00000512648 1456 ntTSL 1 (best) BASIC30.56■■■□□ 2.48
TMOD3Q9NYL9 ZNF821-201ENST00000313565 1874 ntTSL 1 (best) BASIC30.55■■■□□ 2.48
TMOD3Q9NYL9 ERRFI1-203ENST00000469499 995 ntTSL 3 BASIC30.55■■■□□ 2.48
TMOD3Q9NYL9 RPRD1A-207ENST00000588737 1264 ntTSL 2 BASIC30.55■■■□□ 2.48
TMOD3Q9NYL9 HOXA11-AS1_1.1-201ENST00000613939 98 ntBASIC30.55■■■□□ 2.48
TMOD3Q9NYL9 PICSAR-201ENST00000615826 733 ntTSL 1 (best) BASIC30.55■■■□□ 2.48
TMOD3Q9NYL9 AC106739.1-201ENST00000617035 715 ntBASIC30.55■■■□□ 2.48
TMOD3Q9NYL9 PSKH1-202ENST00000570631 1509 ntTSL 1 (best) BASIC30.55■■■□□ 2.48
TMOD3Q9NYL9 CRACR2B-202ENST00000525077 1578 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.54■■■□□ 2.48
TMOD3Q9NYL9 PBX2P1-201ENST00000493219 1291 ntBASIC30.54■■■□□ 2.48
TMOD3Q9NYL9 PLEKHF1-201ENST00000436066 2084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.54■■■□□ 2.48
TMOD3Q9NYL9 EXOC3L4-201ENST00000380069 2293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.54■■■□□ 2.48
TMOD3Q9NYL9 EBPL-204ENST00000378272 766 ntTSL 3 BASIC30.53■■■□□ 2.48
TMOD3Q9NYL9 NOX4-204ENST00000393282 560 ntTSL 1 (best) BASIC30.53■■■□□ 2.48
TMOD3Q9NYL9 KRTAP5-4-201ENST00000399682 1181 ntAPPRIS P5 BASIC30.53■■■□□ 2.48
TMOD3Q9NYL9 AC009097.2-201ENST00000562763 465 ntTSL 2 BASIC30.53■■■□□ 2.48
TMOD3Q9NYL9 GNB2-203ENST00000393926 1641 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC30.53■■■□□ 2.48
TMOD3Q9NYL9 SDSL-202ENST00000403593 1449 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.53■■■□□ 2.48
TMOD3Q9NYL9 TST-202ENST00000403892 1797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.53■■■□□ 2.48
TMOD3Q9NYL9 HES5-201ENST00000378453 1306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.52■■■□□ 2.48
TMOD3Q9NYL9 LURAP1L-201ENST00000319264 1753 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.52■■■□□ 2.48
TMOD3Q9NYL9 FLT1-202ENST00000539099 1911 ntTSL 1 (best) BASIC30.52■■■□□ 2.48
TMOD3Q9NYL9 PABPN1-207ENST00000556821 1220 ntTSL 2 BASIC30.52■■■□□ 2.48
TMOD3Q9NYL9 GUK1-205ENST00000366722 850 ntTSL 3 BASIC30.51■■■□□ 2.47
TMOD3Q9NYL9 TTBK2-205ENST00000567274 1777 ntTSL 5 BASIC30.51■■■□□ 2.47
TMOD3Q9NYL9 PIK3R2-207ENST00000617130 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.49■■■□□ 2.47
TMOD3Q9NYL9 C1QTNF1-206ENST00000579760 1672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.49■■■□□ 2.47
TMOD3Q9NYL9 AC136475.3-202ENST00000534742 812 ntTSL 2 BASIC30.49■■■□□ 2.47
TMOD3Q9NYL9 MPP5-205ENST00000556345 1163 ntTSL 2 BASIC30.49■■■□□ 2.47
TMOD3Q9NYL9 NRL-205ENST00000560550 788 ntTSL 1 (best) BASIC30.49■■■□□ 2.47
TMOD3Q9NYL9 AC243829.1-202ENST00000618848 486 ntTSL 3 BASIC30.49■■■□□ 2.47
TMOD3Q9NYL9 TCEA1-211ENST00000522635 1432 ntTSL 2 BASIC30.48■■■□□ 2.47
TMOD3Q9NYL9 MRPL41-201ENST00000371443 1262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.48■■■□□ 2.47
TMOD3Q9NYL9 CCDC107-203ENST00000378407 899 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC30.48■■■□□ 2.47
TMOD3Q9NYL9 ZNRF2P3-201ENST00000424200 374 ntBASIC30.48■■■□□ 2.47
TMOD3Q9NYL9 NDUFS3-206ENST00000528192 561 ntTSL 5 BASIC30.48■■■□□ 2.47
TMOD3Q9NYL9 CAPNS1-205ENST00000588780 1035 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC30.48■■■□□ 2.47
TMOD3Q9NYL9 HIST1H2AL-201ENST00000613174 393 ntAPPRIS P1 BASIC30.48■■■□□ 2.47
TMOD3Q9NYL9 CRLF1-201ENST00000392386 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.48■■■□□ 2.47
TMOD3Q9NYL9 PSMG1-201ENST00000331573 2154 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.48■■■□□ 2.47
TMOD3Q9NYL9 HDGFL1-201ENST00000510882 2174 ntAPPRIS P1 BASIC30.48■■■□□ 2.47
TMOD3Q9NYL9 PHF23-212ENST00000576955 1944 ntTSL 2 BASIC30.47■■■□□ 2.47
TMOD3Q9NYL9 CDC16-211ENST00000628084 2058 ntTSL 5 BASIC30.47■■■□□ 2.47
TMOD3Q9NYL9 TMEM55B-201ENST00000250489 1961 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC30.47■■■□□ 2.47
TMOD3Q9NYL9 HSPBP1-201ENST00000255631 1768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.47■■■□□ 2.47
TMOD3Q9NYL9 PEX7-201ENST00000318471 1464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.47■■■□□ 2.47
TMOD3Q9NYL9 UNC93B3-201ENST00000308076 687 ntBASIC30.47■■■□□ 2.47
TMOD3Q9NYL9 FOXB2-201ENST00000376708 1299 ntAPPRIS P1 BASIC30.47■■■□□ 2.47
TMOD3Q9NYL9 AC142381.2-201ENST00000566120 298 ntBASIC30.47■■■□□ 2.47
TMOD3Q9NYL9 TSPAN4-202ENST00000397396 1332 ntTSL 5 BASIC30.47■■■□□ 2.47
TMOD3Q9NYL9 COMMD5-201ENST00000305103 1373 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.46■■■□□ 2.47
TMOD3Q9NYL9 SHISA9-205ENST00000639941 1135 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC30.46■■■□□ 2.47
TMOD3Q9NYL9 ANKS3-203ENST00000450067 2272 ntTSL 5 BASIC30.46■■■□□ 2.47
TMOD3Q9NYL9 TP53I3-201ENST00000238721 1998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.46■■■□□ 2.47
TMOD3Q9NYL9 CLK2-203ENST00000368361 2166 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC30.45■■■□□ 2.47
TMOD3Q9NYL9 EEF1D-201ENST00000317198 1458 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC30.45■■■□□ 2.47
TMOD3Q9NYL9 IL20RA-202ENST00000367746 1244 ntTSL 2 BASIC30.45■■■□□ 2.47
TMOD3Q9NYL9 PRICKLE4-201ENST00000394259 939 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC30.45■■■□□ 2.47
TMOD3Q9NYL9 AC019163.1-201ENST00000512634 610 ntTSL 2 BASIC30.45■■■□□ 2.47
TMOD3Q9NYL9 RUNDC3A-201ENST00000225441 1821 ntTSL 1 (best) BASIC30.45■■■□□ 2.46
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 15.6 ms