Protein–RNA interactions for Protein: Q9GZT8

NIF3L1, NIF3-like protein 1, humanhuman

Predictions only

Length 377 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NIF3L1Q9GZT8 NDEL1-219ENST00000585098 454 ntTSL 3 BASIC25.22■■□□□ 1.63
NIF3L1Q9GZT8 ARL4D-201ENST00000320033 1612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.22■■□□□ 1.63
NIF3L1Q9GZT8 TMUB1-203ENST00000462940 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.22■■□□□ 1.63
NIF3L1Q9GZT8 CST6-201ENST00000312134 759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.21■■□□□ 1.63
NIF3L1Q9GZT8 NAXE-203ENST00000368235 1125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.21■■□□□ 1.63
NIF3L1Q9GZT8 CT47A7-201ENST00000434883 1288 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.21■■□□□ 1.63
NIF3L1Q9GZT8 FAM120C-203ENST00000477084 1140 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.21■■□□□ 1.63
NIF3L1Q9GZT8 FHL2-203ENST00000358129 1578 ntTSL 5 BASIC25.21■■□□□ 1.63
NIF3L1Q9GZT8 C4orf19-202ENST00000381980 1943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.21■■□□□ 1.63
NIF3L1Q9GZT8 E2F5-203ENST00000418930 1890 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.21■■□□□ 1.63
NIF3L1Q9GZT8 MAZ-202ENST00000322945 2532 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.21■■□□□ 1.63
NIF3L1Q9GZT8 MED17-227ENST00000640521 2047 ntTSL 5 BASIC25.2■■□□□ 1.63
NIF3L1Q9GZT8 AMIGO1-201ENST00000369862 2229 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.2■■□□□ 1.62
NIF3L1Q9GZT8 CHSY1-201ENST00000254190 4550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.2■■□□□ 1.62
NIF3L1Q9GZT8 FAM162B-201ENST00000368557 1036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.2■■□□□ 1.62
NIF3L1Q9GZT8 TCEA1-211ENST00000522635 1432 ntTSL 2 BASIC25.2■■□□□ 1.62
NIF3L1Q9GZT8 POLE2-201ENST00000216367 1776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.19■■□□□ 1.62
NIF3L1Q9GZT8 CD63-201ENST00000257857 1070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.19■■□□□ 1.62
NIF3L1Q9GZT8 CDCA5-202ENST00000404147 1012 ntTSL 2 BASIC25.19■■□□□ 1.62
NIF3L1Q9GZT8 FAM173A-202ENST00000564000 1088 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.19■■□□□ 1.62
NIF3L1Q9GZT8 MIR4508-201ENST00000584178 70 ntBASIC25.19■■□□□ 1.62
NIF3L1Q9GZT8 AC138932.3-201ENST00000567634 1902 ntBASIC25.19■■□□□ 1.62
NIF3L1Q9GZT8 NREP-202ENST00000379671 2581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.19■■□□□ 1.62
NIF3L1Q9GZT8 RBM33-201ENST00000287912 1404 ntTSL 2 BASIC25.19■■□□□ 1.62
NIF3L1Q9GZT8 CCND3-223ENST00000616010 2047 ntTSL 5 BASIC25.19■■□□□ 1.62
NIF3L1Q9GZT8 PRDM13-202ENST00000369215 2429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.18■■□□□ 1.62
NIF3L1Q9GZT8 ST6GALNAC2-201ENST00000225276 2170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.18■■□□□ 1.62
NIF3L1Q9GZT8 IGFBP3-201ENST00000275521 2262 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.18■■□□□ 1.62
NIF3L1Q9GZT8 TBC1D10A-201ENST00000215790 2077 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.18■■□□□ 1.62
NIF3L1Q9GZT8 AC103834.1-201ENST00000520383 144 ntBASIC25.18■■□□□ 1.62
NIF3L1Q9GZT8 PKNOX2-AS1-201ENST00000532316 586 ntTSL 3 BASIC25.18■■□□□ 1.62
NIF3L1Q9GZT8 ZNF606-203ENST00000547121 1196 ntTSL 2 BASIC25.18■■□□□ 1.62
NIF3L1Q9GZT8 AC093390.2-201ENST00000638628 1007 ntTSL 5 BASIC25.18■■□□□ 1.62
NIF3L1Q9GZT8 ST3GAL5-214ENST00000638178 2034 ntTSL 5 BASIC25.18■■□□□ 1.62
NIF3L1Q9GZT8 CLEC2L-201ENST00000422142 1359 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC25.18■■□□□ 1.62
NIF3L1Q9GZT8 LDHB-203ENST00000396076 1538 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.17■■□□□ 1.62
NIF3L1Q9GZT8 SRR-201ENST00000344595 2728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.17■■□□□ 1.62
NIF3L1Q9GZT8 IL17RE-203ENST00000421412 2158 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.17■■□□□ 1.62
NIF3L1Q9GZT8 SSSCA1-AS1-201ENST00000567594 614 ntBASIC25.17■■□□□ 1.62
NIF3L1Q9GZT8 PICALM-224ENST00000630913 2261 ntTSL 5 BASIC25.17■■□□□ 1.62
NIF3L1Q9GZT8 KRT8P33-201ENST00000508125 1423 ntBASIC25.17■■□□□ 1.62
NIF3L1Q9GZT8 HOXB3-202ENST00000460160 1525 ntTSL 5 BASIC25.17■■□□□ 1.62
NIF3L1Q9GZT8 GNPTAB-201ENST00000299314 5701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.16■■□□□ 1.62
NIF3L1Q9GZT8 PMS1-205ENST00000409985 1882 ntTSL 2 BASIC25.16■■□□□ 1.62
NIF3L1Q9GZT8 PABPN1-202ENST00000397276 2768 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.16■■□□□ 1.62
NIF3L1Q9GZT8 MRPS7-203ENST00000579002 1638 ntTSL 2 BASIC25.15■■□□□ 1.62
NIF3L1Q9GZT8 PPP1CC-206ENST00000550991 1882 ntTSL 2 BASIC25.15■■□□□ 1.62
NIF3L1Q9GZT8 MRPL4-207ENST00000590669 1423 ntTSL 1 (best) BASIC25.15■■□□□ 1.62
NIF3L1Q9GZT8 CDC16-204ENST00000360383 2211 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC25.14■■□□□ 1.61
NIF3L1Q9GZT8 NKAIN3-202ENST00000523211 1988 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.14■■□□□ 1.61
NIF3L1Q9GZT8 CAPNS1-216ENST00000628306 1389 ntTSL 5 BASIC25.14■■□□□ 1.61
NIF3L1Q9GZT8 MBOAT7-201ENST00000245615 2529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.14■■□□□ 1.61
NIF3L1Q9GZT8 AL357033.1-201ENST00000370520 1933 ntTSL 2 BASIC25.14■■□□□ 1.61
NIF3L1Q9GZT8 PPP1R26-201ENST00000356818 4932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.14■■□□□ 1.61
NIF3L1Q9GZT8 FAM181A-204ENST00000557000 1652 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.13■■□□□ 1.61
NIF3L1Q9GZT8 DDX42-201ENST00000359353 2783 ntTSL 5 BASIC25.13■■□□□ 1.61
NIF3L1Q9GZT8 PCMT1-202ENST00000367380 1628 ntTSL 2 BASIC25.13■■□□□ 1.61
NIF3L1Q9GZT8 LSR-205ENST00000427250 1606 ntTSL 2 BASIC25.13■■□□□ 1.61
NIF3L1Q9GZT8 PCMT1-211ENST00000544496 1628 ntTSL 2 BASIC25.13■■□□□ 1.61
NIF3L1Q9GZT8 AC090877.2-201ENST00000558441 1738 ntBASIC25.13■■□□□ 1.61
NIF3L1Q9GZT8 YBX1P4-201ENST00000392794 808 ntBASIC25.13■■□□□ 1.61
NIF3L1Q9GZT8 MMP25-AS1-209ENST00000576250 779 ntTSL 5 BASIC25.13■■□□□ 1.61
NIF3L1Q9GZT8 CDKN2A-214ENST00000579755 1283 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.13■■□□□ 1.61
NIF3L1Q9GZT8 AC011551.1-201ENST00000614101 683 ntBASIC25.13■■□□□ 1.61
NIF3L1Q9GZT8 PIM3-201ENST00000360612 2369 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.13■■□□□ 1.61
NIF3L1Q9GZT8 R3HCC1-202ENST00000411463 1467 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC25.13■■□□□ 1.61
NIF3L1Q9GZT8 CITED4-201ENST00000372638 1316 ntAPPRIS P1 BASIC25.12■■□□□ 1.61
NIF3L1Q9GZT8 NR6A1-201ENST00000344523 1846 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.12■■□□□ 1.61
NIF3L1Q9GZT8 AC053527.1-201ENST00000502790 685 ntTSL 3 BASIC25.12■■□□□ 1.61
NIF3L1Q9GZT8 TSPAN10-204ENST00000611590 1068 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.12■■□□□ 1.61
NIF3L1Q9GZT8 AP003733.4-201ENST00000623785 1697 ntBASIC25.12■■□□□ 1.61
NIF3L1Q9GZT8 BIN1-201ENST00000259238 2338 ntTSL 1 (best) BASIC25.12■■□□□ 1.61
NIF3L1Q9GZT8 MADCAM1-202ENST00000346144 1309 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.12■■□□□ 1.61
NIF3L1Q9GZT8 RARA-AS1-201ENST00000581080 1790 ntTSL 1 (best) BASIC25.11■■□□□ 1.61
NIF3L1Q9GZT8 TMPO-AS1-201ENST00000546421 738 ntTSL 5 BASIC25.11■■□□□ 1.61
NIF3L1Q9GZT8 AC010913.1-201ENST00000608612 420 ntTSL 2 BASIC25.11■■□□□ 1.61
NIF3L1Q9GZT8 HADH-203ENST00000505878 1719 ntTSL 1 (best) BASIC25.11■■□□□ 1.61
NIF3L1Q9GZT8 SLC22A18-201ENST00000312221 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.11■■□□□ 1.61
NIF3L1Q9GZT8 LINC01970-201ENST00000581489 1810 ntTSL 1 (best) BASIC25.1■■□□□ 1.61
NIF3L1Q9GZT8 IGFBP6-201ENST00000301464 1169 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.1■■□□□ 1.61
NIF3L1Q9GZT8 ARHGEF9-210ENST00000623517 2143 ntTSL 2 BASIC25.1■■□□□ 1.61
NIF3L1Q9GZT8 MOB4-204ENST00000409360 1447 ntTSL 5 BASIC25.1■■□□□ 1.61
NIF3L1Q9GZT8 TNIP2-206ENST00000510267 2006 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.1■■□□□ 1.61
NIF3L1Q9GZT8 DNAJB11-201ENST00000265028 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.1■■□□□ 1.61
NIF3L1Q9GZT8 KLHDC9-203ENST00000392192 1333 ntTSL 1 (best) BASIC25.1■■□□□ 1.61
NIF3L1Q9GZT8 AC105219.1-201ENST00000531565 1963 ntTSL 1 (best) BASIC25.09■■□□□ 1.61
NIF3L1Q9GZT8 ATG16L2-205ENST00000534905 1614 ntTSL 1 (best) BASIC25.09■■□□□ 1.61
NIF3L1Q9GZT8 AC120024.1-201ENST00000562672 995 ntBASIC25.09■■□□□ 1.61
NIF3L1Q9GZT8 AL121906.1-201ENST00000606866 440 ntTSL 3 BASIC25.09■■□□□ 1.61
NIF3L1Q9GZT8 WNT11-201ENST00000322563 1930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.09■■□□□ 1.61
NIF3L1Q9GZT8 MYCL-201ENST00000372815 1944 ntTSL 1 (best) BASIC25.08■■□□□ 1.61
NIF3L1Q9GZT8 CEBPB-201ENST00000303004 1956 ntAPPRIS P1 BASIC25.08■■□□□ 1.61
NIF3L1Q9GZT8 KRT18P24-201ENST00000344739 1156 ntBASIC25.07■■□□□ 1.6
NIF3L1Q9GZT8 AC078883.1-201ENST00000442417 950 ntTSL 3 BASIC25.07■■□□□ 1.6
NIF3L1Q9GZT8 PTRH1-208ENST00000543175 814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.07■■□□□ 1.6
NIF3L1Q9GZT8 AC103724.3-201ENST00000564481 992 ntBASIC25.07■■□□□ 1.6
NIF3L1Q9GZT8 FEZ2-203ENST00000379245 2097 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.07■■□□□ 1.6
NIF3L1Q9GZT8 RFNG-201ENST00000310496 1828 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.07■■□□□ 1.6
NIF3L1Q9GZT8 ECEL1-202ENST00000409941 2322 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.07■■□□□ 1.6
NIF3L1Q9GZT8 NAGS-201ENST00000293404 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.06■■□□□ 1.6
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 110.6 ms