Protein–RNA interactions for Protein: Q9HCM2

PLXNA4, Plexin-A4, humanhuman

Predictions only

Length 1,894 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PLXNA4Q9HCM2 FGF22-201ENST00000215530 1311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.2■■□□□ 1.62
PLXNA4Q9HCM2 ZNF775-201ENST00000329630 2257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.2■■□□□ 1.62
PLXNA4Q9HCM2 SDSL-202ENST00000403593 1449 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.19■■□□□ 1.62
PLXNA4Q9HCM2 SPAG16-201ENST00000272898 1059 ntTSL 5 BASIC25.19■■□□□ 1.62
PLXNA4Q9HCM2 ZNRF2P3-201ENST00000424200 374 ntBASIC25.19■■□□□ 1.62
PLXNA4Q9HCM2 SUDS3P1-201ENST00000505831 966 ntBASIC25.19■■□□□ 1.62
PLXNA4Q9HCM2 YTHDF1-201ENST00000370334 747 ntTSL 3 BASIC25.19■■□□□ 1.62
PLXNA4Q9HCM2 PPP1R14A-204ENST00000591291 433 ntTSL 5 BASIC25.19■■□□□ 1.62
PLXNA4Q9HCM2 PWWP2B-201ENST00000305233 2651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.18■■□□□ 1.62
PLXNA4Q9HCM2 CLTA-206ENST00000466396 695 ntTSL 2 BASIC25.18■■□□□ 1.62
PLXNA4Q9HCM2 GPX4-213ENST00000622390 1002 ntTSL 5 BASIC25.18■■□□□ 1.62
PLXNA4Q9HCM2 KLC3-201ENST00000391946 1780 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.18■■□□□ 1.62
PLXNA4Q9HCM2 PLEKHF1-201ENST00000436066 2084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.18■■□□□ 1.62
PLXNA4Q9HCM2 TNFSF12-TNFSF13-201ENST00000293826 1816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.17■■□□□ 1.62
PLXNA4Q9HCM2 MCRIP1-210ENST00000576431 577 ntTSL 5 BASIC25.17■■□□□ 1.62
PLXNA4Q9HCM2 TMEM203-201ENST00000343666 1557 ntAPPRIS P1 BASIC25.17■■□□□ 1.62
PLXNA4Q9HCM2 TMEM55B-201ENST00000250489 1961 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.17■■□□□ 1.62
PLXNA4Q9HCM2 MEIS3-204ENST00000558555 1715 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.17■■□□□ 1.62
PLXNA4Q9HCM2 TSPAN10-203ENST00000574882 1837 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.17■■□□□ 1.62
PLXNA4Q9HCM2 PIK3R2-207ENST00000617130 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.17■■□□□ 1.62
PLXNA4Q9HCM2 PSKH1-202ENST00000570631 1509 ntTSL 1 (best) BASIC25.17■■□□□ 1.62
PLXNA4Q9HCM2 FSD1-204ENST00000597590 1634 ntTSL 5 BASIC25.17■■□□□ 1.62
PLXNA4Q9HCM2 ERRFI1-204ENST00000474874 479 ntTSL 3 BASIC25.17■■□□□ 1.62
PLXNA4Q9HCM2 CNNM2-201ENST00000369875 2059 ntTSL 1 (best) BASIC25.17■■□□□ 1.62
PLXNA4Q9HCM2 STMN4-201ENST00000265770 1250 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.16■■□□□ 1.62
PLXNA4Q9HCM2 GUK1-205ENST00000366722 850 ntTSL 3 BASIC25.16■■□□□ 1.62
PLXNA4Q9HCM2 TMEM80-207ENST00000608174 800 ntTSL 5 BASIC25.16■■□□□ 1.62
PLXNA4Q9HCM2 NR6A1-203ENST00000416460 1898 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.16■■□□□ 1.62
PLXNA4Q9HCM2 PSMG1-201ENST00000331573 2154 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.16■■□□□ 1.62
PLXNA4Q9HCM2 RRAD-201ENST00000299759 1569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.16■■□□□ 1.62
PLXNA4Q9HCM2 KCNJ4-201ENST00000303592 2065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.15■■□□□ 1.62
PLXNA4Q9HCM2 MIR17HG-201ENST00000400282 931 ntTSL 1 (best) BASIC25.15■■□□□ 1.62
PLXNA4Q9HCM2 PAIP1-208ENST00000514514 1603 ntTSL 5 BASIC25.15■■□□□ 1.62
PLXNA4Q9HCM2 HDGFL1-201ENST00000510882 2174 ntAPPRIS P1 BASIC25.15■■□□□ 1.62
PLXNA4Q9HCM2 RALB-203ENST00000420510 1252 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.15■■□□□ 1.62
PLXNA4Q9HCM2 EIF3J-203ENST00000535391 925 ntTSL 2 BASIC25.15■■□□□ 1.62
PLXNA4Q9HCM2 GSX2-205ENST00000611459 1262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.15■■□□□ 1.62
PLXNA4Q9HCM2 AC005837.3-201ENST00000612163 286 ntBASIC25.15■■□□□ 1.62
PLXNA4Q9HCM2 HOXA11-AS1_1.1-201ENST00000613939 98 ntBASIC25.15■■□□□ 1.62
PLXNA4Q9HCM2 CCR10-201ENST00000332438 1773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.14■■□□□ 1.62
PLXNA4Q9HCM2 ZNF784-202ENST00000591479 1559 ntTSL 1 (best) BASIC25.14■■□□□ 1.62
PLXNA4Q9HCM2 EPHA10-211ENST00000540011 720 ntTSL 5 BASIC25.14■■□□□ 1.61
PLXNA4Q9HCM2 AC133561.4-201ENST00000566112 224 ntBASIC25.14■■□□□ 1.61
PLXNA4Q9HCM2 SSSCA1-AS1-201ENST00000567594 614 ntBASIC25.14■■□□□ 1.61
PLXNA4Q9HCM2 AC106739.1-201ENST00000617035 715 ntBASIC25.14■■□□□ 1.61
PLXNA4Q9HCM2 FAAH-201ENST00000243167 2094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.14■■□□□ 1.61
PLXNA4Q9HCM2 SSR2-210ENST00000480567 895 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.13■■□□□ 1.61
PLXNA4Q9HCM2 RAB40C-201ENST00000248139 2699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.13■■□□□ 1.61
PLXNA4Q9HCM2 NDEL1-202ENST00000380025 2181 ntTSL 5 BASIC25.13■■□□□ 1.61
PLXNA4Q9HCM2 TNIP2-201ENST00000315423 1974 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.13■■□□□ 1.61
PLXNA4Q9HCM2 MRPL41-201ENST00000371443 1262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.13■■□□□ 1.61
PLXNA4Q9HCM2 KRTAP5-4-201ENST00000399682 1181 ntAPPRIS P5 BASIC25.13■■□□□ 1.61
PLXNA4Q9HCM2 USP2-204ENST00000525735 1704 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.13■■□□□ 1.61
PLXNA4Q9HCM2 SUMF1-202ENST00000383843 1447 ntTSL 2 BASIC25.12■■□□□ 1.61
PLXNA4Q9HCM2 FAM66E-202ENST00000533615 2087 ntTSL 2 BASIC25.12■■□□□ 1.61
PLXNA4Q9HCM2 C16orf87-201ENST00000285697 1585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.12■■□□□ 1.61
PLXNA4Q9HCM2 TANGO2-214ENST00000447208 2086 ntTSL 3 BASIC25.12■■□□□ 1.61
PLXNA4Q9HCM2 FOXO3B-201ENST00000395675 1928 ntBASIC25.11■■□□□ 1.61
PLXNA4Q9HCM2 C2CD4D-201ENST00000454109 1757 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.11■■□□□ 1.61
PLXNA4Q9HCM2 IHH-201ENST00000295731 2023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.11■■□□□ 1.61
PLXNA4Q9HCM2 RCC1L-201ENST00000610322 2300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.1■■□□□ 1.61
PLXNA4Q9HCM2 PHF11-202ENST00000378319 1359 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.1■■□□□ 1.61
PLXNA4Q9HCM2 LINC01632-201ENST00000615763 496 ntTSL 3 BASIC25.1■■□□□ 1.61
PLXNA4Q9HCM2 PICSAR-201ENST00000615826 733 ntTSL 1 (best) BASIC25.1■■□□□ 1.61
PLXNA4Q9HCM2 TMEM240-203ENST00000624426 796 ntTSL 3 BASIC25.1■■□□□ 1.61
PLXNA4Q9HCM2 SHISA9-205ENST00000639941 1135 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.1■■□□□ 1.61
PLXNA4Q9HCM2 GTF2E2-201ENST00000355904 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.1■■□□□ 1.61
PLXNA4Q9HCM2 FOXB2-201ENST00000376708 1299 ntAPPRIS P1 BASIC25.09■■□□□ 1.61
PLXNA4Q9HCM2 NRL-205ENST00000560550 788 ntTSL 1 (best) BASIC25.09■■□□□ 1.61
PLXNA4Q9HCM2 SLC25A6-201ENST00000381401 2062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.09■■□□□ 1.61
PLXNA4Q9HCM2 ARPC5L-202ENST00000353214 2507 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.09■■□□□ 1.61
PLXNA4Q9HCM2 EEF1D-201ENST00000317198 1458 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.09■■□□□ 1.61
PLXNA4Q9HCM2 C7orf25-205ENST00000438029 1743 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.09■■□□□ 1.61
PLXNA4Q9HCM2 ERRFI1-203ENST00000469499 995 ntTSL 3 BASIC25.09■■□□□ 1.61
PLXNA4Q9HCM2 PPP1CC-206ENST00000550991 1882 ntTSL 2 BASIC25.09■■□□□ 1.61
PLXNA4Q9HCM2 AL031432.3-201ENST00000607698 485 ntBASIC25.09■■□□□ 1.61
PLXNA4Q9HCM2 CDH24-206ENST00000610348 2037 ntTSL 1 (best) BASIC25.09■■□□□ 1.61
PLXNA4Q9HCM2 C19orf47-202ENST00000392035 2126 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.08■■□□□ 1.61
PLXNA4Q9HCM2 FLT1-202ENST00000539099 1911 ntTSL 1 (best) BASIC25.08■■□□□ 1.61
PLXNA4Q9HCM2 COL13A1-203ENST00000398969 2267 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.08■■□□□ 1.61
PLXNA4Q9HCM2 NDUFS3-206ENST00000528192 561 ntTSL 5 BASIC25.08■■□□□ 1.61
PLXNA4Q9HCM2 MPP5-205ENST00000556345 1163 ntTSL 2 BASIC25.08■■□□□ 1.61
PLXNA4Q9HCM2 PORCN-202ENST00000355961 1848 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.07■■□□□ 1.6
PLXNA4Q9HCM2 NEDD4L-237ENST00000617539 728 ntTSL 2 BASIC25.07■■□□□ 1.6
PLXNA4Q9HCM2 AC026271.2-201ENST00000428091 497 ntBASIC25.06■■□□□ 1.6
PLXNA4Q9HCM2 LGR4-203ENST00000480977 492 ntTSL 2 BASIC25.06■■□□□ 1.6
PLXNA4Q9HCM2 AC243829.1-202ENST00000618848 486 ntTSL 3 BASIC25.06■■□□□ 1.6
PLXNA4Q9HCM2 RNF19B-201ENST00000235150 2334 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.06■■□□□ 1.6
PLXNA4Q9HCM2 CLK2-203ENST00000368361 2166 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.06■■□□□ 1.6
PLXNA4Q9HCM2 AL359317.1-201ENST00000556316 578 ntTSL 4 BASIC25.06■■□□□ 1.6
PLXNA4Q9HCM2 PLSCR3-202ENST00000535512 2067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.06■■□□□ 1.6
PLXNA4Q9HCM2 ZDHHC16-204ENST00000370842 1877 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC25.05■■□□□ 1.6
PLXNA4Q9HCM2 COMMD5-201ENST00000305103 1373 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.05■■□□□ 1.6
PLXNA4Q9HCM2 EBPL-204ENST00000378272 766 ntTSL 3 BASIC25.05■■□□□ 1.6
PLXNA4Q9HCM2 PARD6B-202ENST00000396039 522 ntTSL 1 (best) BASIC25.05■■□□□ 1.6
PLXNA4Q9HCM2 RASGEF1B-208ENST00000510780 539 ntTSL 3 BASIC25.05■■□□□ 1.6
PLXNA4Q9HCM2 RASGEF1B-209ENST00000512343 498 ntTSL 3 BASIC25.05■■□□□ 1.6
PLXNA4Q9HCM2 ANKS3-203ENST00000450067 2272 ntTSL 5 BASIC25.05■■□□□ 1.6
PLXNA4Q9HCM2 MYL5-208ENST00000511290 781 ntTSL 1 (best) BASIC25.04■■□□□ 1.6
PLXNA4Q9HCM2 SCCPDH-201ENST00000366510 2503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.04■■□□□ 1.6
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 93.7 ms