Protein–RNA interactions for Protein: Q9H4F8

SMOC1, SPARC-related modular calcium-binding protein 1, humanhuman

Predictions only

Length 434 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SMOC1Q9H4F8 CCDC71L-201ENST00000315965 1575 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.26■■□□□ 1.31
SMOC1Q9H4F8 HNRNPD-203ENST00000353341 1585 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
SMOC1Q9H4F8 ANKRD13D-211ENST00000511455 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
SMOC1Q9H4F8 TSPAN4-203ENST00000397397 1423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
SMOC1Q9H4F8 RAB33A-201ENST00000257017 1258 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
SMOC1Q9H4F8 AF213884.3-201ENST00000563833 479 ntBASIC23.25■■□□□ 1.31
SMOC1Q9H4F8 C15orf59-201ENST00000379822 1342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
SMOC1Q9H4F8 ADAP1-201ENST00000265846 2363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
SMOC1Q9H4F8 AP004609.3-201ENST00000610705 1884 ntBASIC23.24■■□□□ 1.31
SMOC1Q9H4F8 PDSS1-201ENST00000376215 1626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
SMOC1Q9H4F8 FAIM-202ENST00000360570 1157 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC23.24■■□□□ 1.31
SMOC1Q9H4F8 FAM174B-207ENST00000555748 866 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC23.24■■□□□ 1.31
SMOC1Q9H4F8 SNX5-217ENST00000606557 1087 ntBASIC23.24■■□□□ 1.31
SMOC1Q9H4F8 ZDHHC20-203ENST00000400590 1869 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.24■■□□□ 1.31
SMOC1Q9H4F8 ANKRD65-205ENST00000537107 2190 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.23■■□□□ 1.31
SMOC1Q9H4F8 KLC3-201ENST00000391946 1780 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
SMOC1Q9H4F8 SLC52A2-208ENST00000527078 1790 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.23■■□□□ 1.31
SMOC1Q9H4F8 LAMTOR1-201ENST00000278671 1179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
SMOC1Q9H4F8 SRD5A1P1-201ENST00000442297 786 ntBASIC23.23■■□□□ 1.31
SMOC1Q9H4F8 SERGEF-219ENST00000532265 1124 ntTSL 2 BASIC23.23■■□□□ 1.31
SMOC1Q9H4F8 GRAMD4P4-201ENST00000613563 1115 ntBASIC23.23■■□□□ 1.31
SMOC1Q9H4F8 AL136967.2-201ENST00000623968 743 ntBASIC23.23■■□□□ 1.31
SMOC1Q9H4F8 CCNJL-201ENST00000257536 1848 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.23■■□□□ 1.31
SMOC1Q9H4F8 WDSUB1-205ENST00000409990 1920 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.22■■□□□ 1.31
SMOC1Q9H4F8 LYPD2-201ENST00000359228 594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
SMOC1Q9H4F8 GRAMD1B-217ENST00000640939 1212 ntTSL 5 BASIC23.22■■□□□ 1.31
SMOC1Q9H4F8 RNF130-205ENST00000521389 2263 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
SMOC1Q9H4F8 PHF11-202ENST00000378319 1359 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
SMOC1Q9H4F8 LYL1-201ENST00000264824 1490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
SMOC1Q9H4F8 NRG2-203ENST00000340391 1944 ntTSL 5 BASIC23.21■■□□□ 1.31
SMOC1Q9H4F8 PI4KAP2-202ENST00000450651 2294 ntTSL 5 BASIC23.21■■□□□ 1.31
SMOC1Q9H4F8 STX10-202ENST00000343587 1128 ntTSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
SMOC1Q9H4F8 LBX2-202ENST00000377566 1186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
SMOC1Q9H4F8 RCE1-202ENST00000524506 1379 ntTSL 5 BASIC23.21■■□□□ 1.31
SMOC1Q9H4F8 ARHGAP22-202ENST00000374170 2107 ntTSL 5 BASIC23.2■■□□□ 1.3
SMOC1Q9H4F8 AMH-201ENST00000221496 1821 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
SMOC1Q9H4F8 TMEM203-201ENST00000343666 1557 ntAPPRIS P1 BASIC23.2■■□□□ 1.3
SMOC1Q9H4F8 SIRT3-204ENST00000525319 1475 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.2■■□□□ 1.3
SMOC1Q9H4F8 CCDC160-201ENST00000370809 1299 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.2■■□□□ 1.3
SMOC1Q9H4F8 SUSD3-202ENST00000375472 1195 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
SMOC1Q9H4F8 ATP6V0B-204ENST00000471859 865 ntTSL 5 BASIC23.2■■□□□ 1.3
SMOC1Q9H4F8 SSSCA1-AS1-201ENST00000567594 614 ntBASIC23.2■■□□□ 1.3
SMOC1Q9H4F8 FAM222B-208ENST00000581381 556 ntTSL 4 BASIC23.2■■□□□ 1.3
SMOC1Q9H4F8 AC087623.3-201ENST00000607047 1098 ntBASIC23.2■■□□□ 1.3
SMOC1Q9H4F8 C17orf97-201ENST00000360127 1839 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
SMOC1Q9H4F8 C11orf80-218ENST00000540737 1786 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.19■■□□□ 1.3
SMOC1Q9H4F8 FHL2-203ENST00000358129 1578 ntTSL 5 BASIC23.19■■□□□ 1.3
SMOC1Q9H4F8 APLP1-201ENST00000221891 2495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
SMOC1Q9H4F8 TMEM240-203ENST00000624426 796 ntTSL 3 BASIC23.19■■□□□ 1.3
SMOC1Q9H4F8 FAM117A-201ENST00000240364 2365 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
SMOC1Q9H4F8 TTC3-225ENST00000540756 2025 ntTSL 2 BASIC23.18■■□□□ 1.3
SMOC1Q9H4F8 ATP5C1-202ENST00000356708 1163 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
SMOC1Q9H4F8 MOSPD3-203ENST00000393950 1191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
SMOC1Q9H4F8 ERRFI1-203ENST00000469499 995 ntTSL 3 BASIC23.18■■□□□ 1.3
SMOC1Q9H4F8 MIR6821-201ENST00000617625 74 ntBASIC23.18■■□□□ 1.3
SMOC1Q9H4F8 SLC12A5-217ENST00000626937 1224 ntTSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
SMOC1Q9H4F8 FUS-202ENST00000380244 1818 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
SMOC1Q9H4F8 RBM38-205ENST00000440234 686 ntTSL 2 BASIC23.17■■□□□ 1.3
SMOC1Q9H4F8 AL162430.1-201ENST00000480705 870 ntBASIC23.17■■□□□ 1.3
SMOC1Q9H4F8 MIR6722-201ENST00000617286 78 ntBASIC23.17■■□□□ 1.3
SMOC1Q9H4F8 AC243829.1-202ENST00000618848 486 ntTSL 3 BASIC23.17■■□□□ 1.3
SMOC1Q9H4F8 LLGL2-202ENST00000375227 1374 ntTSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
SMOC1Q9H4F8 FOXA2-202ENST00000419308 2422 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
SMOC1Q9H4F8 MIR939-201ENST00000401314 82 ntBASIC23.16■■□□□ 1.3
SMOC1Q9H4F8 PRELID2-204ENST00000505416 738 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC23.16■■□□□ 1.3
SMOC1Q9H4F8 GFRA4-201ENST00000290417 1427 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
SMOC1Q9H4F8 SDSL-201ENST00000345635 1397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
SMOC1Q9H4F8 AP001330.3-201ENST00000520123 633 ntBASIC23.15■■□□□ 1.3
SMOC1Q9H4F8 TGFBR3L-202ENST00000565886 1260 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.15■■□□□ 1.3
SMOC1Q9H4F8 BAG1-212ENST00000641048 1038 ntAPPRIS P3 BASIC23.15■■□□□ 1.3
SMOC1Q9H4F8 DHFR-203ENST00000505337 1719 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.15■■□□□ 1.3
SMOC1Q9H4F8 THAP11-201ENST00000303596 2114 ntAPPRIS P1 BASIC23.15■■□□□ 1.3
SMOC1Q9H4F8 DPF1-202ENST00000412732 2303 ntTSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
SMOC1Q9H4F8 REXO4-201ENST00000371935 1899 ntTSL 3 BASIC23.15■■□□□ 1.3
SMOC1Q9H4F8 PQLC1-202ENST00000357575 2475 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.15■■□□□ 1.3
SMOC1Q9H4F8 PWWP2B-201ENST00000305233 2651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.29
SMOC1Q9H4F8 BSCL2-205ENST00000403550 1693 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC23.14■■□□□ 1.29
SMOC1Q9H4F8 GLI3-203ENST00000437480 451 ntTSL 2 BASIC23.14■■□□□ 1.29
SMOC1Q9H4F8 NR6A1-201ENST00000344523 1846 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.14■■□□□ 1.29
SMOC1Q9H4F8 COMMD5-201ENST00000305103 1373 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.29
SMOC1Q9H4F8 FOXO3B-201ENST00000395675 1928 ntBASIC23.14■■□□□ 1.29
SMOC1Q9H4F8 TMEM260-202ENST00000538838 1638 ntTSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
SMOC1Q9H4F8 STOML2-201ENST00000356493 1278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
SMOC1Q9H4F8 AC097381.1-201ENST00000429019 1296 ntBASIC23.13■■□□□ 1.29
SMOC1Q9H4F8 CAMTA1-208ENST00000473578 567 ntTSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
SMOC1Q9H4F8 SMARCA5-AS1-201ENST00000500800 945 ntTSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
SMOC1Q9H4F8 CRLF1-201ENST00000392386 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
SMOC1Q9H4F8 PTOV1-220ENST00000601675 1587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
SMOC1Q9H4F8 RHBDD2-202ENST00000318622 1878 ntTSL 2 BASIC23.13■■□□□ 1.29
SMOC1Q9H4F8 PPP1CC-206ENST00000550991 1882 ntTSL 2 BASIC23.13■■□□□ 1.29
SMOC1Q9H4F8 PAFAH1B2-205ENST00000529887 1056 ntTSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
SMOC1Q9H4F8 NKX2-2-AS1-201ENST00000549659 638 ntTSL 5 BASIC23.12■■□□□ 1.29
SMOC1Q9H4F8 ST7-205ENST00000393446 2114 ntTSL 5 BASIC23.12■■□□□ 1.29
SMOC1Q9H4F8 RPUSD3-206ENST00000433535 1178 ntTSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
SMOC1Q9H4F8 EDA-209ENST00000525810 843 ntTSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
SMOC1Q9H4F8 PLD4-205ENST00000553861 667 ntTSL 2 BASIC23.11■■□□□ 1.29
SMOC1Q9H4F8 AIPL1-206ENST00000571740 1202 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
SMOC1Q9H4F8 GATM-206ENST00000558336 1522 ntTSL 2 BASIC23.11■■□□□ 1.29
SMOC1Q9H4F8 STMN4-201ENST00000265770 1250 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
SMOC1Q9H4F8 ST7-202ENST00000323984 2142 ntTSL 5 BASIC23.1■■□□□ 1.29
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 15.8 ms