Protein–RNA interactions for Protein: Q9HBG7

LY9, T-lymphocyte surface antigen Ly-9, humanhuman

Predictions only

Length 655 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LY9Q9HBG7 KRTAP5-5-201ENST00000399676 933 ntAPPRIS P1 BASIC27.6■■■□□ 2.01
LY9Q9HBG7 C7orf25-206ENST00000447342 1823 ntTSL 2 BASIC27.6■■■□□ 2.01
LY9Q9HBG7 ARL4D-201ENST00000320033 1612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.59■■■□□ 2.01
LY9Q9HBG7 CT47A7-201ENST00000434883 1288 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.59■■■□□ 2.01
LY9Q9HBG7 ZNF606-203ENST00000547121 1196 ntTSL 2 BASIC27.59■■■□□ 2.01
LY9Q9HBG7 MIR6089-201ENST00000616698 64 ntBASIC27.59■■■□□ 2.01
LY9Q9HBG7 E2F5-203ENST00000418930 1890 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.59■■■□□ 2.01
LY9Q9HBG7 PRDM13-202ENST00000369215 2429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.59■■■□□ 2.01
LY9Q9HBG7 C4orf19-202ENST00000381980 1943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.59■■■□□ 2.01
LY9Q9HBG7 NFU1-203ENST00000410022 1467 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.58■■■□□ 2.01
LY9Q9HBG7 FHL2-203ENST00000358129 1578 ntTSL 5 BASIC27.58■■■□□ 2.01
LY9Q9HBG7 FAM162B-201ENST00000368557 1036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.58■■■□□ 2.01
LY9Q9HBG7 MIR4508-201ENST00000584178 70 ntBASIC27.58■■■□□ 2.01
LY9Q9HBG7 RBM33-201ENST00000287912 1404 ntTSL 2 BASIC27.58■■■□□ 2
LY9Q9HBG7 TCEA1-211ENST00000522635 1432 ntTSL 2 BASIC27.58■■■□□ 2
LY9Q9HBG7 HOXB3-202ENST00000460160 1525 ntTSL 5 BASIC27.57■■■□□ 2
LY9Q9HBG7 BIN1-201ENST00000259238 2338 ntTSL 1 (best) BASIC27.57■■■□□ 2
LY9Q9HBG7 CCND3-223ENST00000616010 2047 ntTSL 5 BASIC27.57■■■□□ 2
LY9Q9HBG7 MRPS7-203ENST00000579002 1638 ntTSL 2 BASIC27.57■■■□□ 2
LY9Q9HBG7 QDPR-202ENST00000428702 1278 ntTSL 2 BASIC27.57■■■□□ 2
LY9Q9HBG7 AC053527.1-201ENST00000502790 685 ntTSL 3 BASIC27.57■■■□□ 2
LY9Q9HBG7 MMP25-AS1-209ENST00000576250 779 ntTSL 5 BASIC27.57■■■□□ 2
LY9Q9HBG7 LDHB-203ENST00000396076 1538 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.57■■■□□ 2
LY9Q9HBG7 PMS1-205ENST00000409985 1882 ntTSL 2 BASIC27.56■■■□□ 2
LY9Q9HBG7 AC022616.5-201ENST00000518796 181 ntBASIC27.56■■■□□ 2
LY9Q9HBG7 KRT8P33-201ENST00000508125 1423 ntBASIC27.56■■■□□ 2
LY9Q9HBG7 GTF2IP1-204ENST00000616377 2632 ntTSL 2 BASIC27.55■■■□□ 2
LY9Q9HBG7 ECEL1-202ENST00000409941 2322 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC27.55■■■□□ 2
LY9Q9HBG7 CD63-201ENST00000257857 1070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.54■■■□□ 2
LY9Q9HBG7 PIM3-201ENST00000360612 2369 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.54■■■□□ 2
LY9Q9HBG7 TNIP2-206ENST00000510267 2006 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC27.54■■■□□ 2
LY9Q9HBG7 NKAIN3-202ENST00000523211 1988 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.54■■■□□ 2
LY9Q9HBG7 AC105219.1-201ENST00000531565 1963 ntTSL 1 (best) BASIC27.54■■■□□ 2
LY9Q9HBG7 AL121906.1-201ENST00000606866 440 ntTSL 3 BASIC27.54■■■□□ 2
LY9Q9HBG7 PPP1CC-206ENST00000550991 1882 ntTSL 2 BASIC27.53■■■□□ 2
LY9Q9HBG7 LSR-205ENST00000427250 1606 ntTSL 2 BASIC27.53■■■□□ 2
LY9Q9HBG7 WNT11-201ENST00000322563 1930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.53■■■□□ 2
LY9Q9HBG7 NR6A1-201ENST00000344523 1846 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.53■■■□□ 2
LY9Q9HBG7 PKNOX2-AS1-201ENST00000532316 586 ntTSL 3 BASIC27.52■■■□□ 2
LY9Q9HBG7 LINC01970-201ENST00000581489 1810 ntTSL 1 (best) BASIC27.52■■■□□ 2
LY9Q9HBG7 RHOQ-201ENST00000238738 2975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.52■■■□□ 2
LY9Q9HBG7 FAM181A-204ENST00000557000 1652 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.52■■■□□ 2
LY9Q9HBG7 IGFBP6-201ENST00000301464 1169 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.51■■□□□ 1.99
LY9Q9HBG7 TMPO-AS1-201ENST00000546421 738 ntTSL 5 BASIC27.51■■□□□ 1.99
LY9Q9HBG7 HDGFL2-210ENST00000621835 2255 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.51■■□□□ 1.99
LY9Q9HBG7 R3HCC1-202ENST00000411463 1467 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC27.51■■□□□ 1.99
LY9Q9HBG7 KLHDC9-203ENST00000392192 1333 ntTSL 1 (best) BASIC27.5■■□□□ 1.99
LY9Q9HBG7 AL357033.1-201ENST00000370520 1933 ntTSL 2 BASIC27.5■■□□□ 1.99
LY9Q9HBG7 AC010913.1-201ENST00000608612 420 ntTSL 2 BASIC27.5■■□□□ 1.99
LY9Q9HBG7 NAGS-201ENST00000293404 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.5■■□□□ 1.99
LY9Q9HBG7 RARA-AS1-201ENST00000581080 1790 ntTSL 1 (best) BASIC27.5■■□□□ 1.99
LY9Q9HBG7 AC090877.2-201ENST00000558441 1738 ntBASIC27.5■■□□□ 1.99
LY9Q9HBG7 CEBPB-201ENST00000303004 1956 ntAPPRIS P1 BASIC27.49■■□□□ 1.99
LY9Q9HBG7 CAPNS1-216ENST00000628306 1389 ntTSL 5 BASIC27.49■■□□□ 1.99
LY9Q9HBG7 MADCAM1-202ENST00000346144 1309 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.49■■□□□ 1.99
LY9Q9HBG7 CITED4-201ENST00000372638 1316 ntAPPRIS P1 BASIC27.49■■□□□ 1.99
LY9Q9HBG7 DGCR6-208ENST00000608842 1837 ntTSL 2 BASIC27.49■■□□□ 1.99
LY9Q9HBG7 SSSCA1-AS1-201ENST00000567594 614 ntBASIC27.49■■□□□ 1.99
LY9Q9HBG7 TSPAN10-204ENST00000611590 1068 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.49■■□□□ 1.99
LY9Q9HBG7 HADH-203ENST00000505878 1719 ntTSL 1 (best) BASIC27.48■■□□□ 1.99
LY9Q9HBG7 CDCA5-202ENST00000404147 1012 ntTSL 2 BASIC27.48■■□□□ 1.99
LY9Q9HBG7 AC103724.3-201ENST00000564481 992 ntBASIC27.48■■□□□ 1.99
LY9Q9HBG7 CDKN2A-214ENST00000579755 1283 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.48■■□□□ 1.99
LY9Q9HBG7 SLIT1-203ENST00000371041 1695 ntTSL 2 BASIC27.48■■□□□ 1.99
LY9Q9HBG7 FEZ2-203ENST00000379245 2097 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.48■■□□□ 1.99
LY9Q9HBG7 ATG16L2-205ENST00000534905 1614 ntTSL 1 (best) BASIC27.48■■□□□ 1.99
LY9Q9HBG7 ARHGEF9-210ENST00000623517 2143 ntTSL 2 BASIC27.47■■□□□ 1.99
LY9Q9HBG7 RFNG-201ENST00000310496 1828 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.47■■□□□ 1.99
LY9Q9HBG7 RARRES2P1-201ENST00000474487 481 ntBASIC27.47■■□□□ 1.99
LY9Q9HBG7 AC120024.1-201ENST00000562672 995 ntBASIC27.47■■□□□ 1.99
LY9Q9HBG7 SLC22A18-201ENST00000312221 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.47■■□□□ 1.99
LY9Q9HBG7 MYCL-201ENST00000372815 1944 ntTSL 1 (best) BASIC27.47■■□□□ 1.99
LY9Q9HBG7 MORF4L1-202ENST00000379535 2274 ntTSL 2 BASIC27.47■■□□□ 1.99
LY9Q9HBG7 TMEM266-201ENST00000388942 2520 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.46■■□□□ 1.99
LY9Q9HBG7 KAT5-208ENST00000530446 1697 ntTSL 1 (best) BASIC27.46■■□□□ 1.99
LY9Q9HBG7 AP003733.4-201ENST00000623785 1697 ntBASIC27.46■■□□□ 1.99
LY9Q9HBG7 PCMT1-202ENST00000367380 1628 ntTSL 2 BASIC27.46■■□□□ 1.99
LY9Q9HBG7 PCMT1-211ENST00000544496 1628 ntTSL 2 BASIC27.46■■□□□ 1.99
LY9Q9HBG7 PTRH1-208ENST00000543175 814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.46■■□□□ 1.99
LY9Q9HBG7 BTBD7-201ENST00000298896 2621 ntTSL 1 (best) BASIC27.46■■□□□ 1.99
LY9Q9HBG7 ADAD2-202ENST00000315906 1995 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.46■■□□□ 1.99
LY9Q9HBG7 RFLNA-202ENST00000338359 652 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.45■■□□□ 1.98
LY9Q9HBG7 YBX1P4-201ENST00000392794 808 ntBASIC27.45■■□□□ 1.98
LY9Q9HBG7 AC011551.1-201ENST00000614101 683 ntBASIC27.45■■□□□ 1.98
LY9Q9HBG7 AC064853.4-201ENST00000641394 363 ntAPPRIS P1 BASIC27.45■■□□□ 1.98
LY9Q9HBG7 BBC3-203ENST00000439096 1838 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.44■■□□□ 1.98
LY9Q9HBG7 DNAJB11-201ENST00000265028 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.44■■□□□ 1.98
LY9Q9HBG7 ANO8-204ENST00000630631 1905 ntTSL 5 BASIC27.44■■□□□ 1.98
LY9Q9HBG7 AL590094.1-201ENST00000635581 706 ntTSL 2 BASIC27.44■■□□□ 1.98
LY9Q9HBG7 PYCR1-202ENST00000337943 1890 ntTSL 1 (best) BASIC27.44■■□□□ 1.98
LY9Q9HBG7 KRT18P24-201ENST00000344739 1156 ntBASIC27.43■■□□□ 1.98
LY9Q9HBG7 EPM2A-202ENST00000435470 1278 ntTSL 1 (best) BASIC27.43■■□□□ 1.98
LY9Q9HBG7 CLIC3-203ENST00000494426 1017 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.43■■□□□ 1.98
LY9Q9HBG7 AP2M1-202ENST00000382456 2091 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC27.43■■□□□ 1.98
LY9Q9HBG7 RIMKLB-205ENST00000535829 2236 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.43■■□□□ 1.98
LY9Q9HBG7 AL355490.1-201ENST00000445808 805 ntTSL 3 BASIC27.42■■□□□ 1.98
LY9Q9HBG7 APBA3-201ENST00000316757 2075 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.42■■□□□ 1.98
LY9Q9HBG7 MOB4-204ENST00000409360 1447 ntTSL 5 BASIC27.41■■□□□ 1.98
LY9Q9HBG7 CNN3-202ENST00000394202 1974 ntTSL 2 BASIC27.41■■□□□ 1.98
LY9Q9HBG7 TMEM51-205ENST00000434578 1861 ntTSL 1 (best) BASIC27.41■■□□□ 1.98
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 9.8 ms