Protein–RNA interactions for Protein: Q9H4I3

TRABD, TraB domain-containing protein, humanhuman

Predictions only

Length 376 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TRABDQ9H4I3 SNX10-207ENST00000446848 2613 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
TRABDQ9H4I3 CPSF4-207ENST00000451876 1644 ntTSL 5 BASIC24.04■■□□□ 1.44
TRABDQ9H4I3 UXS1-201ENST00000283148 2099 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC24.04■■□□□ 1.44
TRABDQ9H4I3 CTBP1-203ENST00000382952 2467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
TRABDQ9H4I3 LINC01578-209ENST00000557682 2683 ntTSL 2 BASIC24.04■■□□□ 1.44
TRABDQ9H4I3 WRNIP1-205ENST00000618555 2651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
TRABDQ9H4I3 GGH-201ENST00000260118 1607 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
TRABDQ9H4I3 AGAP3-201ENST00000335367 2675 ntTSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
TRABDQ9H4I3 RITA1-203ENST00000552495 1898 ntTSL 2 BASIC24.03■■□□□ 1.44
TRABDQ9H4I3 AP003733.4-201ENST00000623785 1697 ntBASIC24.03■■□□□ 1.44
TRABDQ9H4I3 DGAT1-201ENST00000332324 1473 ntTSL 5 BASIC24.03■■□□□ 1.44
TRABDQ9H4I3 UBE2I-213ENST00000566587 1098 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.03■■□□□ 1.44
TRABDQ9H4I3 CLPTM1-201ENST00000337392 2604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
TRABDQ9H4I3 LTB4R-202ENST00000396782 1627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
TRABDQ9H4I3 PPP4C-201ENST00000279387 1407 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
TRABDQ9H4I3 KRT18P60-201ENST00000312876 1297 ntBASIC24.02■■□□□ 1.44
TRABDQ9H4I3 C20orf24-203ENST00000373852 1059 ntTSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
TRABDQ9H4I3 AC018755.3-202ENST00000596210 929 ntBASIC24.02■■□□□ 1.44
TRABDQ9H4I3 BIN1-203ENST00000346226 2401 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
TRABDQ9H4I3 SCARA5-204ENST00000524352 1945 ntTSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
TRABDQ9H4I3 EPCAM-201ENST00000263735 1724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
TRABDQ9H4I3 ABHD8-201ENST00000247706 2090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
TRABDQ9H4I3 DAZAP1-205ENST00000587079 2086 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.01■■□□□ 1.43
TRABDQ9H4I3 CDYL-203ENST00000397588 2184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
TRABDQ9H4I3 RBFA-201ENST00000262197 1219 ntTSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
TRABDQ9H4I3 TSEN34-201ENST00000302937 2294 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
TRABDQ9H4I3 BBC3-203ENST00000439096 1838 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
TRABDQ9H4I3 TMUB1-202ENST00000392818 1563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
TRABDQ9H4I3 AC133561.1-201ENST00000568600 2415 ntBASIC24■■□□□ 1.43
TRABDQ9H4I3 PSMG4-207ENST00000451246 824 ntTSL 3 BASIC24■■□□□ 1.43
TRABDQ9H4I3 FAM159A-204ENST00000517870 748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
TRABDQ9H4I3 TNFSF12-TNFSF13-201ENST00000293826 1816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
TRABDQ9H4I3 R3HDM4-201ENST00000361574 1815 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
TRABDQ9H4I3 MSX2-201ENST00000239243 2241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
TRABDQ9H4I3 E2F5-202ENST00000416274 1728 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
TRABDQ9H4I3 AC129492.7-201ENST00000622992 756 ntBASIC23.99■■□□□ 1.43
TRABDQ9H4I3 BMP6-201ENST00000283147 2780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
TRABDQ9H4I3 PARL-202ENST00000317096 1414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
TRABDQ9H4I3 CCDC154-201ENST00000389176 2212 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC23.99■■□□□ 1.43
TRABDQ9H4I3 TST-202ENST00000403892 1797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
TRABDQ9H4I3 SLC35B2-202ENST00000393812 2043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
TRABDQ9H4I3 RSPO4-202ENST00000400634 722 ntTSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
TRABDQ9H4I3 NKX2-5-204ENST00000521848 1027 ntTSL 2 BASIC23.98■■□□□ 1.43
TRABDQ9H4I3 OSCAR-202ENST00000351806 1375 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
TRABDQ9H4I3 MEIS3-204ENST00000558555 1715 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.98■■□□□ 1.43
TRABDQ9H4I3 PTOV1-201ENST00000391842 1875 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.98■■□□□ 1.43
TRABDQ9H4I3 LSM8-203ENST00000422760 1920 ntTSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
TRABDQ9H4I3 SLBP-206ENST00000489418 1977 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
TRABDQ9H4I3 TMIE-201ENST00000326431 1824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.97■■□□□ 1.43
TRABDQ9H4I3 UBTD1-201ENST00000370664 1706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.97■■□□□ 1.43
TRABDQ9H4I3 TTLL11-202ENST00000373776 2012 ntTSL 1 (best) BASIC23.97■■□□□ 1.43
TRABDQ9H4I3 DCUN1D2-208ENST00000478244 2045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.97■■□□□ 1.43
TRABDQ9H4I3 SPCS2P3-201ENST00000500401 656 ntBASIC23.97■■□□□ 1.43
TRABDQ9H4I3 VPS53-211ENST00000571805 2356 ntTSL 1 (best) BASIC23.97■■□□□ 1.43
TRABDQ9H4I3 RBM42-205ENST00000589871 1487 ntTSL 5 BASIC23.97■■□□□ 1.43
TRABDQ9H4I3 GADD45A-205ENST00000617962 1142 ntTSL 1 (best) BASIC23.97■■□□□ 1.43
TRABDQ9H4I3 SLCO3A1-201ENST00000318445 5115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.97■■□□□ 1.43
TRABDQ9H4I3 DVL3-201ENST00000313143 5254 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.97■■□□□ 1.43
TRABDQ9H4I3 AC097639.1-201ENST00000565519 1891 ntBASIC23.96■■□□□ 1.43
TRABDQ9H4I3 SLC52A2-208ENST00000527078 1790 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.96■■□□□ 1.43
TRABDQ9H4I3 ANKRD9-204ENST00000559651 1444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
TRABDQ9H4I3 DUX4L9-201ENST00000449051 1259 ntBASIC23.96■■□□□ 1.43
TRABDQ9H4I3 MIR6765-201ENST00000614092 87 ntBASIC23.96■■□□□ 1.43
TRABDQ9H4I3 CASK-201ENST00000378154 2494 ntTSL 5 BASIC23.96■■□□□ 1.43
TRABDQ9H4I3 C16orf72-201ENST00000327827 5953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
TRABDQ9H4I3 GP1BB-201ENST00000366425 1553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.43
TRABDQ9H4I3 KLC1-205ENST00000380038 2322 ntTSL 2 BASIC23.95■■□□□ 1.43
TRABDQ9H4I3 SAMD4B-208ENST00000598913 2877 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.42
TRABDQ9H4I3 SYNGR3-201ENST00000248121 2051 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.42
TRABDQ9H4I3 IL15RA-214ENST00000525219 1850 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.42
TRABDQ9H4I3 ST3GAL5-268ENST00000640982 2465 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.95■■□□□ 1.42
TRABDQ9H4I3 PANK2-201ENST00000316562 2280 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.42
TRABDQ9H4I3 SYT7-202ENST00000535826 1621 ntTSL 5 BASIC23.95■■□□□ 1.42
TRABDQ9H4I3 C5orf58-204ENST00000521850 2113 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.42
TRABDQ9H4I3 SLC39A3-201ENST00000269740 1502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
TRABDQ9H4I3 IDNK-203ENST00000405990 629 ntTSL 2 BASIC23.94■■□□□ 1.42
TRABDQ9H4I3 IFI30-201ENST00000407280 1134 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
TRABDQ9H4I3 IQANK1-201ENST00000527139 1803 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.94■■□□□ 1.42
TRABDQ9H4I3 TOP2B-204ENST00000435706 5389 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
TRABDQ9H4I3 EIF5A-211ENST00000576930 1439 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.93■■□□□ 1.42
TRABDQ9H4I3 SLC6A10P-202ENST00000431994 2058 ntBASIC23.93■■□□□ 1.42
TRABDQ9H4I3 PPP1R14A-201ENST00000301242 777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
TRABDQ9H4I3 FAM98C-202ENST00000343358 1006 ntTSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
TRABDQ9H4I3 CASTOR2-201ENST00000616305 1257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
TRABDQ9H4I3 C16orf95-206ENST00000618367 974 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.93■■□□□ 1.42
TRABDQ9H4I3 CPOX-201ENST00000264193 2825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
TRABDQ9H4I3 HORMAD2-201ENST00000336726 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
TRABDQ9H4I3 ZFYVE28-202ENST00000503000 1874 ntTSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
TRABDQ9H4I3 AQP10-201ENST00000324978 1791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
TRABDQ9H4I3 ZBTB45-205ENST00000600990 2159 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.92■■□□□ 1.42
TRABDQ9H4I3 PNCK-204ENST00000370150 1612 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.92■■□□□ 1.42
TRABDQ9H4I3 FEZ2-203ENST00000379245 2097 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
TRABDQ9H4I3 ZDHHC1-201ENST00000348579 2047 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
TRABDQ9H4I3 CRIM1-201ENST00000280527 5912 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
TRABDQ9H4I3 NAT14-201ENST00000205194 1536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
TRABDQ9H4I3 LINC01233-202ENST00000598832 568 ntTSL 2 BASIC23.91■■□□□ 1.42
TRABDQ9H4I3 MAGI2-208ENST00000522391 4878 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.91■■□□□ 1.42
TRABDQ9H4I3 GFOD1-204ENST00000603223 2388 ntTSL 2 BASIC23.91■■□□□ 1.42
TRABDQ9H4I3 RAB40B-201ENST00000269347 2189 ntTSL 2 BASIC23.91■■□□□ 1.42
TRABDQ9H4I3 EPS8L1-205ENST00000586329 2130 ntTSL 5 BASIC23.9■■□□□ 1.42
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 22.2 ms