Protein–RNA interactions for Protein: Q9H9T3

ELP3, Elongator complex protein 3, humanhuman

Predictions only

Length 547 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ELP3Q9H9T3 PAOX-203ENST00000357296 1633 ntTSL 1 (best) BASIC27.66■■■□□ 2.02
ELP3Q9H9T3 R3HCC1-201ENST00000265806 1773 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.65■■■□□ 2.02
ELP3Q9H9T3 TCF24-201ENST00000563496 2450 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.65■■■□□ 2.02
ELP3Q9H9T3 PRICKLE4-201ENST00000394259 939 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.65■■■□□ 2.02
ELP3Q9H9T3 AC026271.2-201ENST00000428091 497 ntBASIC27.65■■■□□ 2.02
ELP3Q9H9T3 PWWP2B-201ENST00000305233 2651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.64■■■□□ 2.02
ELP3Q9H9T3 RAB33A-201ENST00000257017 1258 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.64■■■□□ 2.02
ELP3Q9H9T3 SUSD3-202ENST00000375472 1195 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.64■■■□□ 2.02
ELP3Q9H9T3 AC136475.3-202ENST00000534742 812 ntTSL 2 BASIC27.64■■■□□ 2.02
ELP3Q9H9T3 AL359317.1-201ENST00000556316 578 ntTSL 4 BASIC27.64■■■□□ 2.02
ELP3Q9H9T3 SHISA9-205ENST00000639941 1135 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.64■■■□□ 2.02
ELP3Q9H9T3 MATK-201ENST00000310132 2133 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.63■■■□□ 2.01
ELP3Q9H9T3 RALB-203ENST00000420510 1252 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.63■■■□□ 2.01
ELP3Q9H9T3 SUDS3P1-201ENST00000505831 966 ntBASIC27.63■■■□□ 2.01
ELP3Q9H9T3 UCK1-204ENST00000372215 2167 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.63■■■□□ 2.01
ELP3Q9H9T3 COL13A1-213ENST00000520267 2276 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.62■■■□□ 2.01
ELP3Q9H9T3 SMARCD3-203ENST00000392811 2018 ntTSL 1 (best) BASIC27.62■■■□□ 2.01
ELP3Q9H9T3 MEIS3-204ENST00000558555 1715 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.62■■■□□ 2.01
ELP3Q9H9T3 EIF6-201ENST00000374436 1252 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.62■■■□□ 2.01
ELP3Q9H9T3 PARD6B-202ENST00000396039 522 ntTSL 1 (best) BASIC27.62■■■□□ 2.01
ELP3Q9H9T3 LGR4-203ENST00000480977 492 ntTSL 2 BASIC27.62■■■□□ 2.01
ELP3Q9H9T3 CDKN2A-210ENST00000530628 748 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.62■■■□□ 2.01
ELP3Q9H9T3 TYROBP-203ENST00000544690 522 ntTSL 1 (best) BASIC27.62■■■□□ 2.01
ELP3Q9H9T3 TMEM240-203ENST00000624426 796 ntTSL 3 BASIC27.62■■■□□ 2.01
ELP3Q9H9T3 ARL4D-201ENST00000320033 1612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.62■■■□□ 2.01
ELP3Q9H9T3 TMEM260-202ENST00000538838 1638 ntTSL 1 (best) BASIC27.62■■■□□ 2.01
ELP3Q9H9T3 PEX7-201ENST00000318471 1464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.62■■■□□ 2.01
ELP3Q9H9T3 RRAD-201ENST00000299759 1569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.61■■■□□ 2.01
ELP3Q9H9T3 CDKN2D-201ENST00000335766 1086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.61■■■□□ 2.01
ELP3Q9H9T3 AC019163.1-201ENST00000512634 610 ntTSL 2 BASIC27.61■■■□□ 2.01
ELP3Q9H9T3 MIR6722-201ENST00000617286 78 ntBASIC27.61■■■□□ 2.01
ELP3Q9H9T3 AC092902.2-206ENST00000625484 846 ntTSL 5 BASIC27.61■■■□□ 2.01
ELP3Q9H9T3 PPP1CC-206ENST00000550991 1882 ntTSL 2 BASIC27.61■■■□□ 2.01
ELP3Q9H9T3 AC135279.3-201ENST00000610945 1311 ntBASIC27.61■■■□□ 2.01
ELP3Q9H9T3 ABL1-201ENST00000318560 5766 ntTSL 1 (best) BASIC27.61■■■□□ 2.01
ELP3Q9H9T3 PTOV1-220ENST00000601675 1587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.6■■■□□ 2.01
ELP3Q9H9T3 CASP9-202ENST00000348549 1621 ntTSL 1 (best) BASIC27.6■■■□□ 2.01
ELP3Q9H9T3 ERRFI1-203ENST00000469499 995 ntTSL 3 BASIC27.6■■■□□ 2.01
ELP3Q9H9T3 NEDD4L-237ENST00000617539 728 ntTSL 2 BASIC27.6■■■□□ 2.01
ELP3Q9H9T3 ZNF784-202ENST00000591479 1559 ntTSL 1 (best) BASIC27.6■■■□□ 2.01
ELP3Q9H9T3 TNFSF12-TNFSF13-201ENST00000293826 1816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.6■■■□□ 2.01
ELP3Q9H9T3 CNNM2-201ENST00000369875 2059 ntTSL 1 (best) BASIC27.6■■■□□ 2.01
ELP3Q9H9T3 FSD1-204ENST00000597590 1634 ntTSL 5 BASIC27.59■■■□□ 2.01
ELP3Q9H9T3 CTSA-203ENST00000372459 1972 ntTSL 1 (best) BASIC27.59■■■□□ 2.01
ELP3Q9H9T3 CDKN2A-206ENST00000494262 989 ntTSL 3 BASIC27.59■■■□□ 2.01
ELP3Q9H9T3 ATP10A-207ENST00000619904 988 ntTSL 5 BASIC27.59■■■□□ 2.01
ELP3Q9H9T3 ACBD4-216ENST00000619916 1276 ntTSL 5 BASIC27.59■■■□□ 2.01
ELP3Q9H9T3 NR6A1-201ENST00000344523 1846 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.59■■■□□ 2.01
ELP3Q9H9T3 ACAA1-220ENST00000627515 1862 ntTSL 5 BASIC27.59■■■□□ 2.01
ELP3Q9H9T3 USP2-204ENST00000525735 1704 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC27.58■■■□□ 2.01
ELP3Q9H9T3 MTCH1-201ENST00000373616 2006 ntTSL 1 (best) BASIC27.57■■■□□ 2
ELP3Q9H9T3 ZNF32-202ENST00000395797 1201 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.57■■■□□ 2
ELP3Q9H9T3 GPR75-ASB3-201ENST00000406625 2113 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.57■■■□□ 2
ELP3Q9H9T3 AC024257.2-201ENST00000549699 147 ntBASIC27.57■■■□□ 2
ELP3Q9H9T3 ZDHHC20-203ENST00000400590 1869 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.57■■■□□ 2
ELP3Q9H9T3 C16orf87-201ENST00000285697 1585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.56■■■□□ 2
ELP3Q9H9T3 HYAL2-202ENST00000395139 2136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.56■■■□□ 2
ELP3Q9H9T3 SMIM29-205ENST00000468145 903 ntTSL 2 BASIC27.56■■■□□ 2
ELP3Q9H9T3 SMIM29-207ENST00000481533 1053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.56■■■□□ 2
ELP3Q9H9T3 FBXO33-202ENST00000554190 534 ntTSL 3 BASIC27.56■■■□□ 2
ELP3Q9H9T3 AC243829.1-202ENST00000618848 486 ntTSL 3 BASIC27.56■■■□□ 2
ELP3Q9H9T3 SLC30A5-201ENST00000380860 1317 ntTSL 1 (best) BASIC27.56■■■□□ 2
ELP3Q9H9T3 MAPKAPK2-201ENST00000294981 2171 ntTSL 1 (best) BASIC27.56■■■□□ 2
ELP3Q9H9T3 HYI-206ENST00000372434 1025 ntTSL 5 BASIC27.55■■■□□ 2
ELP3Q9H9T3 SRD5A1P1-201ENST00000442297 786 ntBASIC27.55■■■□□ 2
ELP3Q9H9T3 AL355987.3-201ENST00000456614 735 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC27.55■■■□□ 2
ELP3Q9H9T3 KRTAP5-4-202ENST00000616115 660 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.55■■■□□ 2
ELP3Q9H9T3 CCDC166-201ENST00000542437 1320 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.55■■■□□ 2
ELP3Q9H9T3 PRSS22-201ENST00000161006 1386 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.55■■■□□ 2
ELP3Q9H9T3 RTN2-202ENST00000344680 2063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.54■■■□□ 2
ELP3Q9H9T3 KAT5-208ENST00000530446 1697 ntTSL 1 (best) BASIC27.54■■■□□ 2
ELP3Q9H9T3 AC090877.2-201ENST00000558441 1738 ntBASIC27.54■■■□□ 2
ELP3Q9H9T3 FEV-201ENST00000295727 1879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.53■■■□□ 2
ELP3Q9H9T3 CRLF1-201ENST00000392386 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.53■■■□□ 2
ELP3Q9H9T3 COMMD5-201ENST00000305103 1373 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.53■■■□□ 2
ELP3Q9H9T3 MRPL46-201ENST00000312475 1019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.53■■■□□ 2
ELP3Q9H9T3 FGF8-204ENST00000347978 823 ntTSL 1 (best) BASIC27.53■■■□□ 2
ELP3Q9H9T3 RHEB-201ENST00000262187 2075 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.53■■■□□ 2
ELP3Q9H9T3 RNF166-201ENST00000312838 1883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.53■■■□□ 2
ELP3Q9H9T3 AQP10-201ENST00000324978 1791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.53■■■□□ 2
ELP3Q9H9T3 PAIP1-208ENST00000514514 1603 ntTSL 5 BASIC27.52■■■□□ 2
ELP3Q9H9T3 CRACR2B-202ENST00000525077 1578 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.52■■■□□ 2
ELP3Q9H9T3 KCNJ4-201ENST00000303592 2065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.52■■■□□ 2
ELP3Q9H9T3 NAA38-201ENST00000333775 999 ntTSL 1 (best) BASIC27.52■■■□□ 2
ELP3Q9H9T3 NOX4-204ENST00000393282 560 ntTSL 1 (best) BASIC27.52■■■□□ 2
ELP3Q9H9T3 AL355001.2-201ENST00000620617 1191 ntBASIC27.52■■■□□ 2
ELP3Q9H9T3 RDH14-201ENST00000381249 1587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.52■■■□□ 2
ELP3Q9H9T3 TOP1MT-208ENST00000519148 1868 ntTSL 2 BASIC27.51■■□□□ 1.99
ELP3Q9H9T3 AC011511.4-201ENST00000586529 1850 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.51■■□□□ 1.99
ELP3Q9H9T3 PORCN-202ENST00000355961 1848 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC27.51■■□□□ 1.99
ELP3Q9H9T3 EDA-201ENST00000338901 1233 ntBASIC27.51■■□□□ 1.99
ELP3Q9H9T3 C19orf60-201ENST00000358607 839 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.51■■□□□ 1.99
ELP3Q9H9T3 LYPD2-201ENST00000359228 594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.51■■□□□ 1.99
ELP3Q9H9T3 TNFRSF6B-201ENST00000369996 1124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.51■■□□□ 1.99
ELP3Q9H9T3 C19orf60-202ENST00000450195 702 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.51■■□□□ 1.99
ELP3Q9H9T3 MIR5787-201ENST00000611784 55 ntBASIC27.51■■□□□ 1.99
ELP3Q9H9T3 BCL3-201ENST00000164227 2038 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.51■■□□□ 1.99
ELP3Q9H9T3 ESRRA-201ENST00000000442 2215 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.51■■□□□ 1.99
ELP3Q9H9T3 CCR10-201ENST00000332438 1773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.5■■□□□ 1.99
ELP3Q9H9T3 GTF2E2-201ENST00000355904 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.5■■□□□ 1.99
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 45.3 ms